Protein–RNA interactions for Protein: P04212

T-cell receptor beta chain V region LB2, mousemouse

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Length 136 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P04212 Rhox13-201ENSMUST00000152730 876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
P04212 Caly-202ENSMUST00000166758 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
P04212 Zfp787-206ENSMUST00000208746 535 ntTSL 2 BASIC11.69□□□□□ -0.54
P04212 Ndufv3-202ENSMUST00000064798 485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
P04212 Rph3al-202ENSMUST00000066504 988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
P04212 Rpl34-ps2-201ENSMUST00000081679 354 ntBASIC11.69□□□□□ -0.54
P04212 Gm10154-201ENSMUST00000084445 354 ntBASIC11.69□□□□□ -0.54
P04212 Gm42471-201ENSMUST00000201457 1865 ntBASIC11.69□□□□□ -0.54
P04212 Zfp169-203ENSMUST00000176176 2162 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
P04212 Carmil3-201ENSMUST00000076236 4602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.69□□□□□ -0.54
P04212 Mfrp-202ENSMUST00000161381 4254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
P04212 Tmem237-201ENSMUST00000087475 1823 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
P04212 Acat3-201ENSMUST00000043923 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
P04212 Mark2-201ENSMUST00000025921 3018 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
P04212 St8sia3-201ENSMUST00000025477 6282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
P04212 Aifm3-202ENSMUST00000115685 2357 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
P04212 Tcf21-202ENSMUST00000218002 1788 ntBASIC11.69□□□□□ -0.54
P04212 AC126250.1-201ENSMUST00000228343 1768 ntBASIC11.69□□□□□ -0.54
P04212 Fam133b-201ENSMUST00000115527 1491 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
P04212 Grik4-202ENSMUST00000114865 5887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
P04212 Dnajc27-201ENSMUST00000020986 4698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
P04212 Abi3-201ENSMUST00000059026 4006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
P04212 Rsrp1-201ENSMUST00000078084 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
P04212 Btbd10-201ENSMUST00000047091 2581 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
P04212 Acat2-201ENSMUST00000007005 2250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
P04212 Gm8281-202ENSMUST00000163719 1954 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
P04212 Gm29530-201ENSMUST00000187556 1956 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
P04212 Adprhl1-201ENSMUST00000033825 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
P04212 Irak1-204ENSMUST00000114352 3825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
P04212 Gm11738-201ENSMUST00000134069 2158 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
P04212 Cblb-204ENSMUST00000227062 3728 ntAPPRIS P2 BASIC11.68□□□□□ -0.54
P04212 9330020H09Rik-201ENSMUST00000163781 2147 ntTSL 2 BASIC11.68□□□□□ -0.54
P04212 Cald1-201ENSMUST00000031775 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
P04212 Slc2a6-201ENSMUST00000045702 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
P04212 Ccdc157-201ENSMUST00000093381 5015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
P04212 Heg1-205ENSMUST00000152782 8161 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
P04212 Gm13387-202ENSMUST00000131147 2646 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
P04212 Gpx3-201ENSMUST00000082430 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
P04212 Sh2b3-202ENSMUST00000086310 4195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
P04212 Gm4081-201ENSMUST00000195287 1838 ntBASIC11.68□□□□□ -0.54
P04212 Opn5-201ENSMUST00000068355 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
P04212 Col1a1-201ENSMUST00000001547 5930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
P04212 Plekha1-201ENSMUST00000048180 3321 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
P04212 Ubqln2-201ENSMUST00000060714 3344 ntAPPRIS P1 BASIC11.68□□□□□ -0.54
P04212 Yif1b-203ENSMUST00000108238 1126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
P04212 Mtif3-203ENSMUST00000110564 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
P04212 Mtif3-204ENSMUST00000110566 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
P04212 Rpl36-ps8-201ENSMUST00000121187 315 ntBASIC11.68□□□□□ -0.54
P04212 Gm13375-201ENSMUST00000126967 854 ntTSL 2 BASIC11.68□□□□□ -0.54
