Protein–RNA interactions for Protein: E9PYK3

Parp4, Poly [ADP-ribose] polymerase, mousemouse

Predictions only

Length 1,969 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Parp4E9PYK3 Wwc2-201ENSMUST00000057561 8678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Parp4E9PYK3 Gm5478-201ENSMUST00000100184 2566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Parp4E9PYK3 Foxl1-201ENSMUST00000181609 2705 ntAPPRIS P1 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Parp4E9PYK3 Ehd4-201ENSMUST00000028755 3730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Parp4E9PYK3 Pcyox1l-201ENSMUST00000025472 2017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Parp4E9PYK3 Dyrk3-201ENSMUST00000016670 3164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Parp4E9PYK3 Dnajc7-201ENSMUST00000014339 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Parp4E9PYK3 Irx3os-201ENSMUST00000062522 2988 ntTSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Parp4E9PYK3 Sorbs3-204ENSMUST00000227929 2460 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
Parp4E9PYK3 Sytl1-201ENSMUST00000030674 1951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Parp4E9PYK3 Ispd-202ENSMUST00000220519 3122 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Parp4E9PYK3 Spg20-201ENSMUST00000044116 3770 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Parp4E9PYK3 Tlnrd1-201ENSMUST00000094216 4433 ntAPPRIS P1 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Parp4E9PYK3 Etfrf1-205ENSMUST00000111724 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Parp4E9PYK3 Cdk2-202ENSMUST00000026416 2406 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Parp4E9PYK3 Vldlr-208ENSMUST00000172302 3855 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Parp4E9PYK3 Ankib1-201ENSMUST00000043551 6426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Parp4E9PYK3 AC115735.4-201ENSMUST00000227460 1944 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
Parp4E9PYK3 Rnaseh2a-206ENSMUST00000128972 1141 ntTSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Parp4E9PYK3 1700072B07Rik-201ENSMUST00000191141 445 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Parp4E9PYK3 Ighv8-8-201ENSMUST00000192591 358 ntAPPRIS P1 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Parp4E9PYK3 Gm45195-201ENSMUST00000205597 1008 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
Parp4E9PYK3 Wdr45-225ENSMUST00000208443 1172 ntTSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Parp4E9PYK3 Prrg2-207ENSMUST00000210500 922 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Parp4E9PYK3 Gm5519-201ENSMUST00000042061 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Parp4E9PYK3 Irf2bpl-201ENSMUST00000038422 4098 ntAPPRIS P1 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Parp4E9PYK3 Mmp17-201ENSMUST00000031390 6422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Parp4E9PYK3 A930033H14Rik-201ENSMUST00000170048 2969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Parp4E9PYK3 Ralgds-201ENSMUST00000028170 3590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Parp4E9PYK3 Afg3l2-201ENSMUST00000025408 3085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Parp4E9PYK3 Rassf5-203ENSMUST00000112442 3388 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Parp4E9PYK3 Etl4-207ENSMUST00000114610 2863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Parp4E9PYK3 Adgrb2-205ENSMUST00000106017 5104 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Parp4E9PYK3 Coil-202ENSMUST00000107898 3120 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Parp4E9PYK3 Alox8-202ENSMUST00000094078 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Parp4E9PYK3 Hadh-201ENSMUST00000029610 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Parp4E9PYK3 Pex2-202ENSMUST00000071280 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Parp4E9PYK3 Nfe2-205ENSMUST00000133600 1605 ntTSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Parp4E9PYK3 Elmod1-201ENSMUST00000048409 2605 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Parp4E9PYK3 Keap1-205ENSMUST00000194542 3151 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Parp4E9PYK3 Jaml-204ENSMUST00000215880 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Parp4E9PYK3 Nr1d1-201ENSMUST00000064941 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Parp4E9PYK3 Rdm1-201ENSMUST00000010506 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Parp4E9PYK3 Gm42722-201ENSMUST00000198855 940 ntTSL 3 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Parp4E9PYK3 Gm45552-201ENSMUST00000209340 778 ntTSL 3 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Parp4E9PYK3 Wwp2-205ENSMUST00000212543 1996 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Parp4E9PYK3 Shroom3-204ENSMUST00000168878 5630 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Parp4E9PYK3 Luc7l3-201ENSMUST00000021226 3373 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Parp4E9PYK3 F420014N23Rik-201ENSMUST00000181578 2396 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Parp4E9PYK3 