Protein–RNA interactions for Protein: P09024

Hoxb7, Homeobox protein Hox-B7, mousemouse

Predictions only

Length 217 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxb7P09024 Gm29417-201ENSMUST00000188160 571 ntTSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
Hoxb7P09024 Gm34030-202ENSMUST00000211434 1126 ntTSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
Hoxb7P09024 Med10-201ENSMUST00000022089 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Hoxb7P09024 Ttr-201ENSMUST00000075312 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Hoxb7P09024 Olfr554-201ENSMUST00000098221 954 ntAPPRIS P1 BASIC18.62■□□□□ 0.57
Hoxb7P09024 Tada3-203ENSMUST00000099118 1282 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Hoxb7P09024 Ccdc106-202ENSMUST00000108571 1318 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Hoxb7P09024 Klhl11-201ENSMUST00000056665 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Hoxb7P09024 Tesk2-203ENSMUST00000106459 2444 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Hoxb7P09024 Tdrp-201ENSMUST00000062613 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Hoxb7P09024 Ttyh1-203ENSMUST00000119661 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Hoxb7P09024 Kcnj8-202ENSMUST00000203945 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Hoxb7P09024 Slc25a19-212ENSMUST00000178003 2614 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
Hoxb7P09024 Pik3ap1-201ENSMUST00000059672 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Hoxb7P09024 Igdcc3-203ENSMUST00000217371 3183 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Hoxb7P09024 Irak1-206ENSMUST00000114354 3835 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Hoxb7P09024 Map3k14-201ENSMUST00000021324 4246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Hoxb7P09024 Dach1-201ENSMUST00000069334 5063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Hoxb7P09024 Camk2d-226ENSMUST00000199300 5524 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Hoxb7P09024 Nipal3-201ENSMUST00000102549 5153 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Hoxb7P09024 Ankrd50-202ENSMUST00000120875 4945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Hoxb7P09024 Islr2-203ENSMUST00000163897 4303 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
Hoxb7P09024 Rasal2-201ENSMUST00000078308 10047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Hoxb7P09024 Rnf138-202ENSMUST00000072847 3002 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Hoxb7P09024 Large2-202ENSMUST00000090582 2291 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Hoxb7P09024 Anks1-202ENSMUST00000088027 6781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Hoxb7P09024 Opn4-201ENSMUST00000022331 2156 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Hoxb7P09024 Itgb4-205ENSMUST00000106461 6208 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
Hoxb7P09024 Mlkl-201ENSMUST00000056157 2003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Hoxb7P09024 Hoxc10-201ENSMUST00000001699 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Hoxb7P09024 Kcnq1-202ENSMUST00000185383 1535 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Hoxb7P09024 Shf-202ENSMUST00000110530 910 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
Hoxb7P09024 Gm14224-201ENSMUST00000147187 864 ntTSL 3 BASIC18.61■□□□□ 0.57
Hoxb7P09024 Gm6460-202ENSMUST00000163787 821 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Hoxb7P09024 Gm8879-201ENSMUST00000170260 1125 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
Hoxb7P09024 4933402N22Rik-202ENSMUST00000170301 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Hoxb7P09024 Gm43094-201ENSMUST00000196549 921 ntBASIC18.61■□□□□ 0.57
Hoxb7P09024 AC150560.1-201ENSMUST00000227731 1187 ntBASIC18.61■□□□□ 0.57
Hoxb7P09024 Zfp318-201ENSMUST00000113481 7850 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
Hoxb7P09024 Gpsm1-202ENSMUST00000066936 3384 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Hoxb7P09024 Camkv-201ENSMUST00000035700 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Hoxb7P09024 Mark2-209ENSMUST00000165965 2874 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Hoxb7P09024 Syt6-201ENSMUST00000090697 4416 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
Hoxb7P09024 Syt3-201ENSMUST00000118831 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
Hoxb7P09024 Whrn-203ENSMUST00000084510 4049 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Hoxb7P09024 Kcng1-201ENSMUST00000099069 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Hoxb7P09024 Bmp4-201ENSMUST00000074077 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Hoxb7P09024 Adck5-207ENSMUST00000160784 1998 ntTSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
