Protein–RNA interactions for Protein: D3YUU6

Crnn, Cornulin, mousemouse

Predictions only

Length 520 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CrnnD3YUU6 Vamp2-201ENSMUST00000021273 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
CrnnD3YUU6 Irgc1-201ENSMUST00000080594 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
CrnnD3YUU6 Spag9-202ENSMUST00000041956 7340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
CrnnD3YUU6 Lmo4-203ENSMUST00000121796 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
CrnnD3YUU6 9930104L06Rik-201ENSMUST00000094769 2911 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
CrnnD3YUU6 Il10rb-201ENSMUST00000023691 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
CrnnD3YUU6 Pam-202ENSMUST00000097625 4102 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
CrnnD3YUU6 Sema6c-202ENSMUST00000090823 4029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
CrnnD3YUU6 Lrig2-205ENSMUST00000198332 3946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
CrnnD3YUU6 Shc1-203ENSMUST00000107417 3079 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
CrnnD3YUU6 Dmbx1-201ENSMUST00000064806 5799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
CrnnD3YUU6 Rab10os-202ENSMUST00000177896 2872 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
CrnnD3YUU6 Armcx1-206ENSMUST00000113201 2228 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
CrnnD3YUU6 Cadm2-202ENSMUST00000120594 3248 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
CrnnD3YUU6 Tmem241-202ENSMUST00000055447 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
CrnnD3YUU6 Gm42706-201ENSMUST00000199733 1910 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
CrnnD3YUU6 Zbtb1-201ENSMUST00000042779 12190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
CrnnD3YUU6 N4bp3-201ENSMUST00000001080 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
CrnnD3YUU6 Echdc1-202ENSMUST00000160399 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
CrnnD3YUU6 Gm11767-201ENSMUST00000129379 493 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
CrnnD3YUU6 Gm44454-201ENSMUST00000198541 138 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
CrnnD3YUU6 Hint1-201ENSMUST00000020504 636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
CrnnD3YUU6 Tdg-208ENSMUST00000151390 3502 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
CrnnD3YUU6 Ankrd16-201ENSMUST00000056108 1618 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
CrnnD3YUU6 Tcf4-210ENSMUST00000128706 2066 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
CrnnD3YUU6 G3bp2-203ENSMUST00000167918 4232 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
CrnnD3YUU6 4632428C04Rik-201ENSMUST00000181485 2430 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
CrnnD3YUU6 Dctn1-201ENSMUST00000077407 4118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
CrnnD3YUU6 C2cd4c-201ENSMUST00000059699 6729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
CrnnD3YUU6 Zfp385c-201ENSMUST00000103119 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
CrnnD3YUU6 Ispd-205ENSMUST00000221895 4022 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
CrnnD3YUU6 Apbb1-215ENSMUST00000190369 1882 ntTSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
CrnnD3YUU6 Epha8-201ENSMUST00000030420 4713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
CrnnD3YUU6 Crhbp-202ENSMUST00000221025 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
CrnnD3YUU6 Itpk1-201ENSMUST00000046518 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
CrnnD3YUU6 Rbmx-202ENSMUST00000114726 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
CrnnD3YUU6 A430093F15Rik-204ENSMUST00000186596 2115 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
CrnnD3YUU6 Gm44414-201ENSMUST00000203660 2109 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
CrnnD3YUU6 Eef1d-206ENSMUST00000109975 2842 ntTSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
CrnnD3YUU6 Gtf2h1-201ENSMUST00000006774 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
CrnnD3YUU6 Spsb1-201ENSMUST00000038562 3092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
CrnnD3YUU6 Ell-201ENSMUST00000093454 3072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
CrnnD3YUU6 Hpca-203ENSMUST00000116442 1568 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.11□□□□□ -0.31
CrnnD3YUU6 Tmem30a-201ENSMUST00000034878 3658 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
CrnnD3YUU6 Ghrhr-201ENSMUST00000063578 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
CrnnD3YUU6 Pgpep1-201ENSMUST00000070173 4883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
CrnnD3YUU6 Pnoc-201ENSMUST00000059339 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
CrnnD3YUU6 Cacng3-201ENSMUST00000084615 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
CrnnD3YUU6 Ncdn-202ENSMUST00000106116 2434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
