Protein–RNA interactions for Protein: O70480

Vamp4, Vesicle-associated membrane protein 4, mousemouse

Predictions only

Length 141 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vamp4O70480 Ginm1-204ENSMUST00000124838 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Vamp4O70480 Tnrc6c-202ENSMUST00000106344 8847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Vamp4O70480 Ap5m1-205ENSMUST00000227431 3757 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
Vamp4O70480 Poli-202ENSMUST00000121674 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Vamp4O70480 Mpl-201ENSMUST00000006556 2083 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Vamp4O70480 Cc2d1b-201ENSMUST00000030320 3303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Vamp4O70480 Nfatc4-204ENSMUST00000226357 2680 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Vamp4O70480 Hps1-204ENSMUST00000160455 2952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Vamp4O70480 Alx1-205ENSMUST00000218282 2012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Vamp4O70480 Bard1-201ENSMUST00000027393 5659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Vamp4O70480 Gm5478-201ENSMUST00000100184 2566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Vamp4O70480 Zfp410-201ENSMUST00000045931 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Vamp4O70480 Pelp1-201ENSMUST00000019065 3435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Vamp4O70480 Isoc2a-201ENSMUST00000125249 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Vamp4O70480 Iars2-201ENSMUST00000027921 5471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Vamp4O70480 Elovl1-207ENSMUST00000167636 1340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Vamp4O70480 Med15-201ENSMUST00000012259 3383 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Vamp4O70480 Cux2-201ENSMUST00000086317 5113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Vamp4O70480 9130008F23Rik-201ENSMUST00000068258 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Vamp4O70480 Glyr1-202ENSMUST00000115844 3348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Vamp4O70480 Glyr1-201ENSMUST00000023189 3330 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Vamp4O70480 Ank1-209ENSMUST00000121802 8218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Vamp4O70480 Marveld2-203ENSMUST00000168772 1888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Vamp4O70480 Fnbp1-208ENSMUST00000113560 4726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Vamp4O70480 Apoo-203ENSMUST00000113897 1218 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Vamp4O70480 Gm7820-201ENSMUST00000121012 1052 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
Vamp4O70480 1700042O10Rik-201ENSMUST00000151032 1075 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Vamp4O70480 Gm17409-201ENSMUST00000167423 962 ntAPPRIS P1 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Vamp4O70480 1010001B22Rik-201ENSMUST00000181488 589 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Vamp4O70480 Gm26808-201ENSMUST00000181569 411 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Vamp4O70480 Cox6b2-203ENSMUST00000182111 585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Vamp4O70480 Gm10576-201ENSMUST00000191927 825 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
Vamp4O70480 Gm6566-201ENSMUST00000221468 1171 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Vamp4O70480 AC139350.3-201ENSMUST00000226151 420 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
Vamp4O70480 Calml4-201ENSMUST00000034777 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Vamp4O70480 Trim15-201ENSMUST00000025329 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Vamp4O70480 Syt10-201ENSMUST00000029441 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Vamp4O70480 Snrk-201ENSMUST00000118886 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Vamp4O70480 Sesn3-207ENSMUST00000209187 1700 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Vamp4O70480 Pfkfb3-205ENSMUST00000114845 1971 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Vamp4O70480 Fbxo44-205ENSMUST00000151127 1403 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Vamp4O70480 Psmd8-202ENSMUST00000182328 1391 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Vamp4O70480 Chst4-202ENSMUST00000211894 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Vamp4O70480 B4galt3-202ENSMUST00000111313 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Vamp4O70480 Olfr1156-203ENSMUST00000216726 3271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Vamp4O70480 Nt5c3b-202ENSMUST00000092689 1344 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Vamp4O70480 Cacna2d2-202ENSMUST00000085092 5183 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Vamp4O70480 Midn-201ENSMUST00000042057 3727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Vamp4O70480 A930033H14Rik-201ENSMUST00000170048 2969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Vamp4O70480 Pou3f2-201ENSMUST00000178174 5587 ntAPPRIS P1 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Vamp4O70480 Mtif2-202ENSMUST00000093239 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Vamp4O70480 Nfkb1-201ENSMUST00000029812 4117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Vamp4O70480 Retreg1-202ENSMUST00000110438 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Vamp4O70480 D11Bhm181e-201ENSMUST00000122252 282 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
