Protein–RNA interactions for Protein: O54804

Chka, Choline kinase alpha, mousemouse

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Length 453 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ChkaO54804 Gm9917-201ENSMUST00000180865 5192 ntTSL 3 BASIC14.52□□□□□ -0.08
ChkaO54804 Mzf1-204ENSMUST00000182490 2872 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
ChkaO54804 Edem3-201ENSMUST00000059498 6327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
ChkaO54804 Kcnq2-207ENSMUST00000103050 2713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.08
ChkaO54804 2810006K23Rik-202ENSMUST00000111477 1637 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
ChkaO54804 Scp2-201ENSMUST00000030340 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
ChkaO54804 Ifnz-201ENSMUST00000105144 1462 ntAPPRIS P1 BASIC14.52□□□□□ -0.08
ChkaO54804 Slc8a3-201ENSMUST00000064594 4379 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.08
ChkaO54804 Tm9sf1-201ENSMUST00000002391 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
ChkaO54804 Syngr1-201ENSMUST00000009727 4180 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
ChkaO54804 Kcnk6-201ENSMUST00000085818 4084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
ChkaO54804 Anks1b-214ENSMUST00000182356 7561 ntTSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.08
ChkaO54804 Fam221a-202ENSMUST00000121903 1304 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
ChkaO54804 Atf7ip2-202ENSMUST00000100191 889 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
ChkaO54804 Gm11779-201ENSMUST00000118541 368 ntBASIC14.52□□□□□ -0.09
ChkaO54804 Kctd14-202ENSMUST00000121987 1210 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
ChkaO54804 Gm9727-201ENSMUST00000161387 555 ntBASIC14.52□□□□□ -0.09
ChkaO54804 Ccnh-202ENSMUST00000163600 1055 ntTSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
ChkaO54804 1600014C10Rik-207ENSMUST00000179503 784 ntTSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
ChkaO54804 Gm3764-206ENSMUST00000181356 1088 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
ChkaO54804 Higd1b-201ENSMUST00000021302 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
ChkaO54804 AC102291.3-201ENSMUST00000226566 405 ntBASIC14.52□□□□□ -0.09
ChkaO54804 Catip-201ENSMUST00000097697 2101 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
ChkaO54804 Tub-202ENSMUST00000119474 2097 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
ChkaO54804 Gm28496-202ENSMUST00000137742 2752 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
ChkaO54804 Id2-202ENSMUST00000221761 1969 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
ChkaO54804 Fam174a-202ENSMUST00000186780 3460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
ChkaO54804 Gm38102-201ENSMUST00000192791 1935 ntBASIC14.52□□□□□ -0.09
ChkaO54804 Casz1-202ENSMUST00000122222 7926 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
ChkaO54804 Myo1c-204ENSMUST00000108431 4718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
ChkaO54804 Sh3glb1-201ENSMUST00000163279 3961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
ChkaO54804 Gm26513-201ENSMUST00000181802 2489 ntBASIC14.52□□□□□ -0.09
ChkaO54804 Asb18-201ENSMUST00000086882 3862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
ChkaO54804 Nfat5-203ENSMUST00000125721 5899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
ChkaO54804 Cdk5r1-201ENSMUST00000053413 4162 ntAPPRIS P1 BASIC14.52□□□□□ -0.09
ChkaO54804 Lpar1-201ENSMUST00000055018 3512 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
ChkaO54804 Cdh7-206ENSMUST00000137092 2681 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
ChkaO54804 Cchcr1-202ENSMUST00000164242 2656 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
ChkaO54804 Elovl6-205ENSMUST00000199910 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
ChkaO54804 Dgki-202ENSMUST00000090314 3784 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
ChkaO54804 Runx2-202ENSMUST00000113571 5898 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
ChkaO54804 Ncs1-201ENSMUST00000000199 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
ChkaO54804 Plxdc1-203ENSMUST00000107565 2439 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
ChkaO54804 Etfdh-201ENSMUST00000029386 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
ChkaO54804 Fam126b-201ENSMUST00000038372 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
ChkaO54804 Tmem164-202ENSMUST00000101198 4443 ntTSL 3 BASIC14.51□□□□□ -0.09
ChkaO54804 Mtrr-209ENSMUST00000223398 3861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
ChkaO54804 Gpr153-202ENSMUST00000105650 3838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
ChkaO54804 Triqk-201ENSMUST00000143186 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
ChkaO54804 Gm27920-201ENSMUST00000183953 96 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
