Protein–RNA interactions for Protein: B2RW38

Cfap58, Cilia- and flagella-associated protein 58, mousemouse

Predictions only

Length 873 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cfap58B2RW38 Slc5a6-202ENSMUST00000114668 3436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Cfap58B2RW38 Sirt4-202ENSMUST00000112067 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Cfap58B2RW38 Dmrtc2-201ENSMUST00000011493 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Cfap58B2RW38 Ywhag-205ENSMUST00000198270 1610 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Cfap58B2RW38 Arl4a-201ENSMUST00000101472 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Cfap58B2RW38 Gm45799-202ENSMUST00000106786 409 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Cfap58B2RW38 Dgcr6-208ENSMUST00000153123 920 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Cfap58B2RW38 Tma7-203ENSMUST00000192801 386 ntTSL 3 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Cfap58B2RW38 1110035H17Rik-202ENSMUST00000205672 1231 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
Cfap58B2RW38 Umpk-ps-201ENSMUST00000211897 827 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
Cfap58B2RW38 AC161829.1-201ENSMUST00000220298 281 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
Cfap58B2RW38 Zfyve21-206ENSMUST00000222843 705 ntTSL 3 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Cfap58B2RW38 Bex3-201ENSMUST00000053540 930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Cfap58B2RW38 9430038I01Rik-201ENSMUST00000068996 1126 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Cfap58B2RW38 Psma5-201ENSMUST00000090569 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Cfap58B2RW38 Rbpms2-202ENSMUST00000169003 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Cfap58B2RW38 Syt10-201ENSMUST00000029441 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Cfap58B2RW38 Tm9sf1-201ENSMUST00000002391 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Cfap58B2RW38 Erg-206ENSMUST00000122199 2007 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Cfap58B2RW38 Mael-202ENSMUST00000194057 1691 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Cfap58B2RW38 Alg10b-201ENSMUST00000100309 3727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Cfap58B2RW38 Tmem86b-202ENSMUST00000205360 1344 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Cfap58B2RW38 Gm5069-201ENSMUST00000050581 1328 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Cfap58B2RW38 Osm-201ENSMUST00000075221 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Cfap58B2RW38 Knop1-204ENSMUST00000106550 5524 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Cfap58B2RW38 Lhx1-201ENSMUST00000018842 3846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Cfap58B2RW38 Spo11-201ENSMUST00000050442 1709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Cfap58B2RW38 Gm38102-201ENSMUST00000192791 1935 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
Cfap58B2RW38 Gm45779-201ENSMUST00000212189 4064 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
Cfap58B2RW38 Tmem220-201ENSMUST00000061786 1597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Cfap58B2RW38 Rims1-201ENSMUST00000081544 5954 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Cfap58B2RW38 Rtn4-205ENSMUST00000102843 4618 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Cfap58B2RW38 CT030684.3-201ENSMUST00000227308 2445 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
Cfap58B2RW38 Gm11992-201ENSMUST00000043285 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Cfap58B2RW38 Hsd17b11-202ENSMUST00000119025 2234 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Cfap58B2RW38 Dnase1l1-201ENSMUST00000019232 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Cfap58B2RW38 Reep5-201ENSMUST00000006027 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Cfap58B2RW38 Elf4-202ENSMUST00000114958 6088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Cfap58B2RW38 Fam133b-201ENSMUST00000115527 1491 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Cfap58B2RW38 Gm10044-203ENSMUST00000166813 1471 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Cfap58B2RW38 Oprl1-203ENSMUST00000108766 1241 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Cfap58B2RW38 Nudt1-204ENSMUST00000110826 606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Cfap58B2RW38 Rpl34-ps1-201ENSMUST00000121998 354 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
Cfap58B2RW38 Gm11452-201ENSMUST00000122376 690 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
Cfap58B2RW38 Gm15758-201ENSMUST00000161681 695 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Cfap58B2RW38 Avpi1-201ENSMUST00000018965 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Cfap58B2RW38 Gm29520-201ENSMUST00000191209 1067 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Cfap58B2RW38 Gm30097-202ENSMUST00000194580 329 ntTSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Cfap58B2RW38 Zfp747-202ENSMUST00000205832 618 ntTSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Cfap58B2RW38 Pih1d1-206ENSMUST00000210139 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Cfap58B2RW38 Pold4-201ENSMUST00000025773 910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Cfap58B2RW38 Khk-201ENSMUST00000031053 1257 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Cfap58B2RW38 Rpl34-ps2-201ENSMUST00000081679 354 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
