Protein–RNA interactions for Protein: J3QPU5

Ccer2, Coiled-coil glutamate-rich protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 274 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccer2J3QPU5 Pcyox1l-201ENSMUST00000025472 2017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Ccer2J3QPU5 Ppp1r18-204ENSMUST00000144382 2536 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Ccer2J3QPU5 Hcrtr1-201ENSMUST00000030562 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Ccer2J3QPU5 Gtpbp3-201ENSMUST00000007754 2800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Ccer2J3QPU5 Arhgef40-220ENSMUST00000182909 5108 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.76■□□□□ 0.91
Ccer2J3QPU5 Cpne6-201ENSMUST00000074225 2201 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Ccer2J3QPU5 Tpbg-201ENSMUST00000006559 3603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Ccer2J3QPU5 Rad51-201ENSMUST00000028795 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Ccer2J3QPU5 Naa15-201ENSMUST00000029303 6090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Ccer2J3QPU5 Rgs3-204ENSMUST00000107420 2752 ntTSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Ccer2J3QPU5 Dse-201ENSMUST00000048010 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Ccer2J3QPU5 Ak1-201ENSMUST00000068271 2034 ntTSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Ccer2J3QPU5 Rhobtb1-210ENSMUST00000167384 2331 ntTSL 5 BASIC20.75■□□□□ 0.91
Ccer2J3QPU5 Gm5108-201ENSMUST00000177891 543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Ccer2J3QPU5 Gm28237-202ENSMUST00000189477 748 ntTSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Ccer2J3QPU5 Agrp-202ENSMUST00000194091 734 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.75■□□□□ 0.91
Ccer2J3QPU5 H2-Bl-209ENSMUST00000194244 862 ntTSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Ccer2J3QPU5 0610005C13Rik-201ENSMUST00000209416 856 ntTSL 5 BASIC20.75■□□□□ 0.91
Ccer2J3QPU5 Gm42196-201ENSMUST00000209618 730 ntTSL 5 BASIC20.75■□□□□ 0.91
Ccer2J3QPU5 Smdt1-201ENSMUST00000023086 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Ccer2J3QPU5 Dctn6-201ENSMUST00000033913 1249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Ccer2J3QPU5 Ythdf3-202ENSMUST00000108346 4929 ntTSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Ccer2J3QPU5 Dzip3-201ENSMUST00000114516 3331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Ccer2J3QPU5 L2hgdh-201ENSMUST00000021370 3340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Ccer2J3QPU5 Tor1aip1-201ENSMUST00000027738 1952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Ccer2J3QPU5 Fbxl16-201ENSMUST00000045692 3478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.75■□□□□ 0.91
Ccer2J3QPU5 Slc5a2-202ENSMUST00000118169 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Ccer2J3QPU5 Il2rb-202ENSMUST00000163494 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Ccer2J3QPU5 Nt5c3b-202ENSMUST00000092689 1344 ntTSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Ccer2J3QPU5 Paf1-201ENSMUST00000003529 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Ccer2J3QPU5 Tmem87b-201ENSMUST00000110325 4807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Ccer2J3QPU5 Tdrp-201ENSMUST00000062613 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Ccer2J3QPU5 AC115735.4-201ENSMUST00000227460 1944 ntBASIC20.74■□□□□ 0.91
Ccer2J3QPU5 Txnrd1-206ENSMUST00000219442 3531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.74■□□□□ 0.91
Ccer2J3QPU5 Ppp2r5e-205ENSMUST00000220035 3135 ntTSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Ccer2J3QPU5 Cep170-205ENSMUST00000192961 2708 ntTSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Ccer2J3QPU5 Syvn1-203ENSMUST00000134667 3159 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Ccer2J3QPU5 Keap1-205ENSMUST00000194542 3151 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Ccer2J3QPU5 Fam78b-206ENSMUST00000190081 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Ccer2J3QPU5 Ins2-205ENSMUST00000105933 552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Ccer2J3QPU5 Ins2-206ENSMUST00000105934 480 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.74■□□□□ 0.91
Ccer2J3QPU5 Crip3-202ENSMUST00000113465 1035 ntTSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Ccer2J3QPU5 Gm6566-201ENSMUST00000221468 1171 ntTSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Ccer2J3QPU5 Gpc5-201ENSMUST00000022707 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Ccer2J3QPU5 Polr2g-201ENSMUST00000096261 868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Ccer2J3QPU5 Syk-203ENSMUST00000120135 5363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Ccer2J3QPU5 Ehd4-201ENSMUST00000028755 3730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Ccer2J3QPU5 Dyrk3-201ENSMUST00000016670 3164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Ccer2J3QPU5 Gas2l3-207ENSMUST00000220128 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Ccer2J3QPU5 Syt10-201ENSMUST00000029441 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Ccer2J3QPU5 Psmd8-202ENSMUST00000182328 1391 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Ccer2J3QPU5 Gm10605-202ENSMUST00000183019 3198 ntBASIC20.73■□□□□ 0.91
