Protein–RNA interactions for Protein: E9PZ54

Gcom1, GRINL1A complex locus, mousemouse

Predictions only

Length 550 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gcom1E9PZ54 Sdhc-201ENSMUST00000081560 815 ntTSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Gcom1E9PZ54 Cux2-202ENSMUST00000111752 8784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Gcom1E9PZ54 Rbm47-201ENSMUST00000094756 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Gcom1E9PZ54 Ghdc-201ENSMUST00000017891 2462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Gcom1E9PZ54 Exoc6b-203ENSMUST00000160197 5439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Gcom1E9PZ54 Acin1-224ENSMUST00000167015 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Gcom1E9PZ54 Rcn3-201ENSMUST00000019683 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Gcom1E9PZ54 Rcn3-208ENSMUST00000211352 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Gcom1E9PZ54 Crybg1-202ENSMUST00000200401 7525 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Gcom1E9PZ54 Pglyrp2-201ENSMUST00000114455 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Gcom1E9PZ54 Ankrd27-202ENSMUST00000186245 1926 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Gcom1E9PZ54 Psmd12-201ENSMUST00000021063 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Gcom1E9PZ54 Rabepk-203ENSMUST00000118108 1431 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Gcom1E9PZ54 Ociad2-205ENSMUST00000201908 2378 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Gcom1E9PZ54 Enc1-201ENSMUST00000041623 4737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Gcom1E9PZ54 Vamp8-202ENSMUST00000142613 2076 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Gcom1E9PZ54 Amn1-201ENSMUST00000095319 1369 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Gcom1E9PZ54 Syngap1-201ENSMUST00000081285 4315 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Gcom1E9PZ54 Dph5-204ENSMUST00000189799 1558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Gcom1E9PZ54 Grk3-203ENSMUST00000197776 1570 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Gcom1E9PZ54 Slc4a1ap-213ENSMUST00000202950 2499 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Gcom1E9PZ54 Ash2l-202ENSMUST00000110608 2134 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Gcom1E9PZ54 4930481B07Rik-201ENSMUST00000128160 1089 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Gcom1E9PZ54 Cdpf1-203ENSMUST00000134631 786 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Gcom1E9PZ54 Psma3-204ENSMUST00000160864 859 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Gcom1E9PZ54 A730015C16Rik-201ENSMUST00000164855 1221 ntAPPRIS P1 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Gcom1E9PZ54 Gm34391-201ENSMUST00000203706 907 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Gcom1E9PZ54 Gsdmcl1-201ENSMUST00000071847 1133 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Gcom1E9PZ54 Slc16a13-201ENSMUST00000060010 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Gcom1E9PZ54 Nfat5-201ENSMUST00000075922 4619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Gcom1E9PZ54 Traf1-201ENSMUST00000028234 2069 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Gcom1E9PZ54 Zfp747-201ENSMUST00000067425 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Gcom1E9PZ54 Rfesd-203ENSMUST00000179078 1436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Gcom1E9PZ54 Tmc8-202ENSMUST00000106334 2644 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Gcom1E9PZ54 Ccdc92b-201ENSMUST00000100866 4002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Gcom1E9PZ54 Atp8a1-201ENSMUST00000037380 8178 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Gcom1E9PZ54 Itgb4-203ENSMUST00000106458 5779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Gcom1E9PZ54 Ccdc24-201ENSMUST00000106422 1365 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Gcom1E9PZ54 Gm45188-201ENSMUST00000207592 1369 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Gcom1E9PZ54 Yap1-202ENSMUST00000086580 4115 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Gcom1E9PZ54 Gtf2ird1-229ENSMUST00000202554 3514 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Gcom1E9PZ54 Slc7a7-209ENSMUST00000226753 2126 ntAPPRIS P1 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Gcom1E9PZ54 Zfp142-203ENSMUST00000113737 7473 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Gcom1E9PZ54 2010300F17Rik-202ENSMUST00000181758 2493 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Gcom1E9PZ54 A930004D18Rik-201ENSMUST00000066163 3217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Gcom1E9PZ54 Clpb-202ENSMUST00000106998 2287 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Gcom1E9PZ54 Gins4-201ENSMUST00000033950 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Gcom1E9PZ54 4930429P21Rik-202ENSMUST00000194547 2061 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Gcom1E9PZ54 Epsti1-201ENSMUST00000022591 1870 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Gcom1E9PZ54 