CrnnD3YUU6 Vcl-201ENSMUST00000022369 5267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
CrnnD3YUU6 Smim14-205ENSMUST00000139122 4560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
CrnnD3YUU6 2610206C17Rik-201ENSMUST00000129059 1717 ntTSL 2 BASIC13.11□□□□□ -0.31
CrnnD3YUU6 Tbc1d16-201ENSMUST00000036113 6986 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
CrnnD3YUU6 Myh3-202ENSMUST00000108689 6031 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
CrnnD3YUU6 Gm26718-201ENSMUST00000181048 1378 ntTSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
CrnnD3YUU6 Arpc1b-211ENSMUST00000196111 1394 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
CrnnD3YUU6 Ntng1-205ENSMUST00000106575 1620 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
CrnnD3YUU6 Smpd4-221ENSMUST00000170996 1619 ntTSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
CrnnD3YUU6 Dnajc9-201ENSMUST00000022345 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
CrnnD3YUU6 Ntng1-202ENSMUST00000072596 1620 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
CrnnD3YUU6 Prrt3-201ENSMUST00000101059 3304 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
CrnnD3YUU6 Snap23-202ENSMUST00000110711 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
CrnnD3YUU6 Klk12-202ENSMUST00000107970 1115 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
CrnnD3YUU6 Fhad1os2-201ENSMUST00000152351 945 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
CrnnD3YUU6 Mir3081-201ENSMUST00000175305 84 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
CrnnD3YUU6 Gm43767-201ENSMUST00000198933 381 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
CrnnD3YUU6 AC127349.1-201ENSMUST00000224590 266 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
CrnnD3YUU6 Atp5l-201ENSMUST00000043675 544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
CrnnD3YUU6 Pla2g12b-201ENSMUST00000009790 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
CrnnD3YUU6 Npnt-204ENSMUST00000117164 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
CrnnD3YUU6 Rnf10-201ENSMUST00000040555 3106 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
CrnnD3YUU6 Morc4-202ENSMUST00000087401 3862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
CrnnD3YUU6 Lipo3-201ENSMUST00000025694 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
CrnnD3YUU6 Hk1-202ENSMUST00000099691 4278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
CrnnD3YUU6 Pcdhgc3-201ENSMUST00000076807 4687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
CrnnD3YUU6 Dsn1-201ENSMUST00000103129 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
CrnnD3YUU6 Gm20743-201ENSMUST00000191735 1576 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
CrnnD3YUU6 Ank-201ENSMUST00000022875 3498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
CrnnD3YUU6 Sfpq-201ENSMUST00000030623 3465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
CrnnD3YUU6 C77080-203ENSMUST00000106051 5049 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
CrnnD3YUU6 C77080-202ENSMUST00000097873 5033 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
CrnnD3YUU6 Id2-202ENSMUST00000221761 1969 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
CrnnD3YUU6 Gm12503-201ENSMUST00000146576 3127 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
CrnnD3YUU6 Klhl8-203ENSMUST00000112815 2898 ntTSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
CrnnD3YUU6 AC157650.3-201ENSMUST00000225058 1476 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
CrnnD3YUU6 Zfp94-201ENSMUST00000032673 2529 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
CrnnD3YUU6 Ahcy-201ENSMUST00000054607 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
CrnnD3YUU6 Tceanc2-202ENSMUST00000057043 6431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
CrnnD3YUU6 Sipa1-204ENSMUST00000169854 3583 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
CrnnD3YUU6 Lag3-201ENSMUST00000032217 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
CrnnD3YUU6 Tmem200a-201ENSMUST00000066049 4115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
CrnnD3YUU6 Tle3-210ENSMUST00000161207 2592 ntTSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
CrnnD3YUU6 Ociad2-201ENSMUST00000087195 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
CrnnD3YUU6 Tfe3-211ENSMUST00000137467 3390 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
CrnnD3YUU6 Irx6-201ENSMUST00000034185 3370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
CrnnD3YUU6 Nrd1-202ENSMUST00000102736 4179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
CrnnD3YUU6 Acr-201ENSMUST00000023295 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
CrnnD3YUU6 Nudt18-201ENSMUST00000089049 3926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
CrnnD3YUU6 Caprin2-202ENSMUST00000111569 3697 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
CrnnD3YUU6 Tcea1-202ENSMUST00000165720 2854 ntTSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.1 ms