Ccer2J3QPU5 Kcnj8-202ENSMUST00000203945 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Ccer2J3QPU5 Ccnh-204ENSMUST00000164127 1718 ntTSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Ccer2J3QPU5 Gata4-202ENSMUST00000118022 3374 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Ccer2J3QPU5 Procr-201ENSMUST00000029140 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Ccer2J3QPU5 Ifnar2-202ENSMUST00000089042 2580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Ccer2J3QPU5 Sirt5-207ENSMUST00000221515 1793 ntTSL 5 BASIC20.73■□□□□ 0.91
Ccer2J3QPU5 Trbc1-201ENSMUST00000103291 512 ntAPPRIS P1 BASIC20.73■□□□□ 0.91
Ccer2J3QPU5 Trbc2-201ENSMUST00000103299 692 ntAPPRIS P1 BASIC20.73■□□□□ 0.91
Ccer2J3QPU5 Ngb-202ENSMUST00000110176 908 ntTSL 3 BASIC20.73■□□□□ 0.91
Ccer2J3QPU5 Rpl36al-203ENSMUST00000110620 757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.73■□□□□ 0.91
Ccer2J3QPU5 AC158982.1-201ENSMUST00000228377 901 ntBASIC20.73■□□□□ 0.91
Ccer2J3QPU5 Mlf1-202ENSMUST00000077916 1114 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Ccer2J3QPU5 Ftl1-201ENSMUST00000094434 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Ccer2J3QPU5 Plekha1-201ENSMUST00000048180 3321 ntTSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Ccer2J3QPU5 Pdlim3-201ENSMUST00000034053 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Ccer2J3QPU5 Snx19-201ENSMUST00000164099 5762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Ccer2J3QPU5 Ldoc1-201ENSMUST00000075983 1459 ntAPPRIS P1 BASIC20.73■□□□□ 0.91
Ccer2J3QPU5 Morn1-201ENSMUST00000030915 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Ccer2J3QPU5 Zbtb7b-204ENSMUST00000107435 4333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Ccer2J3QPU5 Gm38058-201ENSMUST00000194323 4368 ntBASIC20.73■□□□□ 0.91
Ccer2J3QPU5 Pex5-201ENSMUST00000035861 3139 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Ccer2J3QPU5 Cdkl3-201ENSMUST00000063303 2765 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Ccer2J3QPU5 Smpd1-201ENSMUST00000046983 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Ccer2J3QPU5 Tppp3-203ENSMUST00000177126 1396 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.72■□□□□ 0.91
Ccer2J3QPU5 Chtf18-201ENSMUST00000048054 3214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Ccer2J3QPU5 Kif26a-201ENSMUST00000128402 6918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Ccer2J3QPU5 Zfp865-201ENSMUST00000076251 7503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Ccer2J3QPU5 Plekha1-202ENSMUST00000075181 2301 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Ccer2J3QPU5 Alk-201ENSMUST00000086639 4866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Ccer2J3QPU5 6430548M08Rik-201ENSMUST00000034281 5564 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Ccer2J3QPU5 Gm4204-201ENSMUST00000110798 1231 ntBASIC20.72■□□□□ 0.91
Ccer2J3QPU5 Gm15393-201ENSMUST00000120499 219 ntBASIC20.72■□□□□ 0.91
Ccer2J3QPU5 Zfp612-202ENSMUST00000212754 4863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Ccer2J3QPU5 Camk2d-204ENSMUST00000106400 2722 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Ccer2J3QPU5 Glis1-202ENSMUST00000106738 2744 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.72■□□□□ 0.91
Ccer2J3QPU5 Sesn3-207ENSMUST00000209187 1700 ntTSL 5 BASIC20.72■□□□□ 0.91
Ccer2J3QPU5 Prdm4-207ENSMUST00000220032 3962 ntTSL 5 BASIC20.72■□□□□ 0.91
Ccer2J3QPU5 9130008F23Rik-201ENSMUST00000068258 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Ccer2J3QPU5 Acp5-201ENSMUST00000069330 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Ccer2J3QPU5 Slc6a8-203ENSMUST00000114465 3314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
Ccer2J3QPU5 Npas3-204ENSMUST00000223358 3143 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
Ccer2J3QPU5 Klc1-203ENSMUST00000120544 2261 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.71■□□□□ 0.91
Ccer2J3QPU5 Gm20465-201ENSMUST00000174768 1932 ntTSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
Ccer2J3QPU5 Fam53b-204ENSMUST00000106165 1232 ntTSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
Ccer2J3QPU5 Gm15440-201ENSMUST00000110042 1231 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.71■□□□□ 0.91
Ccer2J3QPU5 Gm39228-201ENSMUST00000212456 301 ntTSL 5 BASIC20.71■□□□□ 0.91
Ccer2J3QPU5 Gm18027-201ENSMUST00000218947 619 ntBASIC20.71■□□□□ 0.91
Ccer2J3QPU5 AC238811.1-201ENSMUST00000225302 441 ntBASIC20.71■□□□□ 0.91
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.6 ms