Protein–RNA interactions for Protein: F6Z9R1

Gm20538, Predicted gene 20538 (Fragment), mousemouse

Predictions only

Length 75 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm20538F6Z9R1 Tcf4-243ENSMUST00000202057 1941 ntTSL 5 BASIC6.68□□□□□ -1.34
Gm20538F6Z9R1 Slc29a2-201ENSMUST00000025826 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.68□□□□□ -1.34
Gm20538F6Z9R1 Igsf23-201ENSMUST00000043440 1908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.68□□□□□ -1.34
Gm20538F6Z9R1 Zfp879-202ENSMUST00000109133 2229 ntTSL 5 BASIC6.68□□□□□ -1.34
Gm20538F6Z9R1 Gtf2e1-201ENSMUST00000023525 3084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.68□□□□□ -1.34
Gm20538F6Z9R1 H3f3b-202ENSMUST00000106454 2514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.68□□□□□ -1.34
Gm20538F6Z9R1 Tpra1-219ENSMUST00000203345 3359 ntTSL 5 BASIC6.68□□□□□ -1.34
Gm20538F6Z9R1 Pgap2-203ENSMUST00000120119 1979 ntTSL 1 (best) BASIC6.68□□□□□ -1.34
Gm20538F6Z9R1 Olfr1121-202ENSMUST00000213792 1996 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.68□□□□□ -1.34
Gm20538F6Z9R1 Tnip1-206ENSMUST00000108889 2834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.68□□□□□ -1.34
Gm20538F6Z9R1 Med24-202ENSMUST00000100500 3133 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.67□□□□□ -1.34
Gm20538F6Z9R1 AC166356.1-201ENSMUST00000228236 1426 ntBASIC6.67□□□□□ -1.34
Gm20538F6Z9R1 2810430I11Rik-201ENSMUST00000154246 3416 ntTSL 1 (best) BASIC6.67□□□□□ -1.34
Gm20538F6Z9R1 Sema6d-207ENSMUST00000103240 4372 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC6.67□□□□□ -1.34
Gm20538F6Z9R1 Gtf2i-202ENSMUST00000082057 4375 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.67□□□□□ -1.34
Gm20538F6Z9R1 Slco5a1-207ENSMUST00000188454 8463 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC6.67□□□□□ -1.34
Gm20538F6Z9R1 Tfe3-204ENSMUST00000115677 2943 ntTSL 1 (best) BASIC6.67□□□□□ -1.34
Gm20538F6Z9R1 BC055324-202ENSMUST00000097493 3217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.67□□□□□ -1.34
Gm20538F6Z9R1 Gm8098-201ENSMUST00000146985 1499 ntTSL 1 (best) BASIC6.67□□□□□ -1.34
Gm20538F6Z9R1 Krt83-201ENSMUST00000023718 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.67□□□□□ -1.34
Gm20538F6Z9R1 Aldh1a7-201ENSMUST00000025656 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.67□□□□□ -1.34
Gm20538F6Z9R1 Tdg-201ENSMUST00000092266 2959 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.67□□□□□ -1.34
Gm20538F6Z9R1 Cacna1c-202ENSMUST00000078320 8062 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.67□□□□□ -1.34
Gm20538F6Z9R1 Gm38910-201ENSMUST00000204630 2448 ntBASIC6.67□□□□□ -1.34
Gm20538F6Z9R1 Rapgef4os2-201ENSMUST00000128165 2116 ntTSL 1 (best) BASIC6.67□□□□□ -1.34
Gm20538F6Z9R1 Chst4-202ENSMUST00000211894 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.67□□□□□ -1.34
Gm20538F6Z9R1 Adamtsl1-201ENSMUST00000048885 1842 ntTSL 5 BASIC6.67□□□□□ -1.34
Gm20538F6Z9R1 Catsper4-204ENSMUST00000169381 1506 ntTSL 1 (best) BASIC6.67□□□□□ -1.34
Gm20538F6Z9R1 Synpo2l-202ENSMUST00000117386 3979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.67□□□□□ -1.34
Gm20538F6Z9R1 Necap1-201ENSMUST00000032477 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.67□□□□□ -1.34
Gm20538F6Z9R1 Maged2-203ENSMUST00000112699 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.67□□□□□ -1.34
Gm20538F6Z9R1 Abcc3-201ENSMUST00000021231 4999 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.67□□□□□ -1.34
Gm20538F6Z9R1 Aldh7a1-206ENSMUST00000172734 1880 ntTSL 5 BASIC6.67□□□□□ -1.34
