Protein–RNA interactions for Protein: E9PVA8

Gcn1, eIF-2-alpha kinase activator GCN1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 2,671 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gcn1E9PVA8 Gm11751-201ENSMUST00000126187 460 ntTSL 3 BASIC12□□□□□ -0.49
Gcn1E9PVA8 Gm40576-201ENSMUST00000221773 1152 ntTSL 5 BASIC12□□□□□ -0.49
Gcn1E9PVA8 Med26-201ENSMUST00000058534 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Gcn1E9PVA8 Acbd5-203ENSMUST00000114526 3725 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Gcn1E9PVA8 Rimkla-201ENSMUST00000049994 4097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Gcn1E9PVA8 Ewsr1-202ENSMUST00000073308 2269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Gcn1E9PVA8 Smarcd1-201ENSMUST00000023759 3153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Gcn1E9PVA8 Mink1-201ENSMUST00000072237 4994 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12□□□□□ -0.49
Gcn1E9PVA8 Arfgap2-202ENSMUST00000080008 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Gcn1E9PVA8 Siglecf-201ENSMUST00000012798 2510 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Gcn1E9PVA8 Rec8-201ENSMUST00000002395 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Gcn1E9PVA8 Necab3-201ENSMUST00000000895 1829 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Gcn1E9PVA8 Rcc1-203ENSMUST00000105951 2326 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12□□□□□ -0.49
Gcn1E9PVA8 Oas1g-201ENSMUST00000086368 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Gcn1E9PVA8 Lzts2-201ENSMUST00000039016 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Gcn1E9PVA8 Gm6283-201ENSMUST00000182369 1000 ntBASIC12□□□□□ -0.49
Gcn1E9PVA8 Mylk2-201ENSMUST00000028970 2951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Gcn1E9PVA8 Lrrc52-201ENSMUST00000036643 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Gcn1E9PVA8 Exoc8-201ENSMUST00000098312 4598 ntAPPRIS P1 BASIC12□□□□□ -0.49
Gcn1E9PVA8 Rnls-202ENSMUST00000163093 1378 ntTSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Gcn1E9PVA8 Fbxl12os-202ENSMUST00000136376 2349 ntTSL 2 BASIC11.99□□□□□ -0.49
Gcn1E9PVA8 Gadd45gip1-201ENSMUST00000036734 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Gcn1E9PVA8 Bend5-201ENSMUST00000030274 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Gcn1E9PVA8 Lrch3-210ENSMUST00000170201 2902 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Gcn1E9PVA8 Rmnd5b-201ENSMUST00000001081 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Gcn1E9PVA8 Rhbdl2-202ENSMUST00000106204 1120 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.99□□□□□ -0.49
Gcn1E9PVA8 Gm12029-201ENSMUST00000120073 832 ntBASIC11.99□□□□□ -0.49
Gcn1E9PVA8 1700003G18Rik-201ENSMUST00000140689 633 ntTSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Gcn1E9PVA8 Gm23218-201ENSMUST00000158124 276 ntBASIC11.99□□□□□ -0.49
Gcn1E9PVA8 Crb3-205ENSMUST00000169543 778 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.99□□□□□ -0.49
Gcn1E9PVA8 Gm29087-201ENSMUST00000186462 645 ntTSL 5 BASIC11.99□□□□□ -0.49
Gcn1E9PVA8 4930405N21Rik-201ENSMUST00000199950 1200 ntBASIC11.99□□□□□ -0.49
Gcn1E9PVA8 Ppcdc-207ENSMUST00000214339 738 ntTSL 2 BASIC11.99□□□□□ -0.49
Gcn1E9PVA8 AC125486.1-201ENSMUST00000218701 320 ntBASIC11.99□□□□□ -0.49
Gcn1E9PVA8 CT025533.2-201ENSMUST00000228715 1248 ntBASIC11.99□□□□□ -0.49
Gcn1E9PVA8 Pf4-201ENSMUST00000031320 588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Gcn1E9PVA8 Adam33-201ENSMUST00000052104 2795 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Gcn1E9PVA8 Gramd3-201ENSMUST00000070166 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Gcn1E9PVA8 Sh3bp2-203ENSMUST00000118545 3034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Gcn1E9PVA8 Large1-202ENSMUST00000119826 4647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.99□□□□□ -0.49
Gcn1E9PVA8 Rarb-201ENSMUST00000063750 3108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Gcn1E9PVA8 Vwa5b2-203ENSMUST00000100074 2512 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Gcn1E9PVA8 Pitpna-206ENSMUST00000179521 3727 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.99□□□□□ -0.49
Gcn1E9PVA8 Taok3-202ENSMUST00000111975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Gcn1E9PVA8 Tmem108-204ENSMUST00000189588 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Gcn1E9PVA8 Maf-202ENSMUST00000109104 6360 ntAPPRIS P2 BASIC11.99□□□□□ -0.49
Gcn1E9PVA8 Olfr1349-204ENSMUST00000207820 1325 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.99□□□□□ -0.49
