Protein–RNA interactions for Protein: B4XVQ1

Phf11b, PHD finger protein 11B, mousemouse

Predictions only

Length 276 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Phf11bB4XVQ1 Slc39a14-201ENSMUST00000022688 2098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
Phf11bB4XVQ1 Fam19a4-201ENSMUST00000089295 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
Phf11bB4XVQ1 Rhobtb1-210ENSMUST00000167384 2331 ntTSL 5 BASIC14.03□□□□□ -0.16
Phf11bB4XVQ1 Leng9-201ENSMUST00000058358 2460 ntAPPRIS P1 BASIC14.03□□□□□ -0.16
Phf11bB4XVQ1 Apol8-202ENSMUST00000089450 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.03□□□□□ -0.16
Phf11bB4XVQ1 Car10-203ENSMUST00000107858 2742 ntTSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
Phf11bB4XVQ1 Fam169b-202ENSMUST00000125685 2821 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
Phf11bB4XVQ1 Ano7-201ENSMUST00000058682 2963 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
Phf11bB4XVQ1 Keap1-205ENSMUST00000194542 3151 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
Phf11bB4XVQ1 Tmem30a-202ENSMUST00000120690 3627 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.02□□□□□ -0.16
Phf11bB4XVQ1 Tgif2-201ENSMUST00000073352 2690 ntTSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.16
Phf11bB4XVQ1 Pgap2-225ENSMUST00000156529 2034 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.16
Phf11bB4XVQ1 Dab1-203ENSMUST00000106830 5278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.16
Phf11bB4XVQ1 BC026585-201ENSMUST00000046743 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.16
Phf11bB4XVQ1 Gm16845-201ENSMUST00000180419 1415 ntTSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.16
Phf11bB4XVQ1 Gm11611-201ENSMUST00000134289 1326 ntTSL 3 BASIC14.02□□□□□ -0.17
Phf11bB4XVQ1 Gm26728-202ENSMUST00000203423 1333 ntTSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.17
Phf11bB4XVQ1 Cdkn1a-203ENSMUST00000122348 857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.17
Phf11bB4XVQ1 Gm11508-201ENSMUST00000129337 440 ntTSL 2 BASIC14.02□□□□□ -0.17
Phf11bB4XVQ1 Gm17613-201ENSMUST00000138893 669 ntTSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.17
Phf11bB4XVQ1 Med22-201ENSMUST00000015920 973 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC14.02□□□□□ -0.17
Phf11bB4XVQ1 Nptn-211ENSMUST00000177064 582 ntTSL 5 BASIC14.02□□□□□ -0.17
Phf11bB4XVQ1 AC166341.4-201ENSMUST00000220625 123 ntBASIC14.02□□□□□ -0.17
Phf11bB4XVQ1 Ndufs6-203ENSMUST00000222930 512 ntTSL 3 BASIC14.02□□□□□ -0.17
Phf11bB4XVQ1 Lrrc26-201ENSMUST00000028337 1190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.17
Phf11bB4XVQ1 Mt3-201ENSMUST00000034211 536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.17
Phf11bB4XVQ1 Crygn-201ENSMUST00000047119 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.17
Phf11bB4XVQ1 Rhbdl3-201ENSMUST00000017836 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.17
Phf11bB4XVQ1 Wdr90-201ENSMUST00000079461 5991 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.02□□□□□ -0.17
Phf11bB4XVQ1 Ank-201ENSMUST00000022875 3498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.17
Phf11bB4XVQ1 Gm37240-203ENSMUST00000154148 2913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.17
Phf11bB4XVQ1 Six3os1-211ENSMUST00000176958 2889 ntTSL 2 BASIC14.02□□□□□ -0.17
Phf11bB4XVQ1 Mtrr-209ENSMUST00000223398 3861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.17
Phf11bB4XVQ1 Slco3a1-203ENSMUST00000107453 3793 ntTSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.17
Phf11bB4XVQ1 Gpr108-201ENSMUST00000005975 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.17
Phf11bB4XVQ1 Apbb1-215ENSMUST00000190369 1882 ntTSL 5 BASIC14.01□□□□□ -0.17
Phf11bB4XVQ1 Arpc1b-201ENSMUST00000085679 3105 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
Phf11bB4XVQ1 Nupr1l-201ENSMUST00000178355 1827 ntAPPRIS P1 BASIC14.01□□□□□ -0.17
Phf11bB4XVQ1 Pnkd-201ENSMUST00000027370 2937 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
Phf11bB4XVQ1 Rsrp1-201ENSMUST00000078084 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
Phf11bB4XVQ1 Rab11fip2-201ENSMUST00000051996 4482 ntTSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
Phf11bB4XVQ1 Fuz-213ENSMUST00000209039 1453 ntTSL 5 BASIC14.01□□□□□ -0.17
Phf11bB4XVQ1 Sem1-201ENSMUST00000041111 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
Phf11bB4XVQ1 Clcnka-201ENSMUST00000042617 2428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
Phf11bB4XVQ1 Mapk7-202ENSMUST00000101085 3254 ntTSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
Phf11bB4XVQ1 Olfr718-ps1-203ENSMUST00000215102 4913 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC14.01□□□□□ -0.17
Phf11bB4XVQ1 Coq10a-205ENSMUST00000220027 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.01□□□□□ -0.17
Phf11bB4XVQ1 Gm37912-201ENSMUST00000191895 3076 ntBASIC14.01□□□□□ -0.17
