Protein–RNA interactions for Protein: B5KM66

Syce3, Synaptonemal complex central element protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 88 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Syce3B5KM66 Map7d1-202ENSMUST00000106132 3195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.22
Syce3B5KM66 Sema4b-201ENSMUST00000032754 3949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
Syce3B5KM66 Ggt7-201ENSMUST00000029131 2614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
Syce3B5KM66 Slc38a1-201ENSMUST00000088452 7266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Syce3B5KM66 Klf4-201ENSMUST00000107619 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Syce3B5KM66 Pisd-201ENSMUST00000061895 2183 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Syce3B5KM66 Cklf-208ENSMUST00000212433 1304 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Syce3B5KM66 Ube3a-201ENSMUST00000107537 4911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Syce3B5KM66 Kank2-201ENSMUST00000034717 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Syce3B5KM66 1700022A21Rik-202ENSMUST00000182910 1448 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Syce3B5KM66 Tjap1-202ENSMUST00000164342 2559 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Syce3B5KM66 Pcolce-201ENSMUST00000031731 1626 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Syce3B5KM66 Pja1-202ENSMUST00000113790 2108 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Syce3B5KM66 Otop2-202ENSMUST00000106544 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Syce3B5KM66 Ilvbl-203ENSMUST00000218215 2331 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Syce3B5KM66 Desi1-206ENSMUST00000152227 2934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Syce3B5KM66 Rsbn1l-201ENSMUST00000036489 5550 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Syce3B5KM66 Gm14042-201ENSMUST00000120139 833 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
Syce3B5KM66 Rbm4-203ENSMUST00000178615 1018 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Syce3B5KM66 Gm40457-201ENSMUST00000205319 1174 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Syce3B5KM66 AC140264.2-201ENSMUST00000219668 289 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Syce3B5KM66 Rph3al-202ENSMUST00000066504 988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Syce3B5KM66 Gstt2-201ENSMUST00000038257 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Syce3B5KM66 Dnmt3b-204ENSMUST00000088976 4130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Syce3B5KM66 H2-T23-201ENSMUST00000102678 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Syce3B5KM66 Sem1-201ENSMUST00000041111 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Syce3B5KM66 Tmem59l-201ENSMUST00000045286 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Syce3B5KM66 Rtn4-205ENSMUST00000102843 4618 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Syce3B5KM66 Kmt5c-203ENSMUST00000108583 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Syce3B5KM66 Ddx23-201ENSMUST00000003450 3187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Syce3B5KM66 Ptbp2-201ENSMUST00000029780 3364 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Syce3B5KM66 D930019O06Rik-201ENSMUST00000181841 3663 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Syce3B5KM66 Ncbp1-201ENSMUST00000030014 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Syce3B5KM66 Rwdd4a-201ENSMUST00000033973 2921 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Syce3B5KM66 Slc30a2-201ENSMUST00000081094 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Syce3B5KM66 Itga3-201ENSMUST00000001548 4861 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Syce3B5KM66 Tmem86b-202ENSMUST00000205360 1344 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Syce3B5KM66 Yod1-201ENSMUST00000049813 6128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Syce3B5KM66 Zbtb20-205ENSMUST00000114695 2977 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Syce3B5KM66 Slc8b1-204ENSMUST00000111890 2775 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Syce3B5KM66 G3bp2-203ENSMUST00000167918 4232 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Syce3B5KM66 Rxra-203ENSMUST00000113934 1989 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Syce3B5KM66 Col1a1-201ENSMUST00000001547 5930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Syce3B5KM66 Klf12-201ENSMUST00000097079 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Syce3B5KM66 Arid4b-202ENSMUST00000110533 3020 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Syce3B5KM66 Nat8f6-202ENSMUST00000174143 1571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Syce3B5KM66 Nfkbia-201ENSMUST00000021413 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Syce3B5KM66 Parp16-202ENSMUST00000213396 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Syce3B5KM66 B3gnt8-201ENSMUST00000076034 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Syce3B5KM66 Ercc1-201ENSMUST00000003645 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Syce3B5KM66 Ncam2-201ENSMUST00000037785 4893 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Syce3B5KM66 Gm4535-201ENSMUST00000182274 558 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
