Protein–RNA interactions for Protein: O54751

Crx, Cone-rod homeobox protein, mousemouse

Predictions only

Length 299 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CrxO54751 Phldb1-213ENSMUST00000144251 3589 ntTSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
CrxO54751 Tmem215-202ENSMUST00000179526 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
CrxO54751 Kcnj9-202ENSMUST00000194204 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
CrxO54751 Grhl2-201ENSMUST00000022895 4947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
CrxO54751 Cacna1c-203ENSMUST00000112790 7631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
CrxO54751 Armcx1-201ENSMUST00000035748 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
CrxO54751 Epha5-204ENSMUST00000113401 5158 ntTSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
CrxO54751 Gm39377-201ENSMUST00000214587 2533 ntTSL 5 BASIC10.47□□□□□ -0.73
CrxO54751 Olfr71-202ENSMUST00000107862 2587 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.47□□□□□ -0.73
CrxO54751 Nop56-202ENSMUST00000103198 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
CrxO54751 Ciz1-202ENSMUST00000113331 2604 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.47□□□□□ -0.73
CrxO54751 Prkacb-202ENSMUST00000102515 4347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
CrxO54751 Setd5-201ENSMUST00000042889 6755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
CrxO54751 Glis2-201ENSMUST00000014447 3619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
CrxO54751 Eef1d-206ENSMUST00000109975 2842 ntTSL 5 BASIC10.47□□□□□ -0.73
CrxO54751 Pfkfb3-203ENSMUST00000100411 2008 ntTSL 5 BASIC10.47□□□□□ -0.73
CrxO54751 Mrgprf-201ENSMUST00000033386 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
CrxO54751 Gm13559-201ENSMUST00000120476 863 ntBASIC10.47□□□□□ -0.73
CrxO54751 Gm13524-201ENSMUST00000125869 662 ntTSL 3 BASIC10.47□□□□□ -0.73
CrxO54751 Zfp629-207ENSMUST00000134446 670 ntTSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
CrxO54751 Gm17178-201ENSMUST00000163273 357 ntTSL 5 BASIC10.47□□□□□ -0.73
CrxO54751 Prlh-201ENSMUST00000166281 276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
CrxO54751 Vdac2-209ENSMUST00000173456 956 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.47□□□□□ -0.73
CrxO54751 Mir5130-201ENSMUST00000175160 84 ntBASIC10.47□□□□□ -0.73
CrxO54751 6530437J22Rik-201ENSMUST00000207515 773 ntTSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
CrxO54751 Fam92a-201ENSMUST00000087052 1292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
CrxO54751 Tigd2-201ENSMUST00000062626 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
CrxO54751 Kmt5c-203ENSMUST00000108583 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
CrxO54751 Mecom-202ENSMUST00000108270 5692 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.47□□□□□ -0.73
CrxO54751 1300014J16Rik-201ENSMUST00000219015 1337 ntBASIC10.47□□□□□ -0.73
CrxO54751 Slc39a4-201ENSMUST00000073428 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
CrxO54751 Srr-204ENSMUST00000121738 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
CrxO54751 Scfd2-203ENSMUST00000113542 2279 ntTSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
CrxO54751 Yap1-202ENSMUST00000086580 4115 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
CrxO54751 Dohh-201ENSMUST00000072751 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
CrxO54751 Zeb2-212ENSMUST00000176438 9124 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.47□□□□□ -0.73
CrxO54751 Gm26781-201ENSMUST00000181385 1477 ntTSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
CrxO54751 Kcna6-202ENSMUST00000112242 3464 ntAPPRIS P1 BASIC10.47□□□□□ -0.73
CrxO54751 Rbm42-202ENSMUST00000108141 1526 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.47□□□□□ -0.73
CrxO54751 Gatsl3-201ENSMUST00000020699 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
CrxO54751 Nfxl1-202ENSMUST00000087216 3712 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.47□□□□□ -0.73
CrxO54751 Mast1-201ENSMUST00000109741 4872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
CrxO54751 Acaa1b-201ENSMUST00000010795 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
CrxO54751 Tbr1-201ENSMUST00000048934 3977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
CrxO54751 Sept4-201ENSMUST00000018544 1726 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
CrxO54751 Eya1-201ENSMUST00000027066 4347 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.47□□□□□ -0.73
CrxO54751 Jrk-201ENSMUST00000050234 5853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
CrxO54751 Mlkl-201ENSMUST00000056157 2003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
CrxO54751 Mtf1-202ENSMUST00000106193 7554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.46□□□□□ -0.73
