Protein–RNA interactions for Protein: J3QP53

Gm5294, Predicted gene 5294, mousemouse

Predictions only

Length 216 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm5294J3QP53 Dmrtc2-201ENSMUST00000011493 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Gm5294J3QP53 Gm6756-201ENSMUST00000180647 1620 ntBASIC11.17□□□□□ -0.62
Gm5294J3QP53 BC026585-201ENSMUST00000046743 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Gm5294J3QP53 Pth2r-201ENSMUST00000027083 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Gm5294J3QP53 Nfatc4-204ENSMUST00000226357 2680 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.17□□□□□ -0.62
Gm5294J3QP53 Tex13b-201ENSMUST00000044179 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Gm5294J3QP53 Atp2a2-202ENSMUST00000177974 3984 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Gm5294J3QP53 Ccdc157-201ENSMUST00000093381 5015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Gm5294J3QP53 Olfr1411-202ENSMUST00000190844 1821 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.17□□□□□ -0.62
Gm5294J3QP53 Wdr13-205ENSMUST00000130832 4374 ntTSL 5 BASIC11.17□□□□□ -0.62
Gm5294J3QP53 Ankrd24-201ENSMUST00000119336 3561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.17□□□□□ -0.62
Gm5294J3QP53 Chchd7-205ENSMUST00000120732 711 ntTSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Gm5294J3QP53 Cdkn1a-203ENSMUST00000122348 857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Gm5294J3QP53 Mir1895-201ENSMUST00000122615 79 ntBASIC11.17□□□□□ -0.62
Gm5294J3QP53 Banf1-202ENSMUST00000170010 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Gm5294J3QP53 Rpsa-ps1-201ENSMUST00000191040 886 ntBASIC11.17□□□□□ -0.62
Gm5294J3QP53 Gm43332-201ENSMUST00000202511 1044 ntBASIC11.17□□□□□ -0.62
Gm5294J3QP53 AW822252-206ENSMUST00000208904 237 ntBASIC11.17□□□□□ -0.62
Gm5294J3QP53 Gm15500-202ENSMUST00000071641 1019 ntBASIC11.17□□□□□ -0.62
Gm5294J3QP53 Gm10073-201ENSMUST00000073722 496 ntAPPRIS P1 BASIC11.17□□□□□ -0.62
Gm5294J3QP53 Rplp1-201ENSMUST00000008036 499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Gm5294J3QP53 Ifnl2-201ENSMUST00000081684 702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Gm5294J3QP53 G430095P16Rik-201ENSMUST00000098571 721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Gm5294J3QP53 Crxos-201ENSMUST00000098801 934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Gm5294J3QP53 Gm15850-201ENSMUST00000134998 2049 ntTSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Gm5294J3QP53 F11r-201ENSMUST00000043839 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Gm5294J3QP53 Eif4g3-215ENSMUST00000203828 5289 ntTSL 5 BASIC11.17□□□□□ -0.62
Gm5294J3QP53 Dym-201ENSMUST00000039608 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Gm5294J3QP53 Fbxo8-202ENSMUST00000110322 1709 ntTSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Gm5294J3QP53 Galnt17-201ENSMUST00000086023 8040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Gm5294J3QP53 Clcnka-201ENSMUST00000042617 2428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Gm5294J3QP53 Abi2-201ENSMUST00000052332 5768 ntTSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Gm5294J3QP53 Ispd-202ENSMUST00000220519 3122 ntTSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Gm5294J3QP53 Eomes-201ENSMUST00000035020 3560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Gm5294J3QP53 Prok2-202ENSMUST00000032152 1423 ntTSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Gm5294J3QP53 Cald1-201ENSMUST00000031775 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.17□□□□□ -0.62
Gm5294J3QP53 Dnm1-217ENSMUST00000202578 2820 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.17□□□□□ -0.62
Gm5294J3QP53 Gm4981-201ENSMUST00000099726 1854 ntAPPRIS P1 BASIC11.17□□□□□ -0.62
Gm5294J3QP53 Thap12-201ENSMUST00000033009 3723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Gm5294J3QP53 Cers5-202ENSMUST00000109035 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Gm5294J3QP53 Phtf2-201ENSMUST00000118174 4840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Gm5294J3QP53 Tpm1-202ENSMUST00000034928 1824 ntTSL 5 BASIC11.16□□□□□ -0.62
Gm5294J3QP53 Srp72-202ENSMUST00000120550 2297 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.16□□□□□ -0.62
Gm5294J3QP53 Anks1b-205ENSMUST00000179694 2663 ntTSL 5 BASIC11.16□□□□□ -0.62
Gm5294J3QP53 Pgd-201ENSMUST00000084124 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Gm5294J3QP53 Six1-201ENSMUST00000050029 3316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Gm5294J3QP53 Gm42466-201ENSMUST00000202099 1301 ntBASIC11.16□□□□□ -0.62
Gm5294J3QP53 Cdk2-202ENSMUST00000026416 2406 ntTSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Gm5294J3QP53 Srsf10-202ENSMUST00000097844 3055 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC11.16□□□□□ -0.62
