Protein–RNA interactions for Protein: O35305

Tnfrsf11a, Tumor necrosis factor receptor superfamily member 11A, mousemouse

Predictions only

Length 625 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tnfrsf11aO35305 AC154767.3-201ENSMUST00000225150 1342 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Tnfrsf11aO35305 Fgf17-202ENSMUST00000227123 1336 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Tnfrsf11aO35305 Mn1-201ENSMUST00000094463 6860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Tnfrsf11aO35305 Ppp1r15a-202ENSMUST00000167273 2809 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Tnfrsf11aO35305 Nr3c2-203ENSMUST00000109912 5675 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Tnfrsf11aO35305 Ffar2-202ENSMUST00000163504 1913 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Tnfrsf11aO35305 Gm38102-201ENSMUST00000192791 1935 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Tnfrsf11aO35305 Gm26578-201ENSMUST00000181702 4611 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Tnfrsf11aO35305 Pds5b-208ENSMUST00000202170 6598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Tnfrsf11aO35305 Tc2n-203ENSMUST00000160830 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Tnfrsf11aO35305 BC001981-202ENSMUST00000191393 1545 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Tnfrsf11aO35305 N4bp3-201ENSMUST00000001080 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Tnfrsf11aO35305 Gm12428-201ENSMUST00000119844 727 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Tnfrsf11aO35305 Zdhhc23-202ENSMUST00000165648 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Tnfrsf11aO35305 Gm44081-201ENSMUST00000204406 643 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Tnfrsf11aO35305 Rbfox2-208ENSMUST00000227930 1218 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Tnfrsf11aO35305 AC121598.1-201ENSMUST00000228224 1019 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Tnfrsf11aO35305 Ifnl2-201ENSMUST00000081684 702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Tnfrsf11aO35305 Morc4-201ENSMUST00000033811 4412 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Tnfrsf11aO35305 Slc39a8-202ENSMUST00000081978 3314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Tnfrsf11aO35305 Pitpnm1-202ENSMUST00000100022 4512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Tnfrsf11aO35305 Ywhag-205ENSMUST00000198270 1610 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Tnfrsf11aO35305 Irf7-203ENSMUST00000106023 2237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Tnfrsf11aO35305 Cd72-202ENSMUST00000098104 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Tnfrsf11aO35305 Klhl12-203ENSMUST00000116528 3277 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Tnfrsf11aO35305 Tmem19-203ENSMUST00000217884 2799 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Tnfrsf11aO35305 Stra8-203ENSMUST00000114999 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Tnfrsf11aO35305 Arhgap8-205ENSMUST00000168811 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Tnfrsf11aO35305 Gnao1-203ENSMUST00000125716 3462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Tnfrsf11aO35305 Kpna6-201ENSMUST00000003828 2195 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Tnfrsf11aO35305 Ctu2-201ENSMUST00000116412 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Tnfrsf11aO35305 Dnajb2-210ENSMUST00000188931 3066 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Tnfrsf11aO35305 Mto1-201ENSMUST00000034896 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Tnfrsf11aO35305 Gm15850-201ENSMUST00000134998 2049 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Tnfrsf11aO35305 Gm28182-201ENSMUST00000188354 2477 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Tnfrsf11aO35305 Me2-201ENSMUST00000025439 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Tnfrsf11aO35305 Pcdha9-201ENSMUST00000115659 5341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Tnfrsf11aO35305 Traf1-201ENSMUST00000028234 2069 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Tnfrsf11aO35305 Fgf2-208ENSMUST00000200585 5973 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Tnfrsf11aO35305 Irf2bpl-201ENSMUST00000038422 4098 ntAPPRIS P1 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Tnfrsf11aO35305 Gm13616-201ENSMUST00000120600 222 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Tnfrsf11aO35305 Gm12882-201ENSMUST00000121696 517 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Tnfrsf11aO35305 Nudcd2-203ENSMUST00000127382 727 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Tnfrsf11aO35305 Gm16091-201ENSMUST00000156664 963 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Tnfrsf11aO35305 Gm40493-201ENSMUST00000210223 400 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Tnfrsf11aO35305 Mobp-207ENSMUST00000215512 498 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Tnfrsf11aO35305 Klk5-201ENSMUST00000048444 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Tnfrsf11aO35305 Tmem116-202ENSMUST00000060004 1297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Tnfrsf11aO35305 Smim4-202ENSMUST00000064032 791 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Tnfrsf11aO35305 