Protein–RNA interactions for Protein: O35943

Fxn, Frataxin, mitochondrial, mousemouse

Predictions only

Length 207 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FxnO35943 Gm26826-201ENSMUST00000181317 1395 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
FxnO35943 Srpx-203ENSMUST00000115544 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
FxnO35943 App-204ENSMUST00000227021 3264 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.42□□□□□ -0.26
FxnO35943 Mto1-201ENSMUST00000034896 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
FxnO35943 H2-Q10-201ENSMUST00000068291 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
FxnO35943 Chuk-201ENSMUST00000026217 3502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
FxnO35943 Gpr35-205ENSMUST00000186298 2647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
FxnO35943 Slc8b1-201ENSMUST00000068326 2898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
FxnO35943 Unc93b1-204ENSMUST00000165711 1991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
FxnO35943 Fundc1-201ENSMUST00000026016 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
FxnO35943 Adal-201ENSMUST00000028702 2471 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
FxnO35943 Fasn-201ENSMUST00000055655 10050 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
FxnO35943 Mbp-204ENSMUST00000080658 2063 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
FxnO35943 Gm996-204ENSMUST00000191602 4812 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.41□□□□□ -0.26
FxnO35943 Arid3a-202ENSMUST00000105376 4892 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
FxnO35943 Rragb-201ENSMUST00000039720 2258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
FxnO35943 Gckr-201ENSMUST00000072228 2014 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
FxnO35943 Wnk1-203ENSMUST00000088644 11330 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
FxnO35943 Cyb5rl-204ENSMUST00000106760 840 ntTSL 3 BASIC13.41□□□□□ -0.26
FxnO35943 Nnat-202ENSMUST00000109526 1213 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
FxnO35943 Gm13830-202ENSMUST00000144202 381 ntTSL 3 BASIC13.41□□□□□ -0.26
FxnO35943 Sox2ot-202ENSMUST00000196058 753 ntTSL 3 BASIC13.41□□□□□ -0.26
FxnO35943 Tspan32-211ENSMUST00000207211 1220 ntTSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
FxnO35943 Sf3b6-201ENSMUST00000046207 1180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
FxnO35943 Idnk-201ENSMUST00000051490 764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
FxnO35943 Teddm2-202ENSMUST00000123490 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
FxnO35943 Cdk8-205ENSMUST00000161181 2467 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
FxnO35943 Gm29683-203ENSMUST00000209071 2488 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
FxnO35943 Grin3a-201ENSMUST00000076674 7431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
FxnO35943 Pcolce-201ENSMUST00000031731 1626 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
FxnO35943 Camk2b-209ENSMUST00000109813 4023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
FxnO35943 Etv3-202ENSMUST00000119109 5309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
FxnO35943 Msantd3-202ENSMUST00000064807 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
FxnO35943 Vdac3-201ENSMUST00000009036 1354 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
FxnO35943 Dnmt3b-202ENSMUST00000072997 4208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
FxnO35943 Pax7-201ENSMUST00000030508 5854 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
FxnO35943 Ap4b1-204ENSMUST00000106824 2412 ntTSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
FxnO35943 Gm12500-202ENSMUST00000186471 2428 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
FxnO35943 Sftpb-204ENSMUST00000183018 1490 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
FxnO35943 Tmem59l-201ENSMUST00000045286 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
FxnO35943 Stra8-201ENSMUST00000031876 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
FxnO35943 Atp2a3-207ENSMUST00000163326 4606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
FxnO35943 Stx5a-201ENSMUST00000010254 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
FxnO35943 Cd34-202ENSMUST00000110815 2554 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
FxnO35943 B3gnt7-201ENSMUST00000113306 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
FxnO35943 Cfap69-201ENSMUST00000054865 4956 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
FxnO35943 Irf3-202ENSMUST00000107834 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
FxnO35943 Enoph1-201ENSMUST00000031268 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
FxnO35943 Wnt11-201ENSMUST00000067495 3451 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
FxnO35943 2410002F23Rik-218ENSMUST00000188382 2301 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
