Protein–RNA interactions for Protein: E9PZQ1

Ddx60, DEAD (Asp-Glu-Ala-Asp) box polypeptide 60, mousemouse

Predictions only

Length 1,711 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ddx60E9PZQ1 Ak1-201ENSMUST00000068271 2034 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Ddx60E9PZQ1 Ccna2-201ENSMUST00000029270 2965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Ddx60E9PZQ1 Fars2-208ENSMUST00000224611 1750 ntAPPRIS P1 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Ddx60E9PZQ1 Itpk1-201ENSMUST00000046518 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Ddx60E9PZQ1 Gm23931-201ENSMUST00000103842 109 ntBASIC17.49■□□□□ 0.39
Ddx60E9PZQ1 Pnpo-202ENSMUST00000107629 681 ntTSL 3 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Ddx60E9PZQ1 Gm16122-201ENSMUST00000142625 1158 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Ddx60E9PZQ1 Gm8584-201ENSMUST00000171982 758 ntBASIC17.49■□□□□ 0.39
Ddx60E9PZQ1 Gm37047-201ENSMUST00000191992 533 ntTSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Ddx60E9PZQ1 Ube2a-205ENSMUST00000201068 1298 ntTSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Ddx60E9PZQ1 AC122459.1-201ENSMUST00000228373 885 ntBASIC17.49■□□□□ 0.39
Ddx60E9PZQ1 Cfc1-201ENSMUST00000027298 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Ddx60E9PZQ1 Duoxa1-201ENSMUST00000028653 1026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Ddx60E9PZQ1 Tex26-201ENSMUST00000031667 1137 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Ddx60E9PZQ1 Mark2-209ENSMUST00000165965 2874 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Ddx60E9PZQ1 Lrrfip2-201ENSMUST00000035078 3260 ntTSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Ddx60E9PZQ1 Snx11-201ENSMUST00000021246 2551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Ddx60E9PZQ1 Apbb1-215ENSMUST00000190369 1882 ntTSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Ddx60E9PZQ1 Fhl2-202ENSMUST00000185893 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Ddx60E9PZQ1 Slc5a2-202ENSMUST00000118169 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Ddx60E9PZQ1 Nat3-201ENSMUST00000070514 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Ddx60E9PZQ1 Scarf1-202ENSMUST00000118243 2617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Ddx60E9PZQ1 AC114008.2-201ENSMUST00000227699 1347 ntBASIC17.48■□□□□ 0.39
Ddx60E9PZQ1 Gm12957-201ENSMUST00000117835 377 ntBASIC17.48■□□□□ 0.39
Ddx60E9PZQ1 Med28-203ENSMUST00000119579 636 ntTSL 3 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Ddx60E9PZQ1 Map2k3os-201ENSMUST00000123544 1291 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Ddx60E9PZQ1 Gm10863-205ENSMUST00000148028 905 ntTSL 3 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Ddx60E9PZQ1 1700123K08Rik-201ENSMUST00000031501 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Ddx60E9PZQ1 Wdr83-201ENSMUST00000093357 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Ddx60E9PZQ1 Cd3d-201ENSMUST00000034602 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Ddx60E9PZQ1 Chd5-202ENSMUST00000030775 9486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Ddx60E9PZQ1 Gm45504-201ENSMUST00000211407 2107 ntBASIC17.48■□□□□ 0.39
Ddx60E9PZQ1 Cdk6-201ENSMUST00000042410 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Ddx60E9PZQ1 Map2k6-201ENSMUST00000020949 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Ddx60E9PZQ1 Adora2a-201ENSMUST00000105420 2596 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Ddx60E9PZQ1 Mypn-202ENSMUST00000218978 1833 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Ddx60E9PZQ1 Knop1-203ENSMUST00000106549 1467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Ddx60E9PZQ1 Gm26850-201ENSMUST00000181653 2669 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Ddx60E9PZQ1 Tssc4-202ENSMUST00000105920 895 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Ddx60E9PZQ1 Gm12485-201ENSMUST00000119641 291 ntBASIC17.47■□□□□ 0.39
Ddx60E9PZQ1 9430085M18Rik-201ENSMUST00000198824 1178 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Ddx60E9PZQ1 Gm44799-201ENSMUST00000207639 1202 ntBASIC17.47■□□□□ 0.39
Ddx60E9PZQ1 Saa2-203ENSMUST00000210769 652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Ddx60E9PZQ1 Ccdc159-204ENSMUST00000216710 1126 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Ddx60E9PZQ1 AC153144.2-201ENSMUST00000221766 451 ntTSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Ddx60E9PZQ1 Naa10-201ENSMUST00000033763 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Ddx60E9PZQ1 Saa2-201ENSMUST00000075982 606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Ddx60E9PZQ1 Lyzl4-201ENSMUST00000077706 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Ddx60E9PZQ1 Ifngr2-201ENSMUST00000023687 3254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Ddx60E9PZQ1 Map7d1-203ENSMUST00000122129 3249 