Protein–RNA interactions for Protein: B2RU80

Ptprb, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase beta, mousemouse

Predictions only

Length 1,998 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PtprbB2RU80 Tmem52-205ENSMUST00000178238 968 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
PtprbB2RU80 Mir6420-201ENSMUST00000185032 102 ntBASIC12.72□□□□□ -0.37
PtprbB2RU80 Nabp1-202ENSMUST00000185534 708 ntTSL 2 BASIC12.72□□□□□ -0.37
PtprbB2RU80 Gm7558-201ENSMUST00000193221 1165 ntBASIC12.72□□□□□ -0.37
PtprbB2RU80 4930449I04Rik-201ENSMUST00000198191 1123 ntBASIC12.72□□□□□ -0.37
PtprbB2RU80 Smim11-201ENSMUST00000063641 517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
PtprbB2RU80 Rbpj-203ENSMUST00000113865 5440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
PtprbB2RU80 Slc22a20-201ENSMUST00000041827 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
PtprbB2RU80 B4galt3-202ENSMUST00000111313 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
PtprbB2RU80 Narfl-204ENSMUST00000134108 2062 ntTSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
PtprbB2RU80 Ankrd50-202ENSMUST00000120875 4945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
PtprbB2RU80 Krit1-211ENSMUST00000200386 2343 ntTSL 5 BASIC12.72□□□□□ -0.37
PtprbB2RU80 Asprv1-201ENSMUST00000043400 1547 ntAPPRIS P1 BASIC12.72□□□□□ -0.37
PtprbB2RU80 Spg20-201ENSMUST00000044116 3770 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
PtprbB2RU80 Dusp15-203ENSMUST00000123121 2993 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.72□□□□□ -0.37
PtprbB2RU80 Itga9-201ENSMUST00000044165 7020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
PtprbB2RU80 Efcab14-202ENSMUST00000106522 2636 ntTSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
PtprbB2RU80 Pid1-204ENSMUST00000176559 1564 ntTSL 2 BASIC12.72□□□□□ -0.37
PtprbB2RU80 Zfp697-201ENSMUST00000056096 5166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
PtprbB2RU80 Arhgef2-202ENSMUST00000107510 4390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
PtprbB2RU80 Fam214a-202ENSMUST00000170846 4355 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.71□□□□□ -0.37
PtprbB2RU80 Ap4b1-202ENSMUST00000076599 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
PtprbB2RU80 Usp35-202ENSMUST00000168435 3982 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.71□□□□□ -0.37
PtprbB2RU80 Letm1-201ENSMUST00000005431 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
PtprbB2RU80 Gpsm1-203ENSMUST00000078616 3127 ntTSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
PtprbB2RU80 Itpk1-201ENSMUST00000046518 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
PtprbB2RU80 Gpam-201ENSMUST00000061856 3832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
PtprbB2RU80 Rbl2-201ENSMUST00000034091 4925 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
PtprbB2RU80 Chodl-201ENSMUST00000023568 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
PtprbB2RU80 Sema3b-204ENSMUST00000102531 2958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
PtprbB2RU80 Arhgef10l-206ENSMUST00000105799 4508 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.71□□□□□ -0.37
PtprbB2RU80 Cep44-201ENSMUST00000040330 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
PtprbB2RU80 Sem1-201ENSMUST00000041111 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
PtprbB2RU80 Tars2-204ENSMUST00000163530 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
PtprbB2RU80 L2hgdh-201ENSMUST00000021370 3340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
PtprbB2RU80 Map4k5-201ENSMUST00000049239 4452 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
PtprbB2RU80 Gm13496-201ENSMUST00000141133 1165 ntTSL 2 BASIC12.71□□□□□ -0.37
PtprbB2RU80 2210408F21Rik-214ENSMUST00000155345 1022 ntTSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
PtprbB2RU80 Tdrp-206ENSMUST00000210414 323 ntTSL 3 BASIC12.71□□□□□ -0.37
PtprbB2RU80 Sftpa1-201ENSMUST00000022314 851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
PtprbB2RU80 Tmem139-201ENSMUST00000095987 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.71□□□□□ -0.37
PtprbB2RU80 Pex3-202ENSMUST00000105539 1961 ntTSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
PtprbB2RU80 Sgce-202ENSMUST00000090686 1547 ntTSL 5 BASIC12.71□□□□□ -0.37
PtprbB2RU80 Ythdf3-203ENSMUST00000191774 3196 ntTSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
PtprbB2RU80 Sfrp1-201ENSMUST00000033952 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
PtprbB2RU80 Foxo1-201ENSMUST00000053764 8665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
