Protein–RNA interactions for Protein: F7BCN0

Gm28048, Predicted gene, 28048 (Fragment), mousemouse

Predictions only

Length 99 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm28048F7BCN0 Rab37-201ENSMUST00000021076 2210 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Gm28048F7BCN0 Slfn2-201ENSMUST00000038038 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Gm28048F7BCN0 Tfap2a-202ENSMUST00000110193 2863 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Gm28048F7BCN0 Srgn-204ENSMUST00000160987 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.28□□□□□ -0.28
Gm28048F7BCN0 Ncor2-206ENSMUST00000111402 8862 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.28□□□□□ -0.28
Gm28048F7BCN0 Ppt2-210ENSMUST00000171376 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Gm28048F7BCN0 Slc4a1ap-201ENSMUST00000114533 2424 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Gm28048F7BCN0 Stra8-201ENSMUST00000031876 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Gm28048F7BCN0 Srrm1-203ENSMUST00000105861 3797 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.28□□□□□ -0.28
Gm28048F7BCN0 Park7-204ENSMUST00000105675 882 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.28□□□□□ -0.28
Gm28048F7BCN0 Gm13418-201ENSMUST00000119097 944 ntBASIC13.28□□□□□ -0.28
Gm28048F7BCN0 Gm5682-201ENSMUST00000173402 505 ntBASIC13.28□□□□□ -0.28
Gm28048F7BCN0 Tbc1d7-202ENSMUST00000179852 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Gm28048F7BCN0 CAAA01066804.1-201ENSMUST00000217800 611 ntTSL 3 BASIC13.28□□□□□ -0.28
Gm28048F7BCN0 Pdcd6-201ENSMUST00000022060 1131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Gm28048F7BCN0 Gm18246-201ENSMUST00000221023 728 ntBASIC13.28□□□□□ -0.28
Gm28048F7BCN0 Atp5l-201ENSMUST00000043675 544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Gm28048F7BCN0 1110038F14Rik-201ENSMUST00000071792 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Gm28048F7BCN0 Lce3f-201ENSMUST00000090863 611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Gm28048F7BCN0 Gps1-201ENSMUST00000100134 1925 ntTSL 2 BASIC13.28□□□□□ -0.28
Gm28048F7BCN0 Dnm1-203ENSMUST00000113350 3258 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.28□□□□□ -0.28
Gm28048F7BCN0 Pfkfb3-205ENSMUST00000114845 1971 ntTSL 5 BASIC13.28□□□□□ -0.28
Gm28048F7BCN0 BC006965-201ENSMUST00000124028 1952 ntTSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Gm28048F7BCN0 1500011B03Rik-202ENSMUST00000112160 1333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Gm28048F7BCN0 Adamts7-208ENSMUST00000167122 5338 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.28□□□□□ -0.28
Gm28048F7BCN0 Fnbp4-201ENSMUST00000013759 4691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Gm28048F7BCN0 Avpr1a-201ENSMUST00000020323 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Gm28048F7BCN0 Strip2-201ENSMUST00000046028 5370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Gm28048F7BCN0 Ntf3-202ENSMUST00000112244 1399 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC13.28□□□□□ -0.28
Gm28048F7BCN0 Gm37500-201ENSMUST00000192059 1443 ntBASIC13.28□□□□□ -0.28
Gm28048F7BCN0 Gm11405-201ENSMUST00000118689 1556 ntBASIC13.28□□□□□ -0.28
Gm28048F7BCN0 Gnb2-212ENSMUST00000150063 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Gm28048F7BCN0 Fam53b-201ENSMUST00000065371 5052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Gm28048F7BCN0 R3hdm2-212ENSMUST00000166820 4281 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.27□□□□□ -0.28
Gm28048F7BCN0 Caprin1-201ENSMUST00000028607 6169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
Gm28048F7BCN0 P2rx3-202ENSMUST00000111613 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.27□□□□□ -0.28
Gm28048F7BCN0 Ska1-201ENSMUST00000040188 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
Gm28048F7BCN0 Palm-201ENSMUST00000046945 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
Gm28048F7BCN0 Scarb2-201ENSMUST00000031377 4698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
Gm28048F7BCN0 Slc25a18-201ENSMUST00000112682 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
Gm28048F7BCN0 Canx-205ENSMUST00000179865 4281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
Gm28048F7BCN0 Osbpl10-204ENSMUST00000182384 2158 ntTSL 5 BASIC13.27□□□□□ -0.28
Gm28048F7BCN0 Rap1gap2-202ENSMUST00000102521 6565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.27□□□□□ -0.28
Gm28048F7BCN0 Kif9-204ENSMUST00000198043 2233 ntTSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
Gm28048F7BCN0 Cyp20a1-201ENSMUST00000060608 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
Gm28048F7BCN0 Gtpbp1-201ENSMUST00000046463 3398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
Gm28048F7BCN0 Adat3-201ENSMUST00000178231 4516 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.27□□□□□ -0.28
