Protein–RNA interactions for Protein: J3QMS8

Gm3415, Predicted gene 3415, mousemouse

Predictions only

Length 315 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm3415J3QMS8 1700128F08Rik-202ENSMUST00000213708 717 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Gm3415J3QMS8 1700018B24Rik-201ENSMUST00000036023 593 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Gm3415J3QMS8 Prdm5-203ENSMUST00000081219 984 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Gm3415J3QMS8 Hdac8-201ENSMUST00000087916 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Gm3415J3QMS8 Gatm-201ENSMUST00000028624 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Gm3415J3QMS8 Zbed4-201ENSMUST00000041297 5425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Gm3415J3QMS8 Mfsd6-201ENSMUST00000087701 3493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Gm3415J3QMS8 Adgrb2-202ENSMUST00000097868 4635 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Gm3415J3QMS8 Ints3-203ENSMUST00000196530 3778 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Gm3415J3QMS8 Spns1-202ENSMUST00000119754 2001 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Gm3415J3QMS8 Map3k5-202ENSMUST00000120259 4289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Gm3415J3QMS8 Slc25a47-201ENSMUST00000057026 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Gm3415J3QMS8 Rnf180-203ENSMUST00000224662 2734 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Gm3415J3QMS8 Zscan22-204ENSMUST00000120809 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Gm3415J3QMS8 Clptm1-201ENSMUST00000055242 4143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Gm3415J3QMS8 Gm17315-201ENSMUST00000181408 2504 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Gm3415J3QMS8 Prkg1-206ENSMUST00000182685 1628 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Gm3415J3QMS8 Mapk8-201ENSMUST00000022504 2587 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Gm3415J3QMS8 Catip-204ENSMUST00000191010 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Gm3415J3QMS8 Zfp553-202ENSMUST00000106312 3342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Gm3415J3QMS8 Cc2d1b-201ENSMUST00000030320 3303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Gm3415J3QMS8 Tbc1d4-210ENSMUST00000162617 4762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Gm3415J3QMS8 Gata1-201ENSMUST00000033502 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Gm3415J3QMS8 AU040320-201ENSMUST00000047431 4384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Gm3415J3QMS8 Ddhd1-203ENSMUST00000111828 9802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Gm3415J3QMS8 Slc33a1-202ENSMUST00000160883 1978 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Gm3415J3QMS8 Synm-204ENSMUST00000208231 4457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Gm3415J3QMS8 Dmtn-202ENSMUST00000022695 4080 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Gm3415J3QMS8 Romo1-203ENSMUST00000109598 362 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Gm3415J3QMS8 Acvr1c-203ENSMUST00000112607 1266 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Gm3415J3QMS8 Nfya-203ENSMUST00000159063 1255 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Gm3415J3QMS8 Gm44081-201ENSMUST00000204406 643 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Gm3415J3QMS8 Rxfp4-201ENSMUST00000063119 1245 ntAPPRIS P1 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Gm3415J3QMS8 Kcnip1-202ENSMUST00000101368 2322 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Gm3415J3QMS8 Brd7-201ENSMUST00000034085 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Gm3415J3QMS8 Npas3-204ENSMUST00000223358 3143 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Gm3415J3QMS8 Tsc22d3-203ENSMUST00000112996 1552 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Gm3415J3QMS8 Elk4-201ENSMUST00000027696 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Gm3415J3QMS8 Tmem37-201ENSMUST00000056089 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Gm3415J3QMS8 Pde4dip-201ENSMUST00000045243 6185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Gm3415J3QMS8 Ppp2r5b-201ENSMUST00000025695 2742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Gm3415J3QMS8 Tmbim6-201ENSMUST00000023749 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Gm3415J3QMS8 Kcnc2-201ENSMUST00000092175 5046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Gm3415J3QMS8 Gm11946-201ENSMUST00000123459 3941 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Gm3415J3QMS8 2810408A11Rik-202ENSMUST00000100969 1437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Gm3415J3QMS8 Zpbp2-201ENSMUST00000017339 1455 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Gm3415J3QMS8 Tbk1-201ENSMUST00000020316 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Gm3415J3QMS8 Rapgef6-205ENSMUST00000108895 1829 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Gm3415J3QMS8 1700010B13Rik-202ENSMUST00000189435 1549 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Gm3415J3QMS8 