Protein–RNA interactions for Protein: G3X9U3

Vmn1r58, Vomeronasal type-1 receptor, mousemouse

Predictions only

Length 310 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vmn1r58G3X9U3 Vwc2-202ENSMUST00000109681 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Vmn1r58G3X9U3 Hoxa7-201ENSMUST00000048715 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Vmn1r58G3X9U3 Dpysl4-202ENSMUST00000121184 2727 ntTSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Vmn1r58G3X9U3 Spock3-202ENSMUST00000117377 3066 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Vmn1r58G3X9U3 Mmp2-201ENSMUST00000034187 3078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Vmn1r58G3X9U3 Gm996-204ENSMUST00000191602 4812 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.79□□□□□ -0.36
Vmn1r58G3X9U3 Tmem131l-202ENSMUST00000191758 5555 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Vmn1r58G3X9U3 Gm26847-201ENSMUST00000180407 2109 ntTSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Vmn1r58G3X9U3 Hspa4-201ENSMUST00000020630 4618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Vmn1r58G3X9U3 Cadm2-202ENSMUST00000120594 3248 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.79□□□□□ -0.36
Vmn1r58G3X9U3 Mmp14-206ENSMUST00000225641 3238 ntBASIC12.79□□□□□ -0.36
Vmn1r58G3X9U3 Cyb5r1-201ENSMUST00000027726 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Vmn1r58G3X9U3 Rph3a-203ENSMUST00000202326 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Vmn1r58G3X9U3 Clgn-202ENSMUST00000109831 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Vmn1r58G3X9U3 Senp5-201ENSMUST00000023457 3498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Vmn1r58G3X9U3 Ankrd13c-201ENSMUST00000040787 3903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.78□□□□□ -0.36
Vmn1r58G3X9U3 Ssh1-204ENSMUST00000159592 8436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Vmn1r58G3X9U3 Lag3-201ENSMUST00000032217 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Vmn1r58G3X9U3 Nptn-201ENSMUST00000085651 2024 ntTSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Vmn1r58G3X9U3 1700020A23Rik-202ENSMUST00000110281 521 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.78□□□□□ -0.36
Vmn1r58G3X9U3 Fam3a-203ENSMUST00000114139 931 ntTSL 5 BASIC12.78□□□□□ -0.36
Vmn1r58G3X9U3 Hnrnpa1l2-ps-201ENSMUST00000129154 964 ntBASIC12.78□□□□□ -0.36
Vmn1r58G3X9U3 Gm11767-201ENSMUST00000129379 493 ntTSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Vmn1r58G3X9U3 Vdac2-209ENSMUST00000173456 956 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.78□□□□□ -0.36
Vmn1r58G3X9U3 Dtnb-223ENSMUST00000174547 2112 ntTSL 5 BASIC12.78□□□□□ -0.36
Vmn1r58G3X9U3 Gm21887-203ENSMUST00000180251 531 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC12.78□□□□□ -0.36
Vmn1r58G3X9U3 4930445N18Rik-202ENSMUST00000181345 1033 ntTSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Vmn1r58G3X9U3 2010010A06Rik-202ENSMUST00000186356 694 ntTSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Vmn1r58G3X9U3 Cald1-201ENSMUST00000031775 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.78□□□□□ -0.36
Vmn1r58G3X9U3 Src-202ENSMUST00000092576 3887 ntTSL 5 BASIC12.78□□□□□ -0.36
Vmn1r58G3X9U3 Pdia2-201ENSMUST00000039113 1721 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Vmn1r58G3X9U3 Irgc1-201ENSMUST00000080594 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Vmn1r58G3X9U3 Nfkb1-206ENSMUST00000164430 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Vmn1r58G3X9U3 Pcnx3-201ENSMUST00000068169 5276 ntTSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Vmn1r58G3X9U3 Rab37-201ENSMUST00000021076 2210 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Vmn1r58G3X9U3 B930092H01Rik-201ENSMUST00000213377 2678 ntTSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Vmn1r58G3X9U3 Fam219a-202ENSMUST00000108050 3321 ntTSL 5 BASIC12.78□□□□□ -0.36
Vmn1r58G3X9U3 Cbln3-202ENSMUST00000172378 1438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Vmn1r58G3X9U3 Map2k7-211ENSMUST00000145165 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Vmn1r58G3X9U3 Kifc3-202ENSMUST00000169353 2898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Vmn1r58G3X9U3 Ncdn-202ENSMUST00000106116 2434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Vmn1r58G3X9U3 Fmnl2-205ENSMUST00000155586 3939 ntTSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Vmn1r58G3X9U3 Mfge8-202ENSMUST00000107409 2008 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Vmn1r58G3X9U3 Krt23-201ENSMUST00000006969 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.36
Vmn1r58G3X9U3 Mbp-205ENSMUST00000091789 4797 ntTSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.36
Vmn1r58G3X9U3 3830417A13Rik-201ENSMUST00000033522 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.36
Vmn1r58G3X9U3 Dpp6-201ENSMUST00000071500 3826 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.36
Vmn1r58G3X9U3 Atp13a2-203ENSMUST00000127833 3882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.36