CrxO54751 Gm44414-201ENSMUST00000203660 2109 ntBASIC10.46□□□□□ -0.73
CrxO54751 Sin3a-206ENSMUST00000168177 5086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
CrxO54751 Zfp639-205ENSMUST00000193287 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
CrxO54751 Gpr35-205ENSMUST00000186298 2647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
CrxO54751 Spib-201ENSMUST00000035323 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
CrxO54751 Kcnh7-202ENSMUST00000112452 2849 ntTSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
CrxO54751 E430024P14Rik-203ENSMUST00000160545 2833 ntTSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
CrxO54751 Kansl3-205ENSMUST00000186470 2801 ntTSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
CrxO54751 Limch1-204ENSMUST00000118242 5050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.46□□□□□ -0.73
CrxO54751 Gga3-202ENSMUST00000106508 3582 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
CrxO54751 Myo18a-211ENSMUST00000130627 6202 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.46□□□□□ -0.73
CrxO54751 Sap18-203ENSMUST00000111269 459 ntTSL 2 BASIC10.46□□□□□ -0.73
CrxO54751 1810062O18Rik-202ENSMUST00000128848 745 ntTSL 3 BASIC10.46□□□□□ -0.73
CrxO54751 2210408F21Rik-204ENSMUST00000136571 478 ntTSL 3 BASIC10.46□□□□□ -0.73
CrxO54751 Gm12359-202ENSMUST00000141696 713 ntTSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
CrxO54751 Gm12359-203ENSMUST00000153181 680 ntTSL 3 BASIC10.46□□□□□ -0.73
CrxO54751 Psme2-208ENSMUST00000161807 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
CrxO54751 Gm19345-201ENSMUST00000172815 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
CrxO54751 Gm20472-201ENSMUST00000174403 1240 ntBASIC10.46□□□□□ -0.73
CrxO54751 Gm27011-201ENSMUST00000182352 972 ntBASIC10.46□□□□□ -0.73
CrxO54751 C430014B12Rik-202ENSMUST00000186858 657 ntTSL 2 BASIC10.46□□□□□ -0.73
CrxO54751 Bcl7c-205ENSMUST00000205977 891 ntTSL 2 BASIC10.46□□□□□ -0.73
CrxO54751 Sox6os-201ENSMUST00000032900 420 ntTSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
CrxO54751 Bnip2-203ENSMUST00000117450 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
CrxO54751 Hmg20b-204ENSMUST00000122993 1502 ntTSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
CrxO54751 Noto-201ENSMUST00000089578 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
CrxO54751 Gm44241-201ENSMUST00000203230 1662 ntBASIC10.46□□□□□ -0.74
CrxO54751 Ackr4-204ENSMUST00000219146 1654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.46□□□□□ -0.74
CrxO54751 Bscl2-206ENSMUST00000160556 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
CrxO54751 5830418P13Rik-201ENSMUST00000143564 2178 ntTSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
CrxO54751 Ccdc155-201ENSMUST00000121017 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
CrxO54751 Krt26-201ENSMUST00000100482 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
CrxO54751 Gan-201ENSMUST00000064488 2652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
CrxO54751 Pcdh10-202ENSMUST00000170695 8234 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
CrxO54751 Tubgcp4-215ENSMUST00000186659 2915 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
CrxO54751 Cckar-201ENSMUST00000031093 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
CrxO54751 Zyx-202ENSMUST00000164375 3188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
CrxO54751 Slc39a8-202ENSMUST00000081978 3314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
CrxO54751 Casc4-202ENSMUST00000089912 3602 ntTSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
CrxO54751 Slc8a2-201ENSMUST00000168693 4171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
CrxO54751 Duox1-201ENSMUST00000099461 5267 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.46□□□□□ -0.74
CrxO54751 Zbed4-201ENSMUST00000041297 5425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
CrxO54751 Fam13b-201ENSMUST00000040506 3343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
CrxO54751 D630014O11Rik-201ENSMUST00000160562 3019 ntTSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
CrxO54751 5031415H12Rik-201ENSMUST00000181546 2481 ntTSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
CrxO54751 Hmgn1-201ENSMUST00000050884 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
CrxO54751 Gm15477-201ENSMUST00000140578 2130 ntTSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
CrxO54751 Ces2e-202ENSMUST00000109410 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
CrxO54751 Sgta-202ENSMUST00000218208 1964 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
CrxO54751 Hnrnpa1-201ENSMUST00000036004 1918 ntTSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
CrxO54751 Ccer1-201ENSMUST00000060703 1865 ntAPPRIS P1 BASIC10.45□□□□□ -0.74
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