Gm10110-201ENSMUST00000081204 1891 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Gm3415J3QMS8 Rnf217-201ENSMUST00000081989 11013 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Gm3415J3QMS8 Usp51-201ENSMUST00000095755 2204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Gm3415J3QMS8 Abhd11-202ENSMUST00000111216 972 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Gm3415J3QMS8 Gm11505-201ENSMUST00000130442 737 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Gm3415J3QMS8 Ccnh-202ENSMUST00000163600 1055 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Gm3415J3QMS8 Tmem217-202ENSMUST00000168339 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Gm3415J3QMS8 Hsf4-207ENSMUST00000174837 1251 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Gm3415J3QMS8 Gm24158-201ENSMUST00000175263 71 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Gm3415J3QMS8 Cyb561d2-205ENSMUST00000195235 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Gm3415J3QMS8 Gm5312-201ENSMUST00000203728 547 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Gm3415J3QMS8 Gm32351-201ENSMUST00000220503 438 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Gm3415J3QMS8 Cntfr-204ENSMUST00000102962 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Gm3415J3QMS8 Sf3a1-201ENSMUST00000002198 4920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Gm3415J3QMS8 Canx-205ENSMUST00000179865 4281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Gm3415J3QMS8 Disc1-207ENSMUST00000121953 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Gm3415J3QMS8 Pde7b-205ENSMUST00000169404 1697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Gm3415J3QMS8 Fndc7-201ENSMUST00000053065 3009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Gm3415J3QMS8 Pard3-202ENSMUST00000079777 3394 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Gm3415J3QMS8 Klhl26-202ENSMUST00000166976 2734 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Gm3415J3QMS8 Ubap1l-201ENSMUST00000147185 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Gm3415J3QMS8 Atp2a3-201ENSMUST00000021142 4593 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Gm3415J3QMS8 Raver1-202ENSMUST00000217282 4234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Gm3415J3QMS8 Fam172a-203ENSMUST00000163257 1436 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Gm3415J3QMS8 Pccb-204ENSMUST00000149322 2188 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Gm3415J3QMS8 Dbn1-203ENSMUST00000109923 2940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Gm3415J3QMS8 Glyr1-202ENSMUST00000115844 3348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Gm3415J3QMS8 Glyr1-201ENSMUST00000023189 3330 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Gm3415J3QMS8 Wdtc1-202ENSMUST00000105906 4057 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.05
Gm3415J3QMS8 Pard6b-201ENSMUST00000052125 3399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Gm3415J3QMS8 Mbtd1-202ENSMUST00000063718 3785 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Gm3415J3QMS8 AI467606-201ENSMUST00000056288 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Gm3415J3QMS8 Padi4-201ENSMUST00000026381 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Gm3415J3QMS8 Kif21b-201ENSMUST00000075164 9115 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Gm3415J3QMS8 Eomes-201ENSMUST00000035020 3560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Gm3415J3QMS8 Etfrf1-204ENSMUST00000111723 842 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Gm3415J3QMS8 Hoxa7-202ENSMUST00000134367 807 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Gm3415J3QMS8 Runx2os2-201ENSMUST00000161664 818 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Gm3415J3QMS8 Gm37230-201ENSMUST00000194491 818 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
Gm3415J3QMS8 5830408C22Rik-201ENSMUST00000210072 1115 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Gm3415J3QMS8 Cd3g-201ENSMUST00000002101 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Gm3415J3QMS8 Rgs10-201ENSMUST00000033133 880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Gm3415J3QMS8 Gm8396-201ENSMUST00000057361 823 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
Gm3415J3QMS8 Pcna-ps2-201ENSMUST00000088040 1257 ntAPPRIS P1 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Gm3415J3QMS8 G430095P16Rik-201ENSMUST00000098571 721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Gm3415J3QMS8 9330182L06Rik-202ENSMUST00000115348 3403 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Gm3415J3QMS8 Selenon-201ENSMUST00000060435 3445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Gm3415J3QMS8 Pars2-201ENSMUST00000058905 2191 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Gm3415J3QMS8 Pde4dip-202ENSMUST00000090750 8376 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Gm3415J3QMS8 Nt5e-201ENSMUST00000034992 3995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Gm3415J3QMS8 Ppp2r5e-205ENSMUST00000220035 3135 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.2 ms