Protein–RNA interactions for Protein: D3Z6W3

Rdh8, Retinol dehydrogenase 8, mousemouse

Predictions only

Length 317 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rdh8D3Z6W3 Dcaf13-201ENSMUST00000022909 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Rdh8D3Z6W3 Nrxn1-207ENSMUST00000160844 9309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Rdh8D3Z6W3 Rbfox2-209ENSMUST00000228087 1694 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Rdh8D3Z6W3 Papd7-201ENSMUST00000044081 3994 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Rdh8D3Z6W3 Cfap69-205ENSMUST00000135252 2188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Rdh8D3Z6W3 Osbpl10-204ENSMUST00000182384 2158 ntTSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Rdh8D3Z6W3 Il4ra-201ENSMUST00000033004 5256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Rdh8D3Z6W3 Emilin2-201ENSMUST00000024849 3910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Rdh8D3Z6W3 Mboat2-201ENSMUST00000078902 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Rdh8D3Z6W3 Speg-205ENSMUST00000113590 3393 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Rdh8D3Z6W3 Pank1-201ENSMUST00000036584 3460 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Rdh8D3Z6W3 Tm6sf2-201ENSMUST00000049197 1418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Rdh8D3Z6W3 Gm14451-201ENSMUST00000121581 1542 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Rdh8D3Z6W3 R3hdm4-202ENSMUST00000171416 1543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Rdh8D3Z6W3 Dnase1l2-202ENSMUST00000119932 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Rdh8D3Z6W3 Snx8-205ENSMUST00000196566 1914 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Rdh8D3Z6W3 Gm29361-201ENSMUST00000183323 2000 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Rdh8D3Z6W3 Cfap99-201ENSMUST00000207754 2123 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Rdh8D3Z6W3 Alpl-201ENSMUST00000030551 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Rdh8D3Z6W3 Eml6-201ENSMUST00000058902 8083 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Rdh8D3Z6W3 Rufy3-203ENSMUST00000196894 3703 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Rdh8D3Z6W3 Tcf12-201ENSMUST00000034755 4621 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Rdh8D3Z6W3 Cd34-202ENSMUST00000110815 2554 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Rdh8D3Z6W3 Aifm3-202ENSMUST00000115685 2357 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Rdh8D3Z6W3 AC157650.3-201ENSMUST00000225058 1476 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Rdh8D3Z6W3 Pitpnm2-205ENSMUST00000161273 6792 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Rdh8D3Z6W3 9130204K15Rik-201ENSMUST00000131441 867 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Rdh8D3Z6W3 Tulp3-205ENSMUST00000157005 1053 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Rdh8D3Z6W3 Nabp2-204ENSMUST00000166608 979 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Rdh8D3Z6W3 0610025J13Rik-203ENSMUST00000180374 713 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Rdh8D3Z6W3 Tmem178b-203ENSMUST00000180886 712 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Rdh8D3Z6W3 Gm4535-201ENSMUST00000182274 558 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Rdh8D3Z6W3 Csrp2-207ENSMUST00000220409 780 ntTSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Rdh8D3Z6W3 Rangrf-201ENSMUST00000038644 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Rdh8D3Z6W3 Ptprcap-201ENSMUST00000061086 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Rdh8D3Z6W3 Ifi27-204ENSMUST00000079294 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Rdh8D3Z6W3 Gm10355-201ENSMUST00000097146 517 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Rdh8D3Z6W3 Sox17-206ENSMUST00000192650 3242 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Rdh8D3Z6W3 Mmp14-206ENSMUST00000225641 3238 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Rdh8D3Z6W3 Clcn4-203ENSMUST00000210061 2445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Rdh8D3Z6W3 Hoxa7-201ENSMUST00000048715 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Rdh8D3Z6W3 Cad-206ENSMUST00000201838 3153 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Rdh8D3Z6W3 Gpt-201ENSMUST00000023203 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Rdh8D3Z6W3 Aldh16a1-201ENSMUST00000107815 2685 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Rdh8D3Z6W3 Metap2-206ENSMUST00000180840 2551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Rdh8D3Z6W3 Lypd1-205ENSMUST00000162899 1511 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Rdh8D3Z6W3 Iqck-201ENSMUST00000098087 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Rdh8D3Z6W3 Stox2-201ENSMUST00000079195 10467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Rdh8D3Z6W3 Slc39a8-202ENSMUST00000081978 3314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Rdh8D3Z6W3 9130401M01Rik-201ENSMUST00000100655 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Rdh8D3Z6W3 A230087F16Rik-202ENSMUST00000181561 1303 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Rdh8D3Z6W3 Pnkd-201ENSMUST00000027370 2937 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Rdh8D3Z6W3 Kdm4b-201ENSMUST00000025036 4577 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Rdh8D3Z6W3 Samd11-202ENSMUST00000217934 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Rdh8D3Z6W3 Rab37-201ENSMUST00000021076 2210 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Rdh8D3Z6W3 Gm7901-201ENSMUST00000120430 1597 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
