Protein–RNA interactions for Protein: P01575

Ifnb1, Interferon beta, mousemouse

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Length 182 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ifnb1P01575 Erp29-203ENSMUST00000130451 5204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ifnb1P01575 Pde8a-201ENSMUST00000026672 3802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ifnb1P01575 Mfn2-202ENSMUST00000105714 2427 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ifnb1P01575 A930033H14Rik-201ENSMUST00000170048 2969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ifnb1P01575 Lysmd3-202ENSMUST00000224300 4250 ntAPPRIS P1 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ifnb1P01575 Arl11-201ENSMUST00000055159 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ifnb1P01575 Leng9-201ENSMUST00000058358 2460 ntAPPRIS P1 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ifnb1P01575 Apol8-202ENSMUST00000089450 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ifnb1P01575 Cd164l2-201ENSMUST00000105910 986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ifnb1P01575 2410006H16Rik-201ENSMUST00000131787 462 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ifnb1P01575 Gm11899-201ENSMUST00000142373 745 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ifnb1P01575 Gm11682-201ENSMUST00000144689 516 ntTSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ifnb1P01575 Gm10275-202ENSMUST00000168697 495 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Ifnb1P01575 Gm27525-201ENSMUST00000184465 107 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Ifnb1P01575 Gm45612-201ENSMUST00000211320 160 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Ifnb1P01575 Cidea-201ENSMUST00000025404 1164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ifnb1P01575 Gm10073-201ENSMUST00000073722 496 ntAPPRIS P1 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ifnb1P01575 Rplp1-201ENSMUST00000008036 499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ifnb1P01575 Gm10275-201ENSMUST00000092620 635 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Ifnb1P01575 G430095P16Rik-201ENSMUST00000098571 721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ifnb1P01575 Lce3e-201ENSMUST00000098886 607 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ifnb1P01575 Dnm1-205ENSMUST00000113365 3257 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ifnb1P01575 Col2a1-202ENSMUST00000088355 4862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ifnb1P01575 Fubp1-206ENSMUST00000196739 2526 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ifnb1P01575 Epsti1-201ENSMUST00000022591 1870 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ifnb1P01575 Hp1bp3-202ENSMUST00000097836 3113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ifnb1P01575 Gapdh-203ENSMUST00000118875 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ifnb1P01575 Loxl1-201ENSMUST00000061799 3297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ifnb1P01575 Repin1-204ENSMUST00000135151 3057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ifnb1P01575 Hcrtr1-201ENSMUST00000030562 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ifnb1P01575 Rgs3-201ENSMUST00000065870 4698 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ifnb1P01575 Ak1-203ENSMUST00000113278 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ifnb1P01575 Kdm2b-201ENSMUST00000031435 3532 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ifnb1P01575 Prkcsh-205ENSMUST00000216344 2228 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ifnb1P01575 Rest-202ENSMUST00000113449 6924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ifnb1P01575 Fbxo46-202ENSMUST00000165913 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ifnb1P01575 Camk2b-208ENSMUST00000109812 1875 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ifnb1P01575 Syngr1-201ENSMUST00000009727 4180 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ifnb1P01575 Scube1-205ENSMUST00000171496 7824 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ifnb1P01575 Rhox7b-201ENSMUST00000115156 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ifnb1P01575 Uqcc2-203ENSMUST00000119227 452 ntTSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ifnb1P01575 Qdpr-204ENSMUST00000120867 1234 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ifnb1P01575 Gm12017-201ENSMUST00000122453 1003 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Ifnb1P01575 Klrg2-202ENSMUST00000201345 1225 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ifnb1P01575 AC121788.1-202ENSMUST00000218801 871 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ifnb1P01575 Olfr324-201ENSMUST00000054683 1122 ntAPPRIS P2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ifnb1P01575 Hist1h2bn-201ENSMUST00000091709 381 ntAPPRIS P1 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ifnb1P01575 1700086L19Rik-201ENSMUST00000095617 706 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Ifnb1P01575 Rhox7a-201ENSMUST00000096454 