Vamp4O70480 Gm15487-201ENSMUST00000122373 465 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
Vamp4O70480 Gm12454-201ENSMUST00000139119 978 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Vamp4O70480 Pam16-201ENSMUST00000014445 596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Vamp4O70480 A930015D03Rik-201ENSMUST00000173900 1111 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Vamp4O70480 0610005C13Rik-201ENSMUST00000209416 856 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Vamp4O70480 AC154806.6-201ENSMUST00000228192 202 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
Vamp4O70480 Nradd-201ENSMUST00000035069 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Vamp4O70480 Crat-202ENSMUST00000102854 2160 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Vamp4O70480 Map2k7-202ENSMUST00000062686 3525 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Vamp4O70480 Dhrs1-201ENSMUST00000002403 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Vamp4O70480 Trim41-201ENSMUST00000047145 3432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Vamp4O70480 Sema3b-201ENSMUST00000073448 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Vamp4O70480 Ptp4a2-207ENSMUST00000165853 3382 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Vamp4O70480 Vopp1-202ENSMUST00000127485 2908 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Vamp4O70480 Nfe2-205ENSMUST00000133600 1605 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Vamp4O70480 Tomm70a-201ENSMUST00000166897 3778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Vamp4O70480 Grm7-201ENSMUST00000071076 3127 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Vamp4O70480 Cyp21a2-ps-201ENSMUST00000172970 1383 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
Vamp4O70480 AC126549.2-201ENSMUST00000223997 1976 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
Vamp4O70480 Clptm1-201ENSMUST00000055242 4143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Vamp4O70480 Abhd15-201ENSMUST00000094004 2662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Vamp4O70480 Ttc24-201ENSMUST00000050258 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Vamp4O70480 Pla2g2e-202ENSMUST00000105803 381 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Vamp4O70480 Zfp637-202ENSMUST00000112859 421 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Vamp4O70480 Gm15460-201ENSMUST00000118147 391 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
Vamp4O70480 Gm4875-201ENSMUST00000118257 786 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
Vamp4O70480 Mettl26-204ENSMUST00000169085 324 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Vamp4O70480 Gm20661-203ENSMUST00000177368 900 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Vamp4O70480 Gm33320-201ENSMUST00000192232 530 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
Vamp4O70480 Agrp-202ENSMUST00000194091 734 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Vamp4O70480 Pls1-201ENSMUST00000093800 3704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Vamp4O70480 AC124751.1-201ENSMUST00000222716 1408 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
Vamp4O70480 Fam84b-201ENSMUST00000100635 5565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Vamp4O70480 Gm10406-202ENSMUST00000170738 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Vamp4O70480 Hes2-201ENSMUST00000030782 2521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Vamp4O70480 Klf13-201ENSMUST00000063694 6396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Vamp4O70480 Gm27177-203ENSMUST00000184034 1911 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Vamp4O70480 Kif3a-201ENSMUST00000057330 2290 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Vamp4O70480 Dusp15-203ENSMUST00000123121 2993 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Vamp4O70480 Il2rb-202ENSMUST00000163494 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Vamp4O70480 Epsti1-201ENSMUST00000022591 1870 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Vamp4O70480 Traf2-201ENSMUST00000028311 3044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Vamp4O70480 Tgfb1i1-203ENSMUST00000163609 1053 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Vamp4O70480 Gm20036-201ENSMUST00000177547 844 ntTSL 3 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Vamp4O70480 Gm3436-201ENSMUST00000179930 840 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
Vamp4O70480 Gm37267-201ENSMUST00000194222 681 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31 ms