Protein–RNA interactions for Protein: F6V0H0

Pagr1b, PAXIP1-associated glutamate-rich protein 1B (Fragment), mousemouse

Predictions only

Length 108 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pagr1bF6V0H0 Txndc11-202ENSMUST00000118362 4248 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Pagr1bF6V0H0 Tmem119-201ENSMUST00000067853 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Pagr1bF6V0H0 Ttc14-202ENSMUST00000108210 2684 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Pagr1bF6V0H0 Slc35c1-202ENSMUST00000125276 2668 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Pagr1bF6V0H0 Nxf1-202ENSMUST00000010248 748 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Pagr1bF6V0H0 Coro6-205ENSMUST00000108391 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Pagr1bF6V0H0 Rapgef3os2-201ENSMUST00000124374 920 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Pagr1bF6V0H0 Dhrs2-202ENSMUST00000165432 849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Pagr1bF6V0H0 Krtap16-3-201ENSMUST00000179707 601 ntAPPRIS P1 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Pagr1bF6V0H0 2810429I04Rik-210ENSMUST00000189464 868 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Pagr1bF6V0H0 Tcta-203ENSMUST00000195615 597 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Pagr1bF6V0H0 Prkar2b-202ENSMUST00000036497 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Pagr1bF6V0H0 Nid1-201ENSMUST00000005532 6091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Pagr1bF6V0H0 Rdx-201ENSMUST00000000590 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Pagr1bF6V0H0 Col4a3bp-203ENSMUST00000179226 3040 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Pagr1bF6V0H0 Ptp4a1-202ENSMUST00000076587 2851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Pagr1bF6V0H0 Adnp-201ENSMUST00000057793 4917 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Pagr1bF6V0H0 Rab18-201ENSMUST00000097680 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Pagr1bF6V0H0 Dsg2-202ENSMUST00000120102 3590 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Pagr1bF6V0H0 Scara5-202ENSMUST00000069226 3262 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Pagr1bF6V0H0 Adm-201ENSMUST00000033054 1390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Pagr1bF6V0H0 Fam174b-201ENSMUST00000107456 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Pagr1bF6V0H0 Chd1-205ENSMUST00000173311 4211 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Pagr1bF6V0H0 Map2k7-211ENSMUST00000145165 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Pagr1bF6V0H0 Gm29374-201ENSMUST00000187198 1340 ntTSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Pagr1bF6V0H0 Fkbp10-201ENSMUST00000001595 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Pagr1bF6V0H0 Gm42632-201ENSMUST00000201707 2411 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
Pagr1bF6V0H0 Nap1l4-206ENSMUST00000208190 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Pagr1bF6V0H0 Arid5a-201ENSMUST00000097778 2270 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Pagr1bF6V0H0 Gm16011-201ENSMUST00000121567 2662 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
Pagr1bF6V0H0 Prmt5-201ENSMUST00000023873 2691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Pagr1bF6V0H0 Slc12a5-207ENSMUST00000202223 5690 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Pagr1bF6V0H0 Abhd3-203ENSMUST00000117828 1962 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Pagr1bF6V0H0 Dffa-202ENSMUST00000103216 1835 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Pagr1bF6V0H0 Gm42690-201ENSMUST00000197921 1836 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
Pagr1bF6V0H0 Kcnh2-202ENSMUST00000115098 3193 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Pagr1bF6V0H0 Gamt-202ENSMUST00000105363 988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Pagr1bF6V0H0 Gm4984-201ENSMUST00000115987 360 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
Pagr1bF6V0H0 Gm12882-201ENSMUST00000121696 517 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
Pagr1bF6V0H0 Ankzf1-201ENSMUST00000127625 1167 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Pagr1bF6V0H0 Gm14617-202ENSMUST00000144208 607 ntTSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Pagr1bF6V0H0 Gm15853-201ENSMUST00000160268 556 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Pagr1bF6V0H0 Olfr455-201ENSMUST00000171307 954 ntAPPRIS P1 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Pagr1bF6V0H0 Gm6283-201ENSMUST00000182369 1000 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
Pagr1bF6V0H0 Gm5279-201ENSMUST00000199575 745 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
Pagr1bF6V0H0 Efcab10-201ENSMUST00000020878 673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Pagr1bF6V0H0 AC150560.1-201ENSMUST00000227731 1187 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