PtprbB2RU80 A930033H14Rik-201ENSMUST00000170048 2969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
PtprbB2RU80 Arhgef33-202ENSMUST00000223878 3253 ntAPPRIS P1 BASIC12.71□□□□□ -0.37
PtprbB2RU80 Arhgef33-201ENSMUST00000068175 3260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.71□□□□□ -0.37
PtprbB2RU80 Nupr1l-201ENSMUST00000178355 1827 ntAPPRIS P1 BASIC12.71□□□□□ -0.37
PtprbB2RU80 Gm20517-202ENSMUST00000132397 4807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
PtprbB2RU80 Tpbg-201ENSMUST00000006559 3603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
PtprbB2RU80 Fam151a-201ENSMUST00000047620 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.38
PtprbB2RU80 Crocc-202ENSMUST00000097816 6273 ntTSL 5 BASIC12.71□□□□□ -0.38
PtprbB2RU80 Acot6-201ENSMUST00000056822 3388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.38
PtprbB2RU80 Efnb2-201ENSMUST00000001319 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.38
PtprbB2RU80 P2rx3-202ENSMUST00000111613 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.71□□□□□ -0.38
PtprbB2RU80 Pdia4-201ENSMUST00000077290 2399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.38
PtprbB2RU80 Snx29-207ENSMUST00000180792 2667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.71□□□□□ -0.38
PtprbB2RU80 Nudt1-203ENSMUST00000110825 599 ntTSL 2 BASIC12.7□□□□□ -0.38
PtprbB2RU80 Cd209g-201ENSMUST00000130372 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
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PtprbB2RU80 Gm43568-203ENSMUST00000199116 1270 ntTSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
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PtprbB2RU80 Kazn-201ENSMUST00000036476 3843 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
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PtprbB2RU80 Fam19a4-201ENSMUST00000089295 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
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PtprbB2RU80 Elmod1-201ENSMUST00000048409 2605 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
PtprbB2RU80 Slk-201ENSMUST00000026043 7278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
PtprbB2RU80 Pwwp2a-201ENSMUST00000061070 3277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
PtprbB2RU80 Gm2885-201ENSMUST00000181895 1442 ntTSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
PtprbB2RU80 Afg3l2-201ENSMUST00000025408 3085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
PtprbB2RU80 Tef-201ENSMUST00000023024 4079 ntTSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
PtprbB2RU80 Trmt1-205ENSMUST00000125370 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.7□□□□□ -0.38
PtprbB2RU80 Ttc14-203ENSMUST00000117915 4913 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
PtprbB2RU80 Uxs1-202ENSMUST00000126008 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
PtprbB2RU80 Dmrtc2-201ENSMUST00000011493 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
PtprbB2RU80 Gm13112-201ENSMUST00000138795 1258 ntTSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
PtprbB2RU80 Gnb2-215ENSMUST00000170293 993 ntTSL 5 BASIC12.7□□□□□ -0.38
PtprbB2RU80 Pfdn6-205ENSMUST00000174426 396 ntTSL 2 BASIC12.7□□□□□ -0.38
PtprbB2RU80 Mettl26-201ENSMUST00000026827 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
PtprbB2RU80 Gstm1-201ENSMUST00000004140 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
PtprbB2RU80 Mrps17-201ENSMUST00000042191 832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
PtprbB2RU80 Patz1-201ENSMUST00000057089 3118 ntTSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
PtprbB2RU80 Celf4-203ENSMUST00000223704 2492 ntAPPRIS ALT1 BASIC12.7□□□□□ -0.38
PtprbB2RU80 Arhgap21-201ENSMUST00000114594 7351 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.7□□□□□ -0.38
PtprbB2RU80 Hcfc2-201ENSMUST00000020478 3422 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.7□□□□□ -0.38
PtprbB2RU80 Med22-202ENSMUST00000102899 3506 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
PtprbB2RU80 AC131068.2-201ENSMUST00000226175 1453 ntBASIC12.7□□□□□ -0.38
PtprbB2RU80 Lipo3-201ENSMUST00000025694 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
PtprbB2RU80 Cdk2-202ENSMUST00000026416 2406 ntTSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
PtprbB2RU80 Sorcs2-201ENSMUST00000037370 5707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
PtprbB2RU80 Brpf1-202ENSMUST00000113119 4826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
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