Large1-204ENSMUST00000212459 4746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Parp4E9PYK3 Pomgnt1-202ENSMUST00000106496 2613 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Parp4E9PYK3 Art3-205ENSMUST00000120193 1371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Parp4E9PYK3 Slc8a3-202ENSMUST00000085238 4927 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Parp4E9PYK3 Selenon-201ENSMUST00000060435 3445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Parp4E9PYK3 Fndc7-201ENSMUST00000053065 3009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Parp4E9PYK3 Wtap-201ENSMUST00000007007 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Parp4E9PYK3 Ushbp1-201ENSMUST00000049184 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Parp4E9PYK3 Pigyl-201ENSMUST00000123680 695 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Parp4E9PYK3 Unkl-205ENSMUST00000161679 1053 ntTSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Parp4E9PYK3 Gm5819-201ENSMUST00000171469 465 ntAPPRIS P1 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Parp4E9PYK3 Gm4129-201ENSMUST00000220083 625 ntTSL 3 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Parp4E9PYK3 AC155729.1-201ENSMUST00000227758 544 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
Parp4E9PYK3 Eapp-201ENSMUST00000067272 590 ntTSL 3 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Parp4E9PYK3 Polr2g-201ENSMUST00000096261 868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Parp4E9PYK3 Srp72-202ENSMUST00000120550 2297 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Parp4E9PYK3 Dusp15-203ENSMUST00000123121 2993 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Parp4E9PYK3 Map3k6-201ENSMUST00000030677 4334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Parp4E9PYK3 Pex3-202ENSMUST00000105539 1961 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Parp4E9PYK3 Ppt2-201ENSMUST00000064953 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Parp4E9PYK3 Mex3a-201ENSMUST00000172699 5778 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Parp4E9PYK3 Traf1-201ENSMUST00000028234 2069 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Parp4E9PYK3 Lenep-201ENSMUST00000057431 1806 ntAPPRIS P1 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Parp4E9PYK3 Ptp4a3-201ENSMUST00000053232 3608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Parp4E9PYK3 Kcnh4-201ENSMUST00000107361 3748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Parp4E9PYK3 Syt6-201ENSMUST00000090697 4416 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Parp4E9PYK3 Ankrd13b-202ENSMUST00000092892 3336 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Parp4E9PYK3 Dr1-201ENSMUST00000031190 3085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Parp4E9PYK3 Sema4c-203ENSMUST00000191677 3779 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Parp4E9PYK3 Haglr-202ENSMUST00000152462 443 ntTSL 2 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Parp4E9PYK3 Gnb4-208ENSMUST00000193050 423 ntTSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Parp4E9PYK3 Gm6916-202ENSMUST00000205523 195 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
Parp4E9PYK3 2310016G11Rik-202ENSMUST00000209111 733 ntTSL 3 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Parp4E9PYK3 Gm9797-201ENSMUST00000052902 613 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
Parp4E9PYK3 Msi1-208ENSMUST00000150779 3133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Parp4E9PYK3 Smtnl2-202ENSMUST00000108500 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Parp4E9PYK3 Zfp683-201ENSMUST00000105884 1471 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Parp4E9PYK3 Gm20465-201ENSMUST00000174768 1932 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Parp4E9PYK3 Gm45630-201ENSMUST00000210243 1911 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
Parp4E9PYK3 Rspry1-207ENSMUST00000212729 2800 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Parp4E9PYK3 Rasa4-201ENSMUST00000042135 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Parp4E9PYK3 Stard5-201ENSMUST00000075418 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Parp4E9PYK3 Zfp512b-201ENSMUST00000108789 5714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Parp4E9PYK3 Zfp410-201ENSMUST00000045931 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Parp4E9PYK3 Ncf1-201ENSMUST00000016094 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Parp4E9PYK3 F2r-201ENSMUST00000059193 3336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Parp4E9PYK3 Zmiz1-201ENSMUST00000007961 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Parp4E9PYK3 Mrps9-201ENSMUST00000057208 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Parp4E9PYK3 Rnf168-203ENSMUST00000171474 4460 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Parp4E9PYK3 Acr-201ENSMUST00000023295 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Parp4E9PYK3 Tmem185b-202ENSMUST00000183952 2824 ntAPPRIS P1 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.9 ms