Gm28048F7BCN0 Syt12-201ENSMUST00000059295 3581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Gm28048F7BCN0 Kirrel-203ENSMUST00000159976 7236 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Gm28048F7BCN0 Steap2-201ENSMUST00000015797 3657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Gm28048F7BCN0 Gpc2-201ENSMUST00000014089 2514 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.27□□□□□ -0.29
Gm28048F7BCN0 Zkscan8-202ENSMUST00000110481 728 ntTSL 2 BASIC13.27□□□□□ -0.29
Gm28048F7BCN0 Ascl2-202ENSMUST00000121862 814 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.27□□□□□ -0.29
Gm28048F7BCN0 Tmem9-205ENSMUST00000165125 901 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.27□□□□□ -0.29
Gm28048F7BCN0 Gm4189-202ENSMUST00000174167 367 ntTSL 3 BASIC13.27□□□□□ -0.29
Gm28048F7BCN0 Gm6089-201ENSMUST00000197666 938 ntBASIC13.27□□□□□ -0.29
Gm28048F7BCN0 Tssc4-208ENSMUST00000208779 647 ntTSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Gm28048F7BCN0 Krt10-202ENSMUST00000211768 557 ntTSL 3 BASIC13.27□□□□□ -0.29
Gm28048F7BCN0 AC159301.1-201ENSMUST00000225130 1182 ntBASIC13.27□□□□□ -0.29
Gm28048F7BCN0 Magohb-201ENSMUST00000032307 767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Gm28048F7BCN0 Apoa1-201ENSMUST00000034588 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Gm28048F7BCN0 Neurl2-201ENSMUST00000042775 1014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Gm28048F7BCN0 Sdhc-201ENSMUST00000081560 815 ntTSL 3 BASIC13.27□□□□□ -0.29
Gm28048F7BCN0 Ube3b-201ENSMUST00000074002 5194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Gm28048F7BCN0 Tmem86b-202ENSMUST00000205360 1344 ntTSL 2 BASIC13.27□□□□□ -0.29
Gm28048F7BCN0 Chrm4-201ENSMUST00000045537 1440 ntAPPRIS P1 BASIC13.27□□□□□ -0.29
Gm28048F7BCN0 Mycbpap-201ENSMUST00000040692 1512 ntTSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Gm28048F7BCN0 Cmpk1-201ENSMUST00000030491 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Gm28048F7BCN0 Ywhag-205ENSMUST00000198270 1610 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.27□□□□□ -0.29
Gm28048F7BCN0 AC131743.5-201ENSMUST00000220775 1618 ntBASIC13.27□□□□□ -0.29
Gm28048F7BCN0 Krt74-201ENSMUST00000088018 1648 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.27□□□□□ -0.29
Gm28048F7BCN0 Guca1b-201ENSMUST00000024774 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Gm28048F7BCN0 Neu2-203ENSMUST00000164128 1733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Gm28048F7BCN0 Ap4b1-207ENSMUST00000200377 1823 ntTSL 5 BASIC13.27□□□□□ -0.29
Gm28048F7BCN0 Iah1-204ENSMUST00000223345 1890 ntTSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Gm28048F7BCN0 B3gat1-206ENSMUST00000161431 3858 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.27□□□□□ -0.29
Gm28048F7BCN0 Sytl1-201ENSMUST00000030674 1951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Gm28048F7BCN0 Cyp4x1os-201ENSMUST00000153951 2003 ntTSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Gm28048F7BCN0 Zfp276-201ENSMUST00000001092 4071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Gm28048F7BCN0 Stip1-201ENSMUST00000025918 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Gm28048F7BCN0 Ankrd6-204ENSMUST00000084750 4444 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.27□□□□□ -0.29
Gm28048F7BCN0 Sf3a2-203ENSMUST00000148665 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Gm28048F7BCN0 Gm2420-202ENSMUST00000202224 2249 ntBASIC13.27□□□□□ -0.29
Gm28048F7BCN0 Cyp1b1-201ENSMUST00000024894 5128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Gm28048F7BCN0 Aste1-201ENSMUST00000035181 2755 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Gm28048F7BCN0 Map2k7-211ENSMUST00000145165 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Gm28048F7BCN0 P4hb-201ENSMUST00000026122 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Gm28048F7BCN0 Enox1-201ENSMUST00000022589 3142 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Gm28048F7BCN0 Tbc1d1-201ENSMUST00000043893 6471 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.26□□□□□ -0.29
Gm28048F7BCN0 Naa15-205ENSMUST00000193266 7480 ntTSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Gm28048F7BCN0 Sema3b-205ENSMUST00000102532 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Gm28048F7BCN0 Spsb1-203ENSMUST00000105685 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Gm28048F7BCN0 Lsp1-203ENSMUST00000105966 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Gm28048F7BCN0 Nrn1l-202ENSMUST00000118920 603 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Gm28048F7BCN0 Smim1-205ENSMUST00000131325 842 ntTSL 5 BASIC13.26□□□□□ -0.29
Gm28048F7BCN0 Tle3-204ENSMUST00000159386 4527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.26□□□□□ -0.29
Gm28048F7BCN0 1700023H06Rik-201ENSMUST00000161006 1044 ntTSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Gm28048F7BCN0 Ly6g6e-204ENSMUST00000172959 501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Gm28048F7BCN0 4930556N13Rik-201ENSMUST00000173677 1034 ntTSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Gm28048F7BCN0 Ush1c-207ENSMUST00000176371 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.26□□□□□ -0.29
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.3 ms