Protein–RNA interactions for Protein: G5E861

Sclt1, Sodium channel and clathrin linker 1, mousemouse

Predictions only

Length 688 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sclt1G5E861 Tmem30b-201ENSMUST00000042975 2991 ntAPPRIS P1 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Sclt1G5E861 Ano7-201ENSMUST00000058682 2963 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Sclt1G5E861 Ptcd2-201ENSMUST00000022153 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Sclt1G5E861 Lpcat1-208ENSMUST00000223060 2141 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Sclt1G5E861 Creg2-201ENSMUST00000053355 6091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Sclt1G5E861 Tmem254c-202ENSMUST00000100819 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Sclt1G5E861 Saa1-201ENSMUST00000128088 609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Sclt1G5E861 Pcp2-204ENSMUST00000136105 504 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Sclt1G5E861 Gm31545-201ENSMUST00000209358 1219 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Sclt1G5E861 Pts-206ENSMUST00000214873 511 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Sclt1G5E861 BC031181-201ENSMUST00000040284 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Sclt1G5E861 Pmf1-201ENSMUST00000056370 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Sclt1G5E861 Fmr1nb-201ENSMUST00000069731 799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Sclt1G5E861 2700080J24Rik-201ENSMUST00000205314 1662 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Sclt1G5E861 Atp2b3-202ENSMUST00000088429 4483 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Sclt1G5E861 Elf4-202ENSMUST00000114958 6088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Sclt1G5E861 Trim24-203ENSMUST00000120428 3940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Sclt1G5E861 1700029J07Rik-201ENSMUST00000095323 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Sclt1G5E861 E2f3-203ENSMUST00000221536 4597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Sclt1G5E861 E2f3-204ENSMUST00000222730 4579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Sclt1G5E861 Plch2-210ENSMUST00000176194 5619 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Sclt1G5E861 Riox2-201ENSMUST00000023407 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Sclt1G5E861 Zdhhc25-201ENSMUST00000066949 1368 ntAPPRIS P1 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Sclt1G5E861 Ctu2-201ENSMUST00000116412 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Sclt1G5E861 Fbxo25-201ENSMUST00000043520 2012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Sclt1G5E861 Arhgef5-201ENSMUST00000031750 5469 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.06
Sclt1G5E861 Plekhn1-201ENSMUST00000105569 3014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Sclt1G5E861 Sem1-201ENSMUST00000041111 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Sclt1G5E861 Zbed4-201ENSMUST00000041297 5425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Sclt1G5E861 Cluh-202ENSMUST00000117818 4284 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Sclt1G5E861 Cyp20a1-201ENSMUST00000060608 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Sclt1G5E861 Gm11611-201ENSMUST00000134289 1326 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Sclt1G5E861 Mbl1-202ENSMUST00000225792 1563 ntAPPRIS P1 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Sclt1G5E861 Fam76a-201ENSMUST00000030696 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Sclt1G5E861 Dpp7-201ENSMUST00000028332 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Sclt1G5E861 C920006O11Rik-201ENSMUST00000180974 1444 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Sclt1G5E861 Loxl1-201ENSMUST00000061799 3297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Sclt1G5E861 Slc7a7-206ENSMUST00000197440 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Sclt1G5E861 Dgke-201ENSMUST00000000285 5208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Sclt1G5E861 Tc2n-203ENSMUST00000160830 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Sclt1G5E861 Rnase10-202ENSMUST00000164632 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Sclt1G5E861 Ighv4-1-201ENSMUST00000103464 414 ntAPPRIS P1 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Sclt1G5E861 Prmt7-203ENSMUST00000109297 1094 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Sclt1G5E861 Gm12892-201ENSMUST00000117367 1146 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Sclt1G5E861 Gm15467-201ENSMUST00000120582 445 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Sclt1G5E861 Gm45098-201ENSMUST00000207179 657 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Sclt1G5E861 CT025555.1-201ENSMUST00000225901 1217 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Sclt1G5E861 Tamm41-201ENSMUST00000032461 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Sclt1G5E861 Olfr520-201ENSMUST00000098264 951 ntAPPRIS P1 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Sclt1G5E861 