Protein–RNA interactions for Protein: G3UVU6

Gm20517, Mediator of RNA polymerase II transcription subunit 20, mousemouse

Predictions only

Length 152 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm20517G3UVU6 Snhg4-201ENSMUST00000181664 1190 ntTSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Gm20517G3UVU6 Sbsn-202ENSMUST00000182227 432 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.73□□□□□ -0.69
Gm20517G3UVU6 Sbsn-203ENSMUST00000182229 732 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Gm20517G3UVU6 Gm28793-201ENSMUST00000190845 413 ntTSL 5 BASIC10.73□□□□□ -0.69
Gm20517G3UVU6 Treml1-204ENSMUST00000224001 1220 ntAPPRIS P2 BASIC10.73□□□□□ -0.69
Gm20517G3UVU6 Il17a-201ENSMUST00000027061 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Gm20517G3UVU6 Lce1i-201ENSMUST00000090866 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Gm20517G3UVU6 Itgb4-203ENSMUST00000106458 5779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.73□□□□□ -0.69
Gm20517G3UVU6 Snx8-205ENSMUST00000196566 1914 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.73□□□□□ -0.69
Gm20517G3UVU6 2900026A02Rik-201ENSMUST00000050125 5876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Gm20517G3UVU6 Ror2-201ENSMUST00000021918 3985 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Gm20517G3UVU6 Ube2k-210ENSMUST00000202679 4682 ntTSL 5 BASIC10.73□□□□□ -0.69
Gm20517G3UVU6 Gm42878-202ENSMUST00000200170 4783 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.73□□□□□ -0.69
Gm20517G3UVU6 Plekhb1-201ENSMUST00000079176 2079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Gm20517G3UVU6 Cdkn2aip-201ENSMUST00000038738 3464 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Gm20517G3UVU6 March8-213ENSMUST00000203193 4245 ntTSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Gm20517G3UVU6 Ppia-206ENSMUST00000213200 1450 ntTSL 5 BASIC10.73□□□□□ -0.69
Gm20517G3UVU6 Zkscan14-203ENSMUST00000198959 2243 ntBASIC10.73□□□□□ -0.69
Gm20517G3UVU6 Gm2420-202ENSMUST00000202224 2249 ntBASIC10.73□□□□□ -0.69
Gm20517G3UVU6 Madd-201ENSMUST00000066420 3753 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.73□□□□□ -0.69
Gm20517G3UVU6 Ilvbl-208ENSMUST00000218875 3020 ntTSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Gm20517G3UVU6 Fhl1-204ENSMUST00000114772 2283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Gm20517G3UVU6 Klhl14-201ENSMUST00000049105 4018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Gm20517G3UVU6 Sgms1-212ENSMUST00000151289 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Gm20517G3UVU6 Fgf17-201ENSMUST00000022697 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Gm20517G3UVU6 Slfn2-201ENSMUST00000038038 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Gm20517G3UVU6 Pigg-201ENSMUST00000031189 3427 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.72□□□□□ -0.69
Gm20517G3UVU6 Mcur1-201ENSMUST00000021800 4339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Gm20517G3UVU6 Gm20683-201ENSMUST00000176751 2790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.72□□□□□ -0.69
Gm20517G3UVU6 Matn2-206ENSMUST00000228570 2798 ntBASIC10.72□□□□□ -0.69
Gm20517G3UVU6 Txnrd3-201ENSMUST00000000828 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Gm20517G3UVU6 Lzts3-203ENSMUST00000110260 3827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Gm20517G3UVU6 Tcea1-202ENSMUST00000165720 2854 ntTSL 5 BASIC10.72□□□□□ -0.69
Gm20517G3UVU6 Rarg-201ENSMUST00000043172 2953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Gm20517G3UVU6 Bptf-203ENSMUST00000106763 12036 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.72□□□□□ -0.69
Gm20517G3UVU6 Efemp1-201ENSMUST00000020759 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Gm20517G3UVU6 Dnm1-214ENSMUST00000201433 3146 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.72□□□□□ -0.69
Gm20517G3UVU6 Repin1-201ENSMUST00000009420 3145 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Gm20517G3UVU6 Igfals-201ENSMUST00000050714 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Gm20517G3UVU6 Sf3a2-203ENSMUST00000148665 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Gm20517G3UVU6 Slc39a4-201ENSMUST00000073428 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Gm20517G3UVU6 Cbs-202ENSMUST00000078509 2403 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Gm20517G3UVU6 Gm16181-201ENSMUST00000118793 567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Gm20517G3UVU6 9130204K15Rik-201ENSMUST00000131441 867 ntTSL 5 BASIC10.72□□□□□ -0.69
Gm20517G3UVU6 Gm15890-201ENSMUST00000161024 770 ntTSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Gm20517G3UVU6 1700012D14Rik-201ENSMUST00000209597 605 ntTSL 3 BASIC10.72□□□□□ -0.69
Gm20517G3UVU6 Atp5l-201ENSMUST00000043675 544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Gm20517G3UVU6 Mrpl54-201ENSMUST00000046114 604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Gm20517G3UVU6 Krtap19-3-201ENSMUST00000075284 526 ntAPPRIS P1 BASIC10.72□□□□□ -0.69