A130006I12Rik-201ENSMUST00000091396 408 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Tnfrsf11aO35305 Tmx4-201ENSMUST00000038228 5488 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Tnfrsf11aO35305 Adarb1-202ENSMUST00000098374 6584 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Tnfrsf11aO35305 Jakmip1-201ENSMUST00000043794 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Tnfrsf11aO35305 Leng9-201ENSMUST00000058358 2460 ntAPPRIS P1 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Tnfrsf11aO35305 Taf7l-201ENSMUST00000009740 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Tnfrsf11aO35305 Msl2-201ENSMUST00000085177 4889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Tnfrsf11aO35305 Dnmt3b-210ENSMUST00000109774 4320 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Tnfrsf11aO35305 Sh3bp5-201ENSMUST00000091903 2684 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Tnfrsf11aO35305 Smg9-201ENSMUST00000002280 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Tnfrsf11aO35305 Serpinh1-201ENSMUST00000094154 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Tnfrsf11aO35305 Fam122b-203ENSMUST00000114841 3074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Tnfrsf11aO35305 Gm37912-201ENSMUST00000191895 3076 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Tnfrsf11aO35305 Moxd1-201ENSMUST00000095784 3090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Tnfrsf11aO35305 Pde4d-203ENSMUST00000117420 1955 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Tnfrsf11aO35305 Arhgef18-201ENSMUST00000004684 5271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Tnfrsf11aO35305 Smarce1-201ENSMUST00000103133 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Tnfrsf11aO35305 P2ry2-201ENSMUST00000037540 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Tnfrsf11aO35305 Ror1-201ENSMUST00000039630 5762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Tnfrsf11aO35305 Hsd17b14-201ENSMUST00000107752 1400 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Tnfrsf11aO35305 Cdcp1-201ENSMUST00000039229 5310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Tnfrsf11aO35305 Tap2-201ENSMUST00000025197 3442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Tnfrsf11aO35305 Zfyve19-202ENSMUST00000102519 1505 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Tnfrsf11aO35305 Rad52-201ENSMUST00000032269 1617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Tnfrsf11aO35305 Fgd1-201ENSMUST00000026296 4001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Tnfrsf11aO35305 Il18r1-203ENSMUST00000167723 1919 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Tnfrsf11aO35305 Ggn-205ENSMUST00000209019 2148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Tnfrsf11aO35305 Grik5-201ENSMUST00000003468 3763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Tnfrsf11aO35305 4930474N05Rik-203ENSMUST00000226305 2313 ntAPPRIS P1 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Tnfrsf11aO35305 Tmem198b-201ENSMUST00000051011 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Tnfrsf11aO35305 Pou2f2-201ENSMUST00000098679 2340 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Tnfrsf11aO35305 Ipo8-201ENSMUST00000048418 5360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Tnfrsf11aO35305 Rpl37rt-201ENSMUST00000100847 682 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Tnfrsf11aO35305 Hist1h4d-201ENSMUST00000102968 1138 ntAPPRIS P1 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Tnfrsf11aO35305 Ppil3-203ENSMUST00000114348 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Tnfrsf11aO35305 Atf7ip2-203ENSMUST00000117220 1230 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Tnfrsf11aO35305 AC155937.1-201ENSMUST00000125635 831 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Tnfrsf11aO35305 Btf3-204ENSMUST00000134542 780 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Tnfrsf11aO35305 1810032O08Rik-206ENSMUST00000144049 966 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Tnfrsf11aO35305 1700003M07Rik-202ENSMUST00000147634 564 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Tnfrsf11aO35305 Gm9719-201ENSMUST00000162765 543 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Tnfrsf11aO35305 Gm45453-201ENSMUST00000211758 853 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Tnfrsf11aO35305 Rps27l-201ENSMUST00000040917 499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Tnfrsf11aO35305 Tlcd2-201ENSMUST00000043598 1153 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Tnfrsf11aO35305 Cul3-201ENSMUST00000163119 4709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Tnfrsf11aO35305 Iqcj-201ENSMUST00000063263 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Tnfrsf11aO35305 Tigd5-201ENSMUST00000192937 4801 ntAPPRIS P1 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Tnfrsf11aO35305 AC121801.1-201ENSMUST00000225363 1899 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Tnfrsf11aO35305 Gm43056-201ENSMUST00000197865 2791 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Tnfrsf11aO35305 Tbx3-202ENSMUST00000079719 4982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Tnfrsf11aO35305 Gopc-201ENSMUST00000020008 4216 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 94.4 ms