Protein–RNA interactions for Protein: G3UW71

Vmn1r167, Vomeronasal type-1 receptor, mousemouse

Predictions only

Length 315 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vmn1r167G3UW71 Slc4a5-203ENSMUST00000113900 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Vmn1r167G3UW71 Tfap2c-201ENSMUST00000030391 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Vmn1r167G3UW71 Pgap2-225ENSMUST00000156529 2034 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Vmn1r167G3UW71 Gopc-201ENSMUST00000020008 4216 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Vmn1r167G3UW71 Ntng2-201ENSMUST00000048455 1770 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Vmn1r167G3UW71 Nfat5-203ENSMUST00000125721 5899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Vmn1r167G3UW71 Ptp4a1-202ENSMUST00000076587 2851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Vmn1r167G3UW71 Acsl3-201ENSMUST00000035779 3950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Vmn1r167G3UW71 Por-202ENSMUST00000122113 2606 ntTSL 2 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Vmn1r167G3UW71 Gpank1-202ENSMUST00000165306 1518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Vmn1r167G3UW71 Tomm70a-201ENSMUST00000166897 3778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Vmn1r167G3UW71 Gm15957-201ENSMUST00000118893 974 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
Vmn1r167G3UW71 3000002C10Rik-202ENSMUST00000133495 1008 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
Vmn1r167G3UW71 Gm28942-201ENSMUST00000186334 365 ntTSL 3 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Vmn1r167G3UW71 Gm6473-201ENSMUST00000188572 1210 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
Vmn1r167G3UW71 AL593843.1-201ENSMUST00000195891 145 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
Vmn1r167G3UW71 Mt1-201ENSMUST00000034215 549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Vmn1r167G3UW71 Fam162a-201ENSMUST00000004057 635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Vmn1r167G3UW71 Srd5a2-201ENSMUST00000043458 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Vmn1r167G3UW71 Olfr1412-201ENSMUST00000062964 966 ntAPPRIS P1 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Vmn1r167G3UW71 Hfe-201ENSMUST00000006787 516 ntTSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Vmn1r167G3UW71 Hfe-203ENSMUST00000091707 816 ntTSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Vmn1r167G3UW71 Fam3a-205ENSMUST00000114142 1586 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Vmn1r167G3UW71 Prdm4-201ENSMUST00000037646 3877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Vmn1r167G3UW71 Btbd1-201ENSMUST00000026093 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Vmn1r167G3UW71 Cdadc1-204ENSMUST00000171683 1892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Vmn1r167G3UW71 Asic3-201ENSMUST00000049346 1853 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Vmn1r167G3UW71 Crat-202ENSMUST00000102854 2160 ntTSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Vmn1r167G3UW71 Pdzd4-202ENSMUST00000114438 3625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Vmn1r167G3UW71 Eef1d-204ENSMUST00000089681 2152 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Vmn1r167G3UW71 Adam10-201ENSMUST00000067880 4593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Vmn1r167G3UW71 Fbxo41-201ENSMUST00000159062 6505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Vmn1r167G3UW71 Gm21983-201ENSMUST00000154724 1690 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Vmn1r167G3UW71 Rgs6-216ENSMUST00000200911 2626 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Vmn1r167G3UW71 Mast2-201ENSMUST00000003908 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Vmn1r167G3UW71 Iqcm-201ENSMUST00000034033 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Vmn1r167G3UW71 Usp35-201ENSMUST00000139582 4262 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Vmn1r167G3UW71 Fubp1-205ENSMUST00000196695 2374 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Vmn1r167G3UW71 Tnfaip8l1-201ENSMUST00000077788 2379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Vmn1r167G3UW71 Ahdc1-202ENSMUST00000105914 5898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Vmn1r167G3UW71 Grik2-210ENSMUST00000220263 2085 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Vmn1r167G3UW71 Chmp1a-201ENSMUST00000000759 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Vmn1r167G3UW71 Pdlim3-203ENSMUST00000210422 1479 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Vmn1r167G3UW71 Cnksr2-202ENSMUST00000112513 4471 ntTSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Vmn1r167G3UW71 Wdr31-203ENSMUST00000120095 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Vmn1r167G3UW71 Cspp1-205ENSMUST00000122156 2535 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Vmn1r167G3UW71 Ltbp4-203ENSMUST00000118583 4726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Vmn1r167G3UW71 Spcs2-210ENSMUST00000209032 1610 ntTSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Vmn1r167G3UW71 Gm22189-201ENSMUST00000103822 86 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