Gm20538F6Z9R1 Ppp1r15a-202ENSMUST00000167273 2809 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.67□□□□□ -1.34
Gm20538F6Z9R1 Mtmr2-201ENSMUST00000034396 3788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.67□□□□□ -1.34
Gm20538F6Z9R1 Gm37136-201ENSMUST00000194368 194 ntBASIC6.67□□□□□ -1.34
Gm20538F6Z9R1 M1ap-201ENSMUST00000113980 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.67□□□□□ -1.34
Gm20538F6Z9R1 Alox8-202ENSMUST00000094078 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.67□□□□□ -1.34
Gm20538F6Z9R1 Trpv4-205ENSMUST00000112225 3226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.67□□□□□ -1.34
Gm20538F6Z9R1 Rgs12-207ENSMUST00000114285 2924 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.67□□□□□ -1.34
Gm20538F6Z9R1 Ilvbl-204ENSMUST00000218271 1606 ntTSL 1 (best) BASIC6.67□□□□□ -1.34
Gm20538F6Z9R1 Srpk3-201ENSMUST00000002081 1981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.67□□□□□ -1.34
Gm20538F6Z9R1 Gm21983-201ENSMUST00000154724 1690 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.67□□□□□ -1.34
Gm20538F6Z9R1 4933415A04Rik-201ENSMUST00000056256 2009 ntAPPRIS P1 BASIC6.67□□□□□ -1.34
Gm20538F6Z9R1 Vmn2r18-201ENSMUST00000165928 2367 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.67□□□□□ -1.34
Gm20538F6Z9R1 Adamtsl1-209ENSMUST00000141889 7805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.67□□□□□ -1.34
Gm20538F6Z9R1 CT009601.1-201ENSMUST00000225567 2705 ntBASIC6.67□□□□□ -1.34
Gm20538F6Z9R1 Fam109b-201ENSMUST00000050349 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.67□□□□□ -1.34
Gm20538F6Z9R1 Tcf7l2-208ENSMUST00000111654 3059 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC6.67□□□□□ -1.34
Gm20538F6Z9R1 Adamts6-201ENSMUST00000065766 4822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.67□□□□□ -1.34
Gm20538F6Z9R1 Ctnnbl1-201ENSMUST00000029178 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.67□□□□□ -1.34
Gm20538F6Z9R1 Chrng-201ENSMUST00000027470 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.67□□□□□ -1.34
Gm20538F6Z9R1 Zfp941-201ENSMUST00000080651 2791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.67□□□□□ -1.34
Gm20538F6Z9R1 Zdhhc3-208ENSMUST00000147563 6987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.67□□□□□ -1.34
Gm20538F6Z9R1 Qars-201ENSMUST00000006838 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.67□□□□□ -1.34
Gm20538F6Z9R1 Nrg1-201ENSMUST00000073884 2452 ntTSL 1 (best) BASIC6.67□□□□□ -1.34
Gm20538F6Z9R1 Cadm2-201ENSMUST00000114292 9564 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.67□□□□□ -1.34
Gm20538F6Z9R1 Gatc-201ENSMUST00000139167 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.67□□□□□ -1.34
Gm20538F6Z9R1 Kdm1b-201ENSMUST00000037025 4987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.67□□□□□ -1.34
Gm20538F6Z9R1 Ltb4r2-201ENSMUST00000044554 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.67□□□□□ -1.34
Gm20538F6Z9R1 Eya3-213ENSMUST00000180250 5020 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.67□□□□□ -1.34
Gm20538F6Z9R1 Gm29050-201ENSMUST00000190732 2528 ntTSL 1 (best) BASIC6.67□□□□□ -1.34
Gm20538F6Z9R1 Tmem211-201ENSMUST00000086615 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.66□□□□□ -1.34
Gm20538F6Z9R1 Cast-211ENSMUST00000223206 5141 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.66□□□□□ -1.34
Gm20538F6Z9R1 Diablo-207ENSMUST00000145152 2588 ntTSL 1 (best) BASIC6.66□□□□□ -1.34
Gm20538F6Z9R1 Xiap-204ENSMUST00000115095 6670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.66□□□□□ -1.34
Gm20538F6Z9R1 Cpsf6-207ENSMUST00000176686 2200 ntTSL 1 (best) BASIC6.66□□□□□ -1.34