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Ddx60E9PZQ1 Fam192a-201ENSMUST00000034226 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Ddx60E9PZQ1 Keap1-205ENSMUST00000194542 3151 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Ddx60E9PZQ1 Hadhb-201ENSMUST00000026841 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Ddx60E9PZQ1 Lrrc58-201ENSMUST00000078717 8604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Ddx60E9PZQ1 Metap1d-201ENSMUST00000037210 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Ddx60E9PZQ1 Ppp2r5b-201ENSMUST00000025695 2742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Ddx60E9PZQ1 Cenpl-203ENSMUST00000111620 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Ddx60E9PZQ1 Brix1-201ENSMUST00000022855 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Ddx60E9PZQ1 Mup-ps23-201ENSMUST00000118063 630 ntBASIC17.47■□□□□ 0.39
Ddx60E9PZQ1 Gm9816-201ENSMUST00000122292 1414 ntBASIC17.47■□□□□ 0.39
Ddx60E9PZQ1 1700012C14Rik-201ENSMUST00000132023 498 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Ddx60E9PZQ1 Myl3-203ENSMUST00000136695 614 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Ddx60E9PZQ1 Shisa5-203ENSMUST00000154184 1038 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Ddx60E9PZQ1 Gm12840-201ENSMUST00000156081 627 ntTSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Ddx60E9PZQ1 Gm29152-201ENSMUST00000189284 325 ntTSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Ddx60E9PZQ1 Alx1-205ENSMUST00000218282 2012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Ddx60E9PZQ1 AC114543.1-201ENSMUST00000226451 1558 ntBASIC17.47■□□□□ 0.39
Ddx60E9PZQ1 Mocs1-201ENSMUST00000024797 2646 ntTSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Ddx60E9PZQ1 Snx24-201ENSMUST00000025417 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Ddx60E9PZQ1 Atp5d-201ENSMUST00000003156 931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Ddx60E9PZQ1 Zfand3-201ENSMUST00000057897 2617 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Ddx60E9PZQ1 Pcgf1-201ENSMUST00000092614 866 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Ddx60E9PZQ1 Cdadc1-201ENSMUST00000022555 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Ddx60E9PZQ1 Rtn3-201ENSMUST00000025667 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Ddx60E9PZQ1 Tgif2-201ENSMUST00000073352 2690 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Ddx60E9PZQ1 Zkscan3-203ENSMUST00000116434 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Ddx60E9PZQ1 Por-202ENSMUST00000122113 2606 ntTSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Ddx60E9PZQ1 Tmem143-203ENSMUST00000209350 2466 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Ddx60E9PZQ1 Hcrtr1-201ENSMUST00000030562 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Ddx60E9PZQ1 Gm6159-201ENSMUST00000191249 1724 ntBASIC17.46■□□□□ 0.39
Ddx60E9PZQ1 Tox2-202ENSMUST00000109428 2947 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Ddx60E9PZQ1 Gm39027-201ENSMUST00000208560 2942 ntTSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Ddx60E9PZQ1 Syngr2-202ENSMUST00000120928 1402 ntTSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Ddx60E9PZQ1 Gclm-201ENSMUST00000029769 5589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Ddx60E9PZQ1 Capns2-201ENSMUST00000104947 1005 ntAPPRIS P1 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Ddx60E9PZQ1 Pax5-206ENSMUST00000134968 969 ntTSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Ddx60E9PZQ1 Gm14285-201ENSMUST00000146049 380 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Ddx60E9PZQ1 Gm11723-201ENSMUST00000155505 466 ntTSL 3 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Ddx60E9PZQ1 2610306M01Rik-201ENSMUST00000185414 1042 ntBASIC17.46■□□□□ 0.39
Ddx60E9PZQ1 4930518P08Rik-201ENSMUST00000221281 1187 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Ddx60E9PZQ1 Tchp-201ENSMUST00000094441 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Ddx60E9PZQ1 Btd-201ENSMUST00000090147 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Ddx60E9PZQ1 Gm9200-201ENSMUST00000118513 1354 ntBASIC17.46■□□□□ 0.39
Ddx60E9PZQ1 Disc1-207ENSMUST00000121953 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Ddx60E9PZQ1 Retsat-205ENSMUST00000176364 1647 ntTSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.38
Ddx60E9PZQ1 Kctd18-202ENSMUST00000114410 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.38
Ddx60E9PZQ1 Itga6-201ENSMUST00000028522 4310 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.38
Ddx60E9PZQ1 Vps51-204ENSMUST00000159832 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.38
Ddx60E9PZQ1 Dusp8-201ENSMUST00000039926 4804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.38
Ddx60E9PZQ1 Tspan32-205ENSMUST00000105924 1478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.38
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.3 ms