Stap2-201ENSMUST00000043785 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Gcom1E9PZ54 Cacna2d2-208ENSMUST00000170737 5332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Gcom1E9PZ54 Pcdha11-203ENSMUST00000192447 4583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Gcom1E9PZ54 Cdkn2aip-201ENSMUST00000038738 3464 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Gcom1E9PZ54 Tfpt-202ENSMUST00000108641 1166 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Gcom1E9PZ54 Gm11764-201ENSMUST00000120221 623 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Gcom1E9PZ54 Gm27459-201ENSMUST00000184860 107 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Gcom1E9PZ54 Rpl8-201ENSMUST00000004072 862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Gcom1E9PZ54 Paox-202ENSMUST00000097967 1024 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Gcom1E9PZ54 Fgfr1-201ENSMUST00000084027 5025 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Gcom1E9PZ54 Prkcq-201ENSMUST00000028118 3583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Gcom1E9PZ54 Ndufab1-203ENSMUST00000123296 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Gcom1E9PZ54 Rbbp5-206ENSMUST00000190825 2456 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Gcom1E9PZ54 Sphk2-201ENSMUST00000072836 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Gcom1E9PZ54 Nxpe5-202ENSMUST00000159798 2568 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Gcom1E9PZ54 Rgs12-202ENSMUST00000087684 4713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Gcom1E9PZ54 Rcan1-201ENSMUST00000023672 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Gcom1E9PZ54 Zscan12-202ENSMUST00000099720 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Gcom1E9PZ54 Gm2895-201ENSMUST00000171591 3194 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Gcom1E9PZ54 Pxn-213ENSMUST00000202564 2126 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Gcom1E9PZ54 Slc27a1-201ENSMUST00000034267 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Gcom1E9PZ54 4632404H12Rik-201ENSMUST00000038450 2791 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Gcom1E9PZ54 Mansc4-201ENSMUST00000100780 1125 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Gcom1E9PZ54 Rhox2h-201ENSMUST00000115162 779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Gcom1E9PZ54 A930006K02Rik-201ENSMUST00000149172 776 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Gcom1E9PZ54 Tmem9-205ENSMUST00000165125 901 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Gcom1E9PZ54 Gm21887-202ENSMUST00000179760 483 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Gcom1E9PZ54 4930442P19Rik-201ENSMUST00000193163 1240 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Gcom1E9PZ54 Gtf3c2-202ENSMUST00000200871 318 ntTSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Gcom1E9PZ54 Gm44202-201ENSMUST00000203549 532 ntTSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Gcom1E9PZ54 Atp6v0c-202ENSMUST00000098862 796 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Gcom1E9PZ54 Chaf1a-201ENSMUST00000002914 3308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Gcom1E9PZ54 Trabd2b-201ENSMUST00000094894 6617 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Gcom1E9PZ54 Polg-201ENSMUST00000073889 7837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Gcom1E9PZ54 Adad1-203ENSMUST00000144629 3101 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Gcom1E9PZ54 Gm10110-201ENSMUST00000081204 1891 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Gcom1E9PZ54 Fam57b-202ENSMUST00000098032 1894 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Gcom1E9PZ54 Matn2-206ENSMUST00000228570 2798 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Gcom1E9PZ54 Prss23-201ENSMUST00000041761 3228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Gcom1E9PZ54 Tfe3-211ENSMUST00000137467 3390 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Gcom1E9PZ54 Cfap99-201ENSMUST00000207754 2123 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Gcom1E9PZ54 Srp72-202ENSMUST00000120550 2297 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Gcom1E9PZ54 Fmnl2-205ENSMUST00000155586 3939 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Gcom1E9PZ54 Ccdc85a-204ENSMUST00000109502 5220 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Gcom1E9PZ54 Aph1a-202ENSMUST00000056710 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Gcom1E9PZ54 Gm10489-201ENSMUST00000180511 1466 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Gcom1E9PZ54 Ppia-206ENSMUST00000213200 1450 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Gcom1E9PZ54 Tmem19-203ENSMUST00000217884 2799 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Gcom1E9PZ54 Popdc2-201ENSMUST00000023494 2169 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Gcom1E9PZ54 Bicd1-202ENSMUST00000086829 9667 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Gcom1E9PZ54 Dlk1-205ENSMUST00000109844 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.8 ms