Protein–RNA interactions for Protein: B4XVP9

Phf11c, PHD finger protein 11C, mousemouse

Predictions only

Length 339 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Phf11cB4XVP9 Ak1-201ENSMUST00000068271 2034 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Phf11cB4XVP9 Gpr137-205ENSMUST00000166115 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Phf11cB4XVP9 Sirt4-202ENSMUST00000112067 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Phf11cB4XVP9 6430710C18Rik-203ENSMUST00000136807 1540 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Phf11cB4XVP9 Aqp3-201ENSMUST00000055327 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Phf11cB4XVP9 Kcnk13-204ENSMUST00000177549 3075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Phf11cB4XVP9 Grin3a-202ENSMUST00000093859 7491 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Phf11cB4XVP9 Fam133b-201ENSMUST00000115527 1491 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Phf11cB4XVP9 Gm10044-203ENSMUST00000166813 1471 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Phf11cB4XVP9 4933433G15Rik-201ENSMUST00000180533 1481 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Phf11cB4XVP9 Rab3a-201ENSMUST00000034301 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Phf11cB4XVP9 Srpx-201ENSMUST00000044789 2477 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Phf11cB4XVP9 Elovl1-201ENSMUST00000006557 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Phf11cB4XVP9 4731419I09Rik-201ENSMUST00000180791 2820 ntTSL 2 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Phf11cB4XVP9 Myo1d-201ENSMUST00000041065 5354 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Phf11cB4XVP9 Wdr61-203ENSMUST00000121204 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Phf11cB4XVP9 Olfr1344-201ENSMUST00000168341 1061 ntAPPRIS P1 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Phf11cB4XVP9 Mir5131-201ENSMUST00000175426 93 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
Phf11cB4XVP9 5430405H02Rik-203ENSMUST00000185402 904 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Phf11cB4XVP9 Gm42670-201ENSMUST00000201816 1292 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
Phf11cB4XVP9 1110035H17Rik-202ENSMUST00000205672 1231 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
Phf11cB4XVP9 Gm45144-201ENSMUST00000207473 354 ntTSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Phf11cB4XVP9 AC155729.1-201ENSMUST00000227758 544 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
Phf11cB4XVP9 Bex3-201ENSMUST00000053540 930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Phf11cB4XVP9 Aldh1a2-201ENSMUST00000034723 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Phf11cB4XVP9 Edil3-203ENSMUST00000118731 2721 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Phf11cB4XVP9 Adamts8-201ENSMUST00000068135 3631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Phf11cB4XVP9 Dapk1-201ENSMUST00000044083 5304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Phf11cB4XVP9 Pramel1-201ENSMUST00000037419 2794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Phf11cB4XVP9 Ddx42-201ENSMUST00000021046 4011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Phf11cB4XVP9 Coro6-201ENSMUST00000021190 1418 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Phf11cB4XVP9 Mllt10-203ENSMUST00000114671 5063 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Phf11cB4XVP9 Kctd14-205ENSMUST00000206279 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Phf11cB4XVP9 B3gat1-204ENSMUST00000160899 3801 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Phf11cB4XVP9 Fbxo10-201ENSMUST00000052236 4635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Phf11cB4XVP9 Taz-202ENSMUST00000114180 1786 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Phf11cB4XVP9 P2rx3-203ENSMUST00000111616 1315 ntTSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Phf11cB4XVP9 Pdgfc-201ENSMUST00000029652 3521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Phf11cB4XVP9 Ngef-201ENSMUST00000027477 2746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Phf11cB4XVP9 Kcnk13-202ENSMUST00000160413 3061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Phf11cB4XVP9 Gm8096-201ENSMUST00000209921 1591 ntBASIC13.62□□□□□ -0.23