Vmn1r58G3X9U3 Tgfb1i1-207ENSMUST00000167965 1746 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.36
Vmn1r58G3X9U3 Scarb2-201ENSMUST00000031377 4698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.36
Vmn1r58G3X9U3 Gm4081-201ENSMUST00000195287 1838 ntBASIC12.77□□□□□ -0.37
Vmn1r58G3X9U3 Gm32591-204ENSMUST00000208679 1806 ntTSL 5 BASIC12.77□□□□□ -0.37
Vmn1r58G3X9U3 Adam22-207ENSMUST00000115388 9161 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.77□□□□□ -0.37
Vmn1r58G3X9U3 Rbpjl-201ENSMUST00000017151 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Vmn1r58G3X9U3 Ptger3-201ENSMUST00000041175 3148 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Vmn1r58G3X9U3 Tfe3-202ENSMUST00000079542 3163 ntTSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Vmn1r58G3X9U3 Gm12536-201ENSMUST00000129102 358 ntTSL 2 BASIC12.77□□□□□ -0.37
Vmn1r58G3X9U3 Gm4535-201ENSMUST00000182274 558 ntBASIC12.77□□□□□ -0.37
Vmn1r58G3X9U3 Gm6376-201ENSMUST00000209407 580 ntBASIC12.77□□□□□ -0.37
Vmn1r58G3X9U3 5830454E08Rik-202ENSMUST00000213974 744 ntBASIC12.77□□□□□ -0.37
Vmn1r58G3X9U3 Gm18622-201ENSMUST00000219361 595 ntBASIC12.77□□□□□ -0.37
Vmn1r58G3X9U3 Rangrf-201ENSMUST00000038644 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Vmn1r58G3X9U3 Cd300c-201ENSMUST00000061637 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.77□□□□□ -0.37
Vmn1r58G3X9U3 Hacd1-201ENSMUST00000074854 926 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.77□□□□□ -0.37
Vmn1r58G3X9U3 Cd300c-202ENSMUST00000092466 700 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC12.77□□□□□ -0.37
Vmn1r58G3X9U3 Gm10313-201ENSMUST00000095320 1002 ntBASIC12.77□□□□□ -0.37
Vmn1r58G3X9U3 Gm10355-201ENSMUST00000097146 517 ntBASIC12.77□□□□□ -0.37
Vmn1r58G3X9U3 Rusc1-201ENSMUST00000052539 3316 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Vmn1r58G3X9U3 Slc39a8-202ENSMUST00000081978 3314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Vmn1r58G3X9U3 Gm34419-201ENSMUST00000211383 1387 ntTSL 5 BASIC12.77□□□□□ -0.37
Vmn1r58G3X9U3 Trem1-202ENSMUST00000113251 2077 ntTSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Vmn1r58G3X9U3 Yap1-201ENSMUST00000065353 4171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Vmn1r58G3X9U3 Gga3-202ENSMUST00000106508 3582 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Vmn1r58G3X9U3 Araf-203ENSMUST00000122312 2854 ntTSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Vmn1r58G3X9U3 Usp20-202ENSMUST00000102849 5088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Vmn1r58G3X9U3 Pnkd-201ENSMUST00000027370 2937 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Vmn1r58G3X9U3 Kcnj9-202ENSMUST00000194204 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Vmn1r58G3X9U3 Heg1-205ENSMUST00000152782 8161 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.77□□□□□ -0.37
Vmn1r58G3X9U3 Magi1-206ENSMUST00000203688 4969 ntTSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Vmn1r58G3X9U3 Tmem163-205ENSMUST00000185560 3488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Vmn1r58G3X9U3 Pqlc2-202ENSMUST00000105801 2756 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.76□□□□□ -0.37
Vmn1r58G3X9U3 Kcna5-201ENSMUST00000060972 2862 ntAPPRIS P1 BASIC12.76□□□□□ -0.37
Vmn1r58G3X9U3 Il6ra-202ENSMUST00000197679 8639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Vmn1r58G3X9U3 Haus5-201ENSMUST00000019697 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Vmn1r58G3X9U3 Eif4g1-205ENSMUST00000115461 5507 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.76□□□□□ -0.37
Vmn1r58G3X9U3 Plch2-210ENSMUST00000176194 5619 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.76□□□□□ -0.37
Vmn1r58G3X9U3 Zscan29-205ENSMUST00000163766 3611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.76□□□□□ -0.37
Vmn1r58G3X9U3 Xrcc3-201ENSMUST00000021715 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Vmn1r58G3X9U3 Adgrg3-201ENSMUST00000051259 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Vmn1r58G3X9U3 Fam234a-201ENSMUST00000114988 3714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Vmn1r58G3X9U3 Oxa1l-201ENSMUST00000000985 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Vmn1r58G3X9U3 Mansc4-201ENSMUST00000100780 1125 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Vmn1r58G3X9U3 Gm8344-201ENSMUST00000119813 856 ntBASIC12.76□□□□□ -0.37
Vmn1r58G3X9U3 Tpt1-ps6-201ENSMUST00000121768 523 ntBASIC12.76□□□□□ -0.37
Vmn1r58G3X9U3 Gm12480-201ENSMUST00000129576 774 ntTSL 3 BASIC12.76□□□□□ -0.37
Vmn1r58G3X9U3 Magohb-201ENSMUST00000032307 767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Vmn1r58G3X9U3 Yif1b-201ENSMUST00000032809 1111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Vmn1r58G3X9U3 Manbal-201ENSMUST00000081202 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Vmn1r58G3X9U3 Cyfip1-201ENSMUST00000032629 6440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Vmn1r58G3X9U3 Gm18856-201ENSMUST00000178096 1374 ntBASIC12.76□□□□□ -0.37
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.4 ms