Rdh8D3Z6W3 Pid1-204ENSMUST00000176559 1564 ntTSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Rdh8D3Z6W3 Dsp-202ENSMUST00000127906 7761 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Rdh8D3Z6W3 Hnf1b-203ENSMUST00000108114 2659 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Rdh8D3Z6W3 Gm38575-203ENSMUST00000215824 1490 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Rdh8D3Z6W3 Pglyrp2-201ENSMUST00000114455 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Rdh8D3Z6W3 Gk5-202ENSMUST00000122383 4455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Rdh8D3Z6W3 Scyl3-201ENSMUST00000027876 4368 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Rdh8D3Z6W3 Rnf141-201ENSMUST00000106682 1101 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Rdh8D3Z6W3 Zkscan8-202ENSMUST00000110481 728 ntTSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Rdh8D3Z6W3 Nrn1l-202ENSMUST00000118920 603 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Rdh8D3Z6W3 Psmc4-206ENSMUST00000140053 1244 ntTSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Rdh8D3Z6W3 Gm7977-201ENSMUST00000193787 748 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
Rdh8D3Z6W3 Gm38973-201ENSMUST00000206810 878 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Rdh8D3Z6W3 5830454E08Rik-202ENSMUST00000213974 744 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
Rdh8D3Z6W3 Ahnak-201ENSMUST00000092955 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Rdh8D3Z6W3 Wfdc6b-201ENSMUST00000094346 984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Rdh8D3Z6W3 Mettl14-201ENSMUST00000029759 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Rdh8D3Z6W3 Pdpk1-204ENSMUST00000115409 4623 ntTSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Rdh8D3Z6W3 Gm14168-201ENSMUST00000144818 2197 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Rdh8D3Z6W3 Gm44065-201ENSMUST00000203184 3527 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
Rdh8D3Z6W3 Gm2115-201ENSMUST00000180387 7055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Rdh8D3Z6W3 Bhmt2-201ENSMUST00000015941 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Rdh8D3Z6W3 Renbp-201ENSMUST00000114379 1318 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Rdh8D3Z6W3 Ephx3-202ENSMUST00000162117 1590 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Rdh8D3Z6W3 Klhl34-201ENSMUST00000087157 1935 ntAPPRIS P1 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Rdh8D3Z6W3 Stip1-201ENSMUST00000025918 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Rdh8D3Z6W3 Scamp3-203ENSMUST00000120697 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Rdh8D3Z6W3 Pitx2-206ENSMUST00000174623 1493 ntTSL 2 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Rdh8D3Z6W3 AC122301.2-201ENSMUST00000219020 1474 ntTSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Rdh8D3Z6W3 Nol9-201ENSMUST00000084116 3722 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Rdh8D3Z6W3 Tmem169-201ENSMUST00000027380 2928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Rdh8D3Z6W3 Galnt6os-201ENSMUST00000160960 1389 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Rdh8D3Z6W3 Flot1-209ENSMUST00000174080 1383 ntTSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Rdh8D3Z6W3 Eif1ad-201ENSMUST00000025759 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Rdh8D3Z6W3 F2r-201ENSMUST00000059193 3336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Rdh8D3Z6W3 Mfng-201ENSMUST00000018313 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Rdh8D3Z6W3 Pih1d1-202ENSMUST00000107811 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Rdh8D3Z6W3 Znhit1-203ENSMUST00000111090 698 ntTSL 2 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Rdh8D3Z6W3 Gm11453-201ENSMUST00000117318 1007 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
Rdh8D3Z6W3 Tpm3-205ENSMUST00000121503 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Rdh8D3Z6W3 Psmg4-201ENSMUST00000124996 474 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Rdh8D3Z6W3 Rasl2-9-201ENSMUST00000147835 1013 ntAPPRIS P1 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Rdh8D3Z6W3 Gm14964-202ENSMUST00000149574 716 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Rdh8D3Z6W3 Gm21887-203ENSMUST00000180251 531 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.9 ms