Protein–RNA interactions for Protein: O55028

Bckdk, [3-methyl-2-oxobutanoate dehydrogenase [lipoamide]] kinase, mitochondrial, mousemouse

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Length 412 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BckdkO55028 Gm26506-201ENSMUST00000179692 110 ntBASIC13.35□□□□□ -0.27
BckdkO55028 Gm25086-201ENSMUST00000179931 110 ntBASIC13.35□□□□□ -0.27
BckdkO55028 Gm23243-201ENSMUST00000180047 110 ntBASIC13.35□□□□□ -0.27
BckdkO55028 Gm24659-201ENSMUST00000180212 110 ntBASIC13.35□□□□□ -0.27
BckdkO55028 Gm24169-201ENSMUST00000180244 110 ntBASIC13.35□□□□□ -0.27
BckdkO55028 Gm23689-201ENSMUST00000180354 110 ntBASIC13.35□□□□□ -0.27
BckdkO55028 Gm27359-201ENSMUST00000184153 110 ntBASIC13.35□□□□□ -0.27
BckdkO55028 Gm27785-201ENSMUST00000184268 110 ntBASIC13.35□□□□□ -0.27
BckdkO55028 Gm27466-201ENSMUST00000184396 110 ntBASIC13.35□□□□□ -0.27
BckdkO55028 Gm27430-201ENSMUST00000184585 107 ntBASIC13.35□□□□□ -0.27
BckdkO55028 Gm27703-201ENSMUST00000184836 110 ntBASIC13.35□□□□□ -0.27
BckdkO55028 H2-Bl-209ENSMUST00000194244 862 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
BckdkO55028 Gm44333-201ENSMUST00000197168 107 ntBASIC13.35□□□□□ -0.27
BckdkO55028 Gm7774-201ENSMUST00000200064 533 ntBASIC13.35□□□□□ -0.27
BckdkO55028 Tmem86b-204ENSMUST00000206610 522 ntTSL 3 BASIC13.35□□□□□ -0.27
BckdkO55028 Gnpat-201ENSMUST00000034466 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
BckdkO55028 Mdfic-206ENSMUST00000189359 3435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
BckdkO55028 Mocos-201ENSMUST00000068006 2884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
BckdkO55028 Ascc3-201ENSMUST00000035606 7760 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
BckdkO55028 Limk1-201ENSMUST00000015137 3331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
BckdkO55028 Fbxo27-202ENSMUST00000108280 2031 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
BckdkO55028 Rbbp8nl-201ENSMUST00000038529 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
BckdkO55028 Dmtn-202ENSMUST00000022695 4080 ntTSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
BckdkO55028 Apol8-202ENSMUST00000089450 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
BckdkO55028 Zfp503-201ENSMUST00000043409 4216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
BckdkO55028 Gm9913-201ENSMUST00000066157 2793 ntAPPRIS P1 BASIC13.35□□□□□ -0.27
BckdkO55028 Stk33-203ENSMUST00000121378 1304 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
BckdkO55028 Mef2b-205ENSMUST00000163756 1337 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.35□□□□□ -0.27
BckdkO55028 Gjb3-202ENSMUST00000106091 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
BckdkO55028 Grin2a-202ENSMUST00000115835 5023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
BckdkO55028 Ap1s2-202ENSMUST00000069041 2226 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
BckdkO55028 Ranbp3-201ENSMUST00000002445 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
BckdkO55028 Igf2-202ENSMUST00000097936 2503 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
BckdkO55028 Ptp4a1-202ENSMUST00000076587 2851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
BckdkO55028 Gm21981-201ENSMUST00000143789 2721 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
BckdkO55028 Sec61a2-209ENSMUST00000193792 2110 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
BckdkO55028 Cyb5r1-201ENSMUST00000027726 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
BckdkO55028 Gm21009-201ENSMUST00000197169 1669 ntBASIC13.34□□□□□ -0.27
BckdkO55028 Gstm7-201ENSMUST00000004137 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
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BckdkO55028 Ercc2-203ENSMUST00000108461 2799 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
BckdkO55028 Gm29683-203ENSMUST00000209071 2488 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
BckdkO55028 Aen-201ENSMUST00000107421 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
BckdkO55028 Fam163b-201ENSMUST00000151224 2959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
BckdkO55028 Nup88-202ENSMUST00000108530 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
BckdkO55028 Luc7l-203ENSMUST00000119928 1441 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
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BckdkO55028 Ropn1l-201ENSMUST00000110408 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
