Protein–RNA interactions for Protein: O35892

Sp100, Nuclear autoantigen Sp-100, mousemouse

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sp100O35892 Mtfp1-201ENSMUST00000004868 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
Sp100O35892 Espn-220ENSMUST00000207676 4618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.61□□□□□ -0.39
Sp100O35892 Gm20708-201ENSMUST00000132298 1780 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.61□□□□□ -0.39
Sp100O35892 Gm28230-201ENSMUST00000053932 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
Sp100O35892 Car10-203ENSMUST00000107858 2742 ntTSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
Sp100O35892 Gatsl3-201ENSMUST00000020699 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
Sp100O35892 Scyl3-201ENSMUST00000027876 4368 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
Sp100O35892 Aatk-201ENSMUST00000064307 5336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
Sp100O35892 Wdr31-203ENSMUST00000120095 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
Sp100O35892 Zfp169-203ENSMUST00000176176 2162 ntTSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
Sp100O35892 Pik3cd-214ENSMUST00000177654 4765 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC12.6□□□□□ -0.39
Sp100O35892 Amotl2-201ENSMUST00000035121 4328 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
Sp100O35892 Pds5b-201ENSMUST00000016569 7417 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
Sp100O35892 Adcyap1r1-202ENSMUST00000070756 6107 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
Sp100O35892 Rnf122-205ENSMUST00000217278 1726 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
Sp100O35892 Spns1-201ENSMUST00000032994 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
Sp100O35892 Nkx6-3-201ENSMUST00000071588 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
Sp100O35892 Gm42471-201ENSMUST00000201457 1865 ntBASIC12.6□□□□□ -0.39
Sp100O35892 Gm5096-201ENSMUST00000091776 1858 ntAPPRIS P1 BASIC12.6□□□□□ -0.39
Sp100O35892 Zglp1-201ENSMUST00000115494 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
Sp100O35892 Znhit1-206ENSMUST00000156963 1208 ntTSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
Sp100O35892 Gm17114-201ENSMUST00000164716 511 ntTSL 3 BASIC12.6□□□□□ -0.39
Sp100O35892 Grtp1-201ENSMUST00000165605 1271 ntTSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
Sp100O35892 Mir5126-201ENSMUST00000175513 77 ntBASIC12.6□□□□□ -0.39
Sp100O35892 Spr-ps1-202ENSMUST00000186281 706 ntTSL 2 BASIC12.6□□□□□ -0.39
Sp100O35892 Gm28411-202ENSMUST00000191318 464 ntTSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
Sp100O35892 Tmem52-201ENSMUST00000023920 932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
Sp100O35892 Cela3a-201ENSMUST00000024200 958 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.6□□□□□ -0.39
Sp100O35892 Izumo1r-201ENSMUST00000034409 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
Sp100O35892 Gabrg3-202ENSMUST00000068911 9767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
Sp100O35892 1110038F14Rik-201ENSMUST00000071792 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
Sp100O35892 Chmp1a-201ENSMUST00000000759 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
Sp100O35892 Zfp24-203ENSMUST00000153337 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
Sp100O35892 Gm26675-201ENSMUST00000181068 1525 ntTSL 5 BASIC12.6□□□□□ -0.39
Sp100O35892 Zfp467-203ENSMUST00000114558 3115 ntTSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
Sp100O35892 Poli-202ENSMUST00000121674 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
Sp100O35892 Fgfr1op-202ENSMUST00000097419 3505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
Sp100O35892 A230072C01Rik-202ENSMUST00000136447 1412 ntTSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
Sp100O35892 Gm12500-202ENSMUST00000186471 2428 ntBASIC12.6□□□□□ -0.39
Sp100O35892 Sirt2-201ENSMUST00000072965 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
Sp100O35892 Tmem220-201ENSMUST00000061786 1597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
Sp100O35892 Adamts20-204ENSMUST00000155907 6886 ntTSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
Sp100O35892 Acot6-202ENSMUST00000222921 3622 ntBASIC12.6□□□□□ -0.39
Sp100O35892 4930402H24Rik-202ENSMUST00000110243 1984 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
Sp100O35892 Iws1-201ENSMUST00000025243 9613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
Sp100O35892 Cnih4-203ENSMUST00000111059 3127 ntTSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