ChkaO54804 Tssc4-208ENSMUST00000208779 647 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
ChkaO54804 Lyzl6-201ENSMUST00000021328 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
ChkaO54804 Pmf1-201ENSMUST00000056370 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
ChkaO54804 A830031A19Rik-201ENSMUST00000068360 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
ChkaO54804 Hist2h3b-201ENSMUST00000098843 488 ntAPPRIS P1 BASIC14.51□□□□□ -0.09
ChkaO54804 Zfp747-201ENSMUST00000067425 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
ChkaO54804 Sh3bp5-201ENSMUST00000091903 2684 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
ChkaO54804 Tmem218-201ENSMUST00000034632 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
ChkaO54804 Dmkn-205ENSMUST00000165887 2063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
ChkaO54804 Slc25a25-203ENSMUST00000113307 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
ChkaO54804 Gata4-201ENSMUST00000067417 3400 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
ChkaO54804 Hmga1-201ENSMUST00000114888 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
ChkaO54804 Hp1bp3-204ENSMUST00000105826 3348 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
ChkaO54804 Ttll5-203ENSMUST00000095536 4150 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
ChkaO54804 Traf5-201ENSMUST00000085573 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
ChkaO54804 Ahctf1-201ENSMUST00000027768 8506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
ChkaO54804 Arl11-201ENSMUST00000055159 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
ChkaO54804 Fgfr3-201ENSMUST00000067150 4218 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
ChkaO54804 Vopp1-204ENSMUST00000145608 4590 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
ChkaO54804 Gm6159-201ENSMUST00000191249 1724 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
ChkaO54804 Arhgef40-204ENSMUST00000182061 4756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
ChkaO54804 Gpr137b-202ENSMUST00000220628 3634 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
ChkaO54804 Atp13a3-202ENSMUST00000100013 7310 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
ChkaO54804 Lrp4-201ENSMUST00000028689 7926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
ChkaO54804 Gamt-202ENSMUST00000105363 988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
ChkaO54804 2200002J24Rik-201ENSMUST00000013227 333 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.5□□□□□ -0.09
ChkaO54804 U2af1l4-216ENSMUST00000166510 835 ntTSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
ChkaO54804 Fau-202ENSMUST00000178310 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
ChkaO54804 Gm18206-201ENSMUST00000207027 926 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
ChkaO54804 AC174742.1-201ENSMUST00000218272 304 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
ChkaO54804 AC131187.1-201ENSMUST00000224567 809 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
ChkaO54804 Ly6g6f-201ENSMUST00000038507 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
ChkaO54804 Dars-202ENSMUST00000064309 645 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
ChkaO54804 Commd5-201ENSMUST00000068407 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
ChkaO54804 Cobll1-201ENSMUST00000090896 4867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
ChkaO54804 Dpp3-201ENSMUST00000025851 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
ChkaO54804 Ablim1-209ENSMUST00000111546 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
ChkaO54804 Gnl3-201ENSMUST00000037739 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
ChkaO54804 Taf7l-201ENSMUST00000009740 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
ChkaO54804 Eef1e1-201ENSMUST00000001757 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
ChkaO54804 Arid3a-203ENSMUST00000105377 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
ChkaO54804 Iah1-204ENSMUST00000223345 1890 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
ChkaO54804 Kcnj8-202ENSMUST00000203945 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
ChkaO54804 Asb16-201ENSMUST00000036467 2843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
ChkaO54804 Rbbp5-206ENSMUST00000190825 2456 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
ChkaO54804 Dnajb12-205ENSMUST00000147914 3041 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
ChkaO54804 AC166491.1-201ENSMUST00000227053 2308 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
ChkaO54804 Mrpl58-209ENSMUST00000153983 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
ChkaO54804 Fstl4-201ENSMUST00000036796 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
ChkaO54804 Fndc3a-201ENSMUST00000089017 6143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
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