Vmn1r167G3UW71 Icam4-201ENSMUST00000001040 971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Vmn1r167G3UW71 Hcrt-202ENSMUST00000107360 509 ntTSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Vmn1r167G3UW71 Gm12446-202ENSMUST00000152069 713 ntTSL 2 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Vmn1r167G3UW71 Gm12352-201ENSMUST00000154452 760 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Vmn1r167G3UW71 Fbxw4-204ENSMUST00000160018 931 ntTSL 3 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Vmn1r167G3UW71 Lamtor3-201ENSMUST00000168345 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Vmn1r167G3UW71 Inpp4a-213ENSMUST00000193774 1243 ntTSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Vmn1r167G3UW71 Gm42612-201ENSMUST00000197986 623 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
Vmn1r167G3UW71 Gm43170-201ENSMUST00000199827 612 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
Vmn1r167G3UW71 1700028J19Rik-203ENSMUST00000206686 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Vmn1r167G3UW71 Hsd17b14-205ENSMUST00000210300 797 ntTSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Vmn1r167G3UW71 Lyzl6-201ENSMUST00000021328 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Vmn1r167G3UW71 AC165157.4-201ENSMUST00000220587 139 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
Vmn1r167G3UW71 Tmem253-203ENSMUST00000227295 704 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Vmn1r167G3UW71 Cav3-201ENSMUST00000075477 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Vmn1r167G3UW71 Plcb3-201ENSMUST00000025912 4201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Vmn1r167G3UW71 Casc4-201ENSMUST00000078752 4215 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Vmn1r167G3UW71 Pcmt1-208ENSMUST00000162606 2757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Vmn1r167G3UW71 Tcf19-203ENSMUST00000161012 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Vmn1r167G3UW71 Fam78b-206ENSMUST00000190081 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Vmn1r167G3UW71 4930423C22Rik-201ENSMUST00000193863 1311 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
Vmn1r167G3UW71 Rnf207-201ENSMUST00000076183 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Vmn1r167G3UW71 9330020H09Rik-201ENSMUST00000163781 2147 ntTSL 2 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Vmn1r167G3UW71 Zswim8-204ENSMUST00000223840 5674 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Vmn1r167G3UW71 Carlr-201ENSMUST00000181515 2574 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
Vmn1r167G3UW71 Ubtf-205ENSMUST00000107119 3013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Vmn1r167G3UW71 Krt18-201ENSMUST00000023803 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Vmn1r167G3UW71 Chpf-202ENSMUST00000094818 3065 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Vmn1r167G3UW71 Rhpn2-201ENSMUST00000032705 3508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Vmn1r167G3UW71 Reps2-202ENSMUST00000112334 7675 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Vmn1r167G3UW71 Ldb3-207ENSMUST00000227819 1499 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
Vmn1r167G3UW71 S100b-201ENSMUST00000036387 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Vmn1r167G3UW71 Nkx3-1-201ENSMUST00000022646 3195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Vmn1r167G3UW71 Camk2g-217ENSMUST00000226630 1937 ntBASIC13.03□□□□□ -0.32
Vmn1r167G3UW71 Gatm-201ENSMUST00000028624 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Vmn1r167G3UW71 Usp33-202ENSMUST00000117492 3886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Vmn1r167G3UW71 Adgrl1-210ENSMUST00000152978 5734 ntTSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Vmn1r167G3UW71 Nrcam-202ENSMUST00000110748 6275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Vmn1r167G3UW71 Casp8-201ENSMUST00000027189 2585 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Vmn1r167G3UW71 Sirt5-207ENSMUST00000221515 1793 ntTSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Vmn1r167G3UW71 Spaca3-202ENSMUST00000103223 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Vmn1r167G3UW71 1700121C08Rik-201ENSMUST00000137546 677 ntTSL 3 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Vmn1r167G3UW71 Pax8-208ENSMUST00000153601 1226 ntTSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Vmn1r167G3UW71 AI413582-204ENSMUST00000154473 836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Vmn1r167G3UW71 Gm21854-201ENSMUST00000179901 471 ntBASIC13.03□□□□□ -0.32
Vmn1r167G3UW71 AC153872.1-201ENSMUST00000199539 128 ntBASIC13.03□□□□□ -0.32
Vmn1r167G3UW71 Cript-201ENSMUST00000024959 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Vmn1r167G3UW71 Gm9797-201ENSMUST00000052902 613 ntBASIC13.03□□□□□ -0.32
Vmn1r167G3UW71 Mrps21-202ENSMUST00000072587 405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Vmn1r167G3UW71 Isg20l2-201ENSMUST00000055984 2893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Vmn1r167G3UW71 Endod1-201ENSMUST00000167549 4470 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 47.3 ms