Protein–RNA interactions for Protein: O70263

Lnx1, E3 ubiquitin-protein ligase LNX, mousemouse

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Length 728 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lnx1O70263 Ush1c-207ENSMUST00000176371 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Lnx1O70263 Tmtc2-201ENSMUST00000061506 5629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Lnx1O70263 Rogdi-201ENSMUST00000023191 1431 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Lnx1O70263 Ubr3-201ENSMUST00000055758 8072 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Lnx1O70263 Emb-201ENSMUST00000022242 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Lnx1O70263 Col8a2-201ENSMUST00000070132 4332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Lnx1O70263 Uck2-202ENSMUST00000053686 4731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Lnx1O70263 Map2k7-211ENSMUST00000145165 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Lnx1O70263 Gm3054-201ENSMUST00000111075 265 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Lnx1O70263 Kir3dl1-201ENSMUST00000113104 1031 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Lnx1O70263 Eef1akmt4-201ENSMUST00000115522 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Lnx1O70263 AC155937.1-201ENSMUST00000125635 831 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Lnx1O70263 Cdk2ap2-204ENSMUST00000174514 669 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Lnx1O70263 Gm9824-201ENSMUST00000178707 561 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
Lnx1O70263 Gm9726-201ENSMUST00000180321 678 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
Lnx1O70263 4930593C16Rik-202ENSMUST00000214011 714 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Lnx1O70263 Tpi-rs5-201ENSMUST00000216947 774 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
Lnx1O70263 Prss29-201ENSMUST00000024993 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Lnx1O70263 Commd9-201ENSMUST00000028584 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Lnx1O70263 Tmem116-202ENSMUST00000060004 1297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Lnx1O70263 Gpbar1-201ENSMUST00000077985 1075 ntAPPRIS P1 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Lnx1O70263 Wnk2-207ENSMUST00000159559 6584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Lnx1O70263 Irf7-203ENSMUST00000106023 2237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Lnx1O70263 Slc25a19-201ENSMUST00000021089 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Lnx1O70263 Plppr2-202ENSMUST00000188468 1480 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Lnx1O70263 Enpp1-203ENSMUST00000135846 2721 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Lnx1O70263 Hyou1-201ENSMUST00000066601 4432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
Lnx1O70263 Tmem19-203ENSMUST00000217884 2799 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.26
Lnx1O70263 2410018L13Rik-205ENSMUST00000149246 3370 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.26
Lnx1O70263 Gm42934-201ENSMUST00000196920 1345 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
Lnx1O70263 Pus1-207ENSMUST00000170468 1510 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Lnx1O70263 Ptbp3-205ENSMUST00000148331 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Lnx1O70263 Tcf4-248ENSMUST00000202354 2120 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Lnx1O70263 Tcf4-257ENSMUST00000202772 2125 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Lnx1O70263 Plcl1-201ENSMUST00000042986 6580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Lnx1O70263 Usp51-201ENSMUST00000095755 2204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Lnx1O70263 Pnkd-201ENSMUST00000027370 2937 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Lnx1O70263 Ash2l-201ENSMUST00000068892 3307 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Lnx1O70263 Tbl1x-201ENSMUST00000088217 5234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Lnx1O70263 Tor1aip2-205ENSMUST00000111757 6118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Lnx1O70263 Anks1b-204ENSMUST00000179337 2692 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Lnx1O70263 Narfl-204ENSMUST00000134108 2062 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Lnx1O70263 Dimt1-201ENSMUST00000022203 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Lnx1O70263 Mcrs1-202ENSMUST00000163506 1795 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Lnx1O70263 Gm20444-201ENSMUST00000174014 648 ntTSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Lnx1O70263 Esd-207ENSMUST00000176957 1117 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Lnx1O70263 4930573H18Rik-201ENSMUST00000197696 906 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Lnx1O70263 4933437G19Rik-201ENSMUST00000197910 1178 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
Lnx1O70263 Vsig2-204ENSMUST00000215271 891 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Lnx1O70263 Rbfox2-208ENSMUST00000227930 1218 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
