Protein–RNA interactions for Protein: B2RS91

Rrn3, RNA polymerase I-specific transcription initiation factor RRN3, mousemouse

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Length 656 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rrn3B2RS91 Sema4b-204ENSMUST00000205822 3760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Rrn3B2RS91 9330182L06Rik-201ENSMUST00000069538 4688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Rrn3B2RS91 Farp2-202ENSMUST00000122402 2816 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Rrn3B2RS91 Gm42466-201ENSMUST00000202099 1301 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
Rrn3B2RS91 Fgf17-202ENSMUST00000227123 1336 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
Rrn3B2RS91 Fbxo41-202ENSMUST00000161078 6562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Rrn3B2RS91 Dym-201ENSMUST00000039608 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Rrn3B2RS91 Farp2-201ENSMUST00000120301 3937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Rrn3B2RS91 Gins2-201ENSMUST00000034278 3900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Rrn3B2RS91 Mbp-202ENSMUST00000062446 2186 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Rrn3B2RS91 Epb41l1-205ENSMUST00000109574 5904 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Rrn3B2RS91 Tubb3-201ENSMUST00000071134 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Rrn3B2RS91 Psmb5-ps-201ENSMUST00000119744 798 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
Rrn3B2RS91 Faap20-210ENSMUST00000178473 1076 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Rrn3B2RS91 4933437G19Rik-201ENSMUST00000197910 1178 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
Rrn3B2RS91 4930593A02Rik-202ENSMUST00000203879 938 ntTSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Rrn3B2RS91 Olfr286-202ENSMUST00000205305 969 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
Rrn3B2RS91 5430427M07Rik-202ENSMUST00000221524 1023 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Rrn3B2RS91 Gm5771-201ENSMUST00000049079 798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Rrn3B2RS91 2610318N02Rik-201ENSMUST00000093336 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Rrn3B2RS91 Lrif1-202ENSMUST00000098751 929 ntTSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Rrn3B2RS91 Atp2a3-201ENSMUST00000021142 4593 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Rrn3B2RS91 E2f3-203ENSMUST00000221536 4597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Rrn3B2RS91 E2f3-204ENSMUST00000222730 4579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Rrn3B2RS91 Nop53-201ENSMUST00000044158 3176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Rrn3B2RS91 Trim24-203ENSMUST00000120428 3940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Rrn3B2RS91 Aen-201ENSMUST00000107421 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Rrn3B2RS91 F11r-201ENSMUST00000043839 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Rrn3B2RS91 Cyp4f18-201ENSMUST00000003574 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Rrn3B2RS91 Fgd1-201ENSMUST00000026296 4001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Rrn3B2RS91 Syn2-201ENSMUST00000009538 2708 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Rrn3B2RS91 Akt2-ps-201ENSMUST00000120718 1449 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
Rrn3B2RS91 Entpd5-204ENSMUST00000117286 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Rrn3B2RS91 Egfl7-212ENSMUST00000166920 1391 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Rrn3B2RS91 Sntb2-203ENSMUST00000212524 9945 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Rrn3B2RS91 Thnsl2-202ENSMUST00000160918 2077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Rrn3B2RS91 Cyp2t4-201ENSMUST00000108385 1599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Rrn3B2RS91 Fgfr3-210ENSMUST00000169212 4245 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Rrn3B2RS91 Grik4-202ENSMUST00000114865 5887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Rrn3B2RS91 Adgrb2-202ENSMUST00000097868 4635 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Rrn3B2RS91 Il9r-202ENSMUST00000128311 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Rrn3B2RS91 Fbxo46-202ENSMUST00000165913 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Rrn3B2RS91 Cbarp-215ENSMUST00000170219 2941 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Rrn3B2RS91 Abhd11-202ENSMUST00000111216 972 ntTSL 3 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Rrn3B2RS91 Atf7ip2-203ENSMUST00000117220 1230 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Rrn3B2RS91 Gm8116-201ENSMUST00000182917 1201 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