Phf11bB4XVQ1 Pfn2-203ENSMUST00000120289 905 ntTSL 2 BASIC14.01□□□□□ -0.17
Phf11bB4XVQ1 Gm11745-201ENSMUST00000121669 448 ntBASIC14.01□□□□□ -0.17
Phf11bB4XVQ1 Znrf1-213ENSMUST00000174333 515 ntTSL 3 BASIC14.01□□□□□ -0.17
Phf11bB4XVQ1 Gm9182-201ENSMUST00000217829 639 ntBASIC14.01□□□□□ -0.17
Phf11bB4XVQ1 AC155729.1-201ENSMUST00000227758 544 ntBASIC14.01□□□□□ -0.17
Phf11bB4XVQ1 Smim8-201ENSMUST00000029972 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
Phf11bB4XVQ1 Anapc15-202ENSMUST00000035395 836 ntTSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
Phf11bB4XVQ1 Spr-201ENSMUST00000045986 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
Phf11bB4XVQ1 Slc35c2-204ENSMUST00000109300 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
Phf11bB4XVQ1 Gm43056-201ENSMUST00000197865 2791 ntBASIC14.01□□□□□ -0.17
Phf11bB4XVQ1 Ddhd1-202ENSMUST00000087320 9820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
Phf11bB4XVQ1 Gm27177-203ENSMUST00000184034 1911 ntTSL 5 BASIC14.01□□□□□ -0.17
Phf11bB4XVQ1 Lsr-202ENSMUST00000098553 1930 ntTSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
Phf11bB4XVQ1 AC167013.2-201ENSMUST00000228520 2684 ntBASIC14.01□□□□□ -0.17
Phf11bB4XVQ1 Gnpda2-201ENSMUST00000031117 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
Phf11bB4XVQ1 Fbxo46-202ENSMUST00000165913 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
Phf11bB4XVQ1 Mfn2-202ENSMUST00000105714 2427 ntTSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
Phf11bB4XVQ1 H13-202ENSMUST00000089059 1743 ntTSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
Phf11bB4XVQ1 Agap1-201ENSMUST00000027521 11921 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
Phf11bB4XVQ1 Slc8a3-201ENSMUST00000064594 4379 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.01□□□□□ -0.17
Phf11bB4XVQ1 4930556H04Rik-201ENSMUST00000222451 1675 ntBASIC14.01□□□□□ -0.17
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Phf11bB4XVQ1 Il17re-202ENSMUST00000058548 2940 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
Phf11bB4XVQ1 Sh2b1-204ENSMUST00000205497 2854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
Phf11bB4XVQ1 Orai2-201ENSMUST00000041048 3908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Phf11bB4XVQ1 Safb2-201ENSMUST00000075510 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Phf11bB4XVQ1 Adad1-203ENSMUST00000144629 3101 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Phf11bB4XVQ1 Agpat1-202ENSMUST00000114140 1941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Phf11bB4XVQ1 Ppp1r1b-206ENSMUST00000150762 1801 ntTSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Phf11bB4XVQ1 Elovl1-201ENSMUST00000006557 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Phf11bB4XVQ1 2410006H16Rik-201ENSMUST00000131787 462 ntTSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Phf11bB4XVQ1 A230065H16Rik-201ENSMUST00000150384 670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Phf11bB4XVQ1 Rbpms-202ENSMUST00000033995 1039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Phf11bB4XVQ1 Olfr324-201ENSMUST00000054683 1122 ntAPPRIS P2 BASIC14□□□□□ -0.17
Phf11bB4XVQ1 Gm10073-201ENSMUST00000073722 496 ntAPPRIS P1 BASIC14□□□□□ -0.17
Phf11bB4XVQ1 Gpbar1-201ENSMUST00000077985 1075 ntAPPRIS P1 BASIC14□□□□□ -0.17
Phf11bB4XVQ1 Rplp1-201ENSMUST00000008036 499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Phf11bB4XVQ1 Tmem19-203ENSMUST00000217884 2799 ntTSL 5 BASIC14□□□□□ -0.17
Phf11bB4XVQ1 Osbpl8-201ENSMUST00000095310 3622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Phf11bB4XVQ1 Lpcat1-208ENSMUST00000223060 2141 ntTSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Phf11bB4XVQ1 P2ry2-201ENSMUST00000037540 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Phf11bB4XVQ1 Slc8b1-203ENSMUST00000111889 1624 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14□□□□□ -0.17
Phf11bB4XVQ1 Gm28182-201ENSMUST00000188354 2477 ntBASIC14□□□□□ -0.17
Phf11bB4XVQ1 Stat3-201ENSMUST00000092671 2927 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Phf11bB4XVQ1 Fam53b-203ENSMUST00000097999 5465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Phf11bB4XVQ1 Gm45630-201ENSMUST00000210243 1911 ntBASIC14□□□□□ -0.17
Phf11bB4XVQ1 Mdfic-203ENSMUST00000125326 3635 ntTSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Phf11bB4XVQ1 Tmem198b-201ENSMUST00000051011 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Phf11bB4XVQ1 Il2rb-202ENSMUST00000163494 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Phf11bB4XVQ1 Sbk2-205ENSMUST00000208109 1422 ntTSL 5 BASIC13.99□□□□□ -0.17
Phf11bB4XVQ1 Slc5a6-202ENSMUST00000114668 3436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Phf11bB4XVQ1 Riox2-201ENSMUST00000023407 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
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