Tap2-201ENSMUST00000025197 3442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Sclt1G5E861 Cgn-201ENSMUST00000107272 4963 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Sclt1G5E861 Eif5-201ENSMUST00000050993 1969 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Sclt1G5E861 Atp4b-201ENSMUST00000033826 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Sclt1G5E861 Miip-201ENSMUST00000030886 1813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Sclt1G5E861 Mtss1-201ENSMUST00000080371 4938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Sclt1G5E861 Tnn-201ENSMUST00000039178 5817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Sclt1G5E861 Smg9-201ENSMUST00000002280 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Sclt1G5E861 Arhgef40-201ENSMUST00000093813 5621 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Sclt1G5E861 Kcng1-201ENSMUST00000099069 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Sclt1G5E861 Hnrnpa2b1-204ENSMUST00000203220 1638 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Sclt1G5E861 Tmc8-202ENSMUST00000106334 2644 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Sclt1G5E861 Sesn1-201ENSMUST00000041438 2600 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Sclt1G5E861 Lysmd3-202ENSMUST00000224300 4250 ntAPPRIS P1 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Sclt1G5E861 Slc17a9-201ENSMUST00000094218 2275 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Sclt1G5E861 Siva1-202ENSMUST00000109755 333 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Sclt1G5E861 Gm15427-201ENSMUST00000117288 531 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Sclt1G5E861 Rpl18-ps1-201ENSMUST00000121555 525 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Sclt1G5E861 Fam241b-208ENSMUST00000142796 1135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Sclt1G5E861 9130024F11Rik-204ENSMUST00000187927 517 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Sclt1G5E861 Gm37230-201ENSMUST00000194491 818 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Sclt1G5E861 Cldn25-ps-201ENSMUST00000197641 693 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Sclt1G5E861 Msrb2-201ENSMUST00000023856 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Sclt1G5E861 Fgfr1op2-201ENSMUST00000037836 687 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Sclt1G5E861 Nutf2-201ENSMUST00000008594 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Sclt1G5E861 Pik3ip1-202ENSMUST00000093399 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Sclt1G5E861 Trp53bp2-201ENSMUST00000117245 4361 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Sclt1G5E861 Lancl1-202ENSMUST00000113979 4461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Sclt1G5E861 Ascc3-201ENSMUST00000035606 7760 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Sclt1G5E861 Celf4-203ENSMUST00000223704 2492 ntAPPRIS ALT1 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Sclt1G5E861 Ptbp3-205ENSMUST00000148331 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Sclt1G5E861 B3gnt8-201ENSMUST00000076034 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Sclt1G5E861 5033426O07Rik-202ENSMUST00000212635 2110 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Sclt1G5E861 Slc25a47-201ENSMUST00000057026 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Sclt1G5E861 Eaf1-201ENSMUST00000022446 4918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Sclt1G5E861 Srsf10-204ENSMUST00000105853 3058 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Sclt1G5E861 Apaf1-201ENSMUST00000020157 6577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Sclt1G5E861 Sh2b3-202ENSMUST00000086310 4195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Sclt1G5E861 Pla2g10-201ENSMUST00000023364 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Sclt1G5E861 Knop1-204ENSMUST00000106550 5524 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Sclt1G5E861 Kdm2b-201ENSMUST00000031435 3532 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Sclt1G5E861 Tbx3-201ENSMUST00000018748 4856 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Sclt1G5E861 Eif2b2-201ENSMUST00000004910 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Sclt1G5E861 Olfr1411-202ENSMUST00000190844 1821 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Sclt1G5E861 Prrc2a-206ENSMUST00000174805 6741 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Sclt1G5E861 Kctd14-201ENSMUST00000050732 2343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Sclt1G5E861 Slc38a1-201ENSMUST00000088452 7266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Sclt1G5E861 Mtif2-202ENSMUST00000093239 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Sclt1G5E861 Rps13-ps4-201ENSMUST00000117927 456 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Sclt1G5E861 Rps13-ps5-201ENSMUST00000117939 456 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Sclt1G5E861 Gm15483-201ENSMUST00000120338 456 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.2 ms