Protein–RNA interactions for Protein: D3YXK1

Samd1, Atherin, mousemouse

Predictions only

Length 519 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Samd1D3YXK1 Wfdc6b-201ENSMUST00000094346 984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Samd1D3YXK1 Entpd5-204ENSMUST00000117286 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Samd1D3YXK1 Rap1gap2-202ENSMUST00000102521 6565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Samd1D3YXK1 Fgd4-211ENSMUST00000162671 2714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Samd1D3YXK1 Plch2-201ENSMUST00000105631 5053 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Samd1D3YXK1 Vasp-201ENSMUST00000032561 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Samd1D3YXK1 Pcdh7-203ENSMUST00000191837 8785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Samd1D3YXK1 Gmpr2-201ENSMUST00000002397 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Samd1D3YXK1 Hpn-201ENSMUST00000039435 1743 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Samd1D3YXK1 Spag16-201ENSMUST00000065425 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Samd1D3YXK1 Ppef2-201ENSMUST00000031359 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Samd1D3YXK1 Fgfr1-203ENSMUST00000119398 3789 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Samd1D3YXK1 Syt1-201ENSMUST00000064054 4745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Samd1D3YXK1 Gm45003-201ENSMUST00000205875 2158 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
Samd1D3YXK1 Rtfdc1-201ENSMUST00000029005 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Samd1D3YXK1 Tomm34-202ENSMUST00000109384 1923 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Samd1D3YXK1 Pls1-201ENSMUST00000093800 3704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Samd1D3YXK1 Utp23-203ENSMUST00000137116 2921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Samd1D3YXK1 Klc2-201ENSMUST00000025798 2940 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Samd1D3YXK1 Itpk1-201ENSMUST00000046518 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Samd1D3YXK1 Mkrn3-201ENSMUST00000094340 2547 ntAPPRIS P1 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Samd1D3YXK1 Megf6-201ENSMUST00000030897 6851 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Samd1D3YXK1 Pik3cd-214ENSMUST00000177654 4765 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Samd1D3YXK1 Siva1-202ENSMUST00000109755 333 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Samd1D3YXK1 Fis1-202ENSMUST00000111094 948 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Samd1D3YXK1 Tmsb4x-201ENSMUST00000112172 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Samd1D3YXK1 Rhox7b-201ENSMUST00000115156 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Samd1D3YXK1 Ankrd13d-204ENSMUST00000167215 639 ntTSL 3 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Samd1D3YXK1 BC022687-202ENSMUST00000177808 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Samd1D3YXK1 Tbc1d7-202ENSMUST00000179852 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Samd1D3YXK1 Cmtm3-204ENSMUST00000212081 850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Samd1D3YXK1 Cort-201ENSMUST00000030815 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Samd1D3YXK1 Rhox7a-201ENSMUST00000096454 983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Samd1D3YXK1 Sumo3-202ENSMUST00000099538 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Samd1D3YXK1 Srr-204ENSMUST00000121738 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Samd1D3YXK1 Scarb2-201ENSMUST00000031377 4698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Samd1D3YXK1 Cmpk2-201ENSMUST00000020969 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Samd1D3YXK1 Nfatc2-202ENSMUST00000074618 6637 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Samd1D3YXK1 Dnaja1-210ENSMUST00000164233 5622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Samd1D3YXK1 Sptb-201ENSMUST00000021458 10394 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Samd1D3YXK1 Mbp-203ENSMUST00000075372 2075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Samd1D3YXK1 Rbak-201ENSMUST00000049861 3335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Samd1D3YXK1 Stard7-201ENSMUST00000110374 1530 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Samd1D3YXK1 Adprhl1-201ENSMUST00000033825 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Samd1D3YXK1 Zfp367-201ENSMUST00000059817 3532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Samd1D3YXK1 Colgalt1-201ENSMUST00000047903 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Samd1D3YXK1 Rgs9-202ENSMUST00000103062 1743 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Samd1D3YXK1 Gstz1-205ENSMUST00000222885 1571 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Samd1D3YXK1 Pank4-201ENSMUST00000030931 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Samd1D3YXK1 Endov-202ENSMUST00000106244 5070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Samd1D3YXK1 Bola3-202ENSMUST00000120040 583 ntTSL 3 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Samd1D3YXK1 Gm13431-203ENSMUST00000147012 388 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Samd1D3YXK1 Slc25a5-201ENSMUST00000016463 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Samd1D3YXK1 Washc3-202ENSMUST00000171151 837 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Samd1D3YXK1 Gm20478-201ENSMUST00000173648 1031 ntTSL 3 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Samd1D3YXK1 Gm20646-202ENSMUST00000199521 660 ntTSL 3 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Samd1D3YXK1 Gm7229-201ENSMUST00000214719 1007 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