Pagr1bF6V0H0 Dpm3-201ENSMUST00000040824 404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Pagr1bF6V0H0 Gm12866-201ENSMUST00000128998 1671 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Pagr1bF6V0H0 Mapk8ip3-207ENSMUST00000121723 5410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Pagr1bF6V0H0 Nxnl1-202ENSMUST00000163659 2730 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Pagr1bF6V0H0 Slco3a1-202ENSMUST00000098371 2709 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Pagr1bF6V0H0 Klc4-201ENSMUST00000003642 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Pagr1bF6V0H0 Dse-201ENSMUST00000048010 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Pagr1bF6V0H0 Skida1-201ENSMUST00000066885 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Pagr1bF6V0H0 Pttg1ip-201ENSMUST00000009435 2294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Pagr1bF6V0H0 Cd151-202ENSMUST00000106000 1865 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Pagr1bF6V0H0 Per3-201ENSMUST00000103204 5999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Pagr1bF6V0H0 AC154527.2-201ENSMUST00000225256 1466 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
Pagr1bF6V0H0 Zfp57-202ENSMUST00000089968 1991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Pagr1bF6V0H0 Rita1-201ENSMUST00000031599 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Pagr1bF6V0H0 E2f3-203ENSMUST00000221536 4597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Pagr1bF6V0H0 E2f3-204ENSMUST00000222730 4579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Pagr1bF6V0H0 Ptp4a3-201ENSMUST00000053232 3608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Pagr1bF6V0H0 Rbm15-201ENSMUST00000061772 4343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Pagr1bF6V0H0 Gm15957-201ENSMUST00000118893 974 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
Pagr1bF6V0H0 Gm11425-201ENSMUST00000119608 498 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
Pagr1bF6V0H0 Rpl12-203ENSMUST00000126610 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Pagr1bF6V0H0 H60b-202ENSMUST00000131558 1080 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Pagr1bF6V0H0 Zfp414-204ENSMUST00000166627 1211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Pagr1bF6V0H0 B230217C12Rik-204ENSMUST00000170806 1118 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Pagr1bF6V0H0 Hist1h3h-201ENSMUST00000188775 411 ntAPPRIS P1 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Pagr1bF6V0H0 Hist1h3i-201ENSMUST00000189457 411 ntAPPRIS P1 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Pagr1bF6V0H0 5430427M07Rik-202ENSMUST00000221524 1023 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Pagr1bF6V0H0 Mettl26-201ENSMUST00000026827 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Pagr1bF6V0H0 Zfp414-201ENSMUST00000073570 1197 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Pagr1bF6V0H0 Gm9396-201ENSMUST00000076703 567 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
Pagr1bF6V0H0 Txnrd3-202ENSMUST00000101171 2494 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Pagr1bF6V0H0 Sec24a-204ENSMUST00000109097 6581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Pagr1bF6V0H0 Fgfr2-207ENSMUST00000117872 4223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Pagr1bF6V0H0 Ptch1-201ENSMUST00000021921 7725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Pagr1bF6V0H0 Opn5-201ENSMUST00000068355 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Pagr1bF6V0H0 Prss44-201ENSMUST00000098345 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Pagr1bF6V0H0 Mrpl58-203ENSMUST00000106539 2522 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Pagr1bF6V0H0 Ptk7-201ENSMUST00000044442 4255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Pagr1bF6V0H0 Tmem229b-206ENSMUST00000174697 3697 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Pagr1bF6V0H0 Tmem101-201ENSMUST00000021296 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Pagr1bF6V0H0 Cadm3-202ENSMUST00000111220 5155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Pagr1bF6V0H0 Pgm1-201ENSMUST00000087324 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Pagr1bF6V0H0 Nfkbid-201ENSMUST00000046177 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Pagr1bF6V0H0 Acadm-201ENSMUST00000072697 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Pagr1bF6V0H0 Gjb4-202ENSMUST00000106090 1446 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Pagr1bF6V0H0 Gm17619-201ENSMUST00000180625 1449 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Pagr1bF6V0H0 Gjb4-201ENSMUST00000060419 1445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Pagr1bF6V0H0 Ano10-201ENSMUST00000042546 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Pagr1bF6V0H0 Ripk3-203ENSMUST00000178399 1865 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Pagr1bF6V0H0 Cadps2-206ENSMUST00000115361 4571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Pagr1bF6V0H0 Fstl1-201ENSMUST00000114763 3789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Pagr1bF6V0H0 4930438A08Rik-201ENSMUST00000108834 2093 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Pagr1bF6V0H0 Mif4gd-202ENSMUST00000106506 993 ntTSL 3 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.8 ms