Protein–RNA interactions for Protein: E9Q2T4

4930523C07Rik, RIKEN cDNA 4930523C07 gene, mousemouse

Predictions only

Length 99 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
4930523C07RikE9Q2T4 Slc45a4-204ENSMUST00000132607 2457 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
4930523C07RikE9Q2T4 Fam71e1-201ENSMUST00000107927 862 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
4930523C07RikE9Q2T4 Prss41-202ENSMUST00000122936 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
4930523C07RikE9Q2T4 Gm20482-202ENSMUST00000174729 825 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
4930523C07RikE9Q2T4 Erg28-201ENSMUST00000021676 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
4930523C07RikE9Q2T4 Clps-201ENSMUST00000025062 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
4930523C07RikE9Q2T4 Retreg1-202ENSMUST00000110438 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
4930523C07RikE9Q2T4 Adck5-214ENSMUST00000162503 2040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
4930523C07RikE9Q2T4 Gm11696-201ENSMUST00000070956 2765 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
4930523C07RikE9Q2T4 Hsd3b3-203ENSMUST00000107018 1443 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
4930523C07RikE9Q2T4 Psrc1-202ENSMUST00000102629 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
4930523C07RikE9Q2T4 Hcn2-202ENSMUST00000099513 3195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
4930523C07RikE9Q2T4 Wdr46-201ENSMUST00000025170 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
4930523C07RikE9Q2T4 Igdcc3-201ENSMUST00000034961 3146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
4930523C07RikE9Q2T4 4933424N20Rik-201ENSMUST00000200749 1463 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
4930523C07RikE9Q2T4 Prn-201ENSMUST00000124100 2132 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
4930523C07RikE9Q2T4 Gstt3-201ENSMUST00000001715 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
4930523C07RikE9Q2T4 Smpd2-201ENSMUST00000019965 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
4930523C07RikE9Q2T4 4933411K16Rik-201ENSMUST00000164518 1380 ntAPPRIS P1 BASIC17.69■□□□□ 0.42
4930523C07RikE9Q2T4 Rbm46-201ENSMUST00000048647 1794 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
4930523C07RikE9Q2T4 Fkbp10-201ENSMUST00000001595 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
4930523C07RikE9Q2T4 Vgf-201ENSMUST00000041543 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
4930523C07RikE9Q2T4 Fam219a-201ENSMUST00000108049 3296 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
4930523C07RikE9Q2T4 Gm11290-201ENSMUST00000124833 396 ntTSL 3 BASIC17.69■□□□□ 0.42
4930523C07RikE9Q2T4 Gm12714-201ENSMUST00000143391 669 ntTSL 3 BASIC17.69■□□□□ 0.42
4930523C07RikE9Q2T4 Gm13070-201ENSMUST00000146532 768 ntTSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
4930523C07RikE9Q2T4 Gm6222-202ENSMUST00000182143 629 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
4930523C07RikE9Q2T4 Gm4819-201ENSMUST00000182170 1009 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
4930523C07RikE9Q2T4 Trmt112-ps1-201ENSMUST00000202320 375 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
4930523C07RikE9Q2T4 Gm21769-201ENSMUST00000211922 111 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
4930523C07RikE9Q2T4 Gm7046-201ENSMUST00000221351 977 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
4930523C07RikE9Q2T4 Olfr222-201ENSMUST00000071943 1115 ntAPPRIS P1 BASIC17.69■□□□□ 0.42
4930523C07RikE9Q2T4 Aurkc-201ENSMUST00000086248 1154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
4930523C07RikE9Q2T4 Usmg5-201ENSMUST00000096014 341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
4930523C07RikE9Q2T4 Pomgnt1-202ENSMUST00000106496 2613 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
4930523C07RikE9Q2T4 Ppcdc-209ENSMUST00000214624 1814 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
4930523C07RikE9Q2T4 Apoa4-201ENSMUST00000034585 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
4930523C07RikE9Q2T4 Mark3-201ENSMUST00000075281 3321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
4930523C07RikE9Q2T4 E230025N22Rik-201ENSMUST00000115682 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
4930523C07RikE9Q2T4 Riox2-203ENSMUST00000120674 1753 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
4930523C07RikE9Q2T4 Gal3st4-203ENSMUST00000161647 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
4930523C07RikE9Q2T4 Klf14-201ENSMUST00000101589 3056 ntAPPRIS P1 BASIC17.68■□□□□ 0.42
4930523C07RikE9Q2T4 Atxn7l2-203ENSMUST00000117784 2387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
4930523C07RikE9Q2T4 Tex13b-201ENSMUST00000044179 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
4930523C07RikE9Q2T4 Zfp13-201ENSMUST00000057029 2139 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
4930523C07RikE9Q2T4 1810043G02Rik-202ENSMUST00000105398 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
4930523C07RikE9Q2T4 Mad2l2-203ENSMUST00000105707 949 ntTSL 3 BASIC17.68■□□□□ 0.42
4930523C07RikE9Q2T4 Prkab1-202ENSMUST00000111999 2026 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
4930523C07RikE9Q2T4 Comtd1-202ENSMUST00000124549 2314 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