Samd1D3YXK1 Chchd1-203ENSMUST00000224633 557 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
Samd1D3YXK1 AC131709.1-201ENSMUST00000224731 1180 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
Samd1D3YXK1 Rhebl1-201ENSMUST00000024518 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Samd1D3YXK1 Tspan18-201ENSMUST00000028646 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Samd1D3YXK1 Spr-201ENSMUST00000045986 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Samd1D3YXK1 Prkce-202ENSMUST00000097275 6254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Samd1D3YXK1 Stx5a-201ENSMUST00000010254 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Samd1D3YXK1 Ankrd16-201ENSMUST00000056108 1618 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Samd1D3YXK1 Gm32369-201ENSMUST00000222630 1467 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Samd1D3YXK1 Dgki-202ENSMUST00000090314 3784 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Samd1D3YXK1 Ephb1-202ENSMUST00000085169 4101 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Samd1D3YXK1 Gm12355-201ENSMUST00000104933 1311 ntAPPRIS P1 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Samd1D3YXK1 Selenok-201ENSMUST00000112268 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Samd1D3YXK1 Kcnip4-201ENSMUST00000087395 2366 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Samd1D3YXK1 Sp9-201ENSMUST00000090813 4514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Samd1D3YXK1 Iqcd-201ENSMUST00000069259 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Samd1D3YXK1 Dcaf10-204ENSMUST00000155551 7250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Samd1D3YXK1 Slc37a1-201ENSMUST00000165149 3354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Samd1D3YXK1 Lancl1-202ENSMUST00000113979 4461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Samd1D3YXK1 Grwd1-202ENSMUST00000131384 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Samd1D3YXK1 Utp3-201ENSMUST00000090413 1629 ntAPPRIS P1 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Samd1D3YXK1 Palld-203ENSMUST00000121493 5445 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Samd1D3YXK1 Gm9918-201ENSMUST00000181801 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Samd1D3YXK1 Rabepk-202ENSMUST00000113086 1106 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Samd1D3YXK1 Paxx-201ENSMUST00000114261 981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Samd1D3YXK1 Taf3-202ENSMUST00000114906 583 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Samd1D3YXK1 Edn3-203ENSMUST00000140908 731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Samd1D3YXK1 Gm5253-201ENSMUST00000187104 1025 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
Samd1D3YXK1 Gm45167-201ENSMUST00000208007 322 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
Samd1D3YXK1 4930428E07Rik-201ENSMUST00000222132 920 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Samd1D3YXK1 Gm15500-202ENSMUST00000071641 1019 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
Samd1D3YXK1 Gm43056-201ENSMUST00000197865 2791 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
Samd1D3YXK1 Ptpn6-203ENSMUST00000171549 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Samd1D3YXK1 Tcf19-203ENSMUST00000161012 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Samd1D3YXK1 Gid8-201ENSMUST00000029090 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Samd1D3YXK1 CT030684.3-201ENSMUST00000227308 2445 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
Samd1D3YXK1 Celf4-207ENSMUST00000225477 2626 ntAPPRIS P3 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Samd1D3YXK1 Loxl2-201ENSMUST00000022660 5316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Samd1D3YXK1 Gm45844-204ENSMUST00000209833 1524 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Samd1D3YXK1 Sytl1-202ENSMUST00000105908 1730 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Samd1D3YXK1 Pax2-201ENSMUST00000004340 3095 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Samd1D3YXK1 Atxn2l-201ENSMUST00000040202 3853 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Samd1D3YXK1 Lysmd3-201ENSMUST00000049055 2338 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.5 ms