Hoxb7P09024 Abhd3-202ENSMUST00000117726 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Hoxb7P09024 Syt6-203ENSMUST00000118117 1856 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Hoxb7P09024 Gm42471-201ENSMUST00000201457 1865 ntBASIC18.6■□□□□ 0.57
Hoxb7P09024 Nectin3-202ENSMUST00000023335 9116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Hoxb7P09024 Tmtc3-202ENSMUST00000099318 2794 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Hoxb7P09024 Rita1-201ENSMUST00000031599 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Hoxb7P09024 Stk40-201ENSMUST00000094761 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Hoxb7P09024 Tmbim6-201ENSMUST00000023749 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Hoxb7P09024 Zfp879-203ENSMUST00000109134 2414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Hoxb7P09024 Taf10-203ENSMUST00000141116 4281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Hoxb7P09024 Rhobtb1-210ENSMUST00000167384 2331 ntTSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Hoxb7P09024 Dhrs3-207ENSMUST00000171001 1349 ntTSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Hoxb7P09024 Cry2-202ENSMUST00000111278 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Hoxb7P09024 Ggt6-203ENSMUST00000108499 874 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Hoxb7P09024 Gm15821-201ENSMUST00000121995 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Hoxb7P09024 Gm15948-201ENSMUST00000150616 403 ntTSL 3 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Hoxb7P09024 Gm26464-201ENSMUST00000157094 305 ntBASIC18.6■□□□□ 0.57
Hoxb7P09024 Alms1-ps2-201ENSMUST00000160606 1170 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Hoxb7P09024 Fbxw4-209ENSMUST00000162433 789 ntTSL 3 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Hoxb7P09024 Chst4-202ENSMUST00000211894 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Hoxb7P09024 Ccdc159-204ENSMUST00000216710 1126 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Hoxb7P09024 AC166997.1-201ENSMUST00000225122 572 ntBASIC18.6■□□□□ 0.57
Hoxb7P09024 Swi5-201ENSMUST00000050410 775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Hoxb7P09024 Ncbp2-201ENSMUST00000023460 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Hoxb7P09024 Slc23a3-201ENSMUST00000027405 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Hoxb7P09024 Zfp740-202ENSMUST00000119168 3932 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Hoxb7P09024 Rbbp9-201ENSMUST00000028915 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Hoxb7P09024 CT010478.1-201ENSMUST00000220747 2787 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
Hoxb7P09024 Lmtk2-201ENSMUST00000041804 8114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Hoxb7P09024 Efcab14-202ENSMUST00000106522 2636 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Hoxb7P09024 Rnf135-201ENSMUST00000017839 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Hoxb7P09024 Dnajb2-210ENSMUST00000188931 3066 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Hoxb7P09024 Mapk7-201ENSMUST00000079080 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Hoxb7P09024 Ugcg-201ENSMUST00000030074 4012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Hoxb7P09024 Avl9-201ENSMUST00000031805 6670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Hoxb7P09024 Gnb5-202ENSMUST00000213990 1803 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Hoxb7P09024 Eda-207ENSMUST00000113780 4915 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Hoxb7P09024 Eda-208ENSMUST00000113781 4915 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Hoxb7P09024 Gm5035-201ENSMUST00000215581 927 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
Hoxb7P09024 AC192088.1-201ENSMUST00000227561 301 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
Hoxb7P09024 Gm15512-201ENSMUST00000137359 2257 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Hoxb7P09024 Gm37728-201ENSMUST00000195025 2292 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
Hoxb7P09024 Fam234a-201ENSMUST00000114988 3714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Hoxb7P09024 Ank1-208ENSMUST00000121075 1740 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Hoxb7P09024 Insc-201ENSMUST00000117543 2170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Hoxb7P09024 Ccdc88b-201ENSMUST00000113440 4959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Hoxb7P09024 Ppp2ca-201ENSMUST00000020608 7102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Hoxb7P09024 Bclaf3-202ENSMUST00000112464 3366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Hoxb7P09024 Ptx4-201ENSMUST00000054930 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Hoxb7P09024 Slc4a5-203ENSMUST00000113900 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Hoxb7P09024 Fubp3-201ENSMUST00000055244 3648 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Hoxb7P09024 Gm9867-201ENSMUST00000192212 2647 ntBASIC18.58■□□□□ 0.57
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.3 ms