983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ifnb1P01575 Commd7-201ENSMUST00000071852 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ifnb1P01575 Cdca5-201ENSMUST00000025704 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ifnb1P01575 Kpna6-201ENSMUST00000003828 2195 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ifnb1P01575 Itgb1-201ENSMUST00000090006 3815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ifnb1P01575 Slc39a14-201ENSMUST00000022688 2098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ifnb1P01575 Tmem204-201ENSMUST00000024984 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ifnb1P01575 Lzts1-201ENSMUST00000037049 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ifnb1P01575 Pltp-201ENSMUST00000059954 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ifnb1P01575 Tle3-201ENSMUST00000034820 4646 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ifnb1P01575 Fam71a-201ENSMUST00000171798 2234 ntAPPRIS P1 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ifnb1P01575 Pim1-201ENSMUST00000024811 2638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ifnb1P01575 Epha1-201ENSMUST00000073387 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ifnb1P01575 Gm26847-201ENSMUST00000180407 2109 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ifnb1P01575 Rrp1b-201ENSMUST00000081339 4874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ifnb1P01575 Avpr1a-201ENSMUST00000020323 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ifnb1P01575 Ak1-201ENSMUST00000068271 2034 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ifnb1P01575 Coq6-203ENSMUST00000110278 1354 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ifnb1P01575 Capg-203ENSMUST00000114072 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ifnb1P01575 Mfsd6-201ENSMUST00000087701 3493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ifnb1P01575 Nrn1-204ENSMUST00000224323 1779 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Ifnb1P01575 Parg-202ENSMUST00000163350 3374 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ifnb1P01575 Gm28182-201ENSMUST00000188354 2477 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Ifnb1P01575 Rabepk-202ENSMUST00000113086 1106 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ifnb1P01575 Rerg-203ENSMUST00000119610 890 ntTSL 3 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ifnb1P01575 2810408I11Rik-202ENSMUST00000150749 711 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ifnb1P01575 Gm5264-201ENSMUST00000190584 848 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Ifnb1P01575 Trip6-203ENSMUST00000199121 366 ntTSL 3 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ifnb1P01575 Mt3-201ENSMUST00000034211 536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ifnb1P01575 Atad3aos-201ENSMUST00000067628 971 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ifnb1P01575 Traf2-201ENSMUST00000028311 3044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ifnb1P01575 Vamp2-201ENSMUST00000021273 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ifnb1P01575 Ptk2-202ENSMUST00000170939 3598 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ifnb1P01575 Tpm1-202ENSMUST00000034928 1824 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ifnb1P01575 Gm26546-201ENSMUST00000181000 4276 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ifnb1P01575 Ociad2-205ENSMUST00000201908 2378 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ifnb1P01575 Mto1-201ENSMUST00000034896 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ifnb1P01575 Pnkd-201ENSMUST00000027370 2937 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ifnb1P01575 R3hcc1-202ENSMUST00000121142 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ifnb1P01575 Ank3-223ENSMUST00000182557 1569 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ifnb1P01575 Adam23-205ENSMUST00000114107 6110 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ifnb1P01575 Ydjc-202ENSMUST00000115702 1713 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ifnb1P01575 Runx2-213ENSMUST00000162878 2987 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ifnb1P01575 Mib1-201ENSMUST00000052838 10231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ifnb1P01575 Cflar-204ENSMUST00000114309 2010 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ifnb1P01575 Wwc2-201ENSMUST00000057561 8678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ifnb1P01575 Ccny-201ENSMUST00000053917 4017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ifnb1P01575 Ssr1-204ENSMUST00000225319 1610 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Ifnb1P01575 Psap-202ENSMUST00000105465 2646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ifnb1P01575 Adamts15-201ENSMUST00000065112 5928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ifnb1P01575 Mmp14-206ENSMUST00000225641 3238 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
Ifnb1P01575 Clcc1-201ENSMUST00000029483 2224 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.3 ms