4930523C07RikE9Q2T4 Borcs5-202ENSMUST00000166591 792 ntTSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
4930523C07RikE9Q2T4 Psme1-202ENSMUST00000172738 681 ntTSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
4930523C07RikE9Q2T4 Gsdmcl-ps-204ENSMUST00000191285 637 ntTSL 3 BASIC17.68■□□□□ 0.42
4930523C07RikE9Q2T4 Gm37922-201ENSMUST00000195596 455 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
4930523C07RikE9Q2T4 Gm43352-201ENSMUST00000196419 3065 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
4930523C07RikE9Q2T4 Gm44985-201ENSMUST00000206202 1016 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
4930523C07RikE9Q2T4 Gm9445-201ENSMUST00000207454 1285 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
4930523C07RikE9Q2T4 Hcfc1r1-201ENSMUST00000024697 946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
4930523C07RikE9Q2T4 Cdv3-201ENSMUST00000035484 3387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
4930523C07RikE9Q2T4 Lsm7-201ENSMUST00000035775 468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
4930523C07RikE9Q2T4 Ceacam10-201ENSMUST00000038069 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
4930523C07RikE9Q2T4 Fgf2-201ENSMUST00000038885 462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
4930523C07RikE9Q2T4 Nudt22-201ENSMUST00000041686 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
4930523C07RikE9Q2T4 Car5a-201ENSMUST00000057653 1249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
4930523C07RikE9Q2T4 Guf1-202ENSMUST00000087228 3433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
4930523C07RikE9Q2T4 Clcn2-201ENSMUST00000007207 3128 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
4930523C07RikE9Q2T4 Arsi-201ENSMUST00000040359 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
4930523C07RikE9Q2T4 Ppfia1-201ENSMUST00000168134 5181 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
4930523C07RikE9Q2T4 Gm16534-201ENSMUST00000149300 1492 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
4930523C07RikE9Q2T4 Trim28-201ENSMUST00000005705 3245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
4930523C07RikE9Q2T4 Ppp2r5c-204ENSMUST00000221074 1971 ntTSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
4930523C07RikE9Q2T4 Sept8-202ENSMUST00000117061 4563 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
4930523C07RikE9Q2T4 Mars-206ENSMUST00000171564 2962 ntTSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
4930523C07RikE9Q2T4 Smim10l1-201ENSMUST00000100864 2842 ntAPPRIS P1 BASIC17.67■□□□□ 0.42
4930523C07RikE9Q2T4 Mink1-205ENSMUST00000102559 4865 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
4930523C07RikE9Q2T4 Rbl2-201ENSMUST00000034091 4925 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
4930523C07RikE9Q2T4 Gm14812-201ENSMUST00000156494 1794 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
4930523C07RikE9Q2T4 Bscl2-206ENSMUST00000160556 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
4930523C07RikE9Q2T4 Emd-204ENSMUST00000119197 768 ntTSL 3 BASIC17.67■□□□□ 0.42
4930523C07RikE9Q2T4 Ptgr2-205ENSMUST00000135001 1286 ntTSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
4930523C07RikE9Q2T4 Pla2g10os-201ENSMUST00000141172 174 ntTSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
4930523C07RikE9Q2T4 Gm37986-201ENSMUST00000193285 383 ntBASIC17.67■□□□□ 0.42
4930523C07RikE9Q2T4 Gm5565-201ENSMUST00000199463 1162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
4930523C07RikE9Q2T4 AC073947.2-201ENSMUST00000215888 1130 ntBASIC17.67■□□□□ 0.42
4930523C07RikE9Q2T4 AC132384.14-201ENSMUST00000219346 1147 ntBASIC17.67■□□□□ 0.42
4930523C07RikE9Q2T4 AC153366.2-201ENSMUST00000219461 1984 ntBASIC17.67■□□□□ 0.42
4930523C07RikE9Q2T4 Prmt5-201ENSMUST00000023873 2691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
4930523C07RikE9Q2T4 Tmcc1-202ENSMUST00000088896 5838 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
4930523C07RikE9Q2T4 Med7-203ENSMUST00000109232 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
4930523C07RikE9Q2T4 Gm43579-201ENSMUST00000202387 1307 ntBASIC17.67■□□□□ 0.42
4930523C07RikE9Q2T4 Gclc-201ENSMUST00000034905 3423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
4930523C07RikE9Q2T4 Gemin2-201ENSMUST00000021379 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
4930523C07RikE9Q2T4 Agfg1-201ENSMUST00000063380 2896 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
4930523C07RikE9Q2T4 Aipl1-201ENSMUST00000048207 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
4930523C07RikE9Q2T4 Skp1a-201ENSMUST00000037324 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
4930523C07RikE9Q2T4 Rassf8-203ENSMUST00000111704 5446 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
4930523C07RikE9Q2T4 Zc3h14-204ENSMUST00000110105 3514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
4930523C07RikE9Q2T4 Klf15-204ENSMUST00000203607 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
4930523C07RikE9Q2T4 Rps10-203ENSMUST00000114882 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
4930523C07RikE9Q2T4 1700061E18Rik-201ENSMUST00000154159 588 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
4930523C07RikE9Q2T4 Lage3-201ENSMUST00000015433 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36 ms