Phf11cB4XVP9 Gnl3-201ENSMUST00000037739 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Phf11cB4XVP9 Samd14-201ENSMUST00000055947 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Phf11cB4XVP9 Dnajb1-201ENSMUST00000005620 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Phf11cB4XVP9 Tmem237-201ENSMUST00000087475 1823 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Phf11cB4XVP9 1600014C10Rik-205ENSMUST00000178876 3283 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Phf11cB4XVP9 Steap2-201ENSMUST00000015797 3657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Phf11cB4XVP9 Celf4-203ENSMUST00000223704 2492 ntAPPRIS ALT1 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Phf11cB4XVP9 Arhgap4-204ENSMUST00000114406 2749 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Phf11cB4XVP9 Sec22b-202ENSMUST00000122288 1177 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Phf11cB4XVP9 Gm12981-201ENSMUST00000131733 622 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Phf11cB4XVP9 Psma6-204ENSMUST00000163070 787 ntTSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Phf11cB4XVP9 Tmem255b-201ENSMUST00000167071 1138 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Phf11cB4XVP9 Egfl7-216ENSMUST00000174211 1163 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Phf11cB4XVP9 Tma7-203ENSMUST00000192801 386 ntTSL 3 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Phf11cB4XVP9 4930500L23Rik-201ENSMUST00000198000 747 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Phf11cB4XVP9 Gm15406-202ENSMUST00000202229 767 ntTSL 2 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Phf11cB4XVP9 Pih1d1-206ENSMUST00000210139 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Phf11cB4XVP9 Tmem52-201ENSMUST00000023920 932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Phf11cB4XVP9 Zfp24-203ENSMUST00000153337 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Phf11cB4XVP9 Ythdf2-203ENSMUST00000152796 4129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Phf11cB4XVP9 Mael-202ENSMUST00000194057 1691 ntTSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Phf11cB4XVP9 Gm45630-201ENSMUST00000210243 1911 ntBASIC13.62□□□□□ -0.23
Phf11cB4XVP9 Cfap45-201ENSMUST00000085894 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Phf11cB4XVP9 Sufu-203ENSMUST00000118440 2663 ntTSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Phf11cB4XVP9 Mbp-203ENSMUST00000075372 2075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Phf11cB4XVP9 Tpm1-202ENSMUST00000034928 1824 ntTSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Phf11cB4XVP9 Lancl1-202ENSMUST00000113979 4461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Phf11cB4XVP9 Gm8281-202ENSMUST00000163719 1954 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Phf11cB4XVP9 Atg16l1-201ENSMUST00000027512 3130 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Phf11cB4XVP9 Pax6-201ENSMUST00000090391 2869 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Phf11cB4XVP9 Tmem59l-201ENSMUST00000045286 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Phf11cB4XVP9 Grtp1-206ENSMUST00000210317 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Phf11cB4XVP9 Acat3-201ENSMUST00000043923 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Phf11cB4XVP9 Slc4a4-207ENSMUST00000148750 7931 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.61□□□□□ -0.23
Phf11cB4XVP9 Rap2b-201ENSMUST00000049064 6793 ntAPPRIS P1 BASIC13.61□□□□□ -0.23
Phf11cB4XVP9 Gm42471-201ENSMUST00000201457 1865 ntBASIC13.61□□□□□ -0.23
Phf11cB4XVP9 Gnpda2-201ENSMUST00000031117 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Phf11cB4XVP9 Cldn11-201ENSMUST00000046174 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Phf11cB4XVP9 Eloa-201ENSMUST00000030427 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Phf11cB4XVP9 Pcdha11-201ENSMUST00000115658 5359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Phf11cB4XVP9 Col7a1-202ENSMUST00000112070 9250 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.61□□□□□ -0.23
Phf11cB4XVP9 Ssr1-204ENSMUST00000225319 1610 ntBASIC13.61□□□□□ -0.23
Phf11cB4XVP9 Prrt3-201ENSMUST00000101059 3304 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Phf11cB4XVP9 Sh3bp5-201ENSMUST00000091903 2684 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Phf11cB4XVP9 Fdps-203ENSMUST00000196709 1382 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.61□□□□□ -0.23
Phf11cB4XVP9 Akirin2-201ENSMUST00000084299 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Phf11cB4XVP9 Mtss1-201ENSMUST00000080371 4938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Phf11cB4XVP9 Gm28230-201ENSMUST00000053932 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Phf11cB4XVP9 Gm43570-201ENSMUST00000199951 3688 ntBASIC13.61□□□□□ -0.23
Phf11cB4XVP9 Arl4a-201ENSMUST00000101472 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Phf11cB4XVP9 Gemin7-204ENSMUST00000122055 609 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.61□□□□□ -0.23
Phf11cB4XVP9 Snx15-207ENSMUST00000154601 767 ntTSL 5 BASIC13.61□□□□□ -0.23
Phf11cB4XVP9 Egfl8-201ENSMUST00000015611 1150 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Phf11cB4XVP9 Bag2-203ENSMUST00000187602 378 ntTSL 2 BASIC13.61□□□□□ -0.23
Phf11cB4XVP9 Gm29103-201ENSMUST00000191034 598 ntTSL 5 BASIC13.61□□□□□ -0.23
Phf11cB4XVP9 Olfr286-202ENSMUST00000205305 969 ntBASIC13.61□□□□□ -0.23
Phf11cB4XVP9 Klk15-201ENSMUST00000068625 845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Phf11cB4XVP9 9430038I01Rik-201ENSMUST00000068996 1126 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Phf11cB4XVP9 Egfl8-202ENSMUST00000097345 1064 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
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