Protein–RNA interactions for Protein: L7N2D2

Gm3278, Predicted gene 3278, mousemouse

Predictions only

Length 218 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm3278L7N2D2 Cts7-204ENSMUST00000225321 1257 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
Gm3278L7N2D2 AC132317.1-201ENSMUST00000227227 962 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
Gm3278L7N2D2 Il27-201ENSMUST00000058429 1021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Gm3278L7N2D2 Eif2a-201ENSMUST00000029387 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Gm3278L7N2D2 Whrn-203ENSMUST00000084510 4049 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Gm3278L7N2D2 Usp35-202ENSMUST00000168435 3982 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Gm3278L7N2D2 Map6-207ENSMUST00000208924 2906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Gm3278L7N2D2 Otop3-201ENSMUST00000019006 2422 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Gm3278L7N2D2 Eps8-203ENSMUST00000111878 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Gm3278L7N2D2 Tcf24-202ENSMUST00000185184 4193 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Gm3278L7N2D2 Pex6-201ENSMUST00000002840 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Gm3278L7N2D2 Glis1-201ENSMUST00000046005 2906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Gm3278L7N2D2 Ric1-201ENSMUST00000043610 7190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Gm3278L7N2D2 Mn1-201ENSMUST00000094463 6860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Gm3278L7N2D2 Khdc1c-201ENSMUST00000070223 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Gm3278L7N2D2 Cpsf4l-203ENSMUST00000106617 1123 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Gm3278L7N2D2 Gm11793-201ENSMUST00000120433 981 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
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Gm3278L7N2D2 Gm16087-201ENSMUST00000124395 964 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Gm3278L7N2D2 Gm829-202ENSMUST00000146622 722 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Gm3278L7N2D2 Glo1-202ENSMUST00000167624 895 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Gm3278L7N2D2 Gm6297-201ENSMUST00000181475 2146 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
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Gm3278L7N2D2 Gm26793-201ENSMUST00000180930 2732 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
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Gm3278L7N2D2 Zic5-201ENSMUST00000039118 4767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
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Gm3278L7N2D2 Lsm1-201ENSMUST00000038421 2663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
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Gm3278L7N2D2 Tcp1-209ENSMUST00000151287 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Gm3278L7N2D2 1500009C09Rik-202ENSMUST00000143238 1552 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Gm3278L7N2D2 Eif2ak3-201ENSMUST00000034093 4513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Gm3278L7N2D2 Camkk2-201ENSMUST00000111668 4861 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Gm3278L7N2D2 Egr1-201ENSMUST00000064795 4484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
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Gm3278L7N2D2 Fmnl3-201ENSMUST00000081224 4137 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Gm3278L7N2D2 Gda-201ENSMUST00000087600 5428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Gm3278L7N2D2 Kpna4-203ENSMUST00000194558 3726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Gm3278L7N2D2 Scin-201ENSMUST00000002640 2995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Gm3278L7N2D2 C77080-201ENSMUST00000052602 5187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
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Gm3278L7N2D2 Rft1-201ENSMUST00000064230 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
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Gm3278L7N2D2 Nr0b2-201ENSMUST00000042706 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
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Gm3278L7N2D2 Fam173a-201ENSMUST00000072735 800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
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Gm3278L7N2D2 Vopp1-204ENSMUST00000145608 4590 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Gm3278L7N2D2 Zgpat-201ENSMUST00000029105 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Gm3278L7N2D2 Pef1-201ENSMUST00000030563 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Gm3278L7N2D2 Cyp4f14-202ENSMUST00000179434 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Gm3278L7N2D2 Cyp4f14-201ENSMUST00000054174 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Gm3278L7N2D2 Mios-201ENSMUST00000040017 3710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Gm3278L7N2D2 Acap3-202ENSMUST00000105584 4365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Gm3278L7N2D2 Gm26755-201ENSMUST00000180703 2657 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Gm3278L7N2D2 Rap2a-201ENSMUST00000062117 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Gm3278L7N2D2 Vcan-201ENSMUST00000109543 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Gm3278L7N2D2 Mindy1-212ENSMUST00000168223 1812 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
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Gm3278L7N2D2 Ewsr1-201ENSMUST00000063232 1320 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Gm3278L7N2D2 Ttll5-201ENSMUST00000040179 5081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Gm3278L7N2D2 4930448E22Rik-202ENSMUST00000215242 2102 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Gm3278L7N2D2 Kbtbd2-201ENSMUST00000114321 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Gm3278L7N2D2 Dek-201ENSMUST00000021807 2556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Gm3278L7N2D2 Ppih-203ENSMUST00000106318 800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Gm3278L7N2D2 Rpl28-ps3-201ENSMUST00000116058 393 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
Gm3278L7N2D2 Prss51-202ENSMUST00000165710 953 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Gm3278L7N2D2 Dnm3os-203ENSMUST00000185878 557 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Gm3278L7N2D2 Ggt5-203ENSMUST00000189972 648 ntTSL 3 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Gm3278L7N2D2 Rpl7a-ps10-201ENSMUST00000190579 798 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
Gm3278L7N2D2 9430085M18Rik-201ENSMUST00000198824 1178 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Gm3278L7N2D2 Msra-205ENSMUST00000210428 1180 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Gm3278L7N2D2 Rit1-201ENSMUST00000029692 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Gm3278L7N2D2 Mrap-201ENSMUST00000038197 1001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Gm3278L7N2D2 Bphl-201ENSMUST00000040656 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Gm3278L7N2D2 Rpl7a-ps3-201ENSMUST00000090170 796 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
Gm3278L7N2D2 Rpl7a-ps5-201ENSMUST00000095218 807 ntAPPRIS P1 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Gm3278L7N2D2 Ece2-204ENSMUST00000133344 3042 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Gm3278L7N2D2 App-201ENSMUST00000005406 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
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