Protein–RNA interactions for Protein: F6RXI4

BC067074, cDNA sequence BC067074, mousemouse

Predictions only

Length 2,391 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BC067074F6RXI4 Cactin-201ENSMUST00000050867 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
BC067074F6RXI4 Ylpm1-207ENSMUST00000168977 4893 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.33□□□□□ -0.6
BC067074F6RXI4 Tyw1-203ENSMUST00000100662 1867 ntTSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
BC067074F6RXI4 Klk11-202ENSMUST00000171458 1260 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC11.33□□□□□ -0.6
BC067074F6RXI4 Stk19-ps1-201ENSMUST00000174597 517 ntBASIC11.33□□□□□ -0.6
BC067074F6RXI4 Ube2a-205ENSMUST00000201068 1298 ntTSL 5 BASIC11.33□□□□□ -0.6
BC067074F6RXI4 Gm19220-201ENSMUST00000222682 803 ntBASIC11.33□□□□□ -0.6
BC067074F6RXI4 Rps21-201ENSMUST00000059080 394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
BC067074F6RXI4 Fzd6-202ENSMUST00000179165 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
BC067074F6RXI4 Wdr13-205ENSMUST00000130832 4374 ntTSL 5 BASIC11.33□□□□□ -0.6
BC067074F6RXI4 Ss18l1-201ENSMUST00000041126 4343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
BC067074F6RXI4 Wasf2-201ENSMUST00000084241 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
BC067074F6RXI4 Tcf3-204ENSMUST00000105340 2826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
BC067074F6RXI4 Rprd1b-202ENSMUST00000103123 4504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
BC067074F6RXI4 Mir3547-201ENSMUST00000175461 88 ntBASIC11.32□□□□□ -0.6
BC067074F6RXI4 Mrpl30-205ENSMUST00000193673 662 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.32□□□□□ -0.6
BC067074F6RXI4 Gm7067-201ENSMUST00000207698 1249 ntBASIC11.32□□□□□ -0.6
BC067074F6RXI4 Tmem219-201ENSMUST00000032926 941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
BC067074F6RXI4 Lrif1-202ENSMUST00000098751 929 ntTSL 2 BASIC11.32□□□□□ -0.6
BC067074F6RXI4 Evc-201ENSMUST00000031005 4325 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
BC067074F6RXI4 Gpx3-201ENSMUST00000082430 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
BC067074F6RXI4 Mpl-203ENSMUST00000106375 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
BC067074F6RXI4 Prkacb-202ENSMUST00000102515 4347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
BC067074F6RXI4 Ube2d3-202ENSMUST00000166033 2504 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
BC067074F6RXI4 Pank3-201ENSMUST00000018990 7376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
BC067074F6RXI4 Gm26803-201ENSMUST00000181705 2011 ntTSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
BC067074F6RXI4 Fbxl18-201ENSMUST00000035985 2831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
BC067074F6RXI4 Rnf44-211ENSMUST00000134862 3797 ntTSL 5 BASIC11.32□□□□□ -0.6
BC067074F6RXI4 Lamc1-201ENSMUST00000027752 7622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
BC067074F6RXI4 Usp31-201ENSMUST00000046929 10198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.32□□□□□ -0.6
BC067074F6RXI4 Fosl2-201ENSMUST00000031017 6537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
BC067074F6RXI4 Sumo2-204ENSMUST00000118155 884 ntTSL 2 BASIC11.32□□□□□ -0.6
BC067074F6RXI4 Pdlim2-210ENSMUST00000153735 1578 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.32□□□□□ -0.6
BC067074F6RXI4 Ptpn6-210ENSMUST00000174265 1743 ntTSL 5 BASIC11.32□□□□□ -0.6
BC067074F6RXI4 Gm27731-201ENSMUST00000185192 107 ntBASIC11.32□□□□□ -0.6
BC067074F6RXI4 4930500L23Rik-201ENSMUST00000198000 747 ntTSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
BC067074F6RXI4 Gm9182-201ENSMUST00000217829 639 ntBASIC11.32□□□□□ -0.6
BC067074F6RXI4 AC162801.1-201ENSMUST00000220612 198 ntBASIC11.32□□□□□ -0.6
BC067074F6RXI4 Spef1-201ENSMUST00000028801 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
BC067074F6RXI4 Selenow-201ENSMUST00000044355 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
BC067074F6RXI4 Lce3a-201ENSMUST00000067318 549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
BC067074F6RXI4 Tpd52-205ENSMUST00000120143 6317 ntTSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
BC067074F6RXI4 Pcnx2-204ENSMUST00000131127 3782 ntTSL 5 BASIC11.32□□□□□ -0.6
BC067074F6RXI4 Pip5k1c-201ENSMUST00000045469 4323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
BC067074F6RXI4 Hif1a-201ENSMUST00000021530 4724 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
BC067074F6RXI4 9930021J03Rik-204ENSMUST00000177155 6632 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.31□□□□□ -0.6
BC067074F6RXI4 Slc30a5-201ENSMUST00000067246 3179 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
BC067074F6RXI4 Kctd3-201ENSMUST00000085678 3706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
BC067074F6RXI4 S100b-201ENSMUST00000036387 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
