Protein–RNA interactions for Protein: O88445

Aurkc, Aurora kinase C, mousemouse

Predictions only

Length 282 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AurkcO88445 Stra8-203ENSMUST00000114999 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
AurkcO88445 F2rl1-201ENSMUST00000022185 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
AurkcO88445 Trim41-201ENSMUST00000047145 3432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
AurkcO88445 Clec2h-201ENSMUST00000032518 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
AurkcO88445 Dysf-214ENSMUST00000204354 6432 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.99□□□□□ -0.17
AurkcO88445 Lysmd3-202ENSMUST00000224300 4250 ntAPPRIS P1 BASIC13.99□□□□□ -0.17
AurkcO88445 Ush1c-202ENSMUST00000078680 2047 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
AurkcO88445 Gm7336-201ENSMUST00000107041 1232 ntBASIC13.99□□□□□ -0.17
AurkcO88445 Ninj2-202ENSMUST00000112711 853 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
AurkcO88445 1700021F05Rik-202ENSMUST00000147196 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
AurkcO88445 AA543401-201ENSMUST00000164248 1269 ntBASIC13.99□□□□□ -0.17
AurkcO88445 Khdc3-202ENSMUST00000167514 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.99□□□□□ -0.17
AurkcO88445 Gm10576-201ENSMUST00000191927 825 ntBASIC13.99□□□□□ -0.17
AurkcO88445 Gm37230-201ENSMUST00000194491 818 ntBASIC13.99□□□□□ -0.17
AurkcO88445 AC159114.1-201ENSMUST00000220349 266 ntBASIC13.99□□□□□ -0.17
AurkcO88445 Ccnj-201ENSMUST00000025983 3819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
AurkcO88445 Mrpl4-201ENSMUST00000003386 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
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AurkcO88445 Olfr615-201ENSMUST00000098198 942 ntAPPRIS P1 BASIC13.99□□□□□ -0.17
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AurkcO88445 Hars-201ENSMUST00000001416 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
AurkcO88445 Kcnk6-201ENSMUST00000085818 4084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
AurkcO88445 Fech-201ENSMUST00000025484 2901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
AurkcO88445 A530083I20Rik-203ENSMUST00000214426 1855 ntTSL 5 BASIC13.99□□□□□ -0.17
AurkcO88445 Zfyve19-202ENSMUST00000102519 1505 ntTSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
AurkcO88445 Mtdh-201ENSMUST00000022865 6919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
AurkcO88445 Traf7-210ENSMUST00000176353 2503 ntTSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
AurkcO88445 Smyd4-201ENSMUST00000044530 3517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
AurkcO88445 Socs5-201ENSMUST00000041369 4392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
AurkcO88445 Slc24a3-201ENSMUST00000081121 1788 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.99□□□□□ -0.17
AurkcO88445 Slc25a34-201ENSMUST00000038661 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
AurkcO88445 Gm26534-201ENSMUST00000181687 1724 ntTSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
AurkcO88445 Scyl3-207ENSMUST00000170359 4288 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.98□□□□□ -0.17
AurkcO88445 C530008M17Rik-204ENSMUST00000121160 6921 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.98□□□□□ -0.17
AurkcO88445 Gm45470-202ENSMUST00000210817 2192 ntTSL 5 BASIC13.98□□□□□ -0.17
AurkcO88445 Ppig-201ENSMUST00000040915 6245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
AurkcO88445 Lix1l-201ENSMUST00000062058 3312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
AurkcO88445 Plch2-207ENSMUST00000139976 5322 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
AurkcO88445 Nfkbia-201ENSMUST00000021413 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
AurkcO88445 Nme1-202ENSMUST00000107844 452 ntTSL 3 BASIC13.98□□□□□ -0.17
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AurkcO88445 Gm28277-201ENSMUST00000187450 885 ntTSL 3 BASIC13.98□□□□□ -0.17
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AurkcO88445 Lce1c-201ENSMUST00000047055 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
AurkcO88445 Krtap19-4-201ENSMUST00000051103 304 ntAPPRIS P1 BASIC13.98□□□□□ -0.17
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AurkcO88445 Coch-202ENSMUST00000164782 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
AurkcO88445 Phldb1-214ENSMUST00000147495 5424 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.98□□□□□ -0.17
AurkcO88445 Syndig1-201ENSMUST00000109934 2081 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.98□□□□□ -0.17
AurkcO88445 Scyl1-201ENSMUST00000025890 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
AurkcO88445 Ncf1-205ENSMUST00000144086 2882 ntTSL 2 BASIC13.98□□□□□ -0.17
AurkcO88445 Vps26a-202ENSMUST00000105447 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
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AurkcO88445 Cacna2d1-202ENSMUST00000078272 7311 ntTSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
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AurkcO88445 Lrp10-201ENSMUST00000022782 4228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
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AurkcO88445 Cdc37l1-204ENSMUST00000224511 2944 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.97□□□□□ -0.17
AurkcO88445 Pcdha1-202ENSMUST00000193839 4925 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
AurkcO88445 Muc3a-201ENSMUST00000179412 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
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AurkcO88445 Arpc4-203ENSMUST00000203578 1323 ntTSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
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AurkcO88445 Nup188-205ENSMUST00000138666 534 ntTSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
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AurkcO88445 Gm26771-201ENSMUST00000180472 1082 ntTSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
AurkcO88445 Mir124-2hg-206ENSMUST00000189754 525 ntTSL 3 BASIC13.97□□□□□ -0.17
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AurkcO88445 Lcn5-201ENSMUST00000028306 696 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
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AurkcO88445 Sergef-201ENSMUST00000033127 1465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
AurkcO88445 Dbndd1-201ENSMUST00000176155 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
AurkcO88445 Dnmt3b-204ENSMUST00000088976 4130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
AurkcO88445 Pip5k1c-201ENSMUST00000045469 4323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
AurkcO88445 2610507B11Rik-201ENSMUST00000010421 7443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
AurkcO88445 Irs3-201ENSMUST00000057314 2337 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
AurkcO88445 Ctnnb1-201ENSMUST00000007130 3623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
AurkcO88445 Zfp444-204ENSMUST00000108567 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
AurkcO88445 Ralgds-201ENSMUST00000028170 3590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
AurkcO88445 3830417A13Rik-201ENSMUST00000033522 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
AurkcO88445 Cdk16-201ENSMUST00000033380 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
AurkcO88445 Tinf2-205ENSMUST00000227842 2001 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.97□□□□□ -0.17
AurkcO88445 Arhgef2-223ENSMUST00000176804 3086 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.17
AurkcO88445 Capg-203ENSMUST00000114072 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
AurkcO88445 Hic1-201ENSMUST00000055619 3497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
AurkcO88445 Ank3-223ENSMUST00000182557 1569 ntTSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
AurkcO88445 Psmd4-203ENSMUST00000117355 1756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
AurkcO88445 Pitpnm2-205ENSMUST00000161273 6792 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.1 ms