Protein–RNA interactions for Protein: P01790

Ig heavy chain V region M511, mousemouse

Predictions only

Length 122 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P01790 Nfkbia-201ENSMUST00000021413 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
P01790 Chd4-203ENSMUST00000112392 6652 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.37□□□□□ -0.59
P01790 Ell-201ENSMUST00000093454 3072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
P01790 Cog3-201ENSMUST00000049168 4222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
P01790 Gm42769-201ENSMUST00000198576 1659 ntBASIC11.36□□□□□ -0.59
P01790 Metap2-206ENSMUST00000180840 2551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
P01790 Syngap1-202ENSMUST00000177932 3927 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.36□□□□□ -0.59
P01790 Spsb1-203ENSMUST00000105685 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
P01790 G3bp2-203ENSMUST00000167918 4232 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
P01790 Eif4e3-201ENSMUST00000032151 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
P01790 Lrrc56-202ENSMUST00000070458 2502 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
P01790 Cnga3-203ENSMUST00000194195 2083 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.36□□□□□ -0.59
P01790 Il11ra2-201ENSMUST00000108006 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
P01790 Zglp1-201ENSMUST00000115494 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
P01790 Znhit1-206ENSMUST00000156963 1208 ntTSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
P01790 Tmem178b-203ENSMUST00000180886 712 ntTSL 5 BASIC11.36□□□□□ -0.59
P01790 Ankrd23-204ENSMUST00000194853 1073 ntTSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
P01790 Gm38973-201ENSMUST00000206810 878 ntTSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
P01790 Ndufs8-201ENSMUST00000075092 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
P01790 Spr-ps1-201ENSMUST00000089584 605 ntBASIC11.36□□□□□ -0.59
P01790 Tmem163-205ENSMUST00000185560 3488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
P01790 Gm28111-201ENSMUST00000187786 1393 ntTSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
P01790 Elk3-201ENSMUST00000008542 4212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
P01790 Tmem59l-201ENSMUST00000045286 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
P01790 Arhgef40-201ENSMUST00000093813 5621 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
P01790 Ero1lb-202ENSMUST00000220811 3341 ntTSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
P01790 Klhl12-201ENSMUST00000027725 3408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
P01790 Myo1d-201ENSMUST00000041065 5354 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.36□□□□□ -0.59
P01790 Cyp20a1-201ENSMUST00000060608 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
P01790 Gak-201ENSMUST00000046603 4453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
P01790 Gnas-204ENSMUST00000087877 3947 ntTSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
P01790 Fam20a-201ENSMUST00000020938 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
P01790 Zfp202-201ENSMUST00000026693 3461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
P01790 Kcnc4-201ENSMUST00000009617 3667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
P01790 4930528D03Rik-201ENSMUST00000181528 1339 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
P01790 Colgalt1-201ENSMUST00000047903 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
P01790 Rfesd-203ENSMUST00000179078 1436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
P01790 Etfdh-201ENSMUST00000029386 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
P01790 Etv3-202ENSMUST00000119109 5309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
P01790 Fbxl19-202ENSMUST00000186116 3641 ntTSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
P01790 Kctd20-203ENSMUST00000118762 3839 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
P01790 Zfp707-202ENSMUST00000109967 1703 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
P01790 Neu2-203ENSMUST00000164128 1733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
P01790 Otub1-201ENSMUST00000025679 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
P01790 Rarg-201ENSMUST00000043172 2953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
P01790 Rpa2-201ENSMUST00000102561 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
P01790 Mmp2-201ENSMUST00000034187 3078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
P01790 Col3a1-201ENSMUST00000087883 5564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
P01790 Il17rd-203ENSMUST00000225146 3366 ntBASIC11.35□□□□□ -0.59
P01790 Gnao1-203ENSMUST00000125716 3462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
P01790 Slc41a3-201ENSMUST00000032177 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
P01790 Add3-202ENSMUST00000050096 4488 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
P01790 Xrra1-201ENSMUST00000036155 2731 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
P01790 Abtb2-201ENSMUST00000076212 4558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
P01790 Camkk2-201ENSMUST00000111668 4861 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
P01790 D330025C20Rik-201ENSMUST00000191632 3046 ntBASIC11.35□□□□□ -0.59
P01790 Grtp1-206ENSMUST00000210317 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
P01790 Sfswap-201ENSMUST00000053737 3313 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
P01790 Gm11764-201ENSMUST00000120221 623 ntBASIC11.35□□□□□ -0.59
P01790 Tmem141-205ENSMUST00000142087 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
P01790 Platr15-201ENSMUST00000147128 768 ntTSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
P01790 Cystm1-205ENSMUST00000152804 445 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC11.35□□□□□ -0.59
P01790 Ubl5-204ENSMUST00000160682 489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
P01790 Ly6g6e-204ENSMUST00000172959 501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
P01790 Gm4691-201ENSMUST00000182339 1000 ntBASIC11.35□□□□□ -0.59
P01790 Ank2-226ENSMUST00000189368 339 ntBASIC11.35□□□□□ -0.59
P01790 Gm2451-201ENSMUST00000199447 999 ntBASIC11.35□□□□□ -0.59
P01790 Gm43347-201ENSMUST00000200226 580 ntBASIC11.35□□□□□ -0.59
P01790 9230114J08Rik-201ENSMUST00000200375 350 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
P01790 Gm10290-201ENSMUST00000200451 999 ntBASIC11.35□□□□□ -0.59
P01790 Olfr286-202ENSMUST00000205305 969 ntBASIC11.35□□□□□ -0.59
P01790 Gm6376-201ENSMUST00000209407 580 ntBASIC11.35□□□□□ -0.59
P01790 AC158538.1-201ENSMUST00000225870 294 ntBASIC11.35□□□□□ -0.59
P01790 Sod1-201ENSMUST00000023707 646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
P01790 Neurl2-201ENSMUST00000042775 1014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
P01790 Cmtm8-201ENSMUST00000047013 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
P01790 Dnmt3b-204ENSMUST00000088976 4130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
P01790 Ccdc85a-201ENSMUST00000042534 5332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
P01790 B230217C12Rik-203ENSMUST00000164364 1859 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
P01790 Gm42872-201ENSMUST00000200026 1967 ntBASIC11.35□□□□□ -0.59
P01790 Gpr108-201ENSMUST00000005975 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
P01790 Aff2-201ENSMUST00000033532 4523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
P01790 Lhx1-201ENSMUST00000018842 3846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
P01790 Rasd2-202ENSMUST00000139848 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
P01790 Prkx-202ENSMUST00000114044 2639 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
P01790 Ift52-201ENSMUST00000018002 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
P01790 Gps1-201ENSMUST00000100134 1925 ntTSL 2 BASIC11.35□□□□□ -0.59
P01790 Zfp109-201ENSMUST00000037448 1935 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
P01790 Taf7l-201ENSMUST00000009740 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
P01790 Gins4-201ENSMUST00000033950 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
P01790 Tex13a-201ENSMUST00000096314 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
P01790 Gtf2ird1-201ENSMUST00000073161 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
P01790 Phka1-201ENSMUST00000043596 5938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
P01790 Gm43364-201ENSMUST00000196046 3274 ntBASIC11.34□□□□□ -0.59
P01790 Cadps2-209ENSMUST00000142913 4533 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
P01790 Ak1-202ENSMUST00000113277 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
P01790 Sytl1-201ENSMUST00000030674 1951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
P01790 Zmym3-208ENSMUST00000121429 1890 ntTSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
P01790 Phgdh-201ENSMUST00000065793 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
P01790 Ptprs-202ENSMUST00000086828 5608 ntTSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38 ms