Cfap58B2RW38 Gm10154-201ENSMUST00000084445 354 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
Cfap58B2RW38 Slc38a1-201ENSMUST00000088452 7266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Cfap58B2RW38 Mapk7-202ENSMUST00000101085 3254 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Cfap58B2RW38 Ncdn-202ENSMUST00000106116 2434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Cfap58B2RW38 Gm11873-201ENSMUST00000117877 1304 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
Cfap58B2RW38 Jakmip3-201ENSMUST00000106111 1571 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Cfap58B2RW38 Gm16685-201ENSMUST00000181286 1592 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Cfap58B2RW38 Iah1-204ENSMUST00000223345 1890 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Cfap58B2RW38 Acin1-201ENSMUST00000022793 4735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Cfap58B2RW38 Tspyl1-201ENSMUST00000061372 3086 ntAPPRIS P1 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Cfap58B2RW38 Tagap1-201ENSMUST00000063683 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Cfap58B2RW38 Haus5-201ENSMUST00000019697 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Cfap58B2RW38 Zfp57-211ENSMUST00000174524 1747 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Cfap58B2RW38 Ptcd2-201ENSMUST00000022153 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Cfap58B2RW38 Hoxc4-201ENSMUST00000100164 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Cfap58B2RW38 Dgke-201ENSMUST00000000285 5208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Cfap58B2RW38 Cluh-202ENSMUST00000117818 4284 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Cfap58B2RW38 Gapvd1-202ENSMUST00000102800 8339 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Cfap58B2RW38 Slc16a13-201ENSMUST00000060010 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Cfap58B2RW38 Hoxa7-201ENSMUST00000048715 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Cfap58B2RW38 Gm14812-201ENSMUST00000156494 1794 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Cfap58B2RW38 Map2k3os-201ENSMUST00000123544 1291 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Cfap58B2RW38 Snhg15-203ENSMUST00000134527 675 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Cfap58B2RW38 Gm17114-201ENSMUST00000164716 511 ntTSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Cfap58B2RW38 Csrp3-202ENSMUST00000167786 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Cfap58B2RW38 Gm26769-201ENSMUST00000180469 619 ntTSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Cfap58B2RW38 AC155714.1-201ENSMUST00000214033 956 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Cfap58B2RW38 Wdyhv1-204ENSMUST00000226955 1094 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
Cfap58B2RW38 Lce1a2-201ENSMUST00000029530 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Cfap58B2RW38 Ap2a1-202ENSMUST00000107857 3301 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Cfap58B2RW38 Ash2l-201ENSMUST00000068892 3307 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Cfap58B2RW38 Nfatc1-202ENSMUST00000078049 4607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Cfap58B2RW38 Hnrnpm-202ENSMUST00000114385 2550 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Cfap58B2RW38 Eef1e1-201ENSMUST00000001757 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Cfap58B2RW38 Dnajb5-204ENSMUST00000107973 2300 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Cfap58B2RW38 Rhobtb1-210ENSMUST00000167384 2331 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Cfap58B2RW38 Osbpl8-201ENSMUST00000095310 3622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Cfap58B2RW38 Cnga3-203ENSMUST00000194195 2083 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Cfap58B2RW38 Gpr108-201ENSMUST00000005975 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Cfap58B2RW38 Mpl-201ENSMUST00000006556 2083 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Cfap58B2RW38 P4hb-201ENSMUST00000026122 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Cfap58B2RW38 Akap17b-201ENSMUST00000051906 6003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Cfap58B2RW38 Grb2-203ENSMUST00000106497 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Cfap58B2RW38 Tbx3-201ENSMUST00000018748 4856 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Cfap58B2RW38 Me1-201ENSMUST00000034989 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Cfap58B2RW38 Atp4b-201ENSMUST00000033826 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Cfap58B2RW38 AI467606-201ENSMUST00000056288 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.7 ms