Protein–RNA interactions for Protein: E9PW72

Gm3002, Predicted gene 3002, mousemouse

Predictions only

Length 216 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm3002E9PW72 Gm6916-202ENSMUST00000205523 195 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
Gm3002E9PW72 Gm7390-201ENSMUST00000212452 1216 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
Gm3002E9PW72 Uts2-201ENSMUST00000030803 538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Gm3002E9PW72 Gm20445-201ENSMUST00000061905 565 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
Gm3002E9PW72 Hs3st3b1-201ENSMUST00000094103 4911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Gm3002E9PW72 Ccdc171-204ENSMUST00000126429 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Gm3002E9PW72 Vps26a-202ENSMUST00000105447 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Gm3002E9PW72 Cnksr3-201ENSMUST00000015346 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Gm3002E9PW72 Htr7-202ENSMUST00000164639 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Gm3002E9PW72 Mthfsd-202ENSMUST00000116415 1520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Gm3002E9PW72 Fam167a-201ENSMUST00000121288 4231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Gm3002E9PW72 Grip2-205ENSMUST00000162300 5206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Gm3002E9PW72 Pcdha1-201ENSMUST00000070797 5248 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Gm3002E9PW72 Klf4-201ENSMUST00000107619 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Gm3002E9PW72 Pdzrn3-201ENSMUST00000075994 4104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Gm3002E9PW72 Smox-208ENSMUST00000110188 1991 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Gm3002E9PW72 Nhlh2-202ENSMUST00000196324 2647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Gm3002E9PW72 Dhrs1-201ENSMUST00000002403 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Gm3002E9PW72 Ldlrap1-201ENSMUST00000037828 6549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Gm3002E9PW72 Prickle1-201ENSMUST00000048982 4085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Gm3002E9PW72 Trnt1-204ENSMUST00000113249 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Gm3002E9PW72 Mettl7a3-201ENSMUST00000075420 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Gm3002E9PW72 Blzf1-202ENSMUST00000086032 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Gm3002E9PW72 Myo9b-203ENSMUST00000170242 7297 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Gm3002E9PW72 Gm10676-201ENSMUST00000098778 3221 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
Gm3002E9PW72 Endod1-201ENSMUST00000167549 4470 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Gm3002E9PW72 Crip3-202ENSMUST00000113465 1035 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Gm3002E9PW72 Gm12212-201ENSMUST00000141032 378 ntTSL 3 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Gm3002E9PW72 1700055C04Rik-201ENSMUST00000176450 355 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Gm3002E9PW72 2410004P03Rik-203ENSMUST00000190691 953 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Gm3002E9PW72 AC140375.2-201ENSMUST00000225283 584 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
Gm3002E9PW72 Olfr750-201ENSMUST00000048478 1132 ntAPPRIS P1 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Gm3002E9PW72 Ufsp1-201ENSMUST00000052825 1037 ntAPPRIS P1 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Gm3002E9PW72 Hfe-201ENSMUST00000006787 516 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Gm3002E9PW72 Hfe-203ENSMUST00000091707 816 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Gm3002E9PW72 Krt18-201ENSMUST00000023803 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Gm3002E9PW72 Gm37736-201ENSMUST00000193564 2802 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
Gm3002E9PW72 Kcnc1-201ENSMUST00000025202 7760 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Gm3002E9PW72 Fam234a-201ENSMUST00000114988 3714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Gm3002E9PW72 Ydjc-203ENSMUST00000115706 3097 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Gm3002E9PW72 Itfg2-206ENSMUST00000203374 1394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Gm3002E9PW72 Ccdc160-201ENSMUST00000101588 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Gm3002E9PW72 Gif-201ENSMUST00000025585 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Gm3002E9PW72 Sphk1-205ENSMUST00000106387 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Gm3002E9PW72 Sgk1-202ENSMUST00000092673 2576 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Gm3002E9PW72 Zfp202-203ENSMUST00000168832 3329 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Gm3002E9PW72 Tbc1d22b-201ENSMUST00000048677 3592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Gm3002E9PW72 Dcaf17-201ENSMUST00000064141 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Gm3002E9PW72 Mast3-201ENSMUST00000166004 5305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Gm3002E9PW72 