P04212 Ptpa-208ENSMUST00000131476 989 ntTSL 2 BASIC11.68□□□□□ -0.54
P04212 Gm26769-201ENSMUST00000180469 619 ntTSL 3 BASIC11.68□□□□□ -0.54
P04212 Mir7036b-201ENSMUST00000184791 63 ntBASIC11.68□□□□□ -0.54
P04212 Gm2651-201ENSMUST00000203560 838 ntBASIC11.68□□□□□ -0.54
P04212 Gm16845-202ENSMUST00000216270 567 ntTSL 2 BASIC11.68□□□□□ -0.54
P04212 AC138767.1-201ENSMUST00000222661 415 ntBASIC11.68□□□□□ -0.54
P04212 Zfyve21-206ENSMUST00000222843 705 ntTSL 3 BASIC11.68□□□□□ -0.54
P04212 1700037H04Rik-201ENSMUST00000028800 832 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
P04212 Rab33a-201ENSMUST00000033430 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
P04212 Klk15-201ENSMUST00000068625 845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
P04212 Rnf7-202ENSMUST00000071301 334 ntTSL 2 BASIC11.68□□□□□ -0.54
P04212 Gli1-201ENSMUST00000026474 4057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
P04212 Slfnl1-201ENSMUST00000062990 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
P04212 Aldh1a2-201ENSMUST00000034723 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
P04212 Wnt3a-201ENSMUST00000010044 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
P04212 Lipo3-201ENSMUST00000025694 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
P04212 Pigg-202ENSMUST00000118910 3030 ntTSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
P04212 Commd7-201ENSMUST00000071852 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
P04212 Cct6a-202ENSMUST00000201414 2454 ntTSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
P04212 Gm12500-202ENSMUST00000186471 2428 ntBASIC11.68□□□□□ -0.54
P04212 Pglyrp2-201ENSMUST00000114455 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
P04212 Ada-201ENSMUST00000017841 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
P04212 Kcnk13-202ENSMUST00000160413 3061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
P04212 Pde4a-202ENSMUST00000039413 4653 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
P04212 Fbrs-202ENSMUST00000205432 4166 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
P04212 Rcbtb1-202ENSMUST00000043227 3903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
P04212 Adam22-203ENSMUST00000088744 9245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
P04212 Map2k6-201ENSMUST00000020949 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
P04212 Timp4-201ENSMUST00000032462 5496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
P04212 Tbrg4-201ENSMUST00000000394 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
P04212 Trim32-201ENSMUST00000050850 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
P04212 Hspa8-202ENSMUST00000117557 2019 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
P04212 Taz-202ENSMUST00000114180 1786 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
P04212 Hspa4-201ENSMUST00000020630 4618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
P04212 Ttc7-201ENSMUST00000041110 4614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
P04212 Oser1-202ENSMUST00000104954 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
P04212 Ube3b-201ENSMUST00000074002 5194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
P04212 Tdrd6-203ENSMUST00000168073 7062 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
P04212 Myl12a-206ENSMUST00000148960 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
P04212 Nme1-202ENSMUST00000107844 452 ntTSL 3 BASIC11.67□□□□□ -0.54
P04212 Nudt1-204ENSMUST00000110826 606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
P04212 Meig1-203ENSMUST00000115082 603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
P04212 Mras-202ENSMUST00000119472 1190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
P04212 Gm16838-201ENSMUST00000144594 816 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
P04212 2310061I04Rik-204ENSMUST00000148721 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
P04212 Slc36a3os-201ENSMUST00000155883 520 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
P04212 Gm16026-204ENSMUST00000162652 683 ntBASIC11.67□□□□□ -0.54
P04212 Hsf4-203ENSMUST00000172525 1276 ntTSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
P04212 Gm26661-201ENSMUST00000181025 471 ntAPPRIS P1 BASIC11.67□□□□□ -0.54
P04212 Gm4691-201ENSMUST00000182339 1000 ntBASIC11.67□□□□□ -0.54
P04212 Gm6944-201ENSMUST00000182449 1006 ntBASIC11.67□□□□□ -0.54
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 46.5 ms