Protein–RNA interactions for Protein: E9Q007

Gm4450, Predicted gene 4450, mousemouse

Predictions only

Length 373 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm4450E9Q007 Lce1c-201ENSMUST00000047055 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Gm4450E9Q007 Nupl2-201ENSMUST00000049887 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Gm4450E9Q007 Parp3-203ENSMUST00000123555 2495 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Gm4450E9Q007 Fbxo46-202ENSMUST00000165913 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Gm4450E9Q007 Cul7-201ENSMUST00000043464 5530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Gm4450E9Q007 Hoxaas3-202ENSMUST00000136806 2207 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Gm4450E9Q007 Gdap1l1-201ENSMUST00000018087 2220 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Gm4450E9Q007 L2hgdh-201ENSMUST00000021370 3340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Gm4450E9Q007 Rhot1-202ENSMUST00000055056 4260 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Gm4450E9Q007 Hdac10-202ENSMUST00000109347 1824 ntTSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.08
Gm4450E9Q007 Nat8f3-201ENSMUST00000050780 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Gm4450E9Q007 Cspg5-204ENSMUST00000197850 7868 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.08
Gm4450E9Q007 Npnt-204ENSMUST00000117164 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Gm4450E9Q007 Ccdc157-202ENSMUST00000101626 5153 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Gm4450E9Q007 Grin2a-202ENSMUST00000115835 5023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.08
Gm4450E9Q007 Fam76b-201ENSMUST00000059579 3702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Gm4450E9Q007 Tepsin-203ENSMUST00000106225 2566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.08
Gm4450E9Q007 Gm43509-201ENSMUST00000196551 2594 ntBASIC14.52□□□□□ -0.08
Gm4450E9Q007 Gnb4-201ENSMUST00000108234 2510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Gm4450E9Q007 Tmem143-203ENSMUST00000209350 2466 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Gm4450E9Q007 Kdm8-201ENSMUST00000033010 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Gm4450E9Q007 Ptprv-210ENSMUST00000183317 6108 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Gm4450E9Q007 Syn1-202ENSMUST00000115345 3261 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Gm4450E9Q007 Kctd20-202ENSMUST00000117672 2219 ntTSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.08
Gm4450E9Q007 AC159621.2-201ENSMUST00000223519 1326 ntBASIC14.52□□□□□ -0.08
Gm4450E9Q007 Dnajc5-202ENSMUST00000108796 934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Gm4450E9Q007 Hagh-202ENSMUST00000118788 1191 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Gm4450E9Q007 Gm15957-201ENSMUST00000118893 974 ntBASIC14.52□□□□□ -0.09
Gm4450E9Q007 Tmem262-201ENSMUST00000143303 545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Gm4450E9Q007 Faap20-210ENSMUST00000178473 1076 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Gm4450E9Q007 Gm27618-201ENSMUST00000183671 60 ntBASIC14.52□□□□□ -0.09
Gm4450E9Q007 Smim22-206ENSMUST00000184256 381 ntTSL 3 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Gm4450E9Q007 Timm13-203ENSMUST00000218481 471 ntTSL 3 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Gm4450E9Q007 Dupd1-202ENSMUST00000224735 548 ntBASIC14.52□□□□□ -0.09
Gm4450E9Q007 AC126408.1-201ENSMUST00000225184 523 ntBASIC14.52□□□□□ -0.09
Gm4450E9Q007 AC121598.1-201ENSMUST00000228224 1019 ntBASIC14.52□□□□□ -0.09
Gm4450E9Q007 Ndufc2-201ENSMUST00000032882 683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Gm4450E9Q007 Wdr70-201ENSMUST00000045766 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Gm4450E9Q007 Ndufa8-201ENSMUST00000070112 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Gm4450E9Q007 Epha1-203ENSMUST00000204357 2948 ntTSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Gm4450E9Q007 Lrch4-202ENSMUST00000175968 2036 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Gm4450E9Q007 Fam151a-201ENSMUST00000047620 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Gm4450E9Q007 Strap-201ENSMUST00000064910 2650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Gm4450E9Q007 Hcfc2-201ENSMUST00000020478 3422 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Gm4450E9Q007 Rgs20-201ENSMUST00000002533 1778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Gm4450E9Q007 Erbb2-201ENSMUST00000058295 5012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Gm4450E9Q007 AC162938.1-201ENSMUST00000213140 2323 ntBASIC14.52□□□□□ -0.09