Mospd3-202ENSMUST00000111007 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Gm3002E9PW72 Arl5b-202ENSMUST00000069870 6981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Gm3002E9PW72 Tmpo-201ENSMUST00000020123 3772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Gm3002E9PW72 Synm-204ENSMUST00000208231 4457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Gm3002E9PW72 Ankrd10-202ENSMUST00000169782 5156 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Gm3002E9PW72 Ren1-201ENSMUST00000094556 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Gm3002E9PW72 Gapdh-203ENSMUST00000118875 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Gm3002E9PW72 D130052B06Rik-201ENSMUST00000101371 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Gm3002E9PW72 Mrpl53-201ENSMUST00000113938 695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Gm3002E9PW72 Trp53tg5-201ENSMUST00000017864 934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Gm3002E9PW72 Gm9522-201ENSMUST00000182394 926 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
Gm3002E9PW72 Gm5745-201ENSMUST00000183748 313 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
Gm3002E9PW72 Gm29585-201ENSMUST00000185270 514 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Gm3002E9PW72 AC151828.1-201ENSMUST00000219552 661 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Gm3002E9PW72 Fam162a-201ENSMUST00000004057 635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Gm3002E9PW72 Cox6b1-201ENSMUST00000075738 618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Gm3002E9PW72 Kcnip2-203ENSMUST00000086993 1005 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Gm3002E9PW72 Hist1h2al-201ENSMUST00000091708 339 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
Gm3002E9PW72 Emd-203ENSMUST00000096424 896 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Gm3002E9PW72 Hsp90b1-201ENSMUST00000020238 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Gm3002E9PW72 Ppp2r2c-201ENSMUST00000031003 4088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Gm3002E9PW72 Efs-202ENSMUST00000227037 2540 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
Gm3002E9PW72 Nlrx1-203ENSMUST00000169651 3621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Gm3002E9PW72 Sox1ot-202ENSMUST00000186174 7420 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.02
Gm3002E9PW72 Trim65-201ENSMUST00000067632 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Gm3002E9PW72 Slc24a3-201ENSMUST00000081121 1788 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.02
Gm3002E9PW72 Ube2d3-210ENSMUST00000197539 2515 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Gm3002E9PW72 Ccnh-204ENSMUST00000164127 1718 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Gm3002E9PW72 Gm26534-201ENSMUST00000181687 1724 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Gm3002E9PW72 Dse-201ENSMUST00000048010 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Gm3002E9PW72 Midn-202ENSMUST00000099492 3597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Gm3002E9PW72 Ubtf-205ENSMUST00000107119 3013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Gm3002E9PW72 Skor1-201ENSMUST00000055281 3657 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Gm3002E9PW72 Prok2-202ENSMUST00000032152 1423 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Gm3002E9PW72 Gbp5-201ENSMUST00000090127 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Gm3002E9PW72 Gm22189-201ENSMUST00000103822 86 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Gm3002E9PW72 Rdm1-201ENSMUST00000010506 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Gm3002E9PW72 Tpd52-206ENSMUST00000121038 849 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Gm3002E9PW72 Tmem109-207ENSMUST00000147699 1096 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Gm3002E9PW72 Six3os1-205ENSMUST00000175913 791 ntTSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Gm3002E9PW72 Agrp-202ENSMUST00000194091 734 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Gm3002E9PW72 Rnf113a1-201ENSMUST00000046433 1223 ntAPPRIS P1 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Gm3002E9PW72 Gm26882-201ENSMUST00000181611 1537 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Gm3002E9PW72 Mcrs1-202ENSMUST00000163506 1795 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Gm3002E9PW72 Fam84b-201ENSMUST00000100635 5565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Gm3002E9PW72 Acadm-201ENSMUST00000072697 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Gm3002E9PW72 Rexo4-201ENSMUST00000064244 2281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Gm3002E9PW72 Arid5a-201ENSMUST00000097778 2270 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Gm3002E9PW72 Cspp1-205ENSMUST00000122156 2535 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Gm3002E9PW72 Ahcy-201ENSMUST00000054607 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Gm3002E9PW72 Tomm70a-201ENSMUST00000166897 3778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 64.1 ms