Gm20517G3UVU6 Rplp2-201ENSMUST00000084434 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Gm20517G3UVU6 Zfp524-201ENSMUST00000086349 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Gm20517G3UVU6 Npw-201ENSMUST00000095544 638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Gm20517G3UVU6 Dysf-214ENSMUST00000204354 6432 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.72□□□□□ -0.69
Gm20517G3UVU6 Hk2-204ENSMUST00000170833 2792 ntTSL 5 BASIC10.72□□□□□ -0.69
Gm20517G3UVU6 4933434E20Rik-209ENSMUST00000162114 1411 ntTSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Gm20517G3UVU6 Babam1-201ENSMUST00000002473 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Gm20517G3UVU6 AI661453-201ENSMUST00000037701 1410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Gm20517G3UVU6 Repin1-204ENSMUST00000135151 3057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Gm20517G3UVU6 Srr-202ENSMUST00000108447 3138 ntTSL 5 BASIC10.72□□□□□ -0.69
Gm20517G3UVU6 Il7-205ENSMUST00000194279 4858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Gm20517G3UVU6 Tfe3-211ENSMUST00000137467 3390 ntTSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Gm20517G3UVU6 Mog-201ENSMUST00000102665 1704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Gm20517G3UVU6 Erg-203ENSMUST00000113848 2139 ntTSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Gm20517G3UVU6 Usf1-208ENSMUST00000161241 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Gm20517G3UVU6 Bpnt1-201ENSMUST00000027916 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Gm20517G3UVU6 Gm12500-202ENSMUST00000186471 2428 ntBASIC10.72□□□□□ -0.69
Gm20517G3UVU6 Gm11992-201ENSMUST00000043285 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Gm20517G3UVU6 Bmp3-202ENSMUST00000197143 2739 ntTSL 2 BASIC10.71□□□□□ -0.69
Gm20517G3UVU6 Jade1-204ENSMUST00000170711 2896 ntTSL 5 BASIC10.71□□□□□ -0.69
Gm20517G3UVU6 Gm44913-201ENSMUST00000208060 2990 ntBASIC10.71□□□□□ -0.69
Gm20517G3UVU6 Opa1-201ENSMUST00000038867 3230 ntTSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Gm20517G3UVU6 Kif5c-201ENSMUST00000028102 6856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Gm20517G3UVU6 Slc39a3-201ENSMUST00000059551 3680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Gm20517G3UVU6 Wbp1l-201ENSMUST00000099376 3911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Gm20517G3UVU6 Sema6c-202ENSMUST00000090823 4029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Gm20517G3UVU6 Edrf1-201ENSMUST00000051169 5424 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Gm20517G3UVU6 Caprin1-201ENSMUST00000028607 6169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Gm20517G3UVU6 1810032O08Rik-201ENSMUST00000106378 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Gm20517G3UVU6 Dlk1-205ENSMUST00000109844 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Gm20517G3UVU6 Tm6sf2-202ENSMUST00000110160 1446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Gm20517G3UVU6 Trav13-3-201ENSMUST00000117226 336 ntBASIC10.71□□□□□ -0.69
Gm20517G3UVU6 Tmem208-201ENSMUST00000015000 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Gm20517G3UVU6 Acin1-221ENSMUST00000150371 2494 ntTSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Gm20517G3UVU6 Gm13003-201ENSMUST00000151040 2904 ntTSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Gm20517G3UVU6 Gm21983-201ENSMUST00000154724 1690 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.71□□□□□ -0.69
Gm20517G3UVU6 Gm25925-201ENSMUST00000158314 306 ntBASIC10.71□□□□□ -0.69
Gm20517G3UVU6 Emp3-202ENSMUST00000164119 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Gm20517G3UVU6 Arhgap40-203ENSMUST00000165398 2028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.71□□□□□ -0.69
Gm20517G3UVU6 Dhx37-201ENSMUST00000169485 4760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Gm20517G3UVU6 Six3os1-211ENSMUST00000176958 2889 ntTSL 2 BASIC10.71□□□□□ -0.69
Gm20517G3UVU6 Rbm4-203ENSMUST00000178615 1018 ntTSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Gm20517G3UVU6 Gm26847-201ENSMUST00000180407 2109 ntTSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Gm20517G3UVU6 Gm37844-201ENSMUST00000192473 4097 ntBASIC10.71□□□□□ -0.69
Gm20517G3UVU6 Gm43156-201ENSMUST00000202338 2127 ntTSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Gm20517G3UVU6 Ilvbl-212ENSMUST00000220430 2350 ntTSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Gm20517G3UVU6 Chaf1a-201ENSMUST00000002914 3308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Gm20517G3UVU6 Snai3-201ENSMUST00000006762 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Gm20517G3UVU6 2310039H08Rik-201ENSMUST00000071430 773 ntAPPRIS P1 BASIC10.71□□□□□ -0.69
Gm20517G3UVU6 Eml3-201ENSMUST00000096241 3322 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Gm20517G3UVU6 Adgrb2-202ENSMUST00000097868 4635 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.71□□□□□ -0.69
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.8 ms