Protein–RNA interactions for Protein: O35914

Bnc1, Zinc finger protein basonuclin-1, mousemouse

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Length 961 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Bnc1O35914 Synrg-201ENSMUST00000049714 3995 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
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Bnc1O35914 CT025610.1-201ENSMUST00000224552 1786 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
Bnc1O35914 Endou-202ENSMUST00000100249 2405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Bnc1O35914 Eif4g1-204ENSMUST00000115460 5638 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Bnc1O35914 Grin1os-201ENSMUST00000129723 2891 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Bnc1O35914 Tsc22d1-202ENSMUST00000048371 4818 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Bnc1O35914 Synj1-203ENSMUST00000121759 7090 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Bnc1O35914 Grk5-201ENSMUST00000003313 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Bnc1O35914 Siglecf-201ENSMUST00000012798 2510 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Bnc1O35914 Ctnnb1-201ENSMUST00000007130 3623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Bnc1O35914 Vldlr-208ENSMUST00000172302 3855 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Bnc1O35914 4930556H04Rik-201ENSMUST00000222451 1675 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
Bnc1O35914 Rnf44-201ENSMUST00000037422 3734 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Bnc1O35914 Ttc16-202ENSMUST00000091059 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Bnc1O35914 Rspry1-202ENSMUST00000121101 3092 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Bnc1O35914 Gm16565-201ENSMUST00000159138 2181 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Bnc1O35914 Rgs19-204ENSMUST00000108772 779 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
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Bnc1O35914 Tmem217-202ENSMUST00000168339 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Bnc1O35914 Lamtor3-201ENSMUST00000168345 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Bnc1O35914 1700055C04Rik-201ENSMUST00000176450 355 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
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Bnc1O35914 Gm33337-201ENSMUST00000219594 228 ntTSL 3 BASIC14.59□□□□□ -0.07
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Bnc1O35914 Parg-202ENSMUST00000163350 3374 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
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Bnc1O35914 9130017K11Rik-202ENSMUST00000135670 3338 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
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Bnc1O35914 Ntng1-202ENSMUST00000072596 1620 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
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Bnc1O35914 Sema3b-204ENSMUST00000102531 2958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
Bnc1O35914 Pde4dip-201ENSMUST00000045243 6185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
Bnc1O35914 Rnf11-201ENSMUST00000030284 4061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
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Bnc1O35914 Sox17-201ENSMUST00000027035 3127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Bnc1O35914 Chtf8-202ENSMUST00000175940 2890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Bnc1O35914 Spsb1-203ENSMUST00000105685 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Bnc1O35914 Pigg-203ENSMUST00000119014 4573 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
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Bnc1O35914 Oas1b-203ENSMUST00000183291 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
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Bnc1O35914 Kctd3-201ENSMUST00000085678 3706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
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Bnc1O35914 Traf7-210ENSMUST00000176353 2503 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Bnc1O35914 Csrnp1-203ENSMUST00000214058 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
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Bnc1O35914 Zfp385a-201ENSMUST00000168828 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Bnc1O35914 Csad-201ENSMUST00000023805 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Bnc1O35914 Kat8-201ENSMUST00000033070 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
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Bnc1O35914 Gm24543-201ENSMUST00000103867 82 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
Bnc1O35914 Mrpl53-201ENSMUST00000113938 695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
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Bnc1O35914 Crybb3-205ENSMUST00000120506 804 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Bnc1O35914 Gm37267-201ENSMUST00000194222 681 ntTSL 2 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Bnc1O35914 AC164567.1-201ENSMUST00000219185 960 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
Bnc1O35914 Pim2-204ENSMUST00000223553 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Bnc1O35914 Il31-201ENSMUST00000031389 806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Bnc1O35914 Ramp3-201ENSMUST00000045374 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Bnc1O35914 Zswim7-201ENSMUST00000072916 732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Bnc1O35914 Polr3d-202ENSMUST00000180358 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Bnc1O35914 Zfp707-202ENSMUST00000109967 1703 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Bnc1O35914 Rgs20-201ENSMUST00000002533 1778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Bnc1O35914 Pcdh10-204ENSMUST00000193252 4638 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Bnc1O35914 Tmem176b-203ENSMUST00000166247 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Bnc1O35914 Adrb3-203ENSMUST00000121838 1864 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Bnc1O35914 Nabp1-201ENSMUST00000027279 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Bnc1O35914 Pdgfrl-201ENSMUST00000034004 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
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