Protein–RNA interactions for Protein: F7BCN9

Gm28038, Predicted gene, 28038 (Fragment), mousemouse

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Length 126 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm28038F7BCN9 Pds5b-201ENSMUST00000016569 7417 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.7
Gm28038F7BCN9 Vmn1r198-203ENSMUST00000226909 6259 ntAPPRIS P2 BASIC10.71□□□□□ -0.7
Gm28038F7BCN9 Sppl2a-201ENSMUST00000028844 5616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.7
Gm28038F7BCN9 Ube3b-201ENSMUST00000074002 5194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.7
Gm28038F7BCN9 Rbm33-201ENSMUST00000030920 3955 ntTSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.7
Gm28038F7BCN9 Ghdc-201ENSMUST00000017891 2462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Gm28038F7BCN9 Kcnj9-202ENSMUST00000194204 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Gm28038F7BCN9 Arl6ip1-201ENSMUST00000032888 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Gm28038F7BCN9 Gm42872-201ENSMUST00000200026 1967 ntBASIC10.7□□□□□ -0.7
Gm28038F7BCN9 Rrp1-201ENSMUST00000062678 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Gm28038F7BCN9 Psmd12-201ENSMUST00000021063 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Gm28038F7BCN9 Gm10110-201ENSMUST00000081204 1891 ntTSL 5 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Gm28038F7BCN9 Rbbp8-201ENSMUST00000047322 3618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Gm28038F7BCN9 Disp2-204ENSMUST00000110846 1732 ntTSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Gm28038F7BCN9 Dnase1l1-201ENSMUST00000019232 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Gm28038F7BCN9 Gm42878-202ENSMUST00000200170 4783 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Gm28038F7BCN9 Suv39h1-203ENSMUST00000115638 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Gm28038F7BCN9 Cts7-201ENSMUST00000021892 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Gm28038F7BCN9 Clns1a-201ENSMUST00000026506 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Gm28038F7BCN9 Rcn3-201ENSMUST00000019683 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Gm28038F7BCN9 Rcn3-208ENSMUST00000211352 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Gm28038F7BCN9 Phactr3-203ENSMUST00000108915 2694 ntTSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Gm28038F7BCN9 Phactr3-204ENSMUST00000108916 2656 ntTSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Gm28038F7BCN9 Tmc8-202ENSMUST00000106334 2644 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Gm28038F7BCN9 Sirt7-202ENSMUST00000106183 427 ntTSL 3 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Gm28038F7BCN9 1700008O03Rik-201ENSMUST00000107933 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
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Gm28038F7BCN9 1700028B04Rik-202ENSMUST00000190841 971 ntTSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
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Gm28038F7BCN9 Gm3336-202ENSMUST00000213065 842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Gm28038F7BCN9 AC133183.1-201ENSMUST00000221229 429 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.7□□□□□ -0.7
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Gm28038F7BCN9 Shc4-203ENSMUST00000110480 3671 ntTSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
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Gm28038F7BCN9 Fgd4-211ENSMUST00000162671 2714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
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Gm28038F7BCN9 Atp2a3-204ENSMUST00000108486 4540 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Gm28038F7BCN9 Unc119b-201ENSMUST00000060798 3659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
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Gm28038F7BCN9 Apobec1-201ENSMUST00000112585 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Gm28038F7BCN9 Peli1-201ENSMUST00000093290 3514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
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Gm28038F7BCN9 Ube2j2-203ENSMUST00000105581 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
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Gm28038F7BCN9 Srpx-203ENSMUST00000115544 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Gm28038F7BCN9 Elovl1-201ENSMUST00000006557 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Gm28038F7BCN9 Osbpl8-201ENSMUST00000095310 3622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Gm28038F7BCN9 Noct-203ENSMUST00000167780 2992 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Gm28038F7BCN9 Gars-201ENSMUST00000003572 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Gm28038F7BCN9 Ank-201ENSMUST00000022875 3498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Gm28038F7BCN9 Dlk1-205ENSMUST00000109844 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Gm28038F7BCN9 Gm5184-201ENSMUST00000220417 1702 ntBASIC10.69□□□□□ -0.7
Gm28038F7BCN9 Yes1-201ENSMUST00000072311 4586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Gm28038F7BCN9 Papd5-201ENSMUST00000066748 4489 ntTSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Gm28038F7BCN9 Gm21983-201ENSMUST00000154724 1690 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Gm28038F7BCN9 Matn2-206ENSMUST00000228570 2798 ntBASIC10.69□□□□□ -0.7
Gm28038F7BCN9 Hdac5-203ENSMUST00000107151 4852 ntTSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Gm28038F7BCN9 Prss23-201ENSMUST00000041761 3228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Gm28038F7BCN9 Cfap99-201ENSMUST00000207754 2123 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Gm28038F7BCN9 Adamts20-204ENSMUST00000155907 6886 ntTSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Gm28038F7BCN9 Myo6-204ENSMUST00000113268 7927 ntTSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Gm28038F7BCN9 A330035P11Rik-202ENSMUST00000144926 3074 ntTSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Gm28038F7BCN9 1700051A21Rik-201ENSMUST00000147937 1516 ntTSL 5 BASIC10.68□□□□□ -0.7
Gm28038F7BCN9 Lypd1-205ENSMUST00000162899 1511 ntTSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Gm28038F7BCN9 Tmprss9-201ENSMUST00000105333 3497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
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