Protein–RNA interactions for Protein: P01648

Ig kappa chain V-V region HP 91A3, mousemouse

Predictions only

Length 108 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P01648 Ankrd50-201ENSMUST00000094300 1944 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
P01648 Foxp4-201ENSMUST00000097311 3197 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
P01648 Ets1-201ENSMUST00000034534 5080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
P01648 Gm26702-201ENSMUST00000181730 4570 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
P01648 Sema6c-213ENSMUST00000168321 3553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
P01648 Spo11-202ENSMUST00000109125 1591 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
P01648 Brap-201ENSMUST00000031414 3744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
P01648 Tgfb2-201ENSMUST00000045288 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
P01648 Cstf2-201ENSMUST00000033609 4502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
P01648 Abhd14b-201ENSMUST00000048527 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
P01648 Cbfa2t3-202ENSMUST00000064674 2867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
P01648 Knop1-203ENSMUST00000106549 1467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
P01648 Tnfaip8l1-201ENSMUST00000077788 2379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
P01648 Ptprs-201ENSMUST00000067538 6855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
P01648 Cfap99-201ENSMUST00000207754 2123 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
P01648 Mms22l-202ENSMUST00000108222 4478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
P01648 Cep295nl-202ENSMUST00000168100 1602 ntAPPRIS P1 BASIC14.63□□□□□ -0.07
P01648 Pitpnm2-210ENSMUST00000162812 6952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
P01648 Qsox1-207ENSMUST00000194632 2433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
P01648 Lgr6-202ENSMUST00000137968 2820 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
P01648 Prpf31-202ENSMUST00000108636 1798 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
P01648 Whrn-203ENSMUST00000084510 4049 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
P01648 Kri1-201ENSMUST00000038671 2598 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
P01648 Jag1-201ENSMUST00000028735 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
P01648 Xpo6-213ENSMUST00000168189 4552 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
P01648 Lsr-202ENSMUST00000098553 1930 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
P01648 Dlg4-204ENSMUST00000108589 3271 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
P01648 Zscan22-203ENSMUST00000119989 2087 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
P01648 Gm29676-201ENSMUST00000222396 1689 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
P01648 Selenoh-202ENSMUST00000102647 654 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
P01648 Gm13689-201ENSMUST00000119360 685 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
P01648 Gm12416-201ENSMUST00000120911 1008 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
P01648 Gm27486-201ENSMUST00000184923 80 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
P01648 AC131690.1-201ENSMUST00000218406 374 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
P01648 Cby3-201ENSMUST00000052596 703 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
P01648 Lyzl4-201ENSMUST00000077706 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
P01648 Gnb5-202ENSMUST00000213990 1803 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
P01648 Nploc4-201ENSMUST00000044271 4121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
P01648 Gli1-201ENSMUST00000026474 4057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
P01648 Gm8775-201ENSMUST00000170943 1327 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
P01648 Opn4-201ENSMUST00000022331 2156 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
P01648 Slc30a10-201ENSMUST00000061093 5836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
P01648 AC131068.2-201ENSMUST00000226175 1453 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
P01648 Amdhd2-201ENSMUST00000040735 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
P01648 Fgf11-202ENSMUST00000102585 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
P01648 Tdrp-201ENSMUST00000062613 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
P01648 Nt5c2-202ENSMUST00000168536 3769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
P01648 Cyfip2-205ENSMUST00000165599 6659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
P01648 Kdm2a-202ENSMUST00000075856 7242 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
P01648 Prss45-201ENSMUST00000011391 1232 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
P01648 Opn1sw-203ENSMUST00000147483 1426 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
P01648 Rsf1os2-203ENSMUST00000155074 998 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
P01648 Gm3764-203ENSMUST00000180635 1191 ntTSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
P01648 Gm42906-201ENSMUST00000202365 408 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
P01648 Gm7561-201ENSMUST00000211203 886 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
P01648 Gm33460-201ENSMUST00000212286 536 ntTSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
P01648 9130008F23Rik-201ENSMUST00000068258 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
P01648 Ddx20-201ENSMUST00000090680 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
P01648 Repin1-202ENSMUST00000118229 3138 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
P01648 Pcsk4-201ENSMUST00000020340 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
P01648 Rnf169-201ENSMUST00000080817 7147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
P01648 Tmem56-203ENSMUST00000128909 6696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
P01648 Phf23-209ENSMUST00000153684 1797 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
P01648 Car6-202ENSMUST00000105683 1460 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
P01648 Ppm1d-201ENSMUST00000020835 2899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
P01648 Fam126a-201ENSMUST00000030849 5659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
P01648 Ppp1r37-201ENSMUST00000058444 3816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
P01648 Sgms1-201ENSMUST00000099514 3665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
P01648 Shisa7-201ENSMUST00000066041 6006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
P01648 Atp8b2-202ENSMUST00000107396 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
P01648 9930104L06Rik-201ENSMUST00000094769 2911 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
P01648 Celf4-203ENSMUST00000223704 2492 ntAPPRIS ALT1 BASIC14.61□□□□□ -0.07
P01648 Ckmt1-202ENSMUST00000078222 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
P01648 Mllt1-201ENSMUST00000025053 3608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
P01648 Fbxl16-201ENSMUST00000045692 3478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
P01648 Arhgef10l-203ENSMUST00000097820 4382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
P01648 Htr7-202ENSMUST00000164639 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
P01648 Smad1-203ENSMUST00000109885 3775 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
P01648 Ttc13-203ENSMUST00000118134 3277 ntTSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
P01648 Pdia3-201ENSMUST00000028683 2770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
P01648 Chst2-201ENSMUST00000036267 7328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
P01648 Pkn1-201ENSMUST00000005616 6662 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
P01648 Gm16342-201ENSMUST00000124025 1025 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
P01648 Gm16122-201ENSMUST00000142625 1158 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
P01648 Mir1938-201ENSMUST00000158746 100 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
P01648 Gm8835-201ENSMUST00000173096 1169 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
P01648 Vhl-ps1-201ENSMUST00000174813 597 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
P01648 Gm37047-201ENSMUST00000191992 533 ntTSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
P01648 Sox2ot-216ENSMUST00000200092 767 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
P01648 Chst4-202ENSMUST00000211894 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
P01648 Gm6983-201ENSMUST00000214912 628 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
P01648 AC166349.1-201ENSMUST00000220866 695 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
P01648 Camkmt-201ENSMUST00000095188 972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
P01648 Tcf24-202ENSMUST00000185184 4193 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
P01648 Pde4d-203ENSMUST00000117420 1955 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
P01648 R3hcc1-202ENSMUST00000121142 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
P01648 Hsd17b4-201ENSMUST00000025385 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
P01648 Bbs5-201ENSMUST00000074963 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
P01648 Mark2-209ENSMUST00000165965 2874 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
P01648 Mief1-202ENSMUST00000166030 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 60.4 ms