Protein–RNA interactions for Protein: E9PW74

Gimd1, GTPase IMAP family member GIMD1, mousemouse

Predictions only

Length 217 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gimd1E9PW74 9330121J05Rik-201ENSMUST00000192267 3009 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Gimd1E9PW74 Fam174a-202ENSMUST00000186780 3460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Gimd1E9PW74 Pla2g2e-202ENSMUST00000105803 381 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Gimd1E9PW74 Kif16bos-201ENSMUST00000124774 495 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Gimd1E9PW74 Gm12454-201ENSMUST00000139119 978 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Gimd1E9PW74 Dynlt1b-201ENSMUST00000179569 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Gimd1E9PW74 2610008E11Rik-204ENSMUST00000220220 799 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Gimd1E9PW74 Prr23a2-201ENSMUST00000071302 881 ntAPPRIS P1 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Gimd1E9PW74 Cldn13-201ENSMUST00000008987 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Gimd1E9PW74 Zfp740-202ENSMUST00000119168 3932 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Gimd1E9PW74 Trnt1-203ENSMUST00000113248 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Gimd1E9PW74 Ctnna2-204ENSMUST00000160894 4162 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Gimd1E9PW74 Map4k5-202ENSMUST00000110567 4250 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Gimd1E9PW74 Rapsn-203ENSMUST00000111446 1458 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Gimd1E9PW74 Pard3-222ENSMUST00000162536 5175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Gimd1E9PW74 Fam228b-201ENSMUST00000053458 2851 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Gimd1E9PW74 Sh2b3-202ENSMUST00000086310 4195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Gimd1E9PW74 Arhgef12-202ENSMUST00000165665 10752 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Gimd1E9PW74 Dab1-203ENSMUST00000106830 5278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Gimd1E9PW74 Garem2-201ENSMUST00000058045 3865 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Gimd1E9PW74 Htr7-205ENSMUST00000166074 3079 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Gimd1E9PW74 Cdca7l-201ENSMUST00000021592 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Gimd1E9PW74 Hhat-201ENSMUST00000044190 2839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Gimd1E9PW74 Ahcy-201ENSMUST00000054607 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Gimd1E9PW74 Ciart-202ENSMUST00000159739 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Gimd1E9PW74 Gm9252-201ENSMUST00000172364 1602 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Gimd1E9PW74 Ncs1-201ENSMUST00000000199 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Gimd1E9PW74 Evc-201ENSMUST00000031005 4325 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Gimd1E9PW74 Rap1gap-203ENSMUST00000105835 4140 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Gimd1E9PW74 Cyp21a2-ps-201ENSMUST00000172970 1383 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Gimd1E9PW74 Pebp1-202ENSMUST00000111973 779 ntTSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Gimd1E9PW74 4930417O22Rik-201ENSMUST00000123249 1184 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Gimd1E9PW74 Cd63-ps-201ENSMUST00000145417 875 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Gimd1E9PW74 Gldnos-201ENSMUST00000149237 841 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Gimd1E9PW74 1700110K17Rik-202ENSMUST00000156511 927 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Gimd1E9PW74 Gm16215-201ENSMUST00000161990 637 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Gimd1E9PW74 1010001B22Rik-201ENSMUST00000181488 589 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Gimd1E9PW74 Gm26808-201ENSMUST00000181569 411 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Gimd1E9PW74 Gm42787-201ENSMUST00000200879 1164 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Gimd1E9PW74 Snapc2-203ENSMUST00000208316 1190 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Gimd1E9PW74 Mrpl36-201ENSMUST00000022098 923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Gimd1E9PW74 Erp29-201ENSMUST00000052590 1123 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Gimd1E9PW74 Phldb1-211ENSMUST00000135436 2844 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Gimd1E9PW74 Ebf4-202ENSMUST00000110287 2580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Gimd1E9PW74 Fbxo46-202ENSMUST00000165913 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Gimd1E9PW74 Gatm-201ENSMUST00000028624 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Gimd1E9PW74 Chmp1a-201ENSMUST00000000759 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Gimd1E9PW74 Slc6a8-203ENSMUST00000114465 3314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Gimd1E9PW74 Tcf3-204ENSMUST00000105340 2826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Gimd1E9PW74 