FxnO35943 Synj1-203ENSMUST00000121759 7090 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
FxnO35943 Sox17-206ENSMUST00000192650 3242 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
FxnO35943 Acr-201ENSMUST00000023295 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
FxnO35943 Jade1-204ENSMUST00000170711 2896 ntTSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
FxnO35943 Ccnt2-202ENSMUST00000112570 4511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
FxnO35943 Fam109b-201ENSMUST00000050349 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
FxnO35943 Nfatc4-201ENSMUST00000024179 3267 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
FxnO35943 Dnajc24-201ENSMUST00000102555 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
FxnO35943 Ifna12-201ENSMUST00000102806 797 ntAPPRIS P1 BASIC13.4□□□□□ -0.26
FxnO35943 Chchd6-202ENSMUST00000113550 1042 ntTSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
FxnO35943 Hoxa13-202ENSMUST00000114416 769 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
FxnO35943 E130218I03Rik-203ENSMUST00000125921 666 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.4□□□□□ -0.26
FxnO35943 E130218I03Rik-206ENSMUST00000135228 544 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.4□□□□□ -0.26
FxnO35943 Mpc1-205ENSMUST00000142594 961 ntTSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
FxnO35943 E130218I03Rik-207ENSMUST00000143448 591 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.4□□□□□ -0.26
FxnO35943 Prr3-202ENSMUST00000165613 767 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
FxnO35943 Hoxb8-203ENSMUST00000168043 1141 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
FxnO35943 Vdac2-209ENSMUST00000173456 956 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
FxnO35943 Chchd6-201ENSMUST00000032172 1121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
FxnO35943 Cbl-206ENSMUST00000206147 3452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
FxnO35943 Abi3-201ENSMUST00000059026 4006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
FxnO35943 Arfgap1-214ENSMUST00000185115 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
FxnO35943 AC131586.3-201ENSMUST00000228355 1367 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
FxnO35943 Tbx15-201ENSMUST00000029462 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
FxnO35943 Csgalnact2-201ENSMUST00000049344 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
FxnO35943 Gm9856-201ENSMUST00000217077 2578 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
FxnO35943 Strap-201ENSMUST00000064910 2650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
FxnO35943 Gm38577-201ENSMUST00000221531 4545 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
FxnO35943 Ntng2-201ENSMUST00000048455 1770 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
FxnO35943 Acbd5-215ENSMUST00000228050 4804 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.39□□□□□ -0.27
FxnO35943 Arid4b-203ENSMUST00000110534 5864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
FxnO35943 Grik4-202ENSMUST00000114865 5887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
FxnO35943 Tm9sf1-201ENSMUST00000002391 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
FxnO35943 Bhmt2-201ENSMUST00000015941 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
FxnO35943 Csdc2-201ENSMUST00000038757 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
FxnO35943 Kcnj12-201ENSMUST00000041944 2459 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
FxnO35943 Krt42-201ENSMUST00000017270 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
FxnO35943 Tbc1d4-210ENSMUST00000162617 4762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
FxnO35943 Fam76b-201ENSMUST00000059579 3702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
FxnO35943 Hist1h1e-201ENSMUST00000062045 1930 ntAPPRIS P1 BASIC13.39□□□□□ -0.27
FxnO35943 Ilf2-201ENSMUST00000001042 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
FxnO35943 Dmkn-204ENSMUST00000085691 2007 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
FxnO35943 Arf2-201ENSMUST00000057921 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
FxnO35943 Chfr-207ENSMUST00000198633 2623 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
FxnO35943 Zfand3-201ENSMUST00000057897 2617 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
FxnO35943 Myef2-207ENSMUST00000147105 2928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
FxnO35943 Ccdc157-202ENSMUST00000101626 5153 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
FxnO35943 Vps25-203ENSMUST00000100414 1220 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
FxnO35943 Ighv4-1-201ENSMUST00000103464 414 ntAPPRIS P1 BASIC13.39□□□□□ -0.27
FxnO35943 Kctd14-202ENSMUST00000121987 1210 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 45.4 ms