Protein–RNA interactions for Protein: P01811

Ig heavy chain V region UPC10, mousemouse

Predictions only

Length 117 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P01811 Dcakd-201ENSMUST00000021313 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
P01811 Irgc1-201ENSMUST00000080594 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
P01811 Mtus2-204ENSMUST00000110514 1532 ntTSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
P01811 1500011B03Rik-202ENSMUST00000112160 1333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
P01811 Gm5069-201ENSMUST00000050581 1328 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
P01811 Adrb3-203ENSMUST00000121838 1864 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
P01811 Cdhr5-202ENSMUST00000167263 2628 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
P01811 Nrxn1-201ENSMUST00000054059 4697 ntTSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
P01811 Trim3-205ENSMUST00000147044 2972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
P01811 Tcp11l1-201ENSMUST00000028597 3512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
P01811 Tc2n-203ENSMUST00000160830 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
P01811 Trappc6a-202ENSMUST00000108455 651 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
P01811 Gm15427-201ENSMUST00000117288 531 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
P01811 Rpl18-ps1-201ENSMUST00000121555 525 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
P01811 Rpl34-ps1-201ENSMUST00000121998 354 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
P01811 1810062O18Rik-203ENSMUST00000129237 647 ntTSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
P01811 Fam241b-208ENSMUST00000142796 1135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
P01811 1190007I07Rik-202ENSMUST00000176200 586 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.64□□□□□ -0.71
P01811 Ccer2-201ENSMUST00000178767 1054 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
P01811 Gm26769-201ENSMUST00000180469 619 ntTSL 3 BASIC10.64□□□□□ -0.71
P01811 1190007I07Rik-203ENSMUST00000183363 406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
P01811 Gm29456-201ENSMUST00000189894 768 ntTSL 3 BASIC10.64□□□□□ -0.71
P01811 Selenov-201ENSMUST00000056589 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
P01811 Klk15-201ENSMUST00000068625 845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
P01811 Gm15500-202ENSMUST00000071641 1019 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
P01811 1190007I07Rik-201ENSMUST00000079648 716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
P01811 Rpl34-ps2-201ENSMUST00000081679 354 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
P01811 Gm10154-201ENSMUST00000084445 354 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
P01811 Tfe3-201ENSMUST00000077680 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
P01811 Gm16565-201ENSMUST00000159138 2181 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
P01811 Acot6-202ENSMUST00000222921 3622 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
P01811 Cnnm2-202ENSMUST00000099373 3558 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
P01811 Lrrc8d-201ENSMUST00000060531 3923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
P01811 AC025913.2-201ENSMUST00000220136 1766 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
P01811 Zfp276-201ENSMUST00000001092 4071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
P01811 Fgfr1-202ENSMUST00000117179 4046 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
P01811 Fbxl12-205ENSMUST00000140702 1555 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
P01811 Srgn-204ENSMUST00000160987 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.64□□□□□ -0.71
P01811 Safb2-201ENSMUST00000075510 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
P01811 Plxnb2-202ENSMUST00000109331 6377 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
P01811 Prkcb-202ENSMUST00000064989 2911 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
P01811 Nr1i3-203ENSMUST00000111328 1359 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
P01811 Cd72-202ENSMUST00000098104 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
P01811 Armc8-201ENSMUST00000035043 4647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
P01811 Nyap1-201ENSMUST00000061789 3912 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
P01811 Pex12-202ENSMUST00000108146 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
P01811 Foxi1-201ENSMUST00000060271 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
P01811 Gjb1-202ENSMUST00000119080 1513 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.63□□□□□ -0.71
P01811 Gm26675-201ENSMUST00000181068 1525 ntTSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
P01811 Rnaseh2a-203ENSMUST00000109738 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
P01811 3110082I17Rik-204ENSMUST00000198474 2030 ntTSL 2 BASIC10.63□□□□□ -0.71
P01811 AC164107.1-201ENSMUST00000227730 2161 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
P01811 Clec2h-201ENSMUST00000032518 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
P01811 Nop9-201ENSMUST00000019441 3694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
P01811 Irs3-201ENSMUST00000057314 2337 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
P01811 Tmem237-201ENSMUST00000087475 1823 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
P01811 Elp6-205ENSMUST00000199592 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
P01811 Jph3-201ENSMUST00000026357 3637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
P01811 Suv39h1-203ENSMUST00000115638 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
P01811 Fktn-204ENSMUST00000221657 6241 ntTSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
P01811 Slc38a10-204ENSMUST00000103018 4578 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
P01811 Cpne1-202ENSMUST00000109607 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
P01811 Chtf18-201ENSMUST00000048054 3214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
P01811 Rps3-201ENSMUST00000032998 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
P01811 Plcb2-202ENSMUST00000102524 5145 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC10.63□□□□□ -0.71
P01811 Foxj2-202ENSMUST00000177927 4620 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
P01811 Mir1895-201ENSMUST00000122615 79 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
P01811 Gm5914-202ENSMUST00000182863 375 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
P01811 Thap4-205ENSMUST00000189728 713 ntTSL 2 BASIC10.63□□□□□ -0.71
P01811 Gm44123-201ENSMUST00000204662 577 ntTSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
P01811 Hapln3-202ENSMUST00000205782 930 ntTSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
P01811 Msrb2-201ENSMUST00000023856 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
P01811 Emg1-201ENSMUST00000004379 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
P01811 Lce3b-201ENSMUST00000046234 562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
P01811 Timm10b-201ENSMUST00000058333 694 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
P01811 Olfr370-201ENSMUST00000058609 1096 ntAPPRIS P1 BASIC10.63□□□□□ -0.71
P01811 G0s2-201ENSMUST00000009777 871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
P01811 Pard6a-202ENSMUST00000098444 1273 ntTSL 2 BASIC10.63□□□□□ -0.71
P01811 Gm2109-201ENSMUST00000189326 1409 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
P01811 Strap-201ENSMUST00000064910 2650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
P01811 Fgfr1-201ENSMUST00000084027 5025 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
P01811 Lpcat2-201ENSMUST00000046290 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
P01811 Cxcr5-201ENSMUST00000062215 2614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
P01811 Gm12689-201ENSMUST00000094955 1359 ntAPPRIS P1 BASIC10.63□□□□□ -0.71
P01811 Entpd5-204ENSMUST00000117286 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
P01811 Endou-202ENSMUST00000100249 2405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
P01811 Endou-201ENSMUST00000023105 2404 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
P01811 Efs-201ENSMUST00000022813 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
P01811 Gpr45-203ENSMUST00000179766 3776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
P01811 Shisa3-201ENSMUST00000087241 3760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
P01811 Atp2a3-204ENSMUST00000108486 4540 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
P01811 Mlxip-201ENSMUST00000068237 7303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
P01811 Slc20a2-201ENSMUST00000067786 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
P01811 Large2-214ENSMUST00000176774 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
P01811 Smg9-201ENSMUST00000002280 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
P01811 Ddx39-202ENSMUST00000109810 1794 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
P01811 Inha-201ENSMUST00000037330 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
P01811 Grin2c-201ENSMUST00000003351 4279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
P01811 Ralyl-206ENSMUST00000193117 2933 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.62□□□□□ -0.71
P01811 Exoc3l-201ENSMUST00000057855 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
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