Sp100O35892 Gtf2ird1-229ENSMUST00000202554 3514 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Sp100O35892 Tagap1-201ENSMUST00000063683 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Sp100O35892 Lrrc8d-201ENSMUST00000060531 3923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Sp100O35892 Slc11a2-201ENSMUST00000023774 3025 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Sp100O35892 Steap2-203ENSMUST00000115425 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Sp100O35892 Hspb7-201ENSMUST00000102486 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Sp100O35892 Trim45-203ENSMUST00000106980 3337 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Sp100O35892 Pxdn-201ENSMUST00000118321 2698 ntTSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Sp100O35892 Cdh7-206ENSMUST00000137092 2681 ntTSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Sp100O35892 Nr2e3-201ENSMUST00000034831 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Sp100O35892 Kpna6-201ENSMUST00000003828 2195 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.59□□□□□ -0.39
Sp100O35892 Ncor2-206ENSMUST00000111402 8862 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.59□□□□□ -0.39
Sp100O35892 Chtf8-202ENSMUST00000175940 2890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Sp100O35892 Ncbp2-201ENSMUST00000023460 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Sp100O35892 Slc31a2-203ENSMUST00000107468 743 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.59□□□□□ -0.39
Sp100O35892 Cgrrf1-204ENSMUST00000140114 419 ntTSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Sp100O35892 Egfl8-201ENSMUST00000015611 1150 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Sp100O35892 4930556N13Rik-201ENSMUST00000173677 1034 ntTSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Sp100O35892 Pih1d1-206ENSMUST00000210139 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Sp100O35892 Pard6a-204ENSMUST00000212352 1234 ntTSL 2 BASIC12.59□□□□□ -0.39
Sp100O35892 4931406C07Rik-209ENSMUST00000217042 691 ntTSL 3 BASIC12.59□□□□□ -0.39
Sp100O35892 Apoa1-201ENSMUST00000034588 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Sp100O35892 Egfl8-202ENSMUST00000097345 1064 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Sp100O35892 Pigg-201ENSMUST00000031189 3427 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.59□□□□□ -0.39
Sp100O35892 Actg1-204ENSMUST00000106215 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Sp100O35892 Gm3373-202ENSMUST00000177556 1955 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC12.59□□□□□ -0.39
Sp100O35892 Gm3500-201ENSMUST00000177986 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.59□□□□□ -0.39
Sp100O35892 Ggn-202ENSMUST00000098609 2653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Sp100O35892 Zfp868-202ENSMUST00000121886 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Sp100O35892 Epb41-208ENSMUST00000105981 5303 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.59□□□□□ -0.39
Sp100O35892 Ankrd17-201ENSMUST00000014421 10458 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC12.59□□□□□ -0.39
Sp100O35892 Spon1-201ENSMUST00000046687 6161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Sp100O35892 Zfp467-205ENSMUST00000114560 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Sp100O35892 1700029H14Rik-203ENSMUST00000134023 1319 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Sp100O35892 Gm5366-201ENSMUST00000215494 1338 ntBASIC12.59□□□□□ -0.39
Sp100O35892 Cluh-202ENSMUST00000117818 4284 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Sp100O35892 Stk16-201ENSMUST00000027401 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Sp100O35892 Arhgef25-202ENSMUST00000167353 2189 ntTSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Sp100O35892 Vangl1-201ENSMUST00000029453 6531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Sp100O35892 Adal-205ENSMUST00000119031 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.59□□□□□ -0.39
Sp100O35892 Ppp1r12b-209ENSMUST00000168381 3621 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.39
Sp100O35892 Syndig1-201ENSMUST00000109934 2081 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.58□□□□□ -0.39
Sp100O35892 Atp8a1-201ENSMUST00000037380 8178 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
Sp100O35892 Rxra-202ENSMUST00000100251 1952 ntTSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
Sp100O35892 Zbtb39-201ENSMUST00000054287 5960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
Sp100O35892 Casc4-203ENSMUST00000089915 3475 ntTSL 2 BASIC12.58□□□□□ -0.4
Sp100O35892 Plagl1-202ENSMUST00000121646 5260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
Sp100O35892 Wdr61-203ENSMUST00000121204 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
Sp100O35892 Mras-203ENSMUST00000122384 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
Sp100O35892 Smim12-201ENSMUST00000142029 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
Sp100O35892 1700039E22Rik-201ENSMUST00000174082 770 ntTSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
Sp100O35892 Tnnt2-205ENSMUST00000178204 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.58□□□□□ -0.4
Sp100O35892 Tnnt2-207ENSMUST00000179863 1097 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC12.58□□□□□ -0.4
Sp100O35892 1500015A07Rik-203ENSMUST00000184678 890 ntTSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
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