Syce3B5KM66 Rps13-ps1-201ENSMUST00000183478 538 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
Syce3B5KM66 9230114J08Rik-201ENSMUST00000200375 350 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Syce3B5KM66 Vmn2r-ps89-201ENSMUST00000209195 1010 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
Syce3B5KM66 Klhl33-204ENSMUST00000227271 5513 ntAPPRIS P1 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Syce3B5KM66 Nmu-201ENSMUST00000031146 828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Syce3B5KM66 Rangrf-201ENSMUST00000038644 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Syce3B5KM66 Lce1a1-201ENSMUST00000074142 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Syce3B5KM66 Gm10355-201ENSMUST00000097146 517 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
Syce3B5KM66 Papd7-201ENSMUST00000044081 3994 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Syce3B5KM66 Krt26-201ENSMUST00000100482 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Syce3B5KM66 Dnaaf2-201ENSMUST00000021356 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Syce3B5KM66 Olah-201ENSMUST00000027955 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Syce3B5KM66 Lrig2-205ENSMUST00000198332 3946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Syce3B5KM66 Esm1-201ENSMUST00000038144 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Syce3B5KM66 Gm17619-201ENSMUST00000180625 1449 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Syce3B5KM66 Arl6ip6-201ENSMUST00000028336 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Syce3B5KM66 1600002D24Rik-202ENSMUST00000136744 1854 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Syce3B5KM66 Gm14812-201ENSMUST00000156494 1794 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Syce3B5KM66 Shmt2-206ENSMUST00000219239 2238 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Syce3B5KM66 Gga3-202ENSMUST00000106508 3582 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Syce3B5KM66 Slc19a2-201ENSMUST00000044021 3571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Syce3B5KM66 Galns-203ENSMUST00000212319 2111 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Syce3B5KM66 Cox16-201ENSMUST00000002757 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Syce3B5KM66 Ldlrad3-201ENSMUST00000058790 3833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Syce3B5KM66 Rbl2-208ENSMUST00000209518 4792 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Syce3B5KM66 Kcnn2-205ENSMUST00000183850 3546 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Syce3B5KM66 Dhx9-202ENSMUST00000186380 4561 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Syce3B5KM66 Cant1-202ENSMUST00000092378 2995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Syce3B5KM66 Exd2-201ENSMUST00000038185 3310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Syce3B5KM66 Gpr108-201ENSMUST00000005975 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Syce3B5KM66 Gnao1-203ENSMUST00000125716 3462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Syce3B5KM66 Nat9-203ENSMUST00000103040 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Syce3B5KM66 Nat9-204ENSMUST00000103041 953 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Syce3B5KM66 Gm5577-203ENSMUST00000153372 815 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Syce3B5KM66 Tmem176a-202ENSMUST00000168406 1086 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Syce3B5KM66 AC121577.1-201ENSMUST00000227302 707 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
Syce3B5KM66 Kcnk16-201ENSMUST00000024155 916 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Syce3B5KM66 Rhox6-201ENSMUST00000006362 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Syce3B5KM66 Olfm1-202ENSMUST00000100244 2686 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Syce3B5KM66 Llgl2-212ENSMUST00000177736 3612 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Syce3B5KM66 Mtss1-201ENSMUST00000080371 4938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Syce3B5KM66 Naa30-201ENSMUST00000037362 4464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Syce3B5KM66 Brsk2-204ENSMUST00000105989 2149 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Syce3B5KM66 Gm43156-201ENSMUST00000202338 2127 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Syce3B5KM66 Slc26a4-201ENSMUST00000001253 3075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Syce3B5KM66 Vav1-203ENSMUST00000112870 2743 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Syce3B5KM66 Dusp23-201ENSMUST00000027826 1410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Syce3B5KM66 Muc20-201ENSMUST00000041123 2299 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.1 ms