BC067074F6RXI4 Lsm12-202ENSMUST00000107156 2015 ntTSL 5 BASIC11.31□□□□□ -0.6
BC067074F6RXI4 Synrg-207ENSMUST00000183456 3990 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.31□□□□□ -0.6
BC067074F6RXI4 Gm39244-202ENSMUST00000210837 1857 ntTSL 5 BASIC11.31□□□□□ -0.6
BC067074F6RXI4 Gmpr2-201ENSMUST00000002397 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
BC067074F6RXI4 Dusp23-201ENSMUST00000027826 1410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
BC067074F6RXI4 Naxd-205ENSMUST00000178721 1108 ntTSL 5 BASIC11.31□□□□□ -0.6
BC067074F6RXI4 Ppcdc-205ENSMUST00000214144 724 ntTSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
BC067074F6RXI4 Ndufa4l2-201ENSMUST00000035735 934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
BC067074F6RXI4 Gm11149-201ENSMUST00000068730 1250 ntTSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
BC067074F6RXI4 Cox6b1-201ENSMUST00000075738 618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
BC067074F6RXI4 Gm5356-201ENSMUST00000093326 615 ntBASIC11.31□□□□□ -0.6
BC067074F6RXI4 Tssk4-202ENSMUST00000164809 1686 ntTSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
BC067074F6RXI4 Eif4g3-215ENSMUST00000203828 5289 ntTSL 5 BASIC11.31□□□□□ -0.6
BC067074F6RXI4 Apoa5-201ENSMUST00000034584 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
BC067074F6RXI4 Meioc-201ENSMUST00000100378 4573 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.31□□□□□ -0.6
BC067074F6RXI4 Zfand6-208ENSMUST00000209117 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
BC067074F6RXI4 As3mt-201ENSMUST00000003655 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
BC067074F6RXI4 Gm27528-202ENSMUST00000222916 2012 ntBASIC11.31□□□□□ -0.6
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BC067074F6RXI4 Parm1-201ENSMUST00000040576 5068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
BC067074F6RXI4 Scyl1-201ENSMUST00000025890 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
BC067074F6RXI4 Sema3b-202ENSMUST00000102529 2875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
BC067074F6RXI4 Dhx16-201ENSMUST00000025292 3351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
BC067074F6RXI4 Hacd3-201ENSMUST00000036615 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
BC067074F6RXI4 Acox1-201ENSMUST00000066587 3987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
BC067074F6RXI4 Map4k5-202ENSMUST00000110567 4250 ntTSL 5 BASIC11.31□□□□□ -0.6
BC067074F6RXI4 Nhs-202ENSMUST00000087085 8805 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
BC067074F6RXI4 Arhgef9-217ENSMUST00000197364 1796 ntTSL 5 BASIC11.31□□□□□ -0.6
BC067074F6RXI4 Gm12742-201ENSMUST00000117326 410 ntBASIC11.31□□□□□ -0.6
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BC067074F6RXI4 Ift20-203ENSMUST00000128788 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
BC067074F6RXI4 9430007M09Rik-201ENSMUST00000201947 804 ntBASIC11.31□□□□□ -0.6
BC067074F6RXI4 4930518P08Rik-201ENSMUST00000221281 1187 ntTSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
BC067074F6RXI4 AC099934.3-201ENSMUST00000223192 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
BC067074F6RXI4 Prss41-201ENSMUST00000024926 1128 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
BC067074F6RXI4 Mief1-202ENSMUST00000166030 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
BC067074F6RXI4 B3gnt5-202ENSMUST00000119468 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
BC067074F6RXI4 Fkbp4-201ENSMUST00000032508 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
BC067074F6RXI4 Gm42853-201ENSMUST00000201273 1387 ntBASIC11.31□□□□□ -0.6
BC067074F6RXI4 Pbk-201ENSMUST00000022612 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
BC067074F6RXI4 Slc4a5-203ENSMUST00000113900 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.3□□□□□ -0.6
BC067074F6RXI4 Nat6-201ENSMUST00000093785 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
BC067074F6RXI4 Gm26560-201ENSMUST00000181240 2619 ntTSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
BC067074F6RXI4 B3galt4-201ENSMUST00000087543 1569 ntAPPRIS P1 BASIC11.3□□□□□ -0.6
BC067074F6RXI4 Atxn7l2-203ENSMUST00000117784 2387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
BC067074F6RXI4 Gnat1-201ENSMUST00000010205 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
BC067074F6RXI4 Grik2-210ENSMUST00000220263 2085 ntTSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
BC067074F6RXI4 Hs3st5-201ENSMUST00000058738 3078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
BC067074F6RXI4 2210011K15Rik-201ENSMUST00000190690 1741 ntTSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
BC067074F6RXI4 Zfp868-202ENSMUST00000121886 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
BC067074F6RXI4 Pla2g2e-203ENSMUST00000105804 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
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