BckdkO55028 Gm6973-201ENSMUST00000117080 721 ntBASIC13.34□□□□□ -0.27
BckdkO55028 Gm14057-201ENSMUST00000120631 482 ntBASIC13.34□□□□□ -0.27
BckdkO55028 Crem-221ENSMUST00000142690 1256 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
BckdkO55028 Cystm1-205ENSMUST00000152804 445 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC13.34□□□□□ -0.27
BckdkO55028 Slc36a3os-201ENSMUST00000155883 520 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
BckdkO55028 Olfr1344-201ENSMUST00000168341 1061 ntAPPRIS P1 BASIC13.34□□□□□ -0.27
BckdkO55028 Gm25948-201ENSMUST00000175334 112 ntBASIC13.34□□□□□ -0.27
BckdkO55028 Plpp4-203ENSMUST00000205896 714 ntTSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
BckdkO55028 Mcee-203ENSMUST00000206194 532 ntTSL 2 BASIC13.34□□□□□ -0.27
BckdkO55028 AC158982.1-201ENSMUST00000228377 901 ntBASIC13.34□□□□□ -0.27
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BckdkO55028 Khk-201ENSMUST00000031053 1257 ntTSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
BckdkO55028 Neurl2-201ENSMUST00000042775 1014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
BckdkO55028 Rnf138rt1-201ENSMUST00000059320 1191 ntAPPRIS P1 BASIC13.34□□□□□ -0.27
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BckdkO55028 Tvp23b-201ENSMUST00000014321 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
BckdkO55028 Pth2r-201ENSMUST00000027083 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
BckdkO55028 Zkscan4-201ENSMUST00000062609 2400 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.34□□□□□ -0.27
BckdkO55028 Nphp4-202ENSMUST00000081393 5027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
BckdkO55028 Knop1-204ENSMUST00000106550 5524 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
BckdkO55028 Slc20a2-201ENSMUST00000067786 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
BckdkO55028 Pigg-203ENSMUST00000119014 4573 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
BckdkO55028 Cdhr5-202ENSMUST00000167263 2628 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
BckdkO55028 Mcc-202ENSMUST00000164666 3606 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
BckdkO55028 Capn7-201ENSMUST00000022451 3648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
BckdkO55028 Zfp574-202ENSMUST00000179556 4140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
BckdkO55028 Gm6018-201ENSMUST00000216090 1306 ntBASIC13.34□□□□□ -0.27
BckdkO55028 Slc35c2-201ENSMUST00000017808 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
BckdkO55028 Gm44645-201ENSMUST00000205492 1653 ntBASIC13.34□□□□□ -0.27
BckdkO55028 Txndc11-203ENSMUST00000118679 3523 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
BckdkO55028 1700012B07Rik-202ENSMUST00000106674 2035 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
BckdkO55028 Kcnh4-201ENSMUST00000107361 3748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
BckdkO55028 Rnf44-201ENSMUST00000037422 3734 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
BckdkO55028 Ube3a-201ENSMUST00000107537 4911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
BckdkO55028 Ccno-201ENSMUST00000038404 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.27
BckdkO55028 Ino80-202ENSMUST00000110808 3928 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.27
BckdkO55028 Rab3a-202ENSMUST00000110090 1375 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.33□□□□□ -0.27
BckdkO55028 Tmed1-201ENSMUST00000034698 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.27
BckdkO55028 Pax7-201ENSMUST00000030508 5854 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.27
BckdkO55028 Atp2a2-202ENSMUST00000177974 3984 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.27
BckdkO55028 Dsn1-201ENSMUST00000103129 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.27
BckdkO55028 Arl11-202ENSMUST00000224727 2095 ntAPPRIS P1 BASIC13.33□□□□□ -0.27
BckdkO55028 6030408B16Rik-202ENSMUST00000191426 1947 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
BckdkO55028 Cacna2d1-205ENSMUST00000167946 7436 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.28
BckdkO55028 Gm37019-201ENSMUST00000192133 2134 ntBASIC13.33□□□□□ -0.28
BckdkO55028 Sbk2-205ENSMUST00000208109 1422 ntTSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.28
BckdkO55028 Vrk3-201ENSMUST00000002275 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
BckdkO55028 Tsc22d4-203ENSMUST00000100540 2730 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
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