Gm20538F6Z9R1 Rpl7l1-201ENSMUST00000078286 2606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.66□□□□□ -1.34
Gm20538F6Z9R1 Ccdc155-201ENSMUST00000121017 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.66□□□□□ -1.34
Gm20538F6Z9R1 Pde8a-201ENSMUST00000026672 3802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.66□□□□□ -1.34
Gm20538F6Z9R1 Tgfbr2-201ENSMUST00000035014 3476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.66□□□□□ -1.34
Gm20538F6Z9R1 Capn9-201ENSMUST00000093033 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.66□□□□□ -1.34
Gm20538F6Z9R1 Plekha6-201ENSMUST00000038295 7388 ntTSL 1 (best) BASIC6.66□□□□□ -1.34
Gm20538F6Z9R1 Pear1-201ENSMUST00000029714 4260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.66□□□□□ -1.34
Gm20538F6Z9R1 Pear1-202ENSMUST00000079083 4297 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.66□□□□□ -1.34
Gm20538F6Z9R1 Zfp629-203ENSMUST00000122066 5850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.66□□□□□ -1.34
Gm20538F6Z9R1 Shq1-204ENSMUST00000170667 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.66□□□□□ -1.34
Gm20538F6Z9R1 Itfg2-203ENSMUST00000142615 3191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.66□□□□□ -1.34
Gm20538F6Z9R1 Fgfr3-211ENSMUST00000171509 4020 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.66□□□□□ -1.34
Gm20538F6Z9R1 Drc7-201ENSMUST00000058479 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.66□□□□□ -1.34
Gm20538F6Z9R1 Vegfc-201ENSMUST00000033919 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.66□□□□□ -1.34
Gm20538F6Z9R1 Sqstm1-202ENSMUST00000102774 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.66□□□□□ -1.34
Gm20538F6Z9R1 Slc25a25-201ENSMUST00000028160 3294 ntTSL 1 (best) BASIC6.66□□□□□ -1.34
Gm20538F6Z9R1 Pcif1-201ENSMUST00000041643 5772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.66□□□□□ -1.34
Gm20538F6Z9R1 Disp1-201ENSMUST00000003035 4984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.66□□□□□ -1.34
Gm20538F6Z9R1 Morc3-201ENSMUST00000044068 4178 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.66□□□□□ -1.34
Gm20538F6Z9R1 Qrfp-201ENSMUST00000057407 2927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.66□□□□□ -1.34
Gm20538F6Z9R1 Sim1-202ENSMUST00000219436 1687 ntTSL 5 BASIC6.66□□□□□ -1.34
Gm20538F6Z9R1 Myom2-201ENSMUST00000033842 5075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.66□□□□□ -1.34
Gm20538F6Z9R1 Gpr137c-205ENSMUST00000227009 771 ntAPPRIS ALT2 BASIC6.66□□□□□ -1.34
Gm20538F6Z9R1 Nutf2-201ENSMUST00000008594 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.66□□□□□ -1.34
Gm20538F6Z9R1 Traf1-207ENSMUST00000172159 3436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.66□□□□□ -1.34
Gm20538F6Z9R1 Vps33b-201ENSMUST00000032749 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.66□□□□□ -1.34
Gm20538F6Z9R1 Coa5-201ENSMUST00000027286 3863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.66□□□□□ -1.34
Gm20538F6Z9R1 Acly-202ENSMUST00000107385 1741 ntTSL 1 (best) BASIC6.66□□□□□ -1.34
Gm20538F6Z9R1 Gm8036-201ENSMUST00000118089 1718 ntBASIC6.66□□□□□ -1.34
Gm20538F6Z9R1 Gm20671-201ENSMUST00000144673 1731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.66□□□□□ -1.34
Gm20538F6Z9R1 Mdp1-201ENSMUST00000002400 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.66□□□□□ -1.34
Gm20538F6Z9R1 Ppt2-201ENSMUST00000064953 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.66□□□□□ -1.34
Gm20538F6Z9R1 Nit1-201ENSMUST00000111289 3041 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.66□□□□□ -1.34
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.2 ms