Protein–RNA interactions for Protein: O08532

Cacna2d1, Voltage-dependent calcium channel subunit alpha-2/delta-1, mousemouse

Predictions only

Length 1,103 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cacna2d1O08532 Desi2-201ENSMUST00000027783 8802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Cacna2d1O08532 Stxbp2-207ENSMUST00000160708 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Cacna2d1O08532 Tubgcp4-215ENSMUST00000186659 2915 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Cacna2d1O08532 Cntfr-204ENSMUST00000102962 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Cacna2d1O08532 Gm21009-201ENSMUST00000197169 1669 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Cacna2d1O08532 Fam172a-203ENSMUST00000163257 1436 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Cacna2d1O08532 Mageh1-201ENSMUST00000051484 1410 ntAPPRIS P1 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Cacna2d1O08532 Upk1a-201ENSMUST00000006476 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Cacna2d1O08532 Zfp868-202ENSMUST00000121886 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Cacna2d1O08532 Ociad2-204ENSMUST00000200830 2384 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Cacna2d1O08532 Mtif3-203ENSMUST00000110564 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Cacna2d1O08532 Mtif3-204ENSMUST00000110566 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Cacna2d1O08532 Wdr38-202ENSMUST00000112872 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Cacna2d1O08532 Platr13-201ENSMUST00000133945 375 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Cacna2d1O08532 Zdhhc23-202ENSMUST00000165648 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Cacna2d1O08532 Gm27164-201ENSMUST00000184359 723 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Cacna2d1O08532 Lmo4-207ENSMUST00000196264 1263 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Cacna2d1O08532 Pomc-201ENSMUST00000020990 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Cacna2d1O08532 Gm33785-201ENSMUST00000222961 886 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Cacna2d1O08532 AC140397.2-201ENSMUST00000224213 834 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Cacna2d1O08532 Bcs1l-201ENSMUST00000027358 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Cacna2d1O08532 L2hgdh-201ENSMUST00000021370 3340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Cacna2d1O08532 N6amt1-202ENSMUST00000118115 1951 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Cacna2d1O08532 Ntf3-202ENSMUST00000112244 1399 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Cacna2d1O08532 Arfgap1-214ENSMUST00000185115 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Cacna2d1O08532 Commd7-201ENSMUST00000071852 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Cacna2d1O08532 Dhx9-201ENSMUST00000042141 4616 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Cacna2d1O08532 Tacc1-202ENSMUST00000084512 6471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Cacna2d1O08532 Gpr45-203ENSMUST00000179766 3776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Cacna2d1O08532 Wnk1-223ENSMUST00000177761 11303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Cacna2d1O08532 C230004F18Rik-203ENSMUST00000137153 2138 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Cacna2d1O08532 Mfng-201ENSMUST00000018313 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Cacna2d1O08532 Olah-201ENSMUST00000027955 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Cacna2d1O08532 Ggh-201ENSMUST00000098242 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Cacna2d1O08532 Aph1a-202ENSMUST00000056710 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Cacna2d1O08532 Pde4d-204ENSMUST00000117879 1724 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Cacna2d1O08532 Kcnj8-201ENSMUST00000032374 2269 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Cacna2d1O08532 Mir449b-201ENSMUST00000104833 80 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Cacna2d1O08532 Gm11543-201ENSMUST00000120758 370 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Cacna2d1O08532 2810408I11Rik-202ENSMUST00000150749 711 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Cacna2d1O08532 AC155937.1-202ENSMUST00000156229 621 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Cacna2d1O08532 Snu13-203ENSMUST00000166578 1061 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Cacna2d1O08532 9130230N09Rik-201ENSMUST00000174568 663 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Cacna2d1O08532 1190007I07Rik-204ENSMUST00000183416 637 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Cacna2d1O08532 AC131710.1-201ENSMUST00000228336 990 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Cacna2d1O08532 1700018B24Rik-201ENSMUST00000036023 593 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Cacna2d1O08532 Atad3aos-201ENSMUST00000067628 971 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Cacna2d1O08532 Syk-203ENSMUST00000120135 5363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Cacna2d1O08532 Kdm6b-201ENSMUST00000094077 6654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Cacna2d1O08532 