Lnx1O70263 Rab33a-201ENSMUST00000033430 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Lnx1O70263 Rps27l-201ENSMUST00000040917 499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Lnx1O70263 Guca2b-201ENSMUST00000044426 605 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Lnx1O70263 Iqcf3-201ENSMUST00000062917 1131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Lnx1O70263 Rundc1-201ENSMUST00000040561 3223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Lnx1O70263 Actr1b-201ENSMUST00000043951 3248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Lnx1O70263 Ptprn2-201ENSMUST00000070733 3201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Lnx1O70263 Lrp6-201ENSMUST00000032322 9368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Lnx1O70263 9930104L06Rik-201ENSMUST00000094769 2911 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Lnx1O70263 Gm38058-201ENSMUST00000194323 4368 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
Lnx1O70263 Gm17315-201ENSMUST00000181408 2504 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Lnx1O70263 Tmem38a-201ENSMUST00000034244 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Lnx1O70263 Hdac10-202ENSMUST00000109347 1824 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Lnx1O70263 Rsrp1-201ENSMUST00000078084 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Lnx1O70263 Gm14451-201ENSMUST00000121581 1542 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
Lnx1O70263 Olah-201ENSMUST00000027955 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Lnx1O70263 Znfx1-201ENSMUST00000048988 7218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Lnx1O70263 Gm12503-201ENSMUST00000146576 3127 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Lnx1O70263 P2rx3-203ENSMUST00000111616 1315 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Lnx1O70263 AC159621.2-201ENSMUST00000223519 1326 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
Lnx1O70263 Asic3-201ENSMUST00000049346 1853 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Lnx1O70263 Klhl12-203ENSMUST00000116528 3277 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Lnx1O70263 Ntng2-201ENSMUST00000048455 1770 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Lnx1O70263 Elavl3-201ENSMUST00000003501 5014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Lnx1O70263 Phtf2-201ENSMUST00000118174 4840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Lnx1O70263 Isoc2a-201ENSMUST00000125249 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Lnx1O70263 D6Ertd527e-204ENSMUST00000204927 2218 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Lnx1O70263 C230004F18Rik-203ENSMUST00000137153 2138 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Lnx1O70263 Avpr1a-201ENSMUST00000020323 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Lnx1O70263 Stra8-203ENSMUST00000114999 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Lnx1O70263 Arfgap1-214ENSMUST00000185115 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Lnx1O70263 Vps26b-201ENSMUST00000034470 3575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Lnx1O70263 Sohlh2-201ENSMUST00000029369 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Lnx1O70263 Olfr1411-202ENSMUST00000190844 1821 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Lnx1O70263 Haghl-203ENSMUST00000133071 1128 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Lnx1O70263 Ncr3-ps-201ENSMUST00000134687 525 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
Lnx1O70263 Pam16-201ENSMUST00000014445 596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Lnx1O70263 Gm4691-201ENSMUST00000182339 1000 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
Lnx1O70263 Panct2-202ENSMUST00000188631 625 ntTSL 3 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Lnx1O70263 Gm28237-202ENSMUST00000189477 748 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Lnx1O70263 Gm2451-201ENSMUST00000199447 999 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
Lnx1O70263 Gm10290-201ENSMUST00000200451 999 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
Lnx1O70263 Gm8239-201ENSMUST00000204094 444 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Lnx1O70263 Vkorc1-201ENSMUST00000033074 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Lnx1O70263 Mrpl4-201ENSMUST00000003386 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Lnx1O70263 Rph3al-202ENSMUST00000066504 988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Lnx1O70263 Rpl10-ps2-201ENSMUST00000098432 645 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
Lnx1O70263 Tars2-204ENSMUST00000163530 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Lnx1O70263 Ubiad1-201ENSMUST00000051633 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Lnx1O70263 Sept8-202ENSMUST00000117061 4563 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
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