Gcn1E9PVA8 Mink1-205ENSMUST00000102559 4865 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Gcn1E9PVA8 Dnah9-202ENSMUST00000108691 2671 ntTSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Gcn1E9PVA8 Ren1-201ENSMUST00000094556 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Gcn1E9PVA8 Trim7-202ENSMUST00000109213 2356 ntTSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Gcn1E9PVA8 Myrip-201ENSMUST00000048121 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Gcn1E9PVA8 Gm12948-201ENSMUST00000119406 682 ntBASIC11.99□□□□□ -0.49
Gcn1E9PVA8 Gm14208-201ENSMUST00000119645 678 ntBASIC11.99□□□□□ -0.49
Gcn1E9PVA8 Anapc16-205ENSMUST00000182912 566 ntTSL 2 BASIC11.99□□□□□ -0.49
Gcn1E9PVA8 Zfp709-202ENSMUST00000188374 717 ntTSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Gcn1E9PVA8 Gm3028-201ENSMUST00000213805 1119 ntBASIC11.99□□□□□ -0.49
Gcn1E9PVA8 9530020I12Rik-203ENSMUST00000219371 819 ntTSL 3 BASIC11.99□□□□□ -0.49
Gcn1E9PVA8 AC154806.6-201ENSMUST00000228192 202 ntBASIC11.99□□□□□ -0.49
Gcn1E9PVA8 Prss38-201ENSMUST00000061481 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Gcn1E9PVA8 Uhrf2-201ENSMUST00000025739 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Gcn1E9PVA8 Tjap1-214ENSMUST00000225413 2189 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.99□□□□□ -0.49
Gcn1E9PVA8 Dlg1-202ENSMUST00000064477 4663 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Gcn1E9PVA8 Fam71f1-204ENSMUST00000166462 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Gcn1E9PVA8 Mier2-203ENSMUST00000165028 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Gcn1E9PVA8 Jmy-201ENSMUST00000065537 8776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Gcn1E9PVA8 Ppm1d-201ENSMUST00000020835 2899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Gcn1E9PVA8 Chgb-201ENSMUST00000028826 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Gcn1E9PVA8 Fstl1-201ENSMUST00000114763 3789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Gcn1E9PVA8 Olah-201ENSMUST00000027955 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Gcn1E9PVA8 Gm6335-201ENSMUST00000118081 1194 ntBASIC11.98□□□□□ -0.49
Gcn1E9PVA8 Gm7816-201ENSMUST00000119884 1194 ntBASIC11.98□□□□□ -0.49
Gcn1E9PVA8 Gm15542-201ENSMUST00000121585 1194 ntBASIC11.98□□□□□ -0.49
Gcn1E9PVA8 AC140375.1-201ENSMUST00000225421 694 ntBASIC11.98□□□□□ -0.49
Gcn1E9PVA8 Ly6g5c-201ENSMUST00000037849 509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Gcn1E9PVA8 Acyp1-202ENSMUST00000065913 448 ntTSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Gcn1E9PVA8 Prodh2-201ENSMUST00000058280 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Gcn1E9PVA8 Satb1-211ENSMUST00000152830 5993 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC11.98□□□□□ -0.49
Gcn1E9PVA8 Gm6580-201ENSMUST00000117504 1357 ntBASIC11.98□□□□□ -0.49
Gcn1E9PVA8 Alox12-202ENSMUST00000108574 2314 ntTSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Gcn1E9PVA8 Men1-206ENSMUST00000113502 2652 ntTSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Gcn1E9PVA8 Lrriq3-201ENSMUST00000029833 2652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Gcn1E9PVA8 Akap8l-201ENSMUST00000050214 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Gcn1E9PVA8 Gm11470-201ENSMUST00000118868 1475 ntBASIC11.98□□□□□ -0.49
Gcn1E9PVA8 Chchd4-201ENSMUST00000040835 3472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Gcn1E9PVA8 Krt20-201ENSMUST00000017743 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Gcn1E9PVA8 Msx2-201ENSMUST00000021922 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Gcn1E9PVA8 Hnrnpa1-202ENSMUST00000087351 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Gcn1E9PVA8 Brd3os-202ENSMUST00000209765 1898 ntAPPRIS P1 BASIC11.98□□□□□ -0.49
Gcn1E9PVA8 Tmem132e-201ENSMUST00000054245 4386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Gcn1E9PVA8 Tcp1-209ENSMUST00000151287 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Gcn1E9PVA8 Lca5l-202ENSMUST00000113804 3162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Gcn1E9PVA8 Cpsf4l-203ENSMUST00000106617 1123 ntTSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Gcn1E9PVA8 Rbm3-204ENSMUST00000115617 1152 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Gcn1E9PVA8 Gm7541-201ENSMUST00000118361 535 ntBASIC11.98□□□□□ -0.49
Gcn1E9PVA8 Gstt1-202ENSMUST00000120177 1105 ntTSL 2 BASIC11.98□□□□□ -0.49
Gcn1E9PVA8 Gm3625-201ENSMUST00000170816 102 ntAPPRIS P1 BASIC11.98□□□□□ -0.49
Gcn1E9PVA8 Apoe-208ENSMUST00000174191 472 ntTSL 2 BASIC11.98□□□□□ -0.49
Gcn1E9PVA8 Gm9211-201ENSMUST00000182882 975 ntBASIC11.98□□□□□ -0.49
Gcn1E9PVA8 Gm32468-201ENSMUST00000214199 1040 ntTSL 5 BASIC11.98□□□□□ -0.49
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