Pigg-202ENSMUST00000118910 3030 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Cacna2d1O08532 Gata1-201ENSMUST00000033502 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Cacna2d1O08532 9330182L06Rik-201ENSMUST00000069538 4688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Cacna2d1O08532 Gm43509-201ENSMUST00000196551 2594 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Cacna2d1O08532 Lrp11-203ENSMUST00000130590 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Cacna2d1O08532 Plppr2-202ENSMUST00000188468 1480 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Cacna2d1O08532 Catip-201ENSMUST00000097697 2101 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Cacna2d1O08532 Slc44a5-201ENSMUST00000089948 4098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Cacna2d1O08532 Usp51-201ENSMUST00000095755 2204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Cacna2d1O08532 Camsap2-202ENSMUST00000192001 6329 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Cacna2d1O08532 Tcf19-203ENSMUST00000161012 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Cacna2d1O08532 Gm11946-201ENSMUST00000123459 3941 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Cacna2d1O08532 Gpr137c-201ENSMUST00000146150 3917 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Cacna2d1O08532 Cds1-201ENSMUST00000031273 3924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Cacna2d1O08532 Eif2a-201ENSMUST00000029387 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Cacna2d1O08532 Eftud2-202ENSMUST00000107060 3339 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Cacna2d1O08532 Kcnip4-201ENSMUST00000087395 2366 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Cacna2d1O08532 Prdm4-207ENSMUST00000220032 3962 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Cacna2d1O08532 Fgd4-211ENSMUST00000162671 2714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Cacna2d1O08532 Zfp865-201ENSMUST00000076251 7503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Cacna2d1O08532 Gm25287-201ENSMUST00000103846 110 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Cacna2d1O08532 Gm22918-201ENSMUST00000103855 110 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Cacna2d1O08532 Gm11505-201ENSMUST00000130442 737 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Cacna2d1O08532 1700086L19Rik-202ENSMUST00000185822 1028 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Cacna2d1O08532 Gm37171-201ENSMUST00000192636 1185 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Cacna2d1O08532 Gm45091-201ENSMUST00000205799 504 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Cacna2d1O08532 Vkorc1-201ENSMUST00000033074 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Cacna2d1O08532 Atp6v0b-201ENSMUST00000036380 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Cacna2d1O08532 Olfr615-201ENSMUST00000098198 942 ntAPPRIS P1 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Cacna2d1O08532 Rcbtb1-202ENSMUST00000043227 3903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Cacna2d1O08532 Mctp1-204ENSMUST00000125209 4715 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Cacna2d1O08532 Iqcj-201ENSMUST00000063263 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Cacna2d1O08532 Cyp27a1-201ENSMUST00000027356 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Cacna2d1O08532 Clpb-202ENSMUST00000106998 2287 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Cacna2d1O08532 Rgs3-204ENSMUST00000107420 2752 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Cacna2d1O08532 Syt13-201ENSMUST00000028648 3761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Cacna2d1O08532 Cacnb4-201ENSMUST00000078324 8225 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Cacna2d1O08532 Map4-201ENSMUST00000035055 6091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Cacna2d1O08532 BC026585-201ENSMUST00000046743 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Cacna2d1O08532 Akt2-ps-201ENSMUST00000120718 1449 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Cacna2d1O08532 Gm16845-201ENSMUST00000180419 1415 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Cacna2d1O08532 Sec11a-201ENSMUST00000026818 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Cacna2d1O08532 Lgals8-202ENSMUST00000099821 2792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Cacna2d1O08532 Vwa2-201ENSMUST00000026068 4049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Cacna2d1O08532 Slc17a9-201ENSMUST00000094218 2275 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Cacna2d1O08532 Gm43205-201ENSMUST00000198622 1968 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Cacna2d1O08532 Catip-204ENSMUST00000191010 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Cacna2d1O08532 Tubb3-201ENSMUST00000071134 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Cacna2d1O08532 Iws1-206ENSMUST00000212675 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Cacna2d1O08532 Tmx4-201ENSMUST00000038228 5488 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Cacna2d1O08532 Myog-201ENSMUST00000027730 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.9 ms