Rrn3B2RS91 1700086L19Rik-202ENSMUST00000185822 1028 ntTSL 3 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Rrn3B2RS91 Cyb561d2-205ENSMUST00000195235 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Rrn3B2RS91 Plpp4-203ENSMUST00000205896 714 ntTSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Rrn3B2RS91 Stard3nl-209ENSMUST00000221380 1268 ntTSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Rrn3B2RS91 Ccdc172-201ENSMUST00000069419 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Rrn3B2RS91 Disp2-204ENSMUST00000110846 1732 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Rrn3B2RS91 Gm43951-201ENSMUST00000204457 2889 ntAPPRIS P1 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Rrn3B2RS91 Aspm-205ENSMUST00000200083 6072 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Rrn3B2RS91 Slc25a21-201ENSMUST00000044634 2609 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Rrn3B2RS91 Snx8-205ENSMUST00000196566 1914 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Rrn3B2RS91 Gm43399-201ENSMUST00000202546 2374 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
Rrn3B2RS91 Hipk3-202ENSMUST00000111124 4125 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Rrn3B2RS91 Acot3-201ENSMUST00000021653 3431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Rrn3B2RS91 Sugp2-214ENSMUST00000164403 4099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Rrn3B2RS91 Dnmt3b-202ENSMUST00000072997 4208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Rrn3B2RS91 Zcchc3-201ENSMUST00000099207 3073 ntAPPRIS P1 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Rrn3B2RS91 Lrriq4-202ENSMUST00000108267 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Rrn3B2RS91 Mier2-201ENSMUST00000062855 2562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Rrn3B2RS91 2410018L13Rik-205ENSMUST00000149246 3370 ntTSL 2 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Rrn3B2RS91 Tspan11-201ENSMUST00000032501 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Rrn3B2RS91 Orai3-203ENSMUST00000121504 2141 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Rrn3B2RS91 Cep170-205ENSMUST00000192961 2708 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Rrn3B2RS91 Limk1-201ENSMUST00000015137 3331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Rrn3B2RS91 Agap1-201ENSMUST00000027521 11921 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Rrn3B2RS91 Fbxo21-201ENSMUST00000035579 3883 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Rrn3B2RS91 Hic1-201ENSMUST00000055619 3497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Rrn3B2RS91 Nde1-201ENSMUST00000023359 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Rrn3B2RS91 Plch2-210ENSMUST00000176194 5619 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Rrn3B2RS91 Mettl2-201ENSMUST00000021030 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Rrn3B2RS91 Ppil3-203ENSMUST00000114348 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Rrn3B2RS91 Stra8-202ENSMUST00000114997 1207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Rrn3B2RS91 1700003M07Rik-202ENSMUST00000147634 564 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Rrn3B2RS91 5830408C22Rik-201ENSMUST00000210072 1115 ntTSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Rrn3B2RS91 Caly-201ENSMUST00000026541 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Rrn3B2RS91 AU040320-201ENSMUST00000047431 4384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Rrn3B2RS91 Evc-201ENSMUST00000031005 4325 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Rrn3B2RS91 Serinc5-201ENSMUST00000049488 5366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Rrn3B2RS91 Raver1-202ENSMUST00000217282 4234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Rrn3B2RS91 Crmp1-202ENSMUST00000114158 3051 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Rrn3B2RS91 Dr1-201ENSMUST00000031190 3085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Rrn3B2RS91 Iqcj-201ENSMUST00000063263 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Rrn3B2RS91 Ino80-201ENSMUST00000049920 6354 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Rrn3B2RS91 Tpr-201ENSMUST00000119161 7480 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Rrn3B2RS91 Papd5-203ENSMUST00000119033 4624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Rrn3B2RS91 Ccdc85a-201ENSMUST00000042534 5332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Rrn3B2RS91 Plxdc2-203ENSMUST00000114703 2061 ntTSL 5 BASIC14.46□□□□□ -0.09
Rrn3B2RS91 Ubc-203ENSMUST00000156249 2581 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.46□□□□□ -0.09
Rrn3B2RS91 Dgke-201ENSMUST00000000285 5208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Rrn3B2RS91 4933434E20Rik-204ENSMUST00000159064 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Rrn3B2RS91 Gpc6-201ENSMUST00000078849 1668 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Rrn3B2RS91 Cox16-201ENSMUST00000002757 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Rrn3B2RS91 Gm14780-201ENSMUST00000118387 2737 ntBASIC14.46□□□□□ -0.09
Rrn3B2RS91 Zfp574-202ENSMUST00000179556 4140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Rrn3B2RS91 Pltp-201ENSMUST00000059954 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
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