Procr-201ENSMUST00000029140 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Gimd1E9PW74 Rad18-201ENSMUST00000068487 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Gimd1E9PW74 Wdr31-203ENSMUST00000120095 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Gimd1E9PW74 Pcsk4-201ENSMUST00000020340 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Gimd1E9PW74 Adipor1-202ENSMUST00000112237 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Gimd1E9PW74 Dancr-202ENSMUST00000120364 575 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Gimd1E9PW74 H2bfm-201ENSMUST00000059808 1052 ntAPPRIS P1 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Gimd1E9PW74 Pdlim7-203ENSMUST00000069968 1006 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Gimd1E9PW74 Mir125a-201ENSMUST00000083545 68 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Gimd1E9PW74 Rxra-202ENSMUST00000100251 1952 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Gimd1E9PW74 Kcnc2-201ENSMUST00000092175 5046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Gimd1E9PW74 Camk2g-217ENSMUST00000226630 1937 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Gimd1E9PW74 Gm10584-201ENSMUST00000207036 2628 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Gimd1E9PW74 Rgs6-208ENSMUST00000186458 5588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Gimd1E9PW74 Arf1-201ENSMUST00000061242 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Gimd1E9PW74 Rasal3-204ENSMUST00000135618 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Gimd1E9PW74 Prss41-204ENSMUST00000151797 1743 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Gimd1E9PW74 Unc5d-202ENSMUST00000209401 3081 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Gimd1E9PW74 Unc5d-203ENSMUST00000210298 3060 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Gimd1E9PW74 Unc5d-205ENSMUST00000211448 3087 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Gimd1E9PW74 Daxx-208ENSMUST00000174541 2325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Gimd1E9PW74 Ptprs-202ENSMUST00000086828 5608 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Gimd1E9PW74 3830417A13Rik-201ENSMUST00000033522 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Gimd1E9PW74 Aldh1b1-201ENSMUST00000044384 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Gimd1E9PW74 Rbsn-201ENSMUST00000014694 5334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Gimd1E9PW74 Apc-202ENSMUST00000079362 8867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Gimd1E9PW74 Gm36839-201ENSMUST00000222088 2093 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Gimd1E9PW74 Acd-201ENSMUST00000042608 3154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Gimd1E9PW74 Actr3-202ENSMUST00000178474 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Gimd1E9PW74 Gm13613-201ENSMUST00000126240 1444 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Gimd1E9PW74 Dap3-207ENSMUST00000173135 1409 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Gimd1E9PW74 Fahd1-201ENSMUST00000049642 1407 ntAPPRIS P1 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Gimd1E9PW74 Dok7-201ENSMUST00000050709 2498 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Gimd1E9PW74 Gm10110-201ENSMUST00000081204 1891 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Gimd1E9PW74 Sumo3-202ENSMUST00000099538 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Gimd1E9PW74 Dusp13-202ENSMUST00000119866 1342 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Gimd1E9PW74 Lancl1-202ENSMUST00000113979 4461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Gimd1E9PW74 Clstn1-201ENSMUST00000039144 3319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Gimd1E9PW74 Gm14719-201ENSMUST00000121891 340 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Gimd1E9PW74 Mcfd2-202ENSMUST00000129616 813 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Gimd1E9PW74 Gm11615-201ENSMUST00000156205 818 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Gimd1E9PW74 Tmem61-202ENSMUST00000177702 561 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Gimd1E9PW74 Prr29-203ENSMUST00000185986 983 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Gimd1E9PW74 Gm44855-201ENSMUST00000205725 362 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Gimd1E9PW74 Bet1l-209ENSMUST00000211624 769 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Gimd1E9PW74 Bccip-201ENSMUST00000033282 1244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Gimd1E9PW74 Ramp3-201ENSMUST00000045374 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Gimd1E9PW74 D130052B06Rik-201ENSMUST00000101371 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Gimd1E9PW74 Sybu-201ENSMUST00000090057 3230 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Gimd1E9PW74 1810014B01Rik-201ENSMUST00000181587 1661 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Gimd1E9PW74 Alas1-207ENSMUST00000141118 3399 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.7 ms