Gm5294J3QP53 Osr2-201ENSMUST00000022952 1724 ntTSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Gm5294J3QP53 Btbd10-201ENSMUST00000047091 2581 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Gm5294J3QP53 Tsn-201ENSMUST00000027623 7063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Gm5294J3QP53 Cenpl-203ENSMUST00000111620 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Gm5294J3QP53 Asphd1-202ENSMUST00000106339 518 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Gm5294J3QP53 Mmab-202ENSMUST00000112245 644 ntTSL 3 BASIC11.16□□□□□ -0.62
Gm5294J3QP53 Acyp1-203ENSMUST00000117138 735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.16□□□□□ -0.62
Gm5294J3QP53 Gm12882-201ENSMUST00000121696 517 ntBASIC11.16□□□□□ -0.62
Gm5294J3QP53 Dph3-205ENSMUST00000124303 809 ntTSL 2 BASIC11.16□□□□□ -0.62
Gm5294J3QP53 Serpinf1-202ENSMUST00000125982 605 ntTSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Gm5294J3QP53 Gm11535-201ENSMUST00000145517 778 ntTSL 3 BASIC11.16□□□□□ -0.62
Gm5294J3QP53 2810408I11Rik-202ENSMUST00000150749 711 ntTSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Gm5294J3QP53 Gm27525-201ENSMUST00000184465 107 ntBASIC11.16□□□□□ -0.62
Gm5294J3QP53 Gm27494-201ENSMUST00000184735 189 ntBASIC11.16□□□□□ -0.62
Gm5294J3QP53 Cfap99-201ENSMUST00000207754 2123 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.16□□□□□ -0.62
Gm5294J3QP53 AC166341.4-201ENSMUST00000220625 123 ntBASIC11.16□□□□□ -0.62
Gm5294J3QP53 Smim8-201ENSMUST00000029972 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Gm5294J3QP53 Mt3-201ENSMUST00000034211 536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Gm5294J3QP53 1700018B24Rik-201ENSMUST00000036023 593 ntTSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Gm5294J3QP53 Guca2b-201ENSMUST00000044426 605 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Gm5294J3QP53 Tmod4-201ENSMUST00000005769 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Gm5294J3QP53 2410018L13Rik-205ENSMUST00000149246 3370 ntTSL 2 BASIC11.16□□□□□ -0.62
Gm5294J3QP53 Zpbp2-201ENSMUST00000017339 1455 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Gm5294J3QP53 Arl11-201ENSMUST00000055159 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Gm5294J3QP53 Gnb4-201ENSMUST00000108234 2510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Gm5294J3QP53 Gm12503-201ENSMUST00000146576 3127 ntTSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Gm5294J3QP53 Gnpda2-201ENSMUST00000031117 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Gm5294J3QP53 E2f3-203ENSMUST00000221536 4597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Gm5294J3QP53 E2f3-204ENSMUST00000222730 4579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Gm5294J3QP53 P4ha2-215ENSMUST00000174616 2094 ntTSL 5 BASIC11.16□□□□□ -0.62
Gm5294J3QP53 Fbxo46-202ENSMUST00000165913 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Gm5294J3QP53 Rab3a-204ENSMUST00000110093 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Gm5294J3QP53 Gm2109-201ENSMUST00000189326 1409 ntTSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Gm5294J3QP53 Lysmd3-202ENSMUST00000224300 4250 ntAPPRIS P1 BASIC11.16□□□□□ -0.62
Gm5294J3QP53 Pear1-205ENSMUST00000172621 4490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Gm5294J3QP53 2810006K23Rik-202ENSMUST00000111477 1637 ntTSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Gm5294J3QP53 Hnrnpa2b1-204ENSMUST00000203220 1638 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Gm5294J3QP53 Cdca5-201ENSMUST00000025704 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Gm5294J3QP53 Kctd14-205ENSMUST00000206279 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.16□□□□□ -0.62
Gm5294J3QP53 Qsox1-207ENSMUST00000194632 2433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Gm5294J3QP53 Scarf1-202ENSMUST00000118243 2617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Gm5294J3QP53 Slc25a21-201ENSMUST00000044634 2609 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Gm5294J3QP53 Farp2-202ENSMUST00000122402 2816 ntTSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Gm5294J3QP53 Mon1a-202ENSMUST00000191906 2821 ntTSL 2 BASIC11.16□□□□□ -0.62
Gm5294J3QP53 Drd5-201ENSMUST00000041646 3152 ntAPPRIS P1 BASIC11.16□□□□□ -0.62
Gm5294J3QP53 Tmem30b-201ENSMUST00000042975 2991 ntAPPRIS P1 BASIC11.16□□□□□ -0.62
Gm5294J3QP53 Asah1-201ENSMUST00000034000 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Gm5294J3QP53 Hadh-201ENSMUST00000029610 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Gm5294J3QP53 Tbc1d10c-201ENSMUST00000045864 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Gm5294J3QP53 Cplx2-201ENSMUST00000026985 4928 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.16□□□□□ -0.62
Gm5294J3QP53 Chd4-203ENSMUST00000112392 6652 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.16□□□□□ -0.62
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.5 ms