Protein–RNA interactions for Protein: P01649

Ig kappa chain V-V regions, mousemouse

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Length 108 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P01649 Ctdp1-201ENSMUST00000036229 3713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
P01649 Lrch4-202ENSMUST00000175968 2036 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.01□□□□□ -0.49
P01649 Chdh-201ENSMUST00000067620 5690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
P01649 9130017K11Rik-202ENSMUST00000135670 3338 ntTSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
P01649 Gm37019-201ENSMUST00000192133 2134 ntBASIC12.01□□□□□ -0.49
P01649 Rbbp9-201ENSMUST00000028915 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
P01649 Tsc22d2-201ENSMUST00000099090 9799 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC12.01□□□□□ -0.49
P01649 Prrxl1-203ENSMUST00000187377 1629 ntTSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
P01649 Rad52-201ENSMUST00000032269 1617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
P01649 Tssk4-202ENSMUST00000164809 1686 ntTSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
P01649 Mis12-201ENSMUST00000048807 3003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
P01649 Six4-201ENSMUST00000043208 6402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
P01649 Rspry1-202ENSMUST00000121101 3092 ntTSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
P01649 Ccnj-202ENSMUST00000119316 3763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12□□□□□ -0.49
P01649 Itm2b-201ENSMUST00000022704 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
P01649 Gm10676-201ENSMUST00000098778 3221 ntBASIC12□□□□□ -0.49
P01649 Ap1g1-202ENSMUST00000093157 6899 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12□□□□□ -0.49
P01649 Ifngr2-201ENSMUST00000023687 3254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
P01649 Dnajc28-201ENSMUST00000049244 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
P01649 Mrps35-201ENSMUST00000036111 4162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
P01649 Ube2j1-202ENSMUST00000124992 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
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P01649 Dusp14-203ENSMUST00000108101 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
P01649 Ppdpf-202ENSMUST00000108841 689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
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P01649 H2-Bl-209ENSMUST00000194244 862 ntTSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
P01649 AC121804.3-201ENSMUST00000223420 295 ntBASIC12□□□□□ -0.49
P01649 Tex13b-201ENSMUST00000044179 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
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P01649 Lurap1l-201ENSMUST00000055922 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
P01649 Fbxo30-202ENSMUST00000129456 5060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
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P01649 Hcfc2-201ENSMUST00000020478 3422 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12□□□□□ -0.49
P01649 Slc43a1-203ENSMUST00000111625 2487 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
P01649 Gm5320-201ENSMUST00000207163 1519 ntBASIC12□□□□□ -0.49
P01649 Tspan31-201ENSMUST00000060991 1556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
P01649 Slc8b1-201ENSMUST00000068326 2898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
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P01649 Gpr108-201ENSMUST00000005975 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
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P01649 Cry2-202ENSMUST00000111278 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
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P01649 Washc1-201ENSMUST00000072383 2904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
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P01649 Pdzd4-202ENSMUST00000114438 3625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
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P01649 Nfyb-204ENSMUST00000130911 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
P01649 Ggn-202ENSMUST00000098609 2653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
P01649 Syn2-201ENSMUST00000009538 2708 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
P01649 Gm39027-201ENSMUST00000208560 2942 ntTSL 5 BASIC11.99□□□□□ -0.49
P01649 Per3-201ENSMUST00000103204 5999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
P01649 Notch3-201ENSMUST00000087723 8044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
P01649 Prkab2-201ENSMUST00000045743 5006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
P01649 Gng2-204ENSMUST00000160013 3826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
P01649 Cnot11-203ENSMUST00000161515 3482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
P01649 Otud6b-201ENSMUST00000117268 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
P01649 Sox17-201ENSMUST00000027035 3127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
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