Gm4450E9Q007 Cry2-202ENSMUST00000111278 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Gm4450E9Q007 Gm42893-201ENSMUST00000198035 1502 ntTSL 3 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Gm4450E9Q007 Ak1-203ENSMUST00000113278 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Gm4450E9Q007 Jakmip1-212ENSMUST00000174629 1941 ntTSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Gm4450E9Q007 Tbx15-201ENSMUST00000029462 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Gm4450E9Q007 Mcrs1-201ENSMUST00000041190 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Gm4450E9Q007 Atat1-203ENSMUST00000077494 1340 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Gm4450E9Q007 Gm10044-201ENSMUST00000081331 1312 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Gm4450E9Q007 Arhgap44-203ENSMUST00000093002 3982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Gm4450E9Q007 Cacnb1-201ENSMUST00000017552 3396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Gm4450E9Q007 Wdr13-205ENSMUST00000130832 4374 ntTSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Gm4450E9Q007 Gm13453-201ENSMUST00000118708 357 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
Gm4450E9Q007 Gm14767-201ENSMUST00000121559 586 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
Gm4450E9Q007 Gm16091-201ENSMUST00000156664 963 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Gm4450E9Q007 Mir99ahg-211ENSMUST00000183099 1189 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Gm4450E9Q007 Gm37277-201ENSMUST00000194052 1111 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
Gm4450E9Q007 Gm44608-201ENSMUST00000206827 855 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
Gm4450E9Q007 Gm33337-201ENSMUST00000219594 228 ntTSL 3 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Gm4450E9Q007 Clec4g-202ENSMUST00000062037 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Gm4450E9Q007 Mir125a-201ENSMUST00000083545 68 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
Gm4450E9Q007 Gm13111-201ENSMUST00000136217 3542 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Gm4450E9Q007 Reep1-201ENSMUST00000121469 3924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Gm4450E9Q007 Plcb3-201ENSMUST00000025912 4201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Gm4450E9Q007 Rnf25-202ENSMUST00000113721 1451 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Gm4450E9Q007 Serpina11-202ENSMUST00000120251 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Gm4450E9Q007 Sirt3-202ENSMUST00000106048 1416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Gm4450E9Q007 Dap3-207ENSMUST00000173135 1409 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Gm4450E9Q007 Gm26681-201ENSMUST00000180851 1440 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Gm4450E9Q007 Rogdi-201ENSMUST00000023191 1431 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Gm4450E9Q007 Itga8-201ENSMUST00000028106 5812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Gm4450E9Q007 Medag-201ENSMUST00000093110 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Gm4450E9Q007 Per1-203ENSMUST00000102605 4537 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Gm4450E9Q007 Gcnt2-205ENSMUST00000225759 1366 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Gm4450E9Q007 Gm45504-201ENSMUST00000211407 2107 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
Gm4450E9Q007 Rnf138-201ENSMUST00000052396 3110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Gm4450E9Q007 Gm13383-201ENSMUST00000131190 1171 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Gm4450E9Q007 Gm15862-201ENSMUST00000146349 361 ntTSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Gm4450E9Q007 Gm27680-201ENSMUST00000184192 160 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
Gm4450E9Q007 Gm42787-201ENSMUST00000200879 1164 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Gm4450E9Q007 Sar1b-201ENSMUST00000020653 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Gm4450E9Q007 Wdr45-225ENSMUST00000208443 1172 ntTSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Gm4450E9Q007 AC159114.1-201ENSMUST00000220349 266 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
Gm4450E9Q007 Cnpy2-201ENSMUST00000026446 763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Gm4450E9Q007 Dkkl1-201ENSMUST00000033057 1149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Gm4450E9Q007 Tex12-201ENSMUST00000034568 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Gm4450E9Q007 Rnf180-203ENSMUST00000224662 2734 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Gm4450E9Q007 F2-201ENSMUST00000028681 1988 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Gm4450E9Q007 Dnmt3a-205ENSMUST00000172689 2328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Gm4450E9Q007 Tnfrsf11a-201ENSMUST00000027559 5027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Gm4450E9Q007 Adam9-202ENSMUST00000084035 3985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Gm4450E9Q007 Rnf167-201ENSMUST00000037534 1833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Gm4450E9Q007 Acrbp-205ENSMUST00000112414 1498 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Gm4450E9Q007 Tex13b-201ENSMUST00000044179 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 81 ms