Protein–RNA interactions for Protein: P09021

Hoxa5, Homeobox protein Hox-A5, mousemouse

Predictions only

Length 270 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxa5P09021 Ighv6-1-201ENSMUST00000193612 343 ntBASIC11.4□□□□□ -0.58
Hoxa5P09021 Gm37280-201ENSMUST00000194583 375 ntTSL 3 BASIC11.4□□□□□ -0.58
Hoxa5P09021 Mrpl36-202ENSMUST00000221730 717 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.4□□□□□ -0.58
Hoxa5P09021 Snhg10-202ENSMUST00000222812 527 ntTSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Hoxa5P09021 Gm7367-201ENSMUST00000057611 492 ntBASIC11.4□□□□□ -0.58
Hoxa5P09021 Lamc2-201ENSMUST00000027753 5164 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.4□□□□□ -0.58
Hoxa5P09021 Gm26841-201ENSMUST00000180725 1787 ntTSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Hoxa5P09021 Cdk5rap3-201ENSMUST00000103152 2250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Hoxa5P09021 Kcnj9-202ENSMUST00000194204 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Hoxa5P09021 Tepsin-201ENSMUST00000026442 2752 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Hoxa5P09021 Naa15-205ENSMUST00000193266 7480 ntTSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Hoxa5P09021 Fmn2-201ENSMUST00000030039 6442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Hoxa5P09021 Zfp672-204ENSMUST00000108829 3094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Hoxa5P09021 Otx2-209ENSMUST00000226501 2592 ntAPPRIS P1 BASIC11.4□□□□□ -0.58
Hoxa5P09021 Nrp2-204ENSMUST00000102822 6708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Hoxa5P09021 Tmem101-201ENSMUST00000021296 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Hoxa5P09021 Tubb4b-201ENSMUST00000043584 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Hoxa5P09021 Ppp2r5b-201ENSMUST00000025695 2742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Hoxa5P09021 Slc39a8-206ENSMUST00000180196 3383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.4□□□□□ -0.58
Hoxa5P09021 Ccnt2-202ENSMUST00000112570 4511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Hoxa5P09021 Ptpn6-210ENSMUST00000174265 1743 ntTSL 5 BASIC11.4□□□□□ -0.58
Hoxa5P09021 Ispd-205ENSMUST00000221895 4022 ntTSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Hoxa5P09021 Gm7049-201ENSMUST00000223520 1712 ntBASIC11.4□□□□□ -0.58
Hoxa5P09021 Hpn-201ENSMUST00000039435 1743 ntTSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Hoxa5P09021 Rbm48-201ENSMUST00000042753 2368 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Hoxa5P09021 Nrip2-201ENSMUST00000001561 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.59
Hoxa5P09021 C1qtnf1-202ENSMUST00000106286 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.59
Hoxa5P09021 C1qtnf1-201ENSMUST00000017590 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.59
Hoxa5P09021 Nek6-203ENSMUST00000112902 3147 ntTSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.59
Hoxa5P09021 Drc1-201ENSMUST00000101448 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.59
Hoxa5P09021 Gm5422-202ENSMUST00000216161 2928 ntTSL 5 BASIC11.39□□□□□ -0.59
Hoxa5P09021 Banp-201ENSMUST00000026354 1970 ntTSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Hoxa5P09021 Mfn2-203ENSMUST00000105715 4043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Hoxa5P09021 Rbfox2-202ENSMUST00000111581 3072 ntTSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Hoxa5P09021 Plk4-203ENSMUST00000203295 3363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Hoxa5P09021 Elovl6-202ENSMUST00000197070 2275 ntTSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Hoxa5P09021 Sbk1-201ENSMUST00000056028 4109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Hoxa5P09021 Med28-205ENSMUST00000156481 4560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Hoxa5P09021 Ptn-201ENSMUST00000101534 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Hoxa5P09021 Bap1-201ENSMUST00000022458 3460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Hoxa5P09021 Mfsd10-203ENSMUST00000114331 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Hoxa5P09021 Gpr153-203ENSMUST00000105651 3777 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.39□□□□□ -0.59
Hoxa5P09021 Gpr153-201ENSMUST00000055754 3757 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Hoxa5P09021 Trim80-201ENSMUST00000093914 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Hoxa5P09021 Gm3764-205ENSMUST00000181134 2203 ntTSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Hoxa5P09021 Tle3-204ENSMUST00000159386 4527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.39□□□□□ -0.59
Hoxa5P09021 E430024P14Rik-203ENSMUST00000160545 2833 ntTSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Hoxa5P09021 Egr1-201ENSMUST00000064795 4484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Hoxa5P09021 Rims1-201ENSMUST00000081544 5954 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.39□□□□□ -0.59
Hoxa5P09021 Olfr129-201ENSMUST00000122318 993 ntBASIC11.39□□□□□ -0.59
Hoxa5P09021 Gm15295-201ENSMUST00000139874 488 ntTSL 5 BASIC11.39□□□□□ -0.59
Hoxa5P09021 Psme2-208ENSMUST00000161807 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Hoxa5P09021 Fam181a-203ENSMUST00000191218 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.39□□□□□ -0.59
Hoxa5P09021 Gm9889-202ENSMUST00000206983 1577 ntBASIC11.39□□□□□ -0.59
Hoxa5P09021 Gm15823-201ENSMUST00000064305 670 ntBASIC11.39□□□□□ -0.59
Hoxa5P09021 C130026L21Rik-201ENSMUST00000064930 2472 ntTSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Hoxa5P09021 S100a16-202ENSMUST00000098911 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Hoxa5P09021 Tspyl3-201ENSMUST00000099194 3072 ntAPPRIS P1 BASIC11.39□□□□□ -0.59
Hoxa5P09021 Tnks1bp1-202ENSMUST00000111605 5747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Hoxa5P09021 Plcb3-201ENSMUST00000025912 4201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Hoxa5P09021 Tacr2-201ENSMUST00000020278 2258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Hoxa5P09021 Sipa1-201ENSMUST00000071857 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Hoxa5P09021 Cnbp-203ENSMUST00000113619 1661 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Hoxa5P09021 Tmem51os1-203ENSMUST00000150202 1667 ntTSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Hoxa5P09021 Gpank1-202ENSMUST00000165306 1518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Hoxa5P09021 Gm26675-201ENSMUST00000181068 1525 ntTSL 5 BASIC11.39□□□□□ -0.59
Hoxa5P09021 Syt1-202ENSMUST00000105276 4820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Hoxa5P09021 Zfp618-203ENSMUST00000107415 8826 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.39□□□□□ -0.59
Hoxa5P09021 Zhx2-201ENSMUST00000096430 4376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Hoxa5P09021 Muc6-202ENSMUST00000189314 5087 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Hoxa5P09021 Pphln1-203ENSMUST00000109256 3759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Hoxa5P09021 Smtnl1-201ENSMUST00000028471 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Hoxa5P09021 Kmt5b-205ENSMUST00000113972 4159 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.38□□□□□ -0.59
Hoxa5P09021 Hhipl2-202ENSMUST00000192527 2310 ntTSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Hoxa5P09021 Wdr45b-201ENSMUST00000026173 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Hoxa5P09021 Gnb2-203ENSMUST00000111023 1471 ntTSL 5 BASIC11.38□□□□□ -0.59
Hoxa5P09021 Rev3l-201ENSMUST00000019986 10713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Hoxa5P09021 2810468N07Rik-201ENSMUST00000163493 1349 ntTSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Hoxa5P09021 Hsd17b1-201ENSMUST00000019445 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Hoxa5P09021 Tkfc-201ENSMUST00000037678 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Hoxa5P09021 Efr3a-205ENSMUST00000173858 2848 ntTSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Hoxa5P09021 Olfr742-202ENSMUST00000213935 2117 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.38□□□□□ -0.59
Hoxa5P09021 Sirt5-203ENSMUST00000220576 1579 ntTSL 5 BASIC11.38□□□□□ -0.59
Hoxa5P09021 Pgap2-203ENSMUST00000120119 1979 ntTSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Hoxa5P09021 Pisd-202ENSMUST00000071829 1986 ntTSL 5 BASIC11.38□□□□□ -0.59
Hoxa5P09021 Dohh-201ENSMUST00000072751 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Hoxa5P09021 Hk1-202ENSMUST00000099691 4278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Hoxa5P09021 Pam-202ENSMUST00000097625 4102 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.38□□□□□ -0.59
Hoxa5P09021 Ppcdc-209ENSMUST00000214624 1814 ntTSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Hoxa5P09021 Tekt5-202ENSMUST00000115831 1277 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Hoxa5P09021 Gm16181-201ENSMUST00000118793 567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Hoxa5P09021 4930401G09Rik-201ENSMUST00000139500 637 ntTSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Hoxa5P09021 Aicda-202ENSMUST00000160685 1292 ntTSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Hoxa5P09021 A730015C16Rik-201ENSMUST00000164855 1221 ntAPPRIS P1 BASIC11.38□□□□□ -0.59
Hoxa5P09021 Vdac2-209ENSMUST00000173456 956 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.38□□□□□ -0.59
Hoxa5P09021 Lce1k-201ENSMUST00000179917 663 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.38□□□□□ -0.59
Hoxa5P09021 Gm26644-201ENSMUST00000181365 958 ntTSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Hoxa5P09021 Gm21362-201ENSMUST00000194272 928 ntBASIC11.38□□□□□ -0.59
Hoxa5P09021 Npcd-201ENSMUST00000023060 1162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Hoxa5P09021 Sipa1-202ENSMUST00000080824 3837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.1 ms