Protein–RNA interactions for Protein: O70507

Hcn4, Potassium/sodium hyperpolarization-activated cyclic nucleotide-gated channel 4, mousemouse

Predictions only

Length 1,186 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hcn4O70507 Ifnar2-203ENSMUST00000117836 1099 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Hcn4O70507 Tmbim6-206ENSMUST00000161250 1148 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Hcn4O70507 Mir7654-201ENSMUST00000185082 70 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
Hcn4O70507 Gm29237-201ENSMUST00000186216 448 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Hcn4O70507 Gm38266-201ENSMUST00000194931 421 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
Hcn4O70507 Gm9176-201ENSMUST00000219955 1120 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
Hcn4O70507 Ngf-201ENSMUST00000035952 904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Hcn4O70507 Prss48-201ENSMUST00000061343 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Hcn4O70507 Upk3bl-201ENSMUST00000006303 1045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Hcn4O70507 Rpl10-202ENSMUST00000074085 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Hcn4O70507 Keap1-201ENSMUST00000049567 3172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Hcn4O70507 Rnf138-201ENSMUST00000052396 3110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Hcn4O70507 Ss18-203ENSMUST00000092041 2997 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Hcn4O70507 As3mt-201ENSMUST00000003655 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Hcn4O70507 Elavl3-201ENSMUST00000003501 5014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Hcn4O70507 Ralgapa2-211ENSMUST00000228797 8245 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Hcn4O70507 Mvk-202ENSMUST00000112239 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Hcn4O70507 Gm6756-201ENSMUST00000180647 1620 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
Hcn4O70507 Pald1-201ENSMUST00000020289 4282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Hcn4O70507 Steap2-205ENSMUST00000115427 3470 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Hcn4O70507 Rnf135-201ENSMUST00000017839 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Hcn4O70507 Slc27a5-202ENSMUST00000120903 1468 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Hcn4O70507 Gm36065-202ENSMUST00000219654 1424 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Hcn4O70507 Lrrc56-203ENSMUST00000084446 2390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Hcn4O70507 Nkain2-203ENSMUST00000191234 3760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Hcn4O70507 Akap7-203ENSMUST00000100012 2321 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Hcn4O70507 Nid1-201ENSMUST00000005532 6091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Hcn4O70507 Prcd-202ENSMUST00000116318 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Hcn4O70507 Gm15351-201ENSMUST00000123920 419 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Hcn4O70507 Gm22902-201ENSMUST00000158488 302 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
Hcn4O70507 Tmem205-203ENSMUST00000213698 705 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Hcn4O70507 Gm7446-201ENSMUST00000221035 1240 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
Hcn4O70507 B4galt7-201ENSMUST00000064701 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Hcn4O70507 Rhox2e-201ENSMUST00000072167 799 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Hcn4O70507 Pitpna-203ENSMUST00000143219 3761 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Hcn4O70507 Tmpo-201ENSMUST00000020123 3772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Hcn4O70507 Supt5-208ENSMUST00000209141 3755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Hcn4O70507 Klhdc4-201ENSMUST00000045884 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Hcn4O70507 E530011L22Rik-201ENSMUST00000181325 5282 ntBASIC15.27■□□□□ 0.03
Hcn4O70507 Spag1-202ENSMUST00000171205 3219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Hcn4O70507 Tbl1x-201ENSMUST00000088217 5234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Hcn4O70507 Pnma1-201ENSMUST00000061425 2359 ntAPPRIS P1 BASIC15.27■□□□□ 0.03
Hcn4O70507 Safb-201ENSMUST00000095224 3106 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
Hcn4O70507 Med14-202ENSMUST00000096495 6963 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
Hcn4O70507 Tomm6os-201ENSMUST00000155812 2944 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Hcn4O70507 Cpne6-203ENSMUST00000165262 2178 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Hcn4O70507 Grin1os-201ENSMUST00000129723 2891 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Hcn4O70507 Hnrnph1-202ENSMUST00000077817 2126 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Hcn4O70507 Arhgef10l-206ENSMUST00000105799 4508 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Hcn4O70507 Gm16425-201ENSMUST00000118143 3130 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
Hcn4O70507 Tmx4-201ENSMUST00000038228 5488 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Hcn4O70507 Lman2l-204ENSMUST00000125304 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Hcn4O70507 Kcnt1-213ENSMUST00000198204 4714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Hcn4O70507 Igdcc4-202ENSMUST00000077696 6361 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Hcn4O70507 Rflna-201ENSMUST00000036109 1681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Hcn4O70507 Map3k9-202ENSMUST00000222322 3303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Hcn4O70507 G2e3-202ENSMUST00000119211 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Hcn4O70507 Fam167a-201ENSMUST00000121288 4231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Hcn4O70507 Spock3-204ENSMUST00000119068 3201 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Hcn4O70507 Gm10327-201ENSMUST00000105222 1002 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
Hcn4O70507 Gm6222-201ENSMUST00000120787 396 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
Hcn4O70507 Gm14966-202ENSMUST00000129675 649 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Hcn4O70507 Gm14662-201ENSMUST00000145552 734 ntTSL 3 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Hcn4O70507 Tmem109-207ENSMUST00000147699 1096 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Hcn4O70507 Gm43138-201ENSMUST00000199123 708 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
Hcn4O70507 AC164573.1-201ENSMUST00000218616 963 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Hcn4O70507 AC153937.1-201ENSMUST00000218734 412 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
Hcn4O70507 Nsd1-205ENSMUST00000224693 852 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
Hcn4O70507 Isoc2b-201ENSMUST00000064547 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Hcn4O70507 Tmem40-201ENSMUST00000072933 1272 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Hcn4O70507 Gm12166-201ENSMUST00000093169 958 ntAPPRIS P1 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Hcn4O70507 Snx8-204ENSMUST00000196130 2547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Hcn4O70507 Sbno2-204ENSMUST00000217972 2462 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Hcn4O70507 Htr7-202ENSMUST00000164639 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Hcn4O70507 Tal1-201ENSMUST00000030489 4213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Hcn4O70507 Arhgap11a-204ENSMUST00000110949 4458 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Hcn4O70507 Otud6b-201ENSMUST00000117268 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Hcn4O70507 Ddx20-201ENSMUST00000090680 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Hcn4O70507 Tpm1-209ENSMUST00000113690 2890 ntTSL 3 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Hcn4O70507 Casz1-202ENSMUST00000122222 7926 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Hcn4O70507 Tnfrsf13c-202ENSMUST00000109535 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Hcn4O70507 Cacnb1-201ENSMUST00000017552 3396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Hcn4O70507 Cacna2d2-202ENSMUST00000085092 5183 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Hcn4O70507 Ppp4r3a-202ENSMUST00000163095 4083 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Hcn4O70507 Hmga1b-201ENSMUST00000105046 1626 ntAPPRIS P1 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Hcn4O70507 Sirt6-201ENSMUST00000042923 1891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Hcn4O70507 4930528D03Rik-203ENSMUST00000225577 1348 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
Hcn4O70507 Pank3-201ENSMUST00000018990 7376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Hcn4O70507 Acss1-201ENSMUST00000028944 3618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Hcn4O70507 Adamts14-201ENSMUST00000092486 5188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Hcn4O70507 Impdh1-207ENSMUST00000162099 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Hcn4O70507 Hist1h4b-201ENSMUST00000102965 397 ntAPPRIS P1 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Hcn4O70507 Nudcd2-203ENSMUST00000127382 727 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Hcn4O70507 4930456L15Rik-201ENSMUST00000145577 1185 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Hcn4O70507 C030047K22Rik-201ENSMUST00000150382 1164 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Hcn4O70507 Oprm1-229ENSMUST00000152674 1179 ntTSL 3 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Hcn4O70507 4933421O10Rik-201ENSMUST00000155691 3847 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Hcn4O70507 Gm29585-201ENSMUST00000185270 514 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Hcn4O70507 Gm7558-201ENSMUST00000193221 1165 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
Hcn4